Dplyr变量列表中多个值的select_和starts_with第2部分 - 腾讯云开发者社区

这一次的内容太多了，我讲了 2 小时都没讲完，后续再放视频吧。有一段还忘记录了。。。...涉及编程的数据和代码都会放到 https://github.com/XSLiuLab/Workshop 推荐图书《R for Data Science》[1] 《R 语言编程指南》《R 实战》其他推荐见...is.na()) 位置 mean, meadian 逻辑值 mean, sum 位置 dplyr:: first last nth 排序 quantile min max 分布 IQR mad sd var...文档和《R 语言编程指南》后几期主题本期未讲述的内容？？？...正则表达式与字符串处理：base 与 stringr 列表处理与迭代计算：purrr 统计建模：stats 与 broom 绘图：graphics 与 ggplot2 函数编程：apply家族和purrr

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「R」dplyr 列式计算

第二个参数是 .fns，它是应用到数据列上的一个函数或者是一个函数列表，它也可以是像 ~.x/2 这样「purrr」风格的公式语法。...你可以通过对第二个参数传入一个函数（包括 lambda 函数）的命名列表来对每个变量同时执行多个函数操作。..._if, _at, _all 「dplyr」以前的版本允许以不同的方式将函数应用到多个列：使用带有_if、_at和_all后缀的函数。这些功能解决了迫切的需求而被许多人使用，但现在被取代了。...across() 统一了 _if 和 _at 的语义让我们可以随心按照位置、名字和类型选择变量，甚至是随心所欲地组合它们，这在以前是不可能的。..._at() 函数是「dplyr」中唯一你需要手动引用变量名的地方，这让它们比较奇怪且难以记忆。为什么过了这么久才发现 across()？

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R&Python Data Science 系列：数据处理（1）

在数据转换和可视化模块中，R和Python有很多相近的语法代码。 1 数据转换数据转换广义上也是数据处理，是根据业务需求，筛选、衍生新的变量以及计算一些统计量。...这一部分介绍一下R和Python数据处理用到的筛选、衍生以及计算函数。主要介绍如何使用R语言和Python中的两个程序包进行数据处理，R语言中的dplyr和Python中的dfply第三方包。...R语言 library(ggplot2) library(tidyverse) library(tidyr) library(dplyr) ##筛选cut为Ideal记录的前4行 diamonds %...4.2 row_slice函数使用row_slice进行行切片操作，可以传递单个整数索引或者索引列表选择行： Python实现 ##筛选出diaminds中第11行和第16行 diamonds...R语言实现 ##筛选出diaminds中第11行和16行的数据 diamonds %>% slice(c(11,16)) ?

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Day07 生信马拉松-数据整理中的R

列 1.3 按位置提取字符串 #提取x中第5和第9位的字符串 str_sub(x,5,9) 1.4 字符检测 str_detect(x2,"h") # 第一个参数为向量名，第二个是检测的关键词 str_starts...(x2,"T") #判断x2中T开头的字符串,输出逻辑向量 str_ends(x2,"e") #判断x2中e结尾的字符串,输出逻辑向量 1.5 字符串替换 x2 str_replace(x2,"o",...2.4 连续步骤的不同方法 2.4.1 多次赋值，产生多个中间的变量 x1 = select(iris,-5) #"-5"为删除第5列 x2 = as.matrix(x1) x3 = head(x2,50..., jimmy) 4.2 lapply(list, FUN, …)函数--参数与自定义函数相似 4.2.1 对列表/向量中的每个元素实施相同的操作 lapply(1:4,rnorm) 4.2.2 批量画图...("gene"), # pivot_longer()为宽变长的函数，starts_with("gene")内为需要宽长转换的列名 names_to = "gene",

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跟小洁老师学习R语言的第七天

)#把列表简化为矩阵图片3.按位置提取字符串str_sub(x,5,9)#取5~9位str_sub(x,c(5,9))#分别从第5位和第9位开始str_sub(x,c(5),c(5))#从第5位开始到第...# 1.多次赋值，产生多个变量x1 = filter(iris,Sepal.Width>3)x2 = select(x1, Sepal.Length,Sepal.Width)x3 = arrange(x2...)k2 = str_detect(samples,"normal");k2ifelse(k2,"normal","tumor")多个条件i = 0if (i>0){ print('+')} else...，FUN是函数test2, mean)apply(test, 1, sum)#2.lapply(list, FUN, …) # 对列表/向量中的每个元素...（向量）实施相同的操作test 值是列表，对列表中的每个元素（向量）求均值(试试方差var,分位数quantile

