首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

​CellRanger标准输出文件还分gz格式和非gz格式吗?

有个生信入门课程学员在群里提出一个问题,他发现自己使用Read10x函数读取 CellRanger 标准输出文件报错,明明是非常标准的三个文件,为什么还会报错呢?...和matrix.mtx,分别包含了以下信息: 这些文件的格式标准使得它们可以被广泛用于下游分析,如基因表达差异分析、聚类、降维等。...早期的Cell Ranger版本使用的文件格式与后来的版本之间的变化,主要是由于对数据存储效率、处理速度和用户体验的优化。...以下是对这两个版本文件格式变化的详细解释: 早期版本的文件格式 barcodes.tsv: 包含细胞条形码信息,表示每个细胞的唯一标识符。...兼容性和标准化:随着单细胞分析工具和平台的不断发展,使用压缩文件格式(如.gz)已成为一种标准做法。这使得不同工具和软件之间的数据交换更加方便。

6000

Python小技巧:保存 Pandas 的 datetime 格式

数据库不在此次讨论范围内保存 Pandas 的 datetime 格式Pandas 中的 datetime 格式保存并保留格式,主要取决于你使用的文件格式和读取方式。以下是一些常见方法:1....使用合适的存储格式CSV 格式:默认情况下,CSV 格式会将 datetime 对象转换为字符串。...使用 to_datetime 函数如果你读取的数据中的日期时间列是字符串格式,可以使用 to_datetime 函数将其转换为 datetime 格式:df['datetime_column'] = pd.to_datetime...(df['datetime_column'], format='%Y-%m-%d %H:%M:%S')他们之间的优缺点流行的数据存储格式在数据科学和 Pandas 中,几种流行的数据存储格式各有优缺点,...缺点:不支持复杂的数据类型,例如 datetime 对象需要特殊处理。效率较低,尤其对于大型数据集。2. Parquet:优点:高效的列式存储格式,适用于大型数据集。

23200
  • 您找到你想要的搜索结果了吗?
    是的
    没有找到

    这是EnterLib PIAB的BUG吗?

    在默认的情况下,EnterLib的PIAB采用基于TransparentProxy/RealProxy的机制实现对方法调用的拦截,进而实现了对横切关注点(Crosscutting Concern)的动态注入...也正是其来截机制本身的局限,当我们才用PIAB的方式进行对象的创建的时候,要求本创建对象的类型要么实现某一个接口,要么继承MarshalByRefObject类型。...但是当我们让抽象基类继承自MarshalByRefObject就不行了,我个人觉得这是微软需要改进的地方。...IFoo和Foo定义在如下的代码片断中,上面创建的FooCallHandler通过自定义特性的方式应用到类型Foo上面。...不过,为了让PIAB提供对抽象类的支持而多加上一个非抽象的基类,在设计上是很丑陋的,我个人是不能接受的。实际上,我觉得这是PIAB自身的一个BUG,或者是自身欠考虑的地方。

    55470

    程序返回数据的标准格式

    当你需要写一个函数来验证,处理数据时,返回数据是必须的 通常来讲,写函数是为了重用代码,使这个函数可以通用在很多地方,比如验证表单信息,验证会员身份,验证余额,处理会员数据,查询数据 这个时候,就得返回验证失败或者成功...,验证失败也有验证失败的提示信息,返回数据也有可能有错误信息,也有返回成功的数据,所以我们应该规范一个返回数据的类型格式 简洁来说,一个函数,验证失败应该返回false,并且返回失败信息,验证成功应该返回...true,并且返回数据信息 在很多代码里面,都是返回以下的一种数组格式 $result['status']=true;//false $result['message']='出错信息,验证失败信息';...$result['data']=$data;//返回数据 上面的数组基本是通用格式,并且用处广泛,可以用于接口,自己程序的各种验证函数,数据处理函数,全部通用,希望大家养成一个编码的好习惯.

