首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

FDR校正-从lmer()中提取p值并创建矢量,以便在R中的p.adjust中使用

FDR校正是一种多重假设检验校正方法,用于控制错误发现率(False Discovery Rate)。在统计学中,当进行多个假设检验时,存在一定的概率会出现错误的拒绝或接受原假设的情况。FDR校正的目标是控制错误发现率,即在所有被拒绝的假设中错误拒绝的比例。

FDR校正的主要步骤如下:

  1. 进行多个假设检验,得到每个假设的原始p值。
  2. 将原始p值按升序排序。
  3. 计算每个假设的FDR校正值,通常使用Benjamini-Hochberg方法。该方法根据排序后的p值和总假设数,计算每个假设的校正值。
  4. 根据设定的显著性水平(通常为0.05),确定FDR校正值小于等于该显著性水平的假设为拒绝原假设。

FDR校正在生物学、基因组学、神经科学等领域中广泛应用。它可以有效地控制错误发现率,提高实验结果的可靠性。在基因表达分析中,FDR校正可以用于筛选差异表达基因;在脑成像研究中,FDR校正可以用于识别激活的脑区域。

腾讯云提供了一系列与云计算相关的产品和服务,其中包括云服务器、云数据库、云存储、人工智能等。具体推荐的产品和产品介绍链接地址如下:

  1. 云服务器(Elastic Compute Cloud,简称CVM):提供灵活可扩展的云服务器实例,满足不同规模和需求的计算资源需求。详细信息请参考腾讯云官方文档:云服务器产品介绍
  2. 云数据库(TencentDB):提供多种数据库产品,包括关系型数据库(MySQL、SQL Server、PostgreSQL)、NoSQL数据库(MongoDB、Redis)、分布式数据库(TDSQL)。详细信息请参考腾讯云官方文档:云数据库产品介绍
  3. 云存储(Cloud Object Storage,简称COS):提供高可靠、低成本的对象存储服务,适用于存储和处理各种类型的数据。详细信息请参考腾讯云官方文档:云存储产品介绍
  4. 人工智能(AI):腾讯云提供了丰富的人工智能服务,包括图像识别、语音识别、自然语言处理等。详细信息请参考腾讯云官方文档:人工智能产品介绍

以上是腾讯云在云计算领域的一些产品和服务推荐,供您参考。请注意,这仅是其中的一部分,腾讯云还提供了更多与云计算相关的产品和服务,您可以进一步了解和探索。

页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

识别肿瘤功能失调子通路的方法ICDS

子通路是指具有特定生物学功能的生物通路的局部区域。随着大规模测序数据的产生使我们有更多的机会来研究癌症发生的分子机制。研究DNA甲基化、拷贝数变异(CNV)和基因表达改变对致瘤的失调子通路分子状态的潜在影响是很必要的。本工作提出一个通过整合多组学数据和通路拓扑信息来识别癌症功能失调子通路(ICDS)的方法。利用肝癌(LIHC)、头颈部鳞状细胞癌(HNSC)、宫颈鳞状细胞癌和宫颈腺癌的数据集,验证了ICDS在识别异常子通路方面的有效性。进一步将ICDS和其他识别子通路的方法)(只考虑DNA甲基化、CNV或基因表达)进行比较,通过这些分析,证实ICDS比其他三种只考虑一种数据类型的方法更能识别癌症相关的子通路。

01

与内在功能连接个体变异性相关的基因表达

研究表明,内在功能连接(FC)中的个体间变异性(ISV)与各种各样的认知和行为表现相关。然而,ISV在FC中的潜在组织原理及其相关基因转录谱尚不清楚。使用静息态功能磁共振成像数据从人类连接组计划(299年成人被试)和艾伦人类脑图谱的微阵列基因表达数据,我们进行了转录-神经成像关联研究调查内在的ISV的空间配置及其与空间基因转录谱的关联。我们发现,FC中多模态关联皮层的ISV最大,而单模态皮层和皮层下区域的ISV最小。重要的是,偏最小二乘回归分析显示,与人类加速区(HARs)相关的基因的转录谱可以解释FC中ISV空间分布的31.29%的变异。转录谱中的顶级相关基因在中枢神经系统的发育、神经发生和突触的细胞成分中得到了丰富。此外,我们还观察到,基因转录谱对FC中ISV的异质性分布的影响是由脑血流结构介导的。这些发现强调了ISV在FC中的空间排列,以及它们与转录谱和脑血流供应变化的耦合。

03
领券