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R语言之处理大型数据集的策略

此外，在数据分析的过程中，对于临时对象和不再需要的对象，使用命令 rm(object1,object2, …) 及时将它们清除。 2....dplyr 包的 select 系列函数在这里可以派上用场，尤其是将这些函数与 tidyselect 包的 starts_with( )、ends_with( ) 和 contains( ) 等函数联合使用会带来诸多便利...( ) 分别表示变量的前缀和后缀。...在上面的命令中，subdata1 选取了数据集里所有以 a 开头的变量，而 subdata2 选取了数据集里所有以 2 结尾的变量。...如果要剔除某些变量，只需要在函数 starts_with( )、ends_with( ) 和 contains( ) 前面加上 - 号。

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dplyr数据处理

dplyr::arrange(mtcars,mpg) dplyr::arrange(mtcars,desc(mpg)) 三、利用管道合并多个操作，过滤后排序，%>%快捷键是ctrl+shift...(starts_with('Pop')) %>% View() 五、抽样抽样的函数使用起来比较容易，可以按照个数抽样，也可以按照百分比进行抽样。...mtcars %>% dplyr::sample_n(10) mtcars %>% dplyr::sample_frac(0.2) 六、创建新变量有时需要对已有变量进行重新计算，例如计算几列的和...，会某一列取对数，这样将生成新的变量，这个时候可以使用 mutate 函数。...setdiff(second, first)#2的补集写在最后：有时间我们会努力更新的。

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十二、R语言的综合应用

x2 = str_split(x," ")[[1]];x2 [[1]] ##第一句代码返回值，返回的是列表，不能进行下一步的计算操作 [1] "The" "birch" "canoe"...1.4.字符检测 str_detect(x2,"h") ### 看x2这个长度为8的向量中的每个元素是否含有h这个关键词，生成的与x2长度相等且一一对应的逻辑值向量 str_starts(x2,"...###没有赋值，所以修改后的test还是5列图片 2.4 连续的步骤 select() 筛选列 filter() 筛选行 2.4.1.多次赋值，产生多个变量 x1 = filter(iris,Sepal.Width...# 对列表/向量中的每个元素（向量）实施相同的操作 test <- list(x = 36:33,y = 32:35,z = 30:27);test #返回值是列表，对列表中的每个元素（向量）求均值(...= T) z[,4] # 2.如何把上一题结果中的Control和Vemurafenib改成全部小写？

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R 数据整理（七：使用tidyr和dplyr处理数据框 2.0）

，后续的参数是条件，这些条件是需要同时满足的，另外，条件中取缺失值的观测自动放弃，这一点与直接在数据框的行下标中用逻辑下标有所不同，逻辑下标中有缺失值会在结果中产生缺失值。...pivot_longer/pivot_wider 大部分功能是类似的，这里主要说下pivot_longer 针对下面情况的功能：我们需要指定切分变量名和随访号的模式，以解决一行中有多个属性的多次观测的情形...，再转换回长列表，比如：这个数据的问题是 x, y 应该放在两列中却合并成一个了，2018 和 2019 应该放在一列中却分成了两列。...2.11 处理关系数据参见：中的join 函数介绍部分 2.12 数据框的列拆分与合并参见：34....nest 与unnest 对于数据框，我们可以使用split 将数据框按某列拆分为多个数据框，并储存在列表中。

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MLQuant：基于XGBoost的金融时序交易策略（附代码）

，我们将清理一下数据，将所有列表放入一个单独的数据框中，计算每种资产的每日收益并创建向上或向下的方向，这将是分类模型试图进行预测。...nested_df % mutate(duplicate_ID = ID) %>% nest(-ID) 我们将时间序列数据分为多个列表，以使该analysis()列表在每个列表中包含...100个观测值，并具有一个包含1个观测值的相应assessment()列表。...该函数对我们数据中的每项资产执行以下操作：使用样本外t+1（assessment）数据，将这些列表绑定到一个dataframe中。...接下来，我们使用变量X_train和X_test把数据拆分成X个变量以及使用Y_train和Y_test把相应的Y变量分开。xgboost包需要一个特定类型的xgb.DMatrix()。

