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听说你的KM-plot p值>0.05

而年龄、基因表达量都是连续型数据,他们要做KM-plot时,就必须要先离散化。按照某个具体数值作为分界线,大于该值的是一个组, 小于该值的是另一个组。...常见的离散化方案分界线的选择方法有三种: 1.按照经验值,例如年龄按照60分为年长组和年轻组。...2.按照中位数 3.按照最佳截断值 最佳截断值是约登指数(敏感度+特异度-1)最大的点,说人话就是让KM-plot上的p值最小的值。...set.seed(13) meta = mutate(meta1,age = sample(45:100,nrow(meta1),replace = T)) #伪造一列,年龄,做例子 head(meta) 2.用中位数来作为分界线...survfit(Surv(time, event)~group, data=meta) ggsurvplot(sfit,pval =TRUE, data = meta, risk.table = TRUE) 3.用最佳截断值来作为分界线

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引导图滤波(Guided Image Filtering)原理以及OpenCV实现

权重值W可以用下式表示(原文献有详细推导): ?         μk是窗口内像素点的均值,Ii和Ij指相邻两个像素点的值,σk代表窗口内像素点的方差,ε是一个惩罚值。...而异号时的权重值将远远小于同号时的权重值,这样处于平坦区域的像素则会被加以较大的权重,平滑效果效果更明显,而处于边界两侧的像素则会被加以较小的权重,平滑效果较弱,能够起到保持边界的效果。      ...可以看出当a值很小时,b约等于窗口内像素点的均值pk,近似于均值滤波;而当a值很大时,输出则主要取决于a*▽I的大小,梯度信息能够得到保留。...不同之处在于求a时将原来的方差σ替换为协方差3x3矩阵∑k,表示如下: ? U是3x3单位矩阵,求出来的a将不再是一个值,而是一个1*3的向量,然后求b。...(注:文献中的代码是通过matlab编写的,matlab中读取图像时会自动将图像归一化到0-1,因此截断值ε的设置也对应小很多,比如0.1,0.01等。

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    「史上最强GAN图像生成器」BigGAN的demo出了!

    该研究的创新点是将正交正则化的思想引入 GAN,通过对输入先验分布 z 的适时截断大大提升了 GAN 的生成性能,在 ImageNet 数据集下 Inception Score 竟然比当前最好 GAN...从这种分析中获得的洞察表明,将一种新型的和已有的技术结合可以减少这种不稳定性,但要实现完全的训练稳定性必须以显著降低性能为代价。 ? 由 BigGAN 生成的类条件样本。 ? (a)增加截断的效应。...教你怎么用 Colab Demo 这个 Colab Demo 的使用非常简单,直接用 Chrome 浏览器打开 Colab 地址,登陆你的谷歌账号,就可以开始耍了。...刚打开 Colab 时,我们可以看到代码总体上分成四大块,分别是 BigGAN Demo、Setup、Explore BigGAN samples of a particular category、Interpolate...如上图所示,这个任务的可控参数有:样本数量、插值数量、截断值、噪声种子、以及用于插值的图像类别 A 和 B。样本数量是指每次插值时类别 A 和类别 B 的的初始样本数量,如下图所示样本数量为 2。

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    面试算法:二分查找法寻找数组截断点

    于是问题反过来问,当给定新的总值是155时,我们如何确定截断点就在元素40处,并且截断值应该设置为35?...20, 33.75, 33.75, 33.75, 33.75 看到问题了吧,截断值居然比截断点原来的值要大,这与我们前面总结的阶段点性质矛盾。...2) 得到截断值,公式中(n/2)是包括中点以及后续元素的总个数,得到截断值后我们看看,如果截断值比截断点前面元素的值要小,那么我们可以确定,截断点一定在当前点的左边,于是对左半边数组进行二分查找,如果截断值比截断点原来的值还要大...,那么我们确定,正确的截断点一定在当前点的右边,于是我们可以对右半边数组使用二分查找法来进行查找。...while循环就是在执行二分查找,代码先获取中点,也就是: m = (begin + end) / 2; 接着用总值减去中点前所有元素之后,把剩余的值除以中点之后元素个数,得到截断值,然后判断截断值的属性

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    免疫相关预后分数如何构建?

