首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

ASreml/ASreml-R中缺失响应值的预测

ASreml/ASreml-R是一种统计分析软件,用于处理具有缺失响应值的数据。它提供了一种强大的方法来预测缺失响应值,并进行统计分析。

ASreml/ASreml-R的主要特点和优势包括:

  1. 高效的缺失值处理:ASreml/ASreml-R能够处理具有缺失响应值的数据,通过使用最大似然估计和随机效应模型,可以准确地预测缺失值,从而避免数据分析中的偏差。
  2. 统计分析功能:ASreml/ASreml-R提供了丰富的统计分析功能,包括线性混合模型、广义线性混合模型、非线性混合模型等。它可以进行参数估计、假设检验、模型比较等统计分析任务。
  3. 灵活的数据建模:ASreml/ASreml-R支持灵活的数据建模,可以处理多层次数据、重复测量数据、空间相关数据等。它提供了丰富的随机效应模型和协方差结构选项,可以适应各种复杂的数据结构。
  4. 广泛的应用场景:ASreml/ASreml-R广泛应用于农业、生物医学、环境科学、遗传学等领域的研究和实践中。它可以用于遗传参数估计、品种评价、环境效应分析等任务。

在腾讯云的产品中,可以使用腾讯云提供的云服务器(CVM)来运行ASreml/ASreml-R软件。腾讯云云服务器提供了高性能的计算资源和稳定可靠的网络环境,可以满足ASreml/ASreml-R的计算需求。您可以通过以下链接了解腾讯云云服务器的详细信息:腾讯云云服务器

此外,腾讯云还提供了其他与云计算相关的产品和服务,如云数据库(TencentDB)、云存储(COS)、人工智能服务(AI Lab)等,这些产品可以与ASreml/ASreml-R结合使用,提供更全面的解决方案。您可以通过腾讯云官方网站了解更多相关产品的详细信息。

页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

GLMM:广义线性混合模型(遗传参数评估)

常用软件 Rlme4 SASGLIMMIX ASReml RASReml-R ❝本研究主要目的是对中国四倍体中国四倍体亲本Psa后代测试数据进行深入分析,并对Psa易感附加遗传、环境方差成分和狭义遗传力进行可靠估计...ASReml-R是RASReml实现(Butler等人)。2009年)。虽然ASReml软件能够适应GLMMs,但ASReml-RGLMMs拟合显得有限。...有些杂交是未经试验或不成功:雌性围棋,除了与雄性32和33杂交外;雄性32,除了与雌性围棋杂交外;以及雌性顾对雄性33。我们只为缺失父本提供一个平衡gla×33杂交数据集。...在最初观察,我们记录了葡萄藤主要症状:叶斑存在/缺失、藤茎末端短暂枯萎、甘蔗枯萎、溃疡和渗出。...这个家族对Psa抗性预测随机效应最大,这说明了非加性基因对家族绩效影响。基于双亲平均eBV值和家庭随机效应预测,该家系Pr(Psa)估计值为0.31。 ? ❞ 12.

2K30

ASReml文献解析|如何分析猪繁殖性状遗传参数估计

利用ASReml-R软件对11个性状进行分析,包括:出生猪总数(TNB);活产仔猪数量(NBA);健康出生仔猪数量(NBH);出生仔猪数弱(NBW);新生死产仔猪数量(NS);高龄死产仔猪数量(OS)...关键词 11个繁殖性状 4个固定因子 asreml-R 结果 在11个生殖相关性状,妊娠期属于中等遗传力性状(0.251~0.430),其余性状遗传力较低,在0.005~0.159之间。...使用“ASReml-R”(8)R软件包和vpredict函数对11个生殖性状成分方差进行了遗传力计算。该软件包设计用于拟合线性混合模型,特别是用于动植物育种,以使用有限最大似然估计遗传参数。...关键词 数据质控,小于3或者大于30删除 系谱清洗 ASReml-R进行分析 使用vpredict函数计算遗传力 分析模型—— 单性状模型和多性状模型 动物模型:一个随机因子 遗传力计算 遗传相关和表型计算...在重复性模型,模型2与模型1非常相似。这两个模型之间比较旨在更准确地计算遗传力(即,通过在模型包括或排除永久环境影响之间进行选择)。

20710
  • 我为什么不用ANOVA?

