遇到这个问题是在使用ggtree可视化展示进化树的时候，我想给进化树的枝分组映射颜色，对应的推文是跟着Nature Genetics学画图：R语言ggtree给进化树的枝分组映射颜色 第一步是准备进化树文件...image.png 加载需要用到的R包 library(treeio) library(ggtree) library(ggplot2) 读取树文件和分组信息 tree<-read.tree("practice.tree...image.png 这个结果右侧的图例最下方式有一个NA的，如果不想要那个NA加一行代码 scale_color_discrete(na.translate=FALSE) 参考链接是 https://stackoverflow.com...geom_tiplab(offset = 0.1)+ scale_color_manual(values=colors, na.translate=FALSE) 将图例的线更改的粗一点...image.png 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 需要示例数据和代码 点赞 点击在看 然后在后台留言 20210605 就可以了 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python
image.png 修改图例中的分类名字 basic+labs( colour = "name1", shape = "name2" ) ?...image.png 删除图例中的一类 basic + guides(shape=FALSE) ?...一些自定义图例的测试 # 图例被红框包裹 basic + theme( legend.box.background = element_rect(color="red", size=2),...#图例中的字体设置 basic + theme(legend.text = element_text(size = 8, colour = "red")) ?...# 设置图例中的标题 basic + theme(legend.title = element_text(face = "bold")) ?
在癌症研究中，典型的研究问题如下： 某些临床特征对患者的生存有何影响？ 个人三年存活的概率是多少？ 各组患者的生存率有差异吗？...R生存分析 安装并加载所需的R包 我们将使用两个R包： 生存计算生存分析 survminer的总结和可视化生存分析结果 安装软件包 install.packages(c("survival","survminer...legend.labs更改图例标签。 ? 每组的中位生存时间表示生存概率S（t）为0.5的时间。 使用参数xlim可以缩短生存曲线，如下所示： ?...复杂的生存曲线 在本节中，我们将使用多个因素的组合计算生存曲线。...在这篇文章中，我们演示了如何使用两个R软件包的组合来执行和可视化生存分析：生存（用于分析）和生存者（用于可视化）。
数据集描述 医生数据集doctor 医生编号是唯一的，名称会存在重复 医疗项目数据projects 病例编号是唯一的，注意这个日期编号不是真正的日期。...日期数据date 这里的日期编号对应医疗项目数据中的日期编号 科室数据集Department 维度表 采购成本事实表Purchase costs 事实表，缺乏采购成本唯一编号 分析思路...设置折线图 设置折现簇型图 创建科室季度开支报表 效果 构建矩阵 >选择样式预设 创建 年份 和 季度 切片器 费用金额 饼图 用物品类中做图例 构建科室和费用金额的树状图...完成的效果 常见病分析 创建病症的条形分布 创建地区患者登记分布情况 患者登记 地区分布条形图 病症的前10个 完成效果 科室分析 效果图 病症的计数和...利润综合 和 利润率平均值 按科室 利润总和 和 利润率平均值 按病症 利润率 的平均值 和利润的综合 按 患者满意度
R语言plotrix包，可以帮助我们实现双坐标轴图形的绘制。...以7名患者的DNA测序的质控信息为例，绘制靶向捕获测序深度和重复率的关系： #load plotrix library(plotrix) #Data preparation ID=1:7 PID=paste...', xlab = '患者编号', ylab = '测序深度x（绝对数值）', rylab = '重复率（0-1之间的小数）', type = c('bar','l'), xtickpos=as.numeric...：设置左右坐标轴的颜色，这样可以起到图例的作用 xlab：设置横坐标轴标签 lytickpos：设置左坐标轴刻度标签的位置 ylab：设置左坐标轴标签 ylab.at：设置左坐标轴标签位置 rytickpos...xticklab：设置横坐标轴刻度标签 halfwidth：设置用户给定条形图宽度的一半 axislab.cex：设置坐标轴标签和刻度标签的大小 do.first：通过该参数可以往图形中添加背景色或网格
