那么，在数据分析进入下游之后，如何给自己的研究增加更多可交付的内容呢？Shiny会是一个不错的选择。 ?...其实在我们用Seurat分析过数据之后，许多结果直接保存在了Seurat对象中了，如果每次想看某个基因在UMAP图上的表达情况都要找一番代码，有没有一点糟心。...建立Shiny程序 在Rstudio中像新建文件一样，建立Shiny文件： ?...dataTableOutput('table')) ) ) ) )) #runApp('H:\\singlecell\\SCshiny\\seuratreport') # 我是为了记住这个路径来随时启动我们的...image 在RStudio中运行一下： rsconnect::setAccountInfo(name='注册的名字',token='注册后会得到', secret='注册后会得到') 没有问题的话基本就可以了
本文是一篇图上对抗攻击的实操论文.来自图对抗攻击大佬Stephan. 作者: 雪的味道(清华大学) 编辑: Houye ?...本文通过微小扰动，使得分类准确率比baseline降低很多，并且能够泛化到无监督的表示学习中。 Introduction 之前的工作基本是Targeted攻击，对指定点进行攻击使其误分类。...比如：社交网络中某个人。这本文的工作中，首次提出一个降低模型的全局分类性能的算法。本质上，作者是把基于梯度的深度学习模型优化过程颠倒过来，把输入数据（图）当作一个超参数来学习。...大概意思就是搞个评分矩阵 S，这玩意是邻接觉真的梯度的一个变型，这样这个值就可以直接对应于是否加边减边的score，这样我们就能选一个梯度最大的作为需要改变的边。 ? Experiments ? ?...作者实验发现，如果使用干净图训练得到的参数，那么即使在被攻击的图上测试，效果仅仅略有下降。而用被攻击的图训练的参数，即使在干净图上做预测，结果依然大幅度下降。
在做单细胞分析的时候，时不时会遇到这样的情况：想知道这几个在图上看着很特别的点是哪几个细胞，或是一些可见的小subcluster想要直接标记出来。...最近恰好看到群友们提到类似的需求，手动从降维图上选出目标细胞来做后续分析，那刚好呀，shiny我熟，类似的功能以前实现过，趁着周末不如赶紧包包做起来嘿嘿 产物就是这里要介绍的这个小小包，github地址...： https://github.com/vikkki/xSelectCells 话不多说先开始： 安装 安装这个小工具之前可以先安装shiny，ploty 以及dplyr， 当然还有Seurat啦。...如果看不到下面的按钮和信息栏建议把右下窗口拉大一点，或者在浏览器打开（viewer section 上边 show in new window）： xs界面 细胞信息： xs信息 细胞下载： 选好之后点下载，这时候不会关闭shiny...不过幸好去看了Seurat的源码，才磕磕绊绊完成个这个小小工具。单细胞这么火，其实大佬们的工具真的很强，群友中的大佬也有无数好用的工具和代码。
上面是shiny团队的稿件 shiny是一个直接用R来制作交互式网页应用 (interactive web applications (apps)) 的R包 一、欢迎使用shiny 如下就是一个简单朴素的...，做一些计算然后画成对应柱子数量的直方图 其中renderPlot 包含了大部分脚本，之后会详细解释，目前看不懂也没关系 试试把上面两块拼进一个shiny app的app.R脚本,记住要以library...runApp和其他R中的许多函数(read.csv, read.table)一样，第一个参数的是从工作目录到app的目录的文件路径，以上代码假设my_app文件夹包含在你的工作路径，因此，只需要输入文件夹的名字...Shift+Enter) 点击灰色的向下展开小箭头还有更多惊喜哦 一个个点点看 5.回顾一下怎么创建一个app 创建一个以myapp为名的路径（文件夹） 保存app.R到myapp文件夹中 使用runApp...函数或者Rstudio的按钮启动app 通过点击叉叉或者stop退出app 下一节将开始了解app的每一个部分 Reference： Shiny - Welcome to Shiny
