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kraken注释物种,eggnog注释基因一条龙服务

cd /mnt/10t/database/ kraken2-build –download-library bacteria –db krakenbac –use-ftp kraken2-build –download-library archaea –db krakenarch –use-ftp mkdir /mnt/10t/mzy/24samples/tax cd /mnt/10t/mzy/24samples/tax for i in 123 126 134 131 125 140 132 149 148 122 143 133 145 152 118 147 121 151 135 136 150 146 141 137 do kraken2 –db /mnt/10t/database/krakenbac –report i.DNAbacreport –use-mpa-style –report-zero-counts –threads 80 –gzip-compressed –paired /mnt/10t/mzy/72sample/DNAclip/i.clip.1.fq.gz /mnt/10t/mzy/72sample/DNAclip/i.clip.2.fq.gz > i.DNA.sam kraken2 –db /mnt/10t/database/krakenarch –report i.DNAmetreport –use-mpa-style –report-zero-counts –threads 80 –gzip-compressed –paired /mnt/10t/mzy/72sample/DNAclip/i.clip.1.fq.gz /mnt/10t/mzy/72sample/DNAclip/i.clip.2.fq.gz > i.DNA.sam && rm -f

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    谈谈自己的大数据迁移经历背景问题规模数据迁移要考虑的问题最后

    今天群里有人问起,刚好做过相关的工作,特此分享一下当时的工作内容和感受。 背景 大概说一下这个事情的背景。在2013年大概4月份,人人网打算做一次大规模的数据迁移——评论服务。所谓评论就是指各种资源下的“评论文字”,比如照片的评论、Blog的评论、分享的评论、音乐的评论…… 早期人人网的各个开发小组各自为政,每个团队几乎都实现了一个评论服务,有各自不同的功能和数据结构,但是大体上还算相似。当时,业务部门希望能够集中这些数据做一些统一的管理,比如权限管理(控制谁能看什么评论)、比如数据内容推荐(基于用户评论人

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    关于神舟电脑的体验

    早年买过2台神舟优雅笔记本,设计确实舒服,但是不结实,2台都是从不到50公分高的床上掉到地板上磕坏了屏幕转轴,并且电源适配器质量也一般,没用多久就买新的电源适配器了,电池也不怎么耐用。后来工资涨了一些后,买了人生第1台i7 CPU的神舟战神,做工一流,可电池不行,用了没多久就不得不换新。再后来公司配ThinkPad了,就一直用着,不到3年换了MacBook Pro,总觉得不爽,因为硬盘只有200多G,除过系统占用,剩下没多少空间,没几个月就满了,非常烦,于是自己买了神舟G10-CU7PF(i7-10750H六核处理器,2.6GHz主频,睿频5.0GHz),升配到了64G内存(频率3200)、1T M2的海康SSD系统盘、2T M2的海康SSD数据盘、RTX2070S 8G显卡,17.1寸大屏,这种设备用来办公绰绰有余甚至有点浪费。

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