    ANOVA有三大要求,使用前要逐一检验: 数据平衡(没有缺失值); 响应变量服从正态分布; 方差齐次(处理内不同水平方差要相等; 编者著, 也有表示为: 独立性, 齐次性, 正态性....独立性是指不同处理之间是独立. 动植物育种, 不独立可以定义关系, 比如系谱构成A矩阵, 比如基因组构成G矩阵, 这样可以解决不独立问题....一旦不满足条件需要: 填补缺失值; 转换以服从正态; 方差不齐怎么弄(就这么着吧)。...举例,下图中, 前3列是一个处理3个水平,单独时都服从正态分布,但放在一起(第4列)就不是正态分布,方差不齐很常见,但一般线性模型, 似乎没有合适方法来解决。 ?...SAS ASREML-R R: nlme R: lme4 如发现问题欢迎指正!

    1.6K21

    植物碰撞动物火花--数据分析进阶

    混合线性模型公式和假定 可以指定多个随机因子以及他们分布,可以指定残差矩阵结构,非常灵活。现在用比较广泛软件是ASReml,它有对应R版:ASReml-R,速度非常快。 5....G矩阵计算方法 28. 草莓试验站介绍 29. 草莓实施GS目标 草莓不同性状如何选择GS模型 使用交叉验证检验预测效果 将GS流程整合到育种流程 评估GS效果 30....多年份GS模型 固定因子增加了年份或者地点 随机因子,考虑是年份与基因互作 残差,考虑是空间分析 45. 多年份GS预测效果更好 多年份的话,应该只能使用GBLUP方法。 46....52 分子矩阵缺失数据怎么处理? 53 A矩阵怎么和G矩阵结合? 一步法! 54 G矩阵不正定怎么办? 55 GS面临哪些挑战? 多倍体如何构建G矩阵?...LMM提高育种数据分析效率 分子数据应用范围广泛(动物,植物,人类等等) 现在软件可以非常灵活,快速,准确计算和评估这些数据 57 ASreml???

    44720

    r语言 固定效应模型_r语言coef函数

    噪声是我们模型没有考虑随机因素。而固定效应是那些可预测因素,而且能完整划分总体。例如模型性别变量,我们清楚只有两种性别,而且理解这种变量变化对结果影响。...R线性混合模型介绍(翻译博客)(来自科学网邓飞博客)原来来自:http://www.r-bloggers.com/linear-mixed-models-in-r/ 1、nlme lme4 Asreml...ASReml-R ASReml-RASRemlR版本,它优点:1、可以处理复杂随机因子结构2、可以处理多元数据3、可以处理系谱数据4、可以处理大批量数据 主要缺点:1、它是收费,当然它对于不发达国家科研机构是免费...如果认为随机效应只影响模型截距,那么固定效应回归模型可以用下面的公式 5、ASReml-R包 它功能很强大,用在这里有些杀鸡用牛刀感觉。...代码如下: library(asreml) m1.asreml = asreml(yield ~ variety*nitrogen, random = ~ block

    5.6K30

    R语言︱线性混合模型理论与案例探究(固定效应&随机效应)

    噪声是我们模型没有考虑随机因素。而固定效应是那些可预测因素,而且能完整划分总体。例如模型性别变量,我们清楚只有两种性别,而且理解这种变量变化对结果影响。...R线性混合模型介绍(翻译博客)(来自科学网邓飞博客)原来来自:http://www.r-bloggers.com/linear-mixed-models-in-r/ 1、nlme lme4 Asreml...ASReml-R ASReml-RASRemlR版本,它优点:1、可以处理复杂随机因子结构2、可以处理多元数据3、可以处理系谱数据4、可以处理大批量数据 主要缺点:1、它是收费,当然它对于不发达国家科研机构是免费...如果认为随机效应只影响模型截距,那么固定效应回归模型可以用下面的公式 5、ASReml-R包 它功能很强大,用在这里有些杀鸡用牛刀感觉。...代码如下: library(asreml) m1.asreml = asreml(yield ~ variety*nitrogen, random = ~ block