导语 GUIDE ╲ 在R语言绘图中的一个常见问题是用大量点或标签标记散点图。...背景介绍 在我们的科研中，常常遇到需要用散点图、火山图或者曼哈顿图进行数据可视化，就会碰到一个问题，在众多的点中，哪些才是我们想要找到的呢？...使用交互式shiny和绘图界面，我们可以将鼠标悬停在点上以查看特定点的位置，然后单击点以轻松标记它们。 还提供了一种直接导出为 PDF 以供发表的简单方法。...R包安装 install.packages("easylabel") library(easylabel) 可视化介绍 01 散点图 使用 easylabel() 打开一个shiny的应用程序并绘制和标记散点图...的形式，可以自由的进行可视化调整，对于以上示例我们可以看到，easylabel的画图美观效果是很好的，基本不需要后期进行调整，大家可以自己动手尝试一下哦！
参考： easylabel (r-project.org)[1] 前言 先前我介绍过ggrepel 这个包：[[67-R可视化11-用ggrepel更加美观的添加标记（火山图的实现）]] 其实现的文本标记更加美观...基于shiny 的easylabel 包或许是你的选择。 这里我以火山图为例。...，也是y轴； ylim 是整个坐标轴y 的边界范围； xlim 同上，超过这两个边界的点会被标记为outlier; colScheme 为指定的颜色版; vline 标记y 轴线段，用于分割结果，类似之前的...geom_hline 操作； 接下来我们就可以在shiny 中交互添加了： 在shiny 界面，你还可以对标签的位置进行个性化设置： 此外，除了在图上标记，还有一个非常有意思的筛选框，你可以通过输入基因名的方式标记...： 还有一个非常简单的shiny 数据模块： 3-导出结果 官方支持多种导出格式： 这里我尝试直接pdf： 你们觉得好看吗？
优化开发工作流程的目标是减少做出更改和看到结果之间的时间。迭代的速度越快，你可以进行的实验就越快，你就可以成为一名更好的 Shiny 开发人员。...进一步降低迭代速度的另一种方法是打开自动重新加载（options(shiny.autoreload = TRUE)），然后在后台作业中运行该应用，使用此工作流程，保存文件后，您的应用将重新启动：无需关闭并重新启动...这种技术的主要缺点是，由于应用程序是在单独的进程中运行的，因此调试起来相当困难。 随着你的应用程序变得越来越大，你会发现“交互式实验”步骤开始变得繁重。...很难记住要重新检查应用程序中可能受更改影响的每个组件。在后面的文章中，我们将学习自动测试的工具，该工具可让我们将正在运行的交互式实验转换为自动代码。...在查看器窗格中运行对于较小的应用程序很有用，因为你可以在运行应用程序代码的同时看到它。 在外部浏览器中运行对于大型应用程序很有用，或者如果你要检查应用程序的外观是否与大多数用户看到的情况完全相同。
0.背景知识 在预后分析中，构建了多因素cox模型后可以选择森林图或者是诺谟图进行可视化。 之前看诺谟图，如果有一个新的病人信息，可以从诺谟图上面自行比划看该新病人的1、3、5年生存率。...这样画起来多少有点麻烦，最近埋头苦读的我发现一个人的生存率也可以做成生存曲线。...shinyapp 哈哈，看起来很厉害实际上就是唬唬人的东西，有人会用shiny来做很复杂很炫酷的网页工具，我们这个是个入门版本。...rm(list = ls()) library(shiny) library(rms) library(prodlim) library(survival) # 定义全局模拟数据和模型 simulate_data_and_model...X1 + X2, data=ph, x=TRUE, y=TRUE, surv=TRUE) return(list(ph = ph, mod = mod)) } # 调用一次模拟数据和模型，以便在Shiny