本研究分析了112名接受抗PD-1免疫疗法患者的口腔与肠道菌群，发现那些对免疫疗法“有反应”的患者，其菌群的组成和多样性均和“无反应”的患者有显著不同。...列表示按治疗后反应分组分为R分组和NR分组的患者，并将它们按照多样性进行了排序；行表示细菌OTU，根据其相对于R与NR的富集和/或消减，分为三组，然后按每组内的平均丰度进行排序。...集合1（在R中富集），集合2（未富集）和集合3（在NR中富集）。（B）在目水平的（A）中描述的每个集合内的OTU的分类组成。...图A的主图区，展示上方对应样品中的OTU相对丰度值，按从小到大对应的颜色梯度为红、黄、绿，即越红越高，越绿越低。 对应的图例在下方。...总结 图左使用热图展示不同组中特异OTU对应的功能是否存在，将枯燥的OTU编号与功能相连接，提高了结果的可读性。
LVI的存在与膀胱癌患者的生存率降低、复发风险增加和疾病进展风险升高密切相关。在膀胱癌的风险分层、预后评估和治疗决策中，LVI的识别和评估具有重要作用。...pwd=y4eh ，基本上大家只需要读入表达量矩阵文件到r里面就可以使用Seurat包做全部的流程。...因为文章主要关注点是成纤维细胞亚群的细分，如下所示，其实很明显的可以看到这个编号1的成纤维亚群是可以细分的，虽然说编号1的成纤维亚群确实是在LVI阳性组里面要高于阴性组的，但是如果它细分之后可能会规律不一样哦...我们可以对作者提供的表达量矩阵，做同样的降维聚类分群，如下所示： 做同样的降维聚类分群 可以看到的是作者的编号1成纤维亚群被我们拆分成为了1和2两个亚群，作者的编号2和3亚群在我这里直接就消失了，同时消失的还有作者的编号为...这样的话就很容易破坏整体的细胞比例对比的统计学显著性，所以作者机智地选择了去卷积后看这些单细胞亚群在tcga队列里面的推测的比例的差异情况： 我仔细看了看图例，发现其并不是去卷积，是 (P) The relationship
针对这个问题，推荐使用Seaborn模块中的distplot函数 #取出男性年龄 Age_Male=df.年龄[df.性别=="男性"] #取出女性年龄 Age_Female=df.年龄[df.性别==...添加标题 plt.title("不同性别患者年龄分布直方图") #显示图例 plt.legend() #显示图形 plt.show() ?...":"--"},norm_hist=True,label="女性") #添加标题 plt.title("不同性别患者年龄核密度图") #显示图例 plt.legend() #显示图形 plt.show...15）、label：设置直方图的标签，可通过legend展示图例。 16）、stacked：当有多个数据时，是否需要将直方图呈堆叠摆放，默认水平摆放。...6）、fit：指定一个随机分布对象，需调用scipy模块中随机分布函数，用于绘制随机分布概率密度曲线。 7）、hist_kws：以字典形式传递直方图的其他修饰属性，如填充色、边框色、宽度等。
选择 显示图例(SAP GUI) 或选择更多… à看板à显示图例 (SAPNetWeaver Business Client)来显示看板状态的解释说明。 4....双击空看板可显示补货信息（例如运输请求编号）。选择按钮以显示补货，并在项目清单中向右滚动。在列TO 编号 中，可查看生成的 TO编号。记下此编号___________________。 ?...如果您查看图例（选择按钮图例），将显示此看板的收货已单独完成。 如果您选择控制周期并选择 (NWBC:更多…®) 转到®库存总览，将看到物料 R233-3 在生产存储位置的数量已增加。...在列 TO 编号 中，可查看生成的 TO 的编号。记下此编号___________________。 通过将可用看板设置为 空，将直接创建转储请求和运输单。...6、LT15可选：警报 – 删除运输单 在此活动中，将删除在之前的步骤中自动生成的运输单。 已创建物料 R233-3的看板控制周期，且对于物料R233-3，在存储位置 1070 有足够的可用库存。
plt.ylim(-1.5, 1.5) # 设置轴标签 plt.xlabel('X axis') plt.ylabel('Y axis') # 设置坐标轴标签 # 坐标轴分成 0-10 公差为2 五组，每组对应的标签为数组各元素...# matplotlib中grid()函数用于设置图形中的网格线。...plt.grid(True, ls=':', color='r', alpha=0.5) # 设置标题 plt.title(u"Functional Programming") # 添加图例 (图例就是解释...线条信息 在本例程中 图例就是 --sin(x) # plt.legend(handles=[ln2, ln1], labels=['Android基础', 'Java基础'], # loc...对象式绘图例程 我们先了解下图像中对象隶属关系。在matplotlib中，整个图像为一个Figure对象，所有元素依附于Figure对象中。在Figure对象中可以包含一个或者多个Axes对象。
