R语言数据管理之数据集取子集 在做任何数据分析的第一步,是根据个人需求创建数据集,存储数据的结构是多样的,包括向量,矩阵、数据框、因子以及列表等。...其实,以上几个R语言的独特术语,在C++中也会经常用到,导致很多人都会误认为自己很熟悉了,然而在实际的应用中,却经常出现错误。...最近在处理一波量大的数据,在运行程序的过程中,因为前期数据处理错误却出现各种bug,经过检查数据集发现是数据管理的问题,为了巩固R语言的基本数据管理,特地重新基础知识。...,学R的初心就是为了绘制实验过程产生的数据图,然而随着深度学习,会发现,R语言的数据分析也很重要,常常会在绘制图形的过程中,因为数据框中存在格式不统一,字符或者缺失值等原因导致绘图失败。...对于非数学专业又喜欢R语言的人来说,学R之路漫漫其修远,没有极客基因是不行的,打好基础是进阶的前提!
学习目标 演示如何从现有的数据结构中取子集,合并及创建新数据集。 导出数据表和图以供在R环境以外使用。...] ---- 练习 metadata数据框取子集,返回基因类型为KO的行。...---- 注意:有更简单的方法可以使用逻辑表达式对数据帧进行子集化,包括filter()和subset()函数。这些函数将返回逻辑表达式为TRUE的数据帧的行,允许我们在一个步骤中对数据进行子集化。...从random列表中提取向量 age的第三个元素。 从random列表中的数据框 metadata中提取基因型信息。 ---- 3.导出文件 到目前为止只修改了R中的数据; 文件保持不变。...R函数进行数据处理。
> x[,2] [1] 6 7 8 9 10 > x[,"v2"] [1] 6 7 8 9 10 > x[( x$v1= 8),] #找出第1列小于4并且第2列大于等于8的元素...v1 v2 v3 3 3 8 13 > x[x$v1>2,] #第1列大于2的所有元素 v1 v2 v3 3 3 8 13 4 4 9 NA 5 5 10 15 > x[which(x$v1...>2),] #使用which函数筛选第1列大于2的所有元素 v1 v2 v3 3 3 8 13 4 4 9 NA 5 5 10 15 > ?...$v1>2) [1] 3 4 5 > x$v1>2 [1] FALSE FALSE TRUE TRUE TRUE > subset(x,x$v1>2) #和上面的操作一样,筛选第1列大于2的所有元素
model <- lm(mpg ~ disp + hp + wt + qsec, data = mtcars) k <- ols_all_subset(model) plot(k) 最佳子集回归 选择在满足一些明确的客观标准时做得最好的预测变量的子集...---- 点击标题查阅往期内容 R语言多元逐步回归模型分析房价和葡萄酒价格:选择最合适的预测变量 R语言逐步多元回归模型分析长鼻鱼密度影响因素 R语言特征选择——逐步回归 r语言中对LASSO回归,Ridge...岭回归和弹性网络Elastic Net模型实现 回归分析与相关分析的区别和联系 R语言分位数回归预测筛选有上升潜力的股票 R语言实现LASSO回归——自己编写LASSO回归算法 R语言泊松Poisson...回归模型预测人口死亡率和期望寿命 R语言时间序列TAR阈值自回归模型 R语言用泊松Poisson回归、GAM样条曲线模型预测骑自行车者的数量 R语言分位数回归Quantile Regression分析租房价格...R语言用Garch模型和回归模型对股票价格分析 R语言广义线性模型GLM、多项式回归和广义可加模型GAM预测泰坦尼克号幸存者 R语言分段回归数据数据分析案例报告 R语言实现CNN(卷积神经网络)模型进行回归数据分析
title: "数据框取子集、修改和连接的方法" output: html_document date: "2023-03-18" 先生成一个数据框df1作为示例数据框 df1 <- data.frame...score ## 1 gene1 up 5 ## 2 gene2 up 3 ## 3 gene3 down -2 ## 4 gene4 down -4 1.数据框取子集...(1)按列取子集:用"$"符号 df1$gene #df1后加"$",再按tab键可以直接选择df1的列名 ## [1] "gene1" "gene2" "gene3" "gene4"...1)如何取数据框的最后一列?...对于x逻辑值向量,用于取子集的逻辑值向量与x对应即可,不必须由x生成。