    免疫检查点靶点的出现,为转移性RCC患者提供了另一种治疗策略,强调了肿瘤免疫状态对患者预后的重要性。...最后作者选择出5个IRG:SHC1、IRF7、KDR、JAK3和CXCL5。 ? 表1 5个IRG的单变量Cox回归分析结果 ? 补充图4 5个IRG的K-M分析 ?...收集35对ccRCC正常标本,用qRT-PCR进一步验证了IRG特征中各基因的相对表达,可看出肿瘤样本中的这些基因表达较高(补充图5),与数据库验证方法的结果一致。...补充图6 使用X-tile软件为基于IRG特征的风险评分选择最佳的截断值 作者使用X-tile软件,优化截断值以区分高低风险患者。横坐标所示为风险评分的最佳截断值。...图3 预后风险特征的验证 已知TCGA发现集样本的风险评分截断值为0.135,由此将患者分为高低风险两组。高风险患者的预后较差,而低风险患者的总体生存率更好(图3a,左)。

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    做COX生存分析是否需要把连续值变成高低二分组?

    经过debug,发现他在批量的时候使用的是基因的连续值,单独可视化的时候用的基因二分组。 那么cox生存分析时,将因素的连续值变成二分组有什么影响呢?...寻找最佳截断值:在确定截断值时,可以参考相关文献和指南。...信息损失:将连续变量转化为二分组会丢失变量的精细度,可能导致信息损失。这种信息损失可能会影响模型的预测能力和结果的显性。 截断值选择:在将连续变量转化为二分组时,截断值的选择至关重要。...如果截断值选择不当,可能会导致分组不合理,从而影响结果的显性。 样本量:样本量的大小也会影响结果的显性。如果样本量较小,即使是连续变量,其结果的显性也可能不稳定。...综上所述,将连续变量转化为二分组后,结果的显性发生改变可能是由于多种因素共同作用的结果。在实际应用中,需要根据具体情况综合考虑,选择合适的统计方法和模型设定。

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    8比特数值也能训练模型?商汤提训练加速新算法丨CVPR 2020

    现有很多工作均表明将网络前向过程的浮点计算替换成INT8计算,不会带来明显的精度下降[1][2]。...当考虑将神经网络量化技术应用在卷积神经网络训练中时,为了加速卷积的反向梯度传播过程,不得不对梯度进行量化操作。...在T变大时需要能够达到足够小。通过上式可以发现,在T趋于无穷大时,第(1)项可以忽略不计,主要考虑减小第(2)项和第(3)项。...1、基于方向自适应的梯度截断:调整截断值,让梯度方向保持正确 为了最小化量化误差,之前有很多研究提出优化截断值的方法,其中就有研究提出通过假设数据分布直接求解最优截断值。...3、周期更新:降低由于统计而带来的额外计算耗时 由于量化操作需要的统计数据范围和计算截断值等操作十分耗时,为了减少这些操作的时间开销,本文采用周期更新的方式,周期性地统计数据范围和计算截断值。

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    逻辑回归、决策树和支持向量机(I)

    我将数据绘制在坐标轴上。 ? 这就是特征空间,观测值分布于其中。这里因为我们只有两个预测变量/特征,所有特征空间是二维的。你会发现两个类别的样本用不同颜色的点做了标记。...当你进行预测的时候,对概率值做一个分数截断,高于截断值的概率为1,否则为0。假设截断值用c表示,那么决策过程就变成了这样: Y=1 if p>c, 否则0。最后给出的决策边界是F>常数。...如果你仔细思考,这些决策规则x2 || const OR x1 || const 只是用平行于轴线的直线将特征空间切分,如下图所示。 ?...因此,如果边界是非线性的,并且能通过不断将特征空间切分为矩形来模拟,那么决策树是比逻辑回归更好的选择。 然后我们再来看看SVM的结果。SVM通过把你的特征空间映射到核空间,使得各个类别线性可分。...也就是说,在处理多维数据时,什么时候该选择何种算法?这个问题很重要,因为若是数据维度大于三,你就找不到简单的方法来可视化地呈现数据。我们将在第二部分讨论这么问题,敬请关注。