用法 ggplot2数据可视化包，为R语言中的月亮图提供支持。它们的绘制方式与ggplot2中的点最为相似：它们的位置由一个x和一个y坐标定义，它们的大小与坐标系无关，所以它们总是保持圆形。...图例关键字 三个关键字，用于不同类型的图例：默认值，绘制一个右边的悬臂月（见上文）。 left从左边画出一个新月，与长臂月互补，这对组合图例很有用。...key画的是一个圆。它类似于 "点 "的形状，但计算方式略有不同，所以如果你想让图例月亮的尺寸和月亮的尺寸相匹配，就更合适。...饼图地图在人口遗传学中很流行，所以让我们看一下该领域的一个例子。数据包含果蝇种群中Adh基因的两个变体的频率。这些种群中有许多都很接近，所以我们必须处理过度绘制的问题，我们在下面手动处理。...如果我们想在图例中明确标注等位基因，那么我们需要将它们映射到一个组中，这就要求我们将数据重新排列成一个 "较长"（"整齐"）的格式。
MPAndroidChart_雷达图的那些事及自定义标签颜色 昨天在比赛中遇到了MP的并列柱状图，看网上对这方面记录并不是很多，所以今天就做一个教程吧。...right.setAxisMaximum(5f); //设置图表编译，避免x轴标签显示不全 chart.setExtraBottomOffset(10); //禁用图例...float barspace=0.05f; //每组之间的空间 float groupspcae=0.3f; //柱状图的宽度...right.setAxisMaximum(5f); //设置图表编译，避免x轴标签显示不全 chart.setExtraBottomOffset(10); //禁用图例...float barspace = 0.05f; //每组之间的空间 float groupspcae = 0.3f; //柱状图的宽度
需要说明的是，在字符串r”text\text2 1.2 案例1–图例的展示样式的调整 不仅图例的显示位置可以改变，图例的展示样式也可以进行调整，比如图例的外边框、图例中的文本标签的排列位置和图例的投影效果等方面..."plt.legend(wedges, elements)"，就可以将饼片外部的文本标签放在图例中，而各饼片的数值仍在饼片内部。...函数legend()的参数wedges和elements分别表示饼片实例列表和文本标签列表，而且这两个参数要一起配合才能将外部文本标签放在图例中。...，将源数据按照行进行分组，每组数据放在列表里存储，所有组数据再放在列表里存储 cellLoc: 表格中数据的对齐方式，可左对齐、居中和右对齐 colWidths: 表格中每列的宽度 colLabels:...想要举一反三的同学可以试试将前面讲的饼图外部文本添加到图例中，让图形更加直观。
最近研究描述了两类 TNBC 患者对 NAC 的反应。...来自单细胞分析的数据在TNBC 患者（360 名患者）中得到进一步验证，从而确定了预测 TNBC 无复发生存期（RFS）的三基因特征。...数据显示为热图，左侧图例中显示了丰富的细胞群，顶部显示了相应的单细胞簇。色标显示差异基因表达 (log2)。下面的图例表示细胞起源 (B) UMAP 降维分析揭示了 NAC 前后的 13 个细胞簇。...3.创新路径分析（IPA）显示：响应组和非响应组存在功能类别、途径方面存在显著差异 为了更好地了解响应组和非响应组中的生物过程，作者对治疗响应组或无响应组中上调/下调的基因置于IPA中进行富集分析，揭示了每组中几种典型途径的激活...来自单细胞分析的数据在TNBC 患者（360 名患者）中得到进一步验证，从而确定了预测 TNBC 无复发生存期（RFS）的三基因特征。
本文说明了如何使用该包中的函数来比较两组限制平均生存时间。 2 样本数据 在这个文章中，我们使用了梅奥诊所进行的原发性胆汁性肝硬化（pbc）研究中的部分数据，该研究包括在R语言的生存包中。...生存包中的原始数据由418名患者的数据组成，其中包括参加了随机临床试验的患者和没有参加的患者。...---- 点击标题查阅往期内容 R语言中的生存分析Survival analysis晚期肺癌患者4例 左右滑动查看更多 01 02 03 04 1. RMST的差异 2....请注意，τ需要小于两组中每组的最大观察时间的最小值（我们称其为最大τ）。...rmst2函数返回每组的RMST和RMTL以及上述组间对比测量的结果。 > print(obj) 在本例中，RMST的差异（输出中 "组间对比 "部分的第一行）为-0.137年。
