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如何使用dask-geopandas处理大型地理数据

dask-geopandas的使用: dask-geopandas旨在解决类似的性能问题,通过并行计算和延迟执行来提高处理大规模地理空间数据的效率。...对于dask-geopandas,可以通过调整Dask的工作进程数和内存限制来优化性能。...例如,在合并或连接操作之前,仔细考虑是否所有列都需要参与操作。 使用更高效的空间连接 在使用dask_geopandas进行空间连接时,确保操作是高效的。...dask_geopandas目前可能不支持直接写入文件格式如Shapefile,因为这通常涉及将数据集合并到单个分区。你可能需要先将数据写入Parquet等格式,或者手动分批写入。..., driver='ESRI Shapefile') print(f"合并后的Shapefile已保存至:{output_shp_path}") 点击链接可查看完整代码与在线运行代码

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使用Python和Geopandas进行地理数据可视化的实用指南

Geopandas支持多种地理数据格式,包括Shapefile、GeoJSON、Geopackage等。在本示例中,我们将使用一个Shapefile格式的地图数据。...多图层叠加与控制在交互式地图中,可以添加多个图层,并提供控制选项,以便用户自定义显示内容。...地理数据分析与可视化案例让我们通过一个案例来演示如何利用Python和Geopandas进行地理数据分析和可视化。...结论与展望通过本文的介绍和案例演示,我们了解了如何使用Python和Geopandas进行地理数据的分析和可视化。...数据保存与导出:可以使用Geopandas将地理数据保存为Shapefile、GeoJSON等格式的文件。数据投影与坐标转换:Geopandas支持数据投影和坐标转换,可以将地图投影为不同的投影方式。

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(数据科学学习手札77)基于geopandas的空间数据分析——文件IO

作为基于geopandas的空间数据分析系列文章的第三篇,通过本文你将会学习到geopandas中的文件IO。...图1 2.1.1 shapefile   作为非常常见的一种矢量文件格式,geopandasshapefile提供了很好的读取和写出支持,下面分为不同情况来介绍: 完整的shapefile   如图2...图2   使用geopandas来读取这种形式的shapefile很简单: import geopandas as gpd data = gpd.read_file('geometry/china_provinces...图3 缺少投影的shapefile   当shapefile中缺失.prj文件时,使用geopandas读入后形成的GeoDataFrame会缺失crs属性: ?...图6 读取zip压缩包中的文件 geopandas通过传入特定语法格式的文件路径信息,以支持直接读取.zip格式压缩包中的shapefile文件,主要分为两种情况。

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使用 geopandas 和 shapely(.shp) 进行地理空间数据处理和可视化

本文将介绍如何使用 geopandas 和 shapely 来读取、处理、可视化和保存地理Shapefile文件。 1....安装所需库 首先,我们需要安装 geopandas 和 shapely 库。可以通过以下命令来安装: pip install geopandas pip install shapely 2....通过下面代码,我们可以使用 geopandas 库中的 read_file 函数来读取 Shapefile 文件,并将其保存为一个 GeoDataFrame 对象: import geopandas...通过以下代码,我们可以创建一个图形,并使用 plot 函数将地理数据绘制在图形上: import matplotlib.pyplot as plt # 可视化地图 fig, ax = plt.subplots..." gdf.to_file(new_shp_file) 通过 to_file 函数,我们可以将 GeoDataFrame 对象保存为一个新的 Shapefile 文件。

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geopandas,用python画地图原来这么简单!

你可以把这两个数据结构当作地理空间数据的存储器,shapefile文件的pandas呈现。 Shapefile文件用于描述几何体对象:点,折线与多边形。...例如,Shapefile文件可以存储井、河流、湖泊等空间对象的几何位置。除了几何位置,shp文件也可以存储这些空间对象的属性,例如一条河流的名字,一个城市的温度等等。...而geopandas.datasets.get_path('naturalearth_lowres')则是从geopandas自带的数据集中获取世界地图的shapefile文件。...你也可以用read_file方法读取自己的shapefile文件 所以说,world变量被赋予了一个GeoDataFrame数据列,它长这样: 这个数据列中,不仅有几何列geometry,还有其它属性列...GeoDataFrame文件的输出形式 前面讲到将shapefile读成GeoDataFrame格式,反过来你也可以将GeoDataFrame格式输出为shapefile文件。

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Python地信专题 | 基于geopandas的空间数据分析-文件IO篇