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2023.4生信马拉松day7-R语言综合应用

3. str_sub() 按位置提取字符串子集 str_sub(x,5,9) #提取x的第5到9个字符 4. str_detect() 字符串检测【重要】 -（1）判断每个字符串含不含有某个字母或者多个字母的组合...； -（2）判断之后得到一个与x2相等的逻辑值向量； -（3）可以用来做“根据逻辑值提取x的子集”； str_detect(x2,"h") #判断x的每个字符串含不含有某个字母或者多个字母的组合； str_starts...，产生多个中间的变量 x1 = select(iris,-5) #取iris除了第5列的所有列 x2 = as.matrix(x1) x3 = head(x2,50) #取x2的前50行 pheatmap...TRUE时的返回值 -（4）no：逻辑值为FALSE时的返回值 -（5）支持单个的逻辑值，也支持多个逻辑值组成的向量 -（6）相当于对向量的每个元素逐个进行判断，然后对判断结果F/T进行逐个替换； i...如何挑出30个数里最大的五个 -（1）排序 -（2）取最后五个图片 3.向量/列表的隐式循环-lapply() 对列表/向量中的每个元素实施相同的操作 lapply(1:4,rnorm) #批量画图

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tidyverse

掌握这两个包就可以完成绝大部分的数据处理工作。...官网：https://www.tidyverse.org/ 一、tidyr 数据整理 tidyr 包用于将数据重新整合，替代之前的 reshape 和 reshape2 包，用于数据的重塑与聚合...总而言之，让数据变地更好用（符合下层函数参数的格式要求），方便用户查找和阅读。...数据的整理是一个从数据框的统计结构（变量与观察值）到形式结构（列与行）的映射。...tidyr 包主要就是用来将数据转换为“整洁数据”的包，主要功能为 1)缺失值的简单补齐 2)长形表变宽形表与宽形表变长形表； 1.2 长数据与宽数据长数据宽数据 1.3

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R语言-专题

= T)gg[,4]# 2.如何把上一题结果中的Control和Vemurafenib改成全部小写？...搜索一下tolower(g[,4])str_to_lower(g[,4])3.条件与循环1.if(){}1.if(一个逻辑值，不可以多个逻辑值)...print()2.if(),{} else(){}ifelse...,"normal");k2ifelse(k2,"normal","tumor") #警惕写的代码结果顺序和实际相反3.多个条件#### (3)多个条件i = 0if (i>0){ print('+'...10个数a= norm(100)tail(sort(a),10)2.列表的隐式循环—lapply输入数据是列表，输出数据也是列表### 2.lapply(list, FUN, …) # 对列表/向量中的每个元素...（向量）实施相同的操作test 值是列表，对列表中的每个元素（向量）求均值(试试方差var,分位数quantile

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R语言列筛选的方法--select

我们知道，R语言学习，80%的时间都是在清洗数据，而选择合适的数据进行分析和处理也至关重要，如何选择合适的列进行分析，你知道几种方法？如何优雅高效的选择合适的列，让我们一起来看一下吧。 1....数据描述数据来源是我编写的R包learnasreml中的fm数据集。...5.2 放到环境变量中「推荐的方法：」 r$> select = dplyr::select r$> a3 = a2 %>% select(ID,F1,y1,y2,y3) 推荐在载入包时，将下面代码放在开头...，就可以肆无忌惮的应用select了，毕竟，环境变量的优先级是第一位的。...library(tidyverse) select = dplyr::select 6. 提取h开头的列这里，用starts_with，会匹配开头为h的列。

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Python从零开始第三章数据处理与分析①python中的dplyr（2）目录

目录第二章（pandas） Python从零开始第三章数据处理与分析①dplyr风格的python代码 Python从零开始第三章数据处理与分析①python中的dplyr（2） ==========...===================================== filter/select功能 select和drop函数在数据处理中很有用，可以轻松地选择和删除列。...这些功能旨在select和drop功能，并可与〜一起使用。首先，快速了解可用功能： starts_with（prefix）：查找以字符串前缀开头的列。...ends_with（suffix）：查找以字符串后缀结尾的列。 contains（substr）：查找名称中包含子字符串的列。 everything（）：所有列。...可以传递单个整数索引或索引列表来选择行。这与使用pandas包的的.iloc功能相同。