    1.1K30

    这是你了解的 print()函数吗

    前言 print() 应该是初学者最先接触到的第一个 Python 函数,因为几乎所有的启蒙课程都是从 print(‘Hello world’) 开始的。...事实上, print() 也是程序员使用频率最高的函数之一,同时也是很多程序员喜欢的代码调试利器。但是关于 print() 函数,你真的了解吗?...打字机效果 不了解 print() 的 flush 参数,很难实现下图所示的打字机效果: ?...将第一个字符 ‘-’ 改成 '-- ',还可以实现这样的效果: ? 覆盖式打印效果 ‘\b’ 的作用是回退一个字符,’\r’ 则可以退回到行首。借助于 ‘\r’,可以实现整行覆盖式的打印效果: ?...需要注意的是,整行覆盖的话,新的字符串长度不能小于原字符串长度,否则会留下前一次的打印内容。这个效果,同样需要设置参数 flush 为真。

    56920

    C#关于DateTime得到的当前时间的格式问题

    C#中把DateTime获取到不同格式的时间转换为固定的时间格式:     C#中有严格的大小写限定     yyyy-MM-dd hh:mm:ss      两者之间是有区别的:     yyyy:代表年份...    MM:  代表月份     dd:   代表天     HH:   代表小时(24小时制)     mm:  代表分钟     ss:    代表秒     DateTime dt1 =Convert.ToDateTime...("2010-06-15");     DateTime dt2= Convert.ToDateTime("2010-05-10");     (1)计算两个日期的差值:         TimeSpan...        int day=span.days;     (2)给日期增加一天、减少一天         dt1.AddDays(10);         dt2.AddDays(-10);      (3)格式化日期...:         stirng date=DateTime.Now.Tostring("yyyy-MM-dd hh:mm:ss");

    2K30

    你的EEPROM驱动标准吗?

    ,所以在标准中提出了细致的要求,大家都必须按照标准来走,这样的话就大大提高了程序的复用性,和可靠性,对外置EEPROM和内置EEPROM都适用,也推荐大家使用状态机来做EEPROM的驱动,另外还要维护EEPROM...同样可以参考写和擦除接口,以及错误管理,同样推荐大家写驱动文档也可以按照这个格式和样式来书写,以提高开发文档的书写和表达能力。...我们曾在公众号里给大家介绍过基于AUTOSAR标准的GPIO驱动开发,其实认真阅读AUTOSAR标准,开发出一个符合AUTOSAR标准的驱动没有想象中那么难,希望有兴趣的同学可以阅读下AUTOSAR标准中的以下文档...,对你开发EEPROM有很大的帮助,即使你不完全按照AUTOSAR标准,也会为你提供很好的架构参考。...关于AUTOSAR的完整标准,大家可以登录www.autosar.org官网下载,目前最新的应该是4.2版本。希望会对你们做嵌入式驱动开发的程序猿提供指导 ?

    1.1K80

    这是Blazor上传文件的最佳方式吗?

    Blazor不得不说真是好东西,极大的提升了开发效率,很多的页面交互功能基本上只需要写很少的代码就能实现了,而且还是无js实现,你也绝对没有想到过,Blazor实现文件上传是有多么简单!...先说结论:Blazor实现带进度显示的文件上传真的很简单!效果看图: 实现这么一个小功能,仅仅只花了不到50行的代码就实现了,接下来就给大家分享下案例实现吧。...首先引入Tewr.Blazor.FileReader包,这个包能够提供文件上传的流式读取,这样便可以实现在服务端对上传文件进行一边上传一遍写文件的操作。...配置依赖注入(站长注:这是Blazor Server模式,wasm方式请查看文末仓库文档说明): services.AddFileReaderService(); 接下来我们先进行页面布局,很简单,再声明两个变量用于显示进度和显示图片...1MB的图片,因为Tewr.Blazor.FileReader这个包提供文件上传的流式读取,上传大文件也是可以的,下面这是上传一个34.2MB的ZIP压缩包,Blazor服务端模式: demo做的一般