作为基于geopandas的空间数据分析系列文章的第三篇,通过本文你将会学习到geopandas中的文件IO。...本文使用到的所有数据都可以在文章开头提及的Github仓库对应本文路径下找到: 图1 2.1.1 shapefile 作为非常常见的一种矢量文件格式,geopandasshapefile提供了很好的读取和写出支持...下面分为不同情况来介绍: 完整的shapefile 如图2,这是一个完整的shapefile: 图2 使用geopandas来读取这种形式的shapefile很简单: import geopandas...时,可以直接读取该文件夹: 图6 读取zip压缩包中的文件 geopandas通过传入特定语法格式的文件路径信息,以支持直接读取.zip格式压缩包中的shapefile文件,主要分为两种情况。...行过滤 行过滤的功能就比较简单,通过参数rows控制读入原数据的前若干行,可以用于在读取大型数据时先快速查看前几行以了解整个数据的格式: 图17 2.2 矢量文件的写出 在geopandas中使用to_file

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django合并多个queryset

那么我可以把他所能够操作的菜单通过关联表的id查出来,但是我前台的代码是只能解析一个queryset的,那么我便利用chain方法将他们变为一个queryset; 以下是我的代码: all_actor...menu_list = chain(all_actor) print(menu_list) return menu_list django queryset 合并...通过自带的方法: a1 = User.objects.filter(id__gt=8) a2 = User.objects.filter(id__lt=4) a3 = a1 | a2 注:这种方式合并的结构还是一个...queryset,相当于a3把a1和a2的条件合并了,推荐,因为可以用order_by等函数了 只能合并同种model对象的数据` 2, 用python的chain合并 from itertools..., 他可以作用于其他可迭代对象中他可以把不同model的对象合并,类似于与list相加

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(数据科学学习手札140)详解geopandas中基于pyogrio的矢量读写引擎

图片 2 详解geopandas中的pyogrio读写引擎 geopandas0.11版本之后新增的pyogrio引擎,基于geopandas团队开发的同名Python库,其基于OGR,而OGR则是著名的开源栅格空间数据转换框架...()的读取引擎,获取大幅度性能提升的同时也拥有了众多的新功能参数,其中比较实用的有: 2.1.1 利用columns参数指定需要读入的字段   开启pyogrio引擎后,我们可以通过设置参数columns...sql,可以帮助我们直接书写SQL语句对原数据进行提取(注意,其执行顺序先于上述其他过滤类参数):   但要注意的是,目前pyogrio引擎的sql参数,在读取诸如含有中文等unicode字符信息的shapefile...文件时,不能正常的解析内容,而针对GeoJSON、gpkg等其他格式矢量文件时则一切正常: GeoJSON文件正常 gpkg文件正常 shapefile文件乱码,亲测即使指定encoding也无效...  所以现阶段建议读取shapefile文件时,可以使用columns+where的组合方式代替sql以实现同样的效果。

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(数据科学学习手札80)用Python编写小工具下载OSM路网数据

用户通过输入指定城市的名称并检索,等待数据资源加载完成之后就可以在网页中看到渲染好的城市路网,以重庆为例: ?   ...了解了上述步骤之后,我们利用requests、geopandas等库仅用不到100行代码就可以参考上述过程,提取所需的shapefile或GeoJSON文件保存到本地,具体的代码部分本文不做详细说明,我将这部分功能封装到文章开头对应...2.2 使用方式   按照上文所述的地址下载对应脚本之后(请提前安装完成requests、geopandas、pandas以及tqdm这几个三方库),记住其所在路径,接着在其他脚本开头导入模块部分添加:...如果你想要下载保存JSON格式的数据,换成downloader.download_geojson(path)即可,而如果你想要批量下载多个地区的数据,结合for循环即可,如下例: # 多个地区路网下载...(path='保存路径')   等待一段时间后,我们area_list里多个不同级别行政区的路网数据便下载完成: ?

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用Python编写小工具下载OSM路网数据

以重庆为例: 图3 通过对该网站进行抓包和源码分析,我弄明白了其工作流程大致如下: Step1: 根据用户输入的城市名称,利用OSM官方的API进行模糊匹配,获取可能的对象列表: 图4 Step2:...再通过网站自带的API获取对应的.pbf格式数据,或overpass的API获取JSON格式的矢量数据。...图5 Step3: 渲染路网: 图6 了解了上述步骤之后,我们利用requests、geopandas等库仅用不到100行代码就可以参考上述过程,提取所需的shapefile或GeoJSON文件保存到本地...2.2 使用方式 提示:请提前安装完成requests、geopandas、pandas以及tqdm这几个三方库。...而如果你想要批量下载多个地区的数据,结合for循环即可,如下例: # 多个地区路网下载 area_list = ['北京市', '重庆市江北区', 'Tokyo', 'Boston', '台湾省'] for

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(数据科学学习手札89)geopandas&geoplot近期重要更新