Louis 2.使用chartSeries 来绘价格图 stockVis也依赖于helpers.R, 包含适应通货膨胀调整股票价格的函数 选择框和日期范围 stockVis 包含一些新的小工具 一个日期范围选择器...，反应表达式会返回保存的值，不做任何计算 此举能够被用作防止shiny重新运行不必要的代码 思考如下stockVis app中，反应表达式如何生效 server shiny会持续追踪output所依赖的那个反应表达式，也包括那个小工具。...shiny会重建对象，一旦： 对象的render*函数中，input值改变了 对象的render*函数中，反应表达式过期了 将反应表达式作为一条链中的连接，把input值和output对象连了起来。...： 上述代码中的adjust部分可以不用在renderPlot中 参考答案： Adjust在renderPlot内部被调用。
3）如果是芯片数据，或者自己DIY的数据，数据中至少应该包括：倍数列，p值列，基因名列。分别在图中4、5、6填入。注意！这时在3的地方不要勾选。...回想起来，这都得益于前辈们铺的路，比如徐洲更的shiny教程，比如Y叔的神包(clusterProfiler)，再比如小丫画图的众筹模式，再比如Daying的代码等等，让一个只会回车的小白走向了开发工具的道路...至少要有三列：分别是 基因名（Gene Symbol），倍数（log2FlodChange），p值（padj），在右上那几个列名中分别填写自己表格中各列的名字。...配合AnnoE的功能，可以实现提取LncRNA后做火山图，具体操作看下面： 1.2更新内容： 如果想选某个基因，在2的位置勾选，在1的位置填写准确填写基因SYMBOL（如果不知道准确信息，可以到Geneinfo...当然这个工具还可以实现 1、基因信息查询 之前需要输入准确的基因名字，现在可以实现一丢丢模糊搜索： 不必记住全名，输入几个字母，就能返回结果，可以在下面列表查看结果。
，所绘矩形只能在第一象限 D 旋转（R）：绘制与x轴正方向呈一定夹角的矩形 E 选择矩形命令后的其它命令操作：a 倒角（C）与圆角（F）：直接绘制倒角或圆角矩形b 标高（E）：指定所绘矩形和基准面的垂直距离...trim（TR） A 点选对象或直接使用空格键及右键选择所有对象为剪切边界 B 选择要修剪的对象或按住Shift 键选择要延伸的对象或 [栏选 (F)/窗交(C)/投影(P)/边(E)/删除(R)/放弃...参照（R）：参照中首先选择“参照角”为需修改图形的原有角度（通过指定两点操作）之后通过指定两点指定需要参照的角度（默认第一点为旋转的指定点，要重新定义输入P） 参照中通过选择两点指定方向时应注意选择顺序不同导致参照角度的不同...：奉献教育（店铺） 31 边界创建 boundary（BO） A 使用由对象封闭的区域内的指定点，定义用于创建面域或多段线的对象类型、边界集和孤岛检测方法 B 拾取点：根据围绕指定点构成封闭区域的现有对象来确定边界...a 取消关联性的方法：1 取消关联性勾选 2 直接在图中移动一下填充 b 回复关联性的方法（使用重新创建边界选项）：围绕选定的图案填充或填充对象创建多段线或面域，并使其与图案填充对象相关联（可选） E
前言 同事最近老是跟了不起抱怨，在搬砖打代码的时候经常遇到空指针异常。了不起立马给他安利了一个Java中的神器：Optional，它是一种容器对象，可以包含或不包含非空值。...Optional.of() 就是你找到宝藏的钥匙，而 empty() 则是告诉你这次没有宝藏。记住，不必再把 null 当宝藏了！...Rock"); System.out.println("You found: " + treasure); // 输出：You found: Shiny Gem 自定义宝藏寻找 是否可以有更有趣的方式找到宝藏...，你已经领略了 Java 中 Optional 的妙用。...它就像是编程世界中的魔法药水，帮助你避免空指针异常的麻烦，让你的代码更加精彩、更加安全！Optional提供了丰富的方法来满足不同场景的需求。