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    TCGA生存分析②

    使用Surv()创建的响应变量位于公式的左侧,用〜指定。 让我们使用常见的肺癌数据并对性别进行Cox回归分析。...简单起见可以用下列来解释: HR = 1:无效 HR> 1:危险增加 HR <1:减少危害(保护性) 下一步让我们创建一个模型来分析数据集中的所有变量!...基于截断值我们可以添加labels =选项来标记我们创建的分组,例如,'yong'和'old'。 最后,我们可以将结果分配给肺数据集中的新对象。...NA old 2 15 old 3 15 young 4 11 young 5 0 young 6 0 old 现在,通过截断值我们将...但是,如果我们选择一个不同的切点,比如70岁,这大致是年龄分布的上四分位数的截止值(参见?分位数)。 结果现在略显重要!

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    逻辑回归、决策树和支持向量机(I)

    我将数据绘制在坐标轴上。 ? 这就是特征空间,观测值分布于其中。这里因为我们只有两个预测变量/特征,所有特征空间是二维的。你会发现两个类别的样本用不同颜色的点做了标记。...当你进行预测的时候,对概率值做一个分数截断,高于截断值的概率为1,否则为0。假设截断值用c表示,那么决策过程就变成了这样: Y=1 if p>c, 否则0。最后给出的决策边界是F>常数。...如果你仔细思考,这些决策规则x2 || const OR x1 || const 只是用平行于轴线的直线将特征空间切分,如下图所示。 ?...因此,如果边界是非线性的,并且能通过不断将特征空间切分为矩形来模拟,那么决策树是比逻辑回归更好的选择。 然后我们再来看看SVM的结果。SVM通过把你的特征空间映射到核空间,使得各个类别线性可分。...也就是说,在处理多维数据时,什么时候该选择何种算法?这个问题很重要,因为若是数据维度大于三,你就找不到简单的方法来可视化地呈现数据。我们将在第二部分讨论这么问题,敬请关注。

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    Q-YOLO:用于实时目标检测的高效推理

    以下是计算机视觉历史分享的关于Yolo相关技术: 改进的YOLO:AF-FPN替换金字塔模块提升目标检测精度 FastestDet:比yolov5更快!更强!...当使用诸如MinMax之类的固定截断值时,以极低的概率表示激活值将在有限的整数位宽内消耗相当多的比特,从而导致信息的进一步丢失。...首先,使用全精度和浮点算法对权重和激活进行训练或将网络提供为预训练模型。随后,权重和激活的数值表示被适当地变换用于量化。...对于部署工具,选择了TensorRT和OpenVINO。整个过程包括将torch框架中的权重转换为具有QDQ节点的ONNX模型,然后将它们部署到特定的推理框架中。...由于目前大多数推理框架只支持对称量化和8位量化,不得不选择对称的8位量化方案,这导致与非对称方案相比,精度下降幅度极小。

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    2023-07(数据挖掘马拉松)答疑汇编

    下面是优秀实习生的整理和分享 1安装Rstudio时出现这样的问题怎么办? 卸载,这3个都安装在 C盘,R、Rstudio、Rtools。 2老师,想问下为啥我照课件上这么输入他这里给我报错呢?...我就是想把箱式图和点图叠加。 那个代码,aes后面的x是大写的,换成小写的x就好了。一般大小写都要注意的,代码很严格。 3 你可以直接搜函数,str_split就可以。...调整比例,拉高,或者是保存时设置参数,见帮助文档。...10有一个问题想问一下,单基因画km曲线的时候,我看我有同学用最佳截断值来分组,得出来p大于0.05,我们用的是中位数p小于0.05究竟谁是对的? 谁说我们只用中位数啦?谁说一定有一个对的一个错的啦?...最佳截断值的方法代码在LUAD文件夹里面,这个视情况而定。 11请教一下,我通过一个数据集找到的5个关键差异基因,想要用另外一个数据集验证一下对照组和病例组相比,这5个基因的表达情况,我应该怎么做呢?