    19.8K76

    全基因组选择介绍及实践-1

    使用包是Rsommer和asreml,其实强健还是成熟软件,比如DMU,BLUPF90,PIBLUP,ASreml等,但sommer作为基本功能演示,非常合适。...进行检测 不同群体变化较大 标记可解释遗传变异百分比较低 在动物育种应用非常有限 全基因组选择 优点: 无需进行主效基因或者QTL检测 不依赖于表型信息(候选群) 能够捕获基因组全部变异 对于低遗传力...操作代码 library(asreml) diag(G) = diag(G)+0.01 # 矩阵奇异, 对角线+0.01防止奇异 ginv = write_relation_matrix(G,type...="ginv") # 转化为三元组形式 attr(ginv,"rowNames") = rownames(G) # 对ginv进行rowNames设置 time_asreml = system.time...asreml-r版慢一点,个人体会,asreml-w更快一点。

    1.9K20

    从数量遗传学角度介绍为何结婚要拿彩礼钱

    母亲对后代影响大,不只是从遗传角度(生),还有环境作用(育),还有遗传和环境互作(生育)。...+ 母亲遗传物质 + 母体遗传效应(比如线粒体遗传)+ 母体永久环境效应(比如育儿环境)+ 环境(误差) 上面公式,母亲提供了三个: 母亲遗传物质 母体遗传效应(比如线粒体遗传) 母体环境效应(比如育儿环境...= T) lrt.asreml(m1,m2.1,boundary = T) 可以看到,母体永久环境效应和协方差都不显著,模型可以不加。...我们不是算命大仙,我们是用科学方法评估和预测。 9. 参考文献 ❝Lawrence R....Specification, 2015 D G Butler, ASReml-R Reference Manual Version, 2018❞ 大家好,我是邓飞,一个持续分享农业数据分析师

    37720

    R语言实现混合模型

    普通线性回归只包含两项影响因素,即固定效应(fixed-effect)和噪声(noise)。噪声是我们模型没有考虑随机因素。而固定效应是那些可预测因素,而且能完整划分总体。...例如模型性别变量,我们清楚只有两种性别,而且理解这种变量变化对结果影响。 那么为什么需要 Mixed-effect Model?因为有些现实复杂数据是普通线性回归是处理不了。...你可能会把人员(组间随机效应)看作是一种分类变量放到普通线性回归模型,但这样作是得不偿失。有可能这个factorlevel很多,可能会用去很多自由度。更重要是,这样作没什么意义。...因为人员ID和性别不一样,我们不清楚它意义,而且它也不能完整划分总体。也就是说样本数据路人甲,路人乙不能完全代表总体的人员ID。...3、ASReml-RASReml-RASRemlR版本,它优点:可以处理复杂随机因子结构;可以处理多元数据;可以处理系谱数据;可以处理大批量数据 主要缺点:它是收费,当然它对于不发达国家科研机构是免费

    4.3K70

    pandas缺失值处理

    在真实数据,往往会存在缺失数据。...pandas在设计之初,就考虑了这种缺失情况,默认情况下,大部分计算函数都会自动忽略数据集中缺失值,同时对于缺失值也提供了一些简单填充和删除函数,常见几种缺失值操作技巧如下 1....缺失判断 为了针对缺失值进行操作,常常需要先判断是否有缺失存在,通过isna和notna两个函数可以快速判断,用法如下 >>> a = pd.Series([1, 2, None, 3]) >>...axis=0) A B 0 1.0 1.0 >>> df.dropna(axis=1) Empty DataFrame Columns: [] Index: [0, 1, 2] pandas大部分运算函数在处理时...同时,通过简单上述几种简单缺失值函数,可以方便地对缺失值进行相关操作。

