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    10X Cell Ranger ATAC 算法概述

    执行此步骤是为了修复条形码(barcode,细胞的标识)中偶尔出现的测序错误,从而使片段与原始条形码相关联,从而提高数据质量。16bp条形码序列是从“I2”索引读取得到的。每个条形码序列都根据正确的条形码序列的“白名单”进行检查,并计算每个白名单条形码的频率。我们试图纠正不在白名单上的条形码,方法是找出所有白名单上的条形码,它们与观察到的序列之间的2个差异(汉明距离(Hamming distance)<= 2),并根据reads数据中条形码的丰度和不正确碱基的质量值对它们进行评分。如果在此模型中,未出现在白名单中的观察到的条形码有90%的概率是真实的条形码,则将其更正为白名单条形码。

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    如何隐藏Code39码的星号

    CODE 39是 Intermec公司在1975年研制成功的。包括数字、字母和一些符号在内,条形码共包括43个字符。由于可以处理字母,CODE 39在工业领域必不可少,用于汽车、电子等工厂自动化行业。Code 39码支持26个英文大写字母(A-Z),十个数字(0-9),以及符号(-、.、_(空)、*、$、/、+、%)。可以对任意长度的数据进行编码,Code 39码用于物流跟踪、生产线流程等方面,是比较常用的条形码类型之一。39码的起始码和终止码为固定的星号“*”,即39码前后各有一个星号“*”来标识条形码的开始和结束。因为有些用户制作条码时,不需要显示头尾的星号,所以下面我们就介绍如何隐藏这个起始码和终止码。

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