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    C语言初阶——操作符

    ,右边补0 右移操作符 >> 移位规则:将二进制整体向右移动,左边补值分情况 1.逻辑右移:左边补0 2.算术右移:左边补原符号位(正数为0,负数为1) 小结  左移一位有将原数字扩大两倍的效果...,右移一位有将原数字缩小两倍的效果(特殊数除外,如0、-1、1等) 注意:在使用移位操作符时,不能移动负数位,比如 a<<-1 这种是标准未定义的,可能会导致意想不到错误 位操作符  位操作符有三个...C语言中0表示假,非0表示真(一般用1表示真)。 360笔试题 条件操作符(三目运算符) 条件操作符有三个操作数,形式为这样:exp1 ?...exp2 : exp3  exp1为条件判断式,当判断式为真时,进入exp2,为假就进入exp3 逗号表达式 逗号表达式是用逗号隔开多个表达式,然后从左向右计算,最终取最右边表达式的结果。...因CPU设计问题,使其很难实现整型(4字节,32比特位)以下的运算,于是这些类型在进行运算时会先发生整型提升(整型提升至32比特位,负数补1,正数补0),再进行相应计算,当计算完成后,会发生截断,截断值刚好能返回原来的类型

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    计算与推断思维 十、假设检验

    例如,即使当原假设为真时,机会变异也可能导致样本看起来与原假设的预测完全不同。 在本节中,我们将研究假设的统计检验如何可能得出这样的结论,也就是实际上原假设为真时,数据支持备选假设。...如果按照传统的 5% 截断值作为“较小” P 值的定义,那么 6% 不小了,结果不是统计学显着的。换句话说,你没有足够的证据来拒绝原假设的随机性。 你可以尽管违背约定,选择不同的截断值。...中场休息时,所有的比赛用球都被收集起来检查。两名官方人员 Clete Blakeman 和 Dyrol Prioleau 测量了每个球的压强。这里是数据;压强的单位是磅/平方英寸。...我们将处理它,但你可以自由地用其他自然统计量重复分析,例如整体平均漏气与爱国者之间的差异。...模拟结束时,数组的simulated_statistics将包含所有模拟的检验统计量。

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    RNA-seq 详细教程:假设检验和多重检验(8)

    广义线性模型 如前所述,RNA-seq 生成的计数数据表现出过度分散(方差 > 均值),用于对计数建模的统计分布需要考虑到这一点。...DESeq2 通过以下方式实施 Wald 测试: 取 LFC 并将其除以标准误差,得到 z 统计量 将 z 统计量与标准正态分布进行比较,并计算 p 值,报告随机选择至少与观察值一样极端的 z 统计量的概率...对于这个测试,每个基因估计两个模型;将一个模型的拟合度与另一个模型的拟合度进行比较。...我们正是用这个结果来确定哪些基因被认为是显著差异表达的。但是,我们不能直接使用 p 值。 4.1. p-value 显著性截断值 p 截断值为 0.05,您预计其中 25 个是假阳性。 ----

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    PostgreSQL 分区表为什么要带 pg_pathman 过时了?

    ,以及新的分区的名字,截断值以及下面的值会分割到新的分区中。...另外使用PATHMAN的原因是就是pathman将分区的信息保存在cache中,系统在去对分区的操作会很快获取相关的数据,表的信息会缓存在内存中,同时使用HOOK来实现关系的替换,所以效率高,不会在和不使用...另外使用PATHMAN的原因是就是pathman将分区的信息保存在cache中,系统在去对分区的操作会很快获取相关的数据,表的信息会缓存在内存中,同时使用HOOK来实现关系的替换,所以效率高,不会在和不使用...另外使用PATHMAN的原因是就是pathman将分区的信息保存在cache中,系统在去对分区的操作会很快获取相关的数据,表的信息会缓存在内存中,同时使用HOOK来实现关系的替换,所以效率高,不会在和不使用...这也说明一点,PG的本身的数据库的程序是越来越完善了。如同MYSQL 里面的很多工具,在MYSQL 8上面开始不在被提起。

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