    2.6K10

    模型AIC和BIC以及loglikelihood关系

    AIC和BIC比较 AIC和BIC公式前半部分是一样, 后半部分是惩罚项,当n ≥ 10^2 时候,即kln(n) ≥ 2k,这时候BIC惩罚性得分更多(分数越大,模型越差),所以,BIC...实例演示 「ASReml-R 文档计算方法:」 这里: Ri为似然函数loglikelihood ti为参数个数 v为残差自由度 用两个模型: 模型1:动物模型,固定因子是SEX和BYEAR,...LRT似然比检验 似然比检验用来评估两个模型哪个模型更适合当前数据分析。 具体来说,一个相对复杂模型与一个简单模型比较,来检验它是不是能够显著地适合一个特定数据集。...「ASRemlLRT描述:」 「LRT检验前提」 两个模型固定因子一致 两个模型随机因子属于nested关系(包含关系,分级巢式模型) LRT应用一个前提条件是这些待比较模型应该是分级巢式模型...为了检验两个模型似然值差异是否显著,我们必须要考虑自由度。LRT 检验,自由度等于在复杂模型增加模型参数数目。这样根据卡方分布临界值表,我们就可以判断模型差异是否显著。

    5.5K20

    一文讲清楚动物模型母体效应

    「母体效应」 是母亲对后代生活环境影响(泌乳能力,母性等),是母亲带来效应。 俗话说:“父挫,挫一个;母挫,挫一窝”。因为,母体效应很强大,母亲影响力要甩父亲几条街。...从遗传角度,想要改良家族基因和性格,男性找一个好女性做配偶,比女性找一个好男性做配偶,影响更大。 想到这里,忽然感觉结婚时,给女方大量彩礼,也可以理解了。...女性对后代影响大,不只是从遗传角度,还有环境作用,还有交互作用,更别提还有线粒体遗传呢!...还有同学告诉我, 我之前培训教程,计算母体效应,其实是母体环境效应(仅仅将母体作为随机因子,没有考虑系谱亲缘关系矩阵),我说我知道了,回头我写篇博客解释汇总一下。...Specification, 2015 D G Butler, ASReml-R Reference Manual Version, 2018❞

    1.5K30

    混合线性模型介绍--Wiki

    混合线性模型: 是即包括固定因子,又包括随机因子模型。 混合线性模型被广泛应用于物理、生物和社会科学。尤其是一些重复测量数据及面板数据。...混合线性模型比较突出特点是可以非常好处理缺失值,相对于传统方差分析, 它有更广泛使用范围。...发展历程 Ronald Fisher 最早提出随机因子模型来研究亲属间性状相关性,1950年 Charles Roy Henderson 提出了最佳线性无偏估计(BLUE),这是针对于固定因子评估。...对随机因子评估是最佳线性无偏预测(BLUP)。随后,混合模型在统计学研究成了一个热门领域,相关模型不断提出, 比如非线性混合模型,极大似然发估计,混合模型缺失值处理,贝叶斯估计混合模型等。...评估方差组分方法有很多种, 有EM 方法, REML方法, Beyes方法等, 现在R种包(nlme, lme4, MCMCglmm,asreml)对这些方法都有应用.

    2.1K31

    在机器学习处理缺失数据方法

    数据包含缺失值表示我们现实世界数据是混乱。可能产生原因有:数据录入过程的人为错误,传感器读数不正确以及数据处理管道软件bug等。 一般来说这是令人沮丧事情。...我们对待数据缺失值就如同对待音乐停顿一样 – 表面上它可能被认为是负面的(不提供任何信息),但其内部隐藏着巨大潜力。...想象一下,仅仅因为你某个特征缺少值,你就要删除整个观察记录,即使其余特征都完全填充并且包含大量信息!...虽然这能够帮助你顺利运行模型,但这种方法可能非常危险。原因是有时候这个价可能会让人产生误解。设想在回归问题中出现负值(如预测温度),在这种情况下,这个值会成为一个实际数据点。...,你需要寻找到不同方法从缺失数据获得更多信息,更重要是培养你洞察力机会,而不是烦恼。