    1.4K40

    带毫秒的字符转换成时间(DateTime)格式的通用方法

    C#自身有更好的方式,Net任意String格式转换为DateTime类型 ====================================================== 原文 ====...================================================== 好久没更新日志了,添加个方法吧,本身没有什么技术可言,为了能方便大家,我稍微整理一下咯~ 带毫秒的字符转换成时间...(DateTime)格式通用方法,如下:(支持格式:2014-10-10 10:10:10,666 或 2014-10-10 10:10:10 666) /// /// 带毫秒的字符转换成时间...(DateTime)格式 /// 可处理格式:[2014-10-10 10:10:10,666 或 2014-10-10 10:10:10 666] /// public DateTime...GetDateTime(string dateTime) { string[] strArr = dateTime.Split(new char[] { '-', ' ', ':', ','

    1.3K60

    这是什么原理,有知道的朋友吗

    标签:Excel公式练习 一个非负整数,将其各个位上的数字相加,再将结果的各个位上的数字相加,如此反复,直至结果为个位数。...例如,数字123456789,将其各个位上的数字相加后结果是45,再将45的各个位上的数字相加=4+5=9,最终的结果为9。...那么,非负整数各个位上的数字相加,再将其结果的各个位上的数字相加直至结果为个位数,求这个个位数,如何编写公式? 示例数据如下图1所示。...图1 实际上,很简单,其最终的个位数结果就是原数的余数,在Excel中使用MOD函数求余,即求原数除以9后的余数: MOD(B3,9) 然而,对于9、18、27等9的倍数,其最终结果应该是9。...有了解的朋友吗,欢迎留言指导。 注:有兴趣的朋友可以在知识星球完美Excel社群下载本文配套示例工作簿。

    53920

    这是你想要的技术 leader 吗?| 极客时间

    之前看过一个调查,说超过 80% 的技术管理者都是在没表达管理意愿的情况下,被推到管理岗的,我自己也不例外。 那么,如何才能快速具备技术领导力?怎样让自己的团队高效且有战斗力?...还有一些向管理岗努力的技术人,或平时被看到的机会很少,或卡在技术转管理的节骨眼上腹背受敌,想知道怎样才能避开前人踩过的“雷”等。 如果你也有类似的困惑,我可以明确地告诉你:是时候提升你的技术领导力了。...专栏的每一讲,都是大厂的一线管理者在实践中的总结和提炼,对技术人扩展视野和开拓格局很有帮助,这样一字一句的经验传授,相当于你有了几百个高管朋友,是花多少钱都买不来的。...这些大佬的经验让我站在更高的层面,去思考团队面临的问题并得出解决方法,那会儿听了不到一半,已经感觉受益很多,值回票价了。...此外,你还能快速了解最新的技术与趋势,比如区块链、人工智能、运维技术发展到了哪个阶段,你的企业是否还在用老旧的技术解决别人早已经轻车熟路的问题,乃至更深入地了解国家政策,更好地洞察先机。

    73120

    EDI只能传输标准的EDI报文吗?

    实际业务中,企业之间往往会传输标准化的EDI报文,如X12标准下的850订单,或是EDIFACT标准下的DELFOR交付计划等。但也有人会提出这样的问题:EDI只能传输标准EDI报文吗?不是。...除了符合国际标准的报文以外,EDI还可以传输多种格式的文件。 标准EDI报文只是说明这种报文是被权威机构制定、并且被众多企业一直认可并使用的。...由此可见标准的EDI报文应用广泛,但EDI也可以传输其他非标准报文格式的文件。在以往的项目中,客户根据自身需求也在EDI系统中成功传输了一些非标准报文的内容。...主要传输的非标准报文格式包括:图片、CSV、Json、XML、Excel等。...因此,标准EDI报文是企业使用EDI的最优选择,当企业遇到标准EDI报文无法满足的需求时可以使用非标准报文或者其他非标准格式的内容作为补充。