当然还有其他种类，关于随机分组问题，我推荐大家看医咖会的这篇文章：10篇文章全面了解随机分组，赶快收藏！[1] 本文主要介绍如何使用R语言完成随机分组。...假如需要收100个受试者，随机分为试验组和对照组，那么可以根据患者入组顺序，每人给一个编号，然后从随机数字表任意的某一行某一列开始，抽取随机数字，100个受试者有100个随机数，把这100个随机数按照从小到大排序...上述方法通过SPSS可以实现，大家可以参考这篇文章：SPSS实现简单随机分组[2] 根据这个思路，R语言也是可以实现的。...R语言在临床研究设计中的使用非常成熟，在cran task views中有两个专题都是关于研究设计的，大家感兴趣的可以自己去看一看哦。...简单随机 比如30个人，按照完全随机化的方法分为2组，一组试验组，一组对照组，每组15人。
echarts默认的图例只显示数据的name，不会显示value，如下饼图的图例 image.png 我希望把每个图例对应的value显示出来，如下 image.png echarts中有个配置参数可以实现这个功能...return name + ": " + tarValue; } }, 注释： 1、let data = option.series[0].data; 取series中的数据...2、循环遍历 data ，因为data中每个元素都是一个键值对，所以用每组键值对的name来和图例name比较，如果相等，则获取到对应的值 3、最后把图例name和value拼接返回出去 image.png...} return name + ": " + tarValue; } }, 因为折线图我有2组数据，所以需要获取2组数据中的值并赋给对应图例...，详情见代码中的注释 image.png
2）有一队青蛙从小到大编号：1，2，…，n。 3）初始时：青蛙只能趴在左岸的石头 L 上，按编号一个落一个，小的落在大的上面-----不允许大的在小的上面。 4）在小溪中有S个石柱、有y片荷叶。...5）规定：溪中的每个石柱上如果有多只青蛙也是大在下、小在上，每个荷叶只允许一只青蛙落脚。 6）对于右岸的石柱R，与左岸的石柱L一样允许多个青蛙落脚，但须一个落一个，小的在上，大的在下。...7）当青蛙从左岸的L上跳走后就不允许再跳回来；同样，从左岸L上跳至右岸R，或从溪中荷叶、溪中石柱跳至右岸R上的青蛙也不允许再离开。...(1 <= t <= 15) 每组占一行，每行包含2个数s(s是小溪中的石柱数目)、y(y是小溪中的荷叶数目)。...（0 <= s <= 10 , 0 <= y <= 10) Output 对每组输入，输出有一行，输出最多能跳过的青蛙数目。
2.4 熵计算 我们使用样本熵来表示每个受试者的微状态序列的复杂性。样本熵取决于数据、模板长度m和容差r。样本熵始终为正，样本熵的值越低，表示序列的可预测性越强。...用数字1到4标记微状态，将r设置为0.1，将m值从1调整到10。 2.5 统计分析 对于每个记录，创建了1000个微状态序列标签的随机排列，使得相同的微状态标签不能相邻。...3.结果 3.1 对照受试者和早期精神病患者的微状态图相似，但分布不同 来自对照组和患者组的静息状态EEG记录每组产生了4个EEG微状态图(图1A)。...对于患者，我们发现真实序列中的样本熵与排列序列中的样本熵在统计上从来没有显著不同。...我们用另一组微状态对每组进行了拟合后，再次发现对照组受试者中，熵在m=3后减少，并且没有从患者的排列中分离出来(图2B)。我们在患者和对照组的任何模式长度上都没有发现序列长度和熵之间的相关性。
现有如下关系： 患者（患者编号，患者姓名，性别，出生日期，所在单位） 医疗（患者编号，医生编号，医生姓名，诊断日期，诊断结果） 其中，医疗关系中的外码是（ ）。...A、患者编号 B、患者姓名 C、患者编号和患者姓名 D、医生编号和患者编号 外码就是跟另外一个表关联的字段，这个字段是另外一个表的主码 关系代数运算是以（ ）为基础的运算 。...现有如下关系：患者（患者编号，患者姓名，性别，出生日期，所在单位）医疗（患者编号，医生编号，医生姓名，诊断日期，诊断结果）其中，医疗关系中的外码是（ A ）。 A. 患者编号 B....患者姓名 C. 患者编号和患者姓名 D. 医生编号和患者编号 5. 关系代数运算是以（ C ）为基础的运算 。 A. 关系运算 B. 谓词演算 C....在一个关系 R 中，若每个数据项都是不可再分割的，那么 R 一定属于 __________ 。 第一范式 (1NF) 3.
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