    1.9K100

    GraphQL Federation:您平台战略缺失 API

    平台工程 已成为释放云原生架构开发人员速度关键学科。...在 ChatGPT 使“ AI 功能” 突然成为每个应用程序必需品一年半后,现在出现了无数“AI 基础设施即服务”公司。但是,云原生架构关键要素:API 呢?...虽然无数工具简化并自动化了现代云原生架构 其他核心组件,但我们仍然依赖于单独手写后端到前端 (BFF) 来向每个前端提供后端所有功能。...除非 AI 可以使用 REST 自行编写后端到前端蔓延(可以吗?),如果我们想要减少样板代码并在所有界面更快地交付功能,我们将需要一个更好解决方案。...GraphQL 可以服务于任意数量应用程序,因此不必为每个应用程序编写或维护 BFF。 提高应用程序一致性:当类型及其关系在 API 本身明确定义时,确保跨界面的一致性所需工作就更少了。

    7800

    如何查找递增连续数组缺失数字

    在一个长度为n递增数组,数组中元素范围是0 ~ n-1,如何在这个递增连续数组查找缺失数字? 分析下: 1. 排序数组搜索算法,首先想到就是二分法查找 2....丢失数字之前左子数组:nums[m] = m, 需要找到第一个nums[m] > m数组索引值即可....继续计算m指针值,m= (l + r)/2=(5 + 5)/2=5; 这时发现左,,右三指针都指向了num[4], 但4并不是我们想要值....在处理边界值时候,在(i == r)时候,还多需要多遍历一次,向右移动左指针一次. 4. 这时,左指针值便是最后想要值. 所以我们遍历条件为(l<=r),最后左指针位置即为缺失结果值....综上,对于有序数组查找,一般都会使用二分法查找.在查找数据时候,注意左右边界指针移动.以及遍历标记(l<=j)即可.

    3.1K21

    DMU遗传评估从入门到出家系列

    主要参数介绍 1.1 DMU软件介绍 DMU是一个数量遗传学工具包,主要功能包括估计方差组分和固定效应,预测育种值。DMU开发历史可以追溯到25年前,大部分功能基于数量遗传学研究需求而开发。...在丹麦动物育种研究,DMU是一个主要统计研究工具(估计和预测)。此外,DMU也应用于丹麦牛,羊,貂和马等常规遗传评估研究。...单性状动物模型 本次主要是演示如何使用DMU分析单性状动物模型. 2.1 示例数据 「数据使用learnasreml包数据」 learnasreml是我编写辅助学习asremlR包, 里面有相关数据和代码...3.2 使用数据 「数据使用learnasreml包数据」 learnasreml是我编写辅助学习asremlR包, 里面有相关数据和代码, 这里我们用其中repeatmodel.dat和repeatmodel.ped...「数据使用learnasreml包数据」 learnasreml是我编写辅助学习asremlR包, 里面有相关数据和代码, 这里我们用其中animalmodel.dat和animalmodel.ped

    3.9K42

    计算机教育缺失一课

    相比 bash,zsh 拥有更强大功能,比如说更智能自动补全、更丰富主题等等。这逼绝对是马车跑车,跑车飞行车,史称「终极 Shell」。 再说说窗体内容。...echo "hello world" 当我们在 Shell 执行命令时,实际上是在执行一段 Shell 可以解释执行简单代码。...Shell 路径是一组被分割目录,在 Linux 和 macOS 上使用 / 分割,在 Windows 上是 \,正因为这样,我们在编程时候一定要先获取系统分隔符(Java 是 File.separator...注意,rm (删除文件)这个命令一定要慎用啊,搞不好就是删库跑路节奏! 在 Shell ,程序主要有两个流:输入流和输出流。...当程序尝试读取信息时,就从输入流读取;当程序尝试打印信息时,就将信息输出到输出流。通常来说,键盘作为输入设备,显示器作为输出设备。 可以使用 来重定向输入输出流。

    1.1K20
    领券