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数据分析：宏基因组数据的荟萃分析

数据分析：宏基因组数据的荟萃分析介绍宏基因组数据的荟萃分析是一种综合多个独立宏基因组研究结果的方法，目的是揭示不同人群或样本中微生物群落的共同特征和差异。...meta 包中的 metagen 函数用于进行宏基因组数据的荟萃分析，其核心原理是综合多个独立研究的结果，以评估不同组别间在微生物群落组成上的差异性，并得出更加全面和可靠的结论。...获取该模型中微生物物种的效应值和效应值误差，它们将用于后续荟萃分析。...荟萃分析的结果包含所有研究的效应值（RE）和效应值的误差（SE_RE）。...可视化结果采用森林图展示荟萃分析的结果，该结果包含效应值RE的95%置信区间和对应的P值。

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R语言笔记-6

#str_split()可分割具有多个字符串的向量 strs = c("Joey doesn"t share foods !"...(str," ") 输出结果：图片数据框的处理-dplyr library(dplyr) head(iris,5) #将内部数据iris所有列按Sepal.Length列的数值从小到大排列 head...参数，可使用任何函数，包括自定义的函数 data=iris[1:5,1:4] data #计算每一列的加和 apply(data,1,sum) #计算每一行的平均值 apply(data,2,mean)...输出结果：图片 lapply()函数：列表的隐式循环图片 test = list(x = 36:33,y = 32:35,z = 30:27);test #计算列表每一个元素的平均值 lapply...(i+1) } #下标循环语句 for (i in 1:length(x)){ print(x[[i]]+1) } #下标循环便于将循环结果保存至列表中 result = list() for (i

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R语言基于dplyr实现数据快捷操作

实例： library(dplyr) mtcars <- as_tibble(mtcars) ? 2. arrange 对数据集进行整体基于单列或者多列进行排序。...5. mutate 为数据集增加新的变量。实例： df %>% mutate(z = x + y, z2 = z ^ 2) ? 6. pull 输出单个变量。 7. relocate改变列之间排序。...可以直接填入变量名，也可以直接用列号，或者更深一层添加功能函数：start_with(以什么开头的变量)，where（什么要求的变量）实例： iris %>%select(starts_with("Petal...group_by基于单个或者多个变量进行分组。 13. n() 指的是统计行数 14. slice 选择输出的行。实例： ? 15. nest_by隐掉某个变量后面的数据，赋值给data，只展示大小。...多个表之间的操作： ?

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生信入门马拉松之R语言基础-脚本项目管理、条件循环、表达矩阵和一丢丢数据挖掘(Day 7)

save(pd,exp,gpl,file = "steploutput,Rdata")，这句代码将几个第一个脚本有用的变量保存到Rdata文件中，下次使用这些变量时直接加载load这个Rdata文件即可...多个脚本衔接靠Rdata文件实现。2.1.3 为什么用Rdata而不是表格文件来衔接？变量，自带变量名称，不需要再次赋值，也没有参数。...undefined表格文件需要赋值，读取参数不同导致读取结果不同，不能在后续代码中同等处理。Rdata可以保存多个变量，下次使用只需要一次load可以的到多个数据。...yes：逻辑值T时返回的值no，逻辑值F时返回的值ifelse函数和str_detect()函数连用，王炸炸炸！！！..., sum)#对test每一行求和向量/列表的隐式循环-lapply,批量操作### 2.lapply(list, FUN, …) # 对列表/向量中的每个元素实施相同的操作lapply(1:4,rnorm

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Day6 呦呦鹿鸣—学习R包

(1:2,51:52,101:102),]取R自带的iris数据第1，2，51，52，101，103行?...2：count统计某列的unique值count(test,Species)分类变量每个变量值的频数dplyr处理关系数据将2个表进行连接1.內连inner_join,取交集inner_join(test1..., test2, by = "x")满足两个条件：有相同变量名，相同变量名的列里有相同元素；2.左连left_join列表书写顺序决定了最终合成列表中列的顺序left_join(test1, test2...,每列数值的类型必须相同；以"by"的列为标准，补齐列表，空值为"NA"4.半连接：返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join交集表中test1部分的列semi_join(x = test1,...y = test2, by = 'x')5.反连接：返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_jointest1中去除交叉部分的列表anti_join(x = test2, y = test1, by

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