hello" 解释: 输入字符串可以在前面或者后面包含多余的空格,但是反转后的字符不能包括。...说明: 无空格字符构成一个单词。 输入字符串可以在前面或者后面包含多余的空格,但是反转后的字符不能包括。 如果两个单词间有多余的空格,将反转后单词间的空格减少到只含一个。...解题思路: Java 字符串不支持运算符重载,无法用原地解法。 我们将字符串转为字符型数组并用两个指针来解这道题。指针 i 作为原字符串转为字符数组的索引,从右向左移。...指针 j 作为新字符数组索引,从左向右赋值得到原数组 count 长度的字符。...count记录遇到的字母数量,每次遇到 空格 字符,新数组得到从该空格字符 向右 count 个字符并刷新count 计数。
作为同属于tidyverse 大家庭的一份子,stringr 也为R 的一般字符串处理,献上了一份自己的力量!...(长度为1 的字符串类型的向量)。...str_length 才会返回字符串长度。(其实R 也提供了nchar 的方法) 拆分与组合 拆分 需要注意的是,提取拆分后的元素需要使用 [[]] 双括号选择。...高级用法 字符检测 对字符串分隔后的向量与待检测的字符进行比较,生成等长的逻辑值向量。detect 检测全字符,starts 检测首字母,ends 检测末字母。...replace 会替换字符串中指定的第一个字符。
R的数据类型 R中包含三种最基本的数据类型 字符型(character) "a","abc","1","小明",'大强' 数值型 (numeric) 1,2,3,100,10086 逻辑型(logical...) TRUE FALSE NA 可以看出,字符型数据是在双引号或单引号中括起来的内容;数值型就是数字;逻辑型包括三个TRUE,FALSE和NA。...------- > class(x) [1] "numeric" > class(y) [1] "character" > class(z) [1] "logical" 判断一个数据是否是某个类型的数据...is.character() 判断是否是字符型 is.numeric() 判断是否是数值型 is.logical() 判断是否是逻辑型 如果想一种数据类型转换为另一种,可以用...= 大于, 小于, 小于等于, 大于等于, 等于, 不等于 可用于判断两个数据的大小关系,返回逻辑值 逻辑运算 或&:都是TRUE为TRUE,只要有一个是FALSE就为
hello" 解释: 输入字符串可以在前面或者后面包含多余的空格,但是反转后的字符不能包括。...说明: 无空格字符构成一个单词。 输入字符串可以在前面或者后面包含多余的空格,但是反转后的字符不能包括。 如果两个单词间有多余的空格,将反转后单词间的空格减少到只含一个。...指针 j 作为新字符数组索引,从左向右赋值得到原数组 count 长度的字符。...count记录遇到的字母数量,每次遇到 空格 字符,新数组得到从该空格字符 向右 count 个字符并刷新count 计数。...这里介绍python的函数: split() ,它可以把传入字符串剔除空格后返回 所有单词的数组 join() ,它可以指定一个数组以特定字符为间隔,拼接成一个字符串 加上 [::-1] 反转数组,一行代码既可实现该题目要求
p=30914 我们正和一位朋友讨论如何在R软件中用GLM模型处理全国的气候数据。本文获取了全国的2021年全国的气候数据(点击文末“阅读原文”获取完整代码数据)。...调查的出的各指标数据用R软件进行处理并且用箱图进行对比显示。...全子集回归来选出最优的模型 全子集回归,即基于全模型获得可能的模型子集,并根据AIC值等对子集排序以从中获取最优子集。...R语言贝叶斯广义线性混合(多层次/水平/嵌套)模型GLMM、逻辑回归分析教育留级影响因素数据 R语言估计多元标记的潜过程混合效应模型(lcmm)分析心理测试的认知过程 R语言因子实验设计nlme拟合非线性混合模型分析有机农业施氮水平...effects logistic)模型分析肺癌数据 R语言如何用潜类别混合效应模型(LCMM)分析抑郁症状 R语言基于copula的贝叶斯分层混合模型的诊断准确性研究 R语言建立和可视化混合效应模型