2 geopandas&geoplot近期重要更新内容 2.1 geopandas近期重要更新 2.1.1 新增高性能文件格式   从geopandas0.8.0版本开始,在矢量文件读写方面,新增了.feather...shapely.geometry import Point import pandas as pd from tqdm.notebook import tqdm # 创建虚拟表,其中字段名为了导出shapefile...读写shapefile、feather以及parquet三种数据格式的耗时及文件占硬盘空间大小: ?...图3   具体的性能比较结果如下,可以看到与原始的shapefile相比,feather与parquet取得了非常卓越的性能提升,且parquet的文件体积非常小: 类型 写出耗时 读入耗时 写出文件大小...shapefile 325秒 96秒 619MB feather 50秒 25.7秒 128MB parquet 52.4秒 26秒 81.2MB   所以当你要存储的矢量数据规模较大时,可以尝试使用

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geopandas&geoplot近期重要更新

本文示例代码及数据已上传至我的Github仓库https://github.com/CNFeffery/DataScienceStudyNotes ❞ 1 简介 最近一段时间(本文写作于2020-07-10)geopandas...2 geopandas&geoplot近期重要更新内容 2.1 geopandas近期重要更新 2.1.1 新增高性能文件格式 从geopandas0.8.0版本开始,在矢量文件读写方面,新增了.feather...shapely.geometry import Point import pandas as pd from tqdm.notebook import tqdm # 创建虚拟表,其中字段名为了导出shapefile...读写shapefile、feather以及parquet三种数据格式的耗时及文件占硬盘空间大小: 图2 图3 具体的性能比较结果如下,可以看到与原始的shapefile相比,feather与parquet...取得了非常卓越的性能提升,且parquet的文件体积非常小: 类型 写出耗时 读入耗时 写出文件大小 shapefile 325秒 96秒 619MB feather 50秒 25.7秒 128MB parquet

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git rebase 合并多个提交

rebase可以修改记录,我总是做小更改就提交,仓库有好多看起来很乱的 git没有可以把最后一个提交提交到服务器的能力,可以用rebase来做到把多个提交合并为一个。...下面的代码可以让大家新建一个分支并且到这个分支来做把多个提交合并为一个 git branch 更改 git checkout 更改 提交更改 git commit 更改 然后到主分支看最新提交 git...checkout master git log 记下那提交的 id 然后 把更改合并master分支 git merge 更改的id 用rebase把更改多个合为最后一个 git rebase -i...记下的提交 在打开的文件的pick除了第一个pick,改为s 修改方法:按下 i 修改 修改完,按esc,然后输入:wq保存 然后git会让你写修改commit,按i修改,#开头的是注释,commit是合并多个的...假如我有三个提交 commit : A commit : B commit : C 合并后我就可以写commit : ABC 写完按esc,:wq保存 提交就是最后一个保存的 commit 这样可以多个提交合并为一个

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多个表达矩阵文件合并

ENSG00000237330 RNF223 5 ENSG00000131591 C1orf159 0 ENSG00000162571 TTLL10 8 现在就需要批量依次读取这些文件,然后合并成为表达矩阵...首先参考群主的WGCNA教程的合并方法 当时群主的代码是linux的shell脚本+R里面的dcast函数,如果大家感兴趣群主的WGCNA教程,见: 一文看懂WGCNA 分析(2019更新版) 通过WGCNA...WGCNA分析的文章(代码版) 重复一篇WGCNA分析的文章(解读版)(逆向收费读文献2019-19) 关键问题答疑:WGCNA的输入矩阵到底是什么格式 我仔细看了看代码其实,就是首先在linux是把多个文件合并成为...我猜想应该是那个WGCNA教程已经是四年前的啦,当时群主的主要编程语言并不是R,所以这样的文本合并需求,会采取LINUX+R的方式搞定!...第3种方法你来写吧 反正数据集就是GSE84073,进入就看到了可以下载的txt文件,自行摸索合并

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git rebase 合并多个提交

rebase可以修改记录,我总是做小更改就提交,仓库有好多看起来很乱的 git没有可以把最后一个提交提交到服务器的能力,可以用rebase来做到把多个提交合并为一个。...下面的代码可以让大家新建一个分支并且到这个分支来做把多个提交合并为一个 git branch 更改 git checkout 更改 提交更改 git commit 更改 然后到主分支看最新提交 git...checkout master git log 记下那提交的 id 然后 把更改合并master分支 git merge 更改的id 用rebase把更改多个合为最后一个 git rebase -i 记下的提交...在打开的文件的pick除了第一个pick,改为s 修改方法:按下 i 修改 修改完,按esc,然后输入:wq保存 然后git会让你写修改commit,按i修改,#开头的是注释,commit是合并多个的...假如我有三个提交 commit : A commit : B commit : C 合并后我就可以写commit : ABC 写完按esc,:wq保存 提交就是最后一个保存的 commit 这样可以多个提交合并为一个

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