通用选项 General options Use FormatR 选项可以设置输出R代码的格式，勾选时的可读性更高，这可是R界大神，统计之都和R语言大会创始人谢益辉写的包。...个人推荐勾选，可实现多行并缩进排版，方便阅读和与同行交流。 Multiline results 是选择输出绘图代码形式，可以是行相加所有参数的形式，也可以是一行行独立累加主题的形式。...图例文字属性 Legend Text 同上 图例背景属性 Legend Background 括填充色Fill，外边框类型Type、线宽Size和颜色Colour 图例核心属性 Legend Keys 即图例中颜色图状的属性...可以修改子标题(Subtitle)和图注(Caption)中的内容。...同时还可以修改文字的属性，如字体家族、样式、大小、颜色和水平位置 编辑结果导出绘图代码 以上面板中可修改上百个参数，并提供几百个属性值的选择。这些要是靠自己记住，那可真是太难了。
由于我们发现自己在工作中越来越多地使用这些模型，我们开发了一套R shiny工具来简化和加速与对象交互的lme4常见任务。...shiny的应用程序和演示 演示此应用程序功能的最简单方法是使用Shiny应用程序，在此处启动一些指标以帮助探索模型。 ? 在第一个选项卡上，该函数显示用户选择的数据的预测区间。...该函数通过从固定效应和随机效应项的模拟分布中抽样并组合这些模拟估计来快速计算预测区间，以产生每个观察的预测分布。 ? 在下一个选项卡上，固定效应和组级效果的分布在置信区间图上显示。...这些对于诊断非常有用，并提供了检查各种参数的相对大小的方法。 ? 在第三个标签上有一些方便的方法，显示效果的影响或程度predictInterval。...对于每种情况，最多12个，在所选数据类型中，用户可以查看更改固定效应的影响。这允许用户比较变量之间的效果大小，以及相同数据之间的模型之间的效果大小。 预测 预测像这样。
关键字搜索：1搜变量，2搜函数关键字 工具 fortify，批量化挖掘漏洞，静态挖掘漏洞，支持多种语言，做题先扫描一遍seay： 扫描关键字 , 输入关键字之后点击全局搜索， 但是可能封装到一个类中了， 记住勾选正则和不区分大小写...步骤 搜索select 找到变量 找到变量调用函数 右键定位函数调用位置 看看页面和数据库的互动，根据回显判断注入点 判断过滤机制 看配置文件，看配置文件的关键字，例如：fun、inc 漏洞产生的根本...可控变量 特定函数，决定漏洞类型 不存在过滤或过滤不严谨存在绕过导致的安全漏洞 定点挖掘关键字 可控变量 接受来的id参数将会传递给sql语句执行变量的接受 变量的接受方式：get post 接受关键字...：_GET _POST 特定函数 输出 print echo数据库操作 搜索特定关键字尝试寻找特定漏洞 搜索echo print 尝试挖掘的就是xss漏洞 搜索_GET _POST 尝试挖掘的就是安全漏洞...（可控变量） 搜索select insert update sql执行语句 == sql注入漏洞 定点挖掘功能点 我要挖掘文件上传，通过网站的浏览，发现文件上传的位置，例如会员中心，抓包分析找到源码中的特定文件代码段
要在一个 Shiny 的应用程序中创建这种布局，你需要使用以下代码（注意，fluidRow 中的列宽总和为12）： ui <- fluidPage( fluidRow( column(2,...要在一个 Shiny 的应用程序中创建这种布局，你需要使用以下代码: ui <- fluidPage( fluidRow( column(4, "4" ), column...要在一个 Shiny 的应用程序中创建这种布局，你需要使用以下代码: ui <- fluidPage( fluidRow( column(12, "Fluid 12",...如果启动响应特性是启用的（它们在 Shiny 中是默认情况），那么网格也将适应为724px或1170px宽，这取决于你的视窗（例如，当在平板电脑上）。...以下是需要记住的区别: 你使用 fixedPage() 和 fixedRow() 函数构建网格。