p=30914原文出处:拓端数据部落公众号我们正和一位朋友讨论如何在R软件中用GLM模型处理全国的气候数据。本文获取了全国的2021年全国的气候数据。...本次调查搜集了2021年全国不同地区的风向、降雨量、风速、风速变化、最大风速、最大降雨量、闪电概率等数据。并对不同变量之间的相关性进行了调查,对国家数据预测的错误率进行了GLM模型拟合。...读取数据library(car)library(MuMIn)head(data)读取因变量numberFaults=data$numbltshead(data1) 相关分析调查的出的各指标数据用...全子集回归来选出最优的模型全子集回归,即基于全模型获得可能的模型子集,并根据AIC值等对子集排序以从中获取最优子集。...回归模型分析案例5.R语言回归中的Hosmer-Lemeshow拟合优度检验6.r语言中对LASSO回归,Ridge岭回归和Elastic Net模型实现7.在R语言中实现Logistic逻辑回归8.python
p=30914 最近我们被客户要求撰写关于广义线性模型(GLM)的研究报告,包括一些图形和统计输出。 我们正和一位朋友讨论如何在R软件中用GLM模型处理全国的气候数据。...全子集回归来选出最优的模型 全子集回归,即基于全模型获得可能的模型子集,并根据AIC值等对子集排序以从中获取最优子集。...本文选自《R语言广义线性模型(GLM)、全子集回归模型选择、检验分析全国风向气候数据》。...R语言贝叶斯广义线性混合(多层次/水平/嵌套)模型GLMM、逻辑回归分析教育留级影响因素数据R语言估计多元标记的潜过程混合效应模型(lcmm)分析心理测试的认知过程 R语言因子实验设计nlme拟合非线性混合模型分析有机农业施氮水平...logistic)模型分析肺癌数据 R语言如何用潜类别混合效应模型(LCMM)分析抑郁症状 R语言基于copula的贝叶斯分层混合模型的诊断准确性研究 R语言建立和可视化混合效应模型mixed effect
p=30914最近我们被客户要求撰写关于广义线性模型的研究报告,包括一些图形和统计输出。我们正和一位朋友讨论如何在R软件中用GLM模型处理全国的气候数据。...读取数据library(car)library(MuMIn)head(data)读取因变量numberFaults=data$numbltshead(data1)相关分析调查的出的各指标数据用R软件进行处理并且用箱图进行对比显示...全子集回归来选出最优的模型全子集回归,即基于全模型获得可能的模型子集,并根据AIC值等对子集排序以从中获取最优子集。...本文选自《R语言广义线性模型(GLM)、全子集回归模型选择、检验分析全国风向气候数据》。...logistic)模型分析肺癌数据R语言如何用潜类别混合效应模型(LCMM)分析抑郁症状R语言基于copula的贝叶斯分层混合模型的诊断准确性研究R语言建立和可视化混合效应模型mixed effect
0 前言 数据根据结构可以分为结构化数据、非结构化数据和半结构化数据,前面介绍的数据处理函数针对于结构化数据,而字符串通常包含非结构化或者半结构化数据,这一部分介绍一下R和Python中的字符串函数。...1 目录 三种数据结构简介 R与Python字符串函数 字符串函数-基于R 字符串函数--基于Python 2 三种数据结构 数据根据结构分为三种:结构化数据、非结构化数据、半结构化数据。...结构化数据可以使用关系数据库(RDBMS)存储,可以使用二维表来逻辑表达实现的数据(R和Python中的数据框类型数据)。...3 R与Python字符串函数 R语言中推荐使用stringr包里面的函数进行字符串处理,Python中有正则表达式库re和内置的字符串string包。...str_sub() 根据指定开始和结束位置提取字符串子集。
承接R&Python Data Science系列:数据处理(5)--字符串函数基于R(一),继续介绍R语言中的字符串函数。...4.2 R语言中的正则表达式 正则表达式通过各种函数对字符串进行查询,是一种特殊的字符串模式,定义一组规则去匹配符合该规则的字符。...R语言中stringr包中用到的ICU(http://userguide.icu-project.org/posix)正则表达式,这里简单介绍一下常用到的正则表达式,简单分为下面几种: 完全匹配 转义符..."\b"、"\B"、"^"、"$" "\b"用于匹配字符串的开始或者结束,字符串的边界,而"\B"用于非字符串的边界。 "^"用于匹配字符串的开始,"$"用于匹配字符串的结束。...4.2.6 R语言正则表达式总结 正则表达式部分比较晦涩,看书的时候在这个部分花了很长时间,理解这一块,最好是理论结合练习,多写一下案例,下面会接着介绍stringr包中的使用正则表达式的字符串处理函数