    83800

    这是统治市场的节奏吗?Apple Watch要兼容Android

    而且从2015年WWDC全球开发者大会中也可以看出,蒂姆·库克(Tim Cook)治下的苹果也会作出一些出乎意料的决定——尤其是在可以利用Android平台的弱点的情况下。...Apple Watch最终会支持Android吗?这并不能确定,但是它有一定可能。谁不想占更多的市场份额呢? “我的个人猜想是,在最初的18至24个月里,Apple Watch仅会支持iPhone。...在watchOS 2中,苹果提升了Apple Watch独立运行应用的能力,未来该手表的配对设备的重要性将会降低。 Apple Watch将打造自己的的未来并不是那么遥远。...目前它已经拥有自己的操作系统,这意味着Apple Watch可以创造自己的发展道路。况且,苹果对Apple Watch的期望也远不止是iPhone的一款配件这么简单。...未来,随着Apple Watch更强大、更加独立,它将会形成自己的平台。Apple Watch将会拥有自己的处理器、内存以及SIM卡。当真的实现这些时,Apple Watch还会需要iPhone吗?

    78960

    这是一个众人裸奔的时代,你害怕吗!!!

    生活在科技如此发达的今天,互联网上我们已经没有任何秘密可言。说这是一个「众人裸奔」的时代,其实一点也不过分。不错,皇帝的新衣,说的就是你,重点不在于你是皇帝,而在于「新衣」。...大数据的兴起,云服务的枝繁叶茂,云端数据的计算,让如今这个时代网络安全显的更为重要。...这是一个数据库连接的例子,用户用了自己真实的代码。...当然,这次用户的裸奔是由于 与 FaceBook 合作的第三方机构不靠谱,不正当使用数据造成的。但是你以为像 FaceBook 这样大的超级公司没有在分析你们的每个行为吗?...数据还有互通吗?还是头条和输入法有合作,进行文字的分析? 不管上述操作是如何实现的,我相信大家都多多少少会遇到上面的那种例子和情况。

    69230

    05 X.509 公钥证书的格式标准

    X.509是# 公钥证书的格式标准, 广泛用于TLS/SSL安全通信或者其他需要认证的环境中。X.509证书可以由# CA颁发,也可以自签名产生。...有效性信息:证书的有效时间区间,以及# CRL等相关信息。 X.509证书的标准规范RFC5280中详细描述了证书的# 1.1 Encoding Format和# 1.2 Structure。....pub : PEM格式的公钥文件。 .crt : PEM格式的# 公钥证书文件,也可能是DER。 .cer : DER格式的# 公钥证书文件,也可能是PEM。...Certificate_authority 3.3 DER {#distinguished-encoding-rules} DER=Distinguished Encoding Rules是# X.690标准中的一种二进制编码格式...PEM是一种事实上的标准文件格式,采用base64来编码密钥或证书等其他二进制数据,以便在仅支持ASCII文本的环境中使用二进制数据。PEM在RFC7468中被正式标准化。

    3.2K50

    小姐姐,这是你要的瘦脸大眼效果吗?

    旧文中我们用 OpenGL 给小姐姐实现了瘦身和大长腿效果,结果小姐姐眯着眼睛、嘟着嘴说,我需要瘦身和大长腿效果吗? 笔者若有所思地看着她的眼睛和脸庞,终于弄明白了她需要的是什么效果。...本文所实现的大眼效果进行了简化,是在以人眼为中心的圆形区域内进行放大,距离圆心越远,放大的强度越大。 ?...瘦脸效果 瘦脸效果的实现,是将指定区域内的像素按照一定的规则进行整体偏移,从而形成一种对脸部挤压的效果。 ?...瘦脸效果原理图 如上图所示,BC表示偏移方向和偏移程度的向量,将圆内的所有像素按照向量BC的方向进行一定程度的偏移,像素偏移的强度,和像素与圆心的距离相关,越靠近圆心强度越大。 ?...瘦脸关键点 为了简化计算流程,只做原理性展示,我们选取 了3 个人脸部位的关键点(如上图,左右太阳穴和下巴),再由关键点计算出来控制点(太阳穴和下巴的连线的中心点),控制点组成上述的 BC 向量。

    99411
    领券