软件安装包到电脑磁盘根目录或英文路径文件夹下，并解压缩，安装前先关闭断开网络，然后数据打开“Mathcad15.0 M050”文件夹图片2、找到setup.exe，鼠标右击选择【以管理员身份运行】图片3、点击【下一步】图片4、先勾选“...我接受”，然后点击【下一步】图片5、点击【Mathcad】处图片6、默认，点击【下一步】图片7、勾选“定制”，然后点击【下一步】图片8、选择软件安装路径，默认安装在C盘，点击右侧“文件夹图标”可更改软件安装路径...小编这里将软件安装在D盘Mathcad15文件下，然后点击【下一步】图片温馨提示：请记住软件安装路径，后续操作步骤需要用到。...图片9、点击【下一步】图片10、点击【安装】图片11、正在安装中，这个过程大概需要20分钟左右的时间，请耐心等待安装完成图片12、点击【取消】，注意：一定点击取消，否则无法破解图片13、点击【是】图片14...【退出】图片16、点击【是】图片17、返回软件初始安装包，双击打开“Crack”文件夹图片18、将mathcad.exe文件复制粘贴到软件安装目录（见第8步）文件夹下覆盖原文件图片19、点击【替换目标中的文件
一、装饰器基础（什么是装饰器） Python的函数是对象 要了解装饰器，您必须首先了解函数是Python中的对象。这具有重要的联系。...请记住这一点，我们将在不久后回头再说。 Python函数的另一个有趣特性是可以在另一个函数中定义它们！ def talk(): # 您可以在“talk”中动态定义一个函数......＃只需将其传递给装饰器，它将动态地包装在 ＃您想要的任何代码中，并为您返回准备使用的新功能： a_stand_alone_function_decorated = my_shiny_new_decorator...这很简单，只需a_stand_alone_function用以下方法返回的函数覆盖my_shiny_new_decorator： a_stand_alone_function = my_shiny_new_decorator...Python中嵌入了几种经典的设计模式来简化开发（例如迭代器）。
，那么一路回车就行了，只需要在最后一步选一个离您最近的CPAN 镜像站点。...例如我选的是位于国内的http://www.cnblogs.com/itech/admin/ftp://www.perl87.cn/CPAN/ 。...在Ubuntu的中文系统中自带了中文输入法，通过Ctrl+Space可切换中英文输入法。这里我们主要说下Ubuntu英文系统中，中文输入法的安装。...通过iptables我们可以为我们的Linux服务器配置有动态的防火墙，能够指定并记住为发送或接收信息包所建立的连接的状态，是一套用来设置、维护和检查Linux内核的IP包过滤规则的命令包。...果然，马上3838端口就可以被访问了，我的shiny程序也可以完整的使用啦。
俯视面 Front 前视面 Side 侧视面 Number 视角号码，1～8为系统默认，9号以上为用户新设定 Named 依系统视角管理中的..., 给出半径,生成一整圆 3 entities 与三个图素相切，生成一切弧 Ctr line 与二条相交直线中的一条直线相切...Curve 曲面曲线 Cunst param 常参数 （指定位置） 生成曲面或实体面上选定点的u方向或v方向或uv二个方向上的曲线 Patch bndy 缀面边线 ...生成参数曲面上的多组uv网格参数曲线 Flowline 曲面流线 生成曲面或实体面上选定点的u或v方向上若干组曲面曲线和参数曲线（给出曲线数量或间距） Dynamic...动态绘线 动态选取曲面或实体面上若干点组成的曲线 Slice 剖切线 生成曲面和定义平面按给定间距的若干条交线 Intersect 交线
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