这一部分,将R语言stringr包中的使用正则表达式的字符串函数简单介绍一下,会用到正则表达式的相关内容,有关正则表达式的知识可以回顾R&Python Data Science系列:数据处理(6)--字符串函数基于...R(二) 4.3 使用正则表达式的字符串函数 ?...参数simplify = TRUE时候,返回矩阵形式数据,且长度不够的位置为空字符串。...4.3.9 小结 从非正则表达式字符串函数、R语言中的正则表达式以及使用正则表达式的字符串函数介绍了R语言中stringr包中的字符串函数。...下面将介绍数据处理--字符串函数基于Python的部分。
先看一个数据, data为data.frame格式 ? 进行转置 t(data) ? 数值型数据全部变成了字符型,怎么回事?其实是因为cluster那一列数据并不是数值型,而是字符型。...因为data.frame可以存放多个类型的数据,但matrix只能存放同一种数据类型,对于输入的data.frame而言,如果有字符型数据,那么整个data.frame的数值型数据都会被转成字符型·。...想将字符型数据再变成数值型向量可参考:https://blog.csdn.net/Candle_light/article/details/84374814
#""引号里什么都不装,则分割为字母(更小单位): str_split("learn","")[[1]] ## [1] "l" "e" "a" "r" "n" 返回列表的用处:输入为多个元素组成的向量时有用...:str_sub(x,n,m)第几到第几 str_sub(x,5,9)#x的字符串里的第5至9位 ## [1] "birch" 4.字符检测:str_detect(),结果为与字符串长度相等的逻辑值 str_detect...(x2,"h")#看分割的每个字符里是否含有某个元素,结果为与字符串长度相等的逻辑值 ## [1] TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE FALSE str_starts...x[[i]]和x[i]作用是一样的,都是按位置取子集,只是写这个包的人推荐写x[[i]] for (i in 1:length(x)){ s=s+x[[i]] print(c(x[[i]],s)...## [,1] [,2] [,3] [,4] ## [1,] 1 5 7 3 ## [2,] 1 6 13 16 其他:管理长脚本的方式 R.data
另外还可以设置访问网络的代理。 读取数据库 如果需要在R中连接数据库,主要是使用ODBC来连接,需要安装包RODBC。如果是Linux或者Mac平台,对于MySQL数据库,可以安装RMySQL包。...因为我现在是Mac,就以MySQL为例,我在MySQL的test数据库中建立了一个表Employee,现在需要读取该表。...dbConnect(MySQL(),dbname="test",host="127.0.0.1") 接下来我们要查看有哪些表,可以: dbListTables(conn) 如果我要查询Employee表中的所有数据...,那么: emp<-dbGetQuery(conn,"select * from Employee”) 查询完了数据库记得关闭连接,这是一个好习惯: dbDisconnect(conn) 如果我们连接的不是...MySQL,那么就需要安装对应的数据库连接的包。
数据汇总 summary 对一个数据框 d,用 summary(d) 可以获得每个连续型变量的基本统计量,和每个离散取值变量的频率。以及分类变量的各种类型的统计结果。...table 还可以接受两个参数,实现列联表: 对于 table() 的结果列联表,可以用 addmargins() 函数增加行和与列和: 数据框概括 用 colMeans() 对数据框或矩阵的每列计算均值...,用 colSums() 对数据框或矩阵的每列计算总和。...split split 函数可以把数据框的各行按照一个或几个分组变量分为子集的列表,然后可以用 sapply() 或 vapply() 对每组进行概括。...如: sp <- split(d.cancer[,c("v0","v1")], d.cancer[["sex"]]) sapply(sp, colMeans) 顾名思义,字符处理函数就是用来处理文本型数据的
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