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系统比较Seurat和scanpy版本之间、软件之间的分析差异

Seurat和Scanpy是实现这种工作流的最广泛使用的软件,通常被认为是实现类似的单个步骤。下面我们就需要比较一下软件之间、以及不同版本之间的数据分析差异。...Seurat和Scanpy在默认的scnaseq工作流中显示出相当大的差异下图显示了使用PBMC 10k数据集与默认设置比较Seurat v5.0.2和Scanpy v1.9.5的结果,展示了“标准”单细胞...Scree图也显示出差异,最明显的是第一个PC解释的方差比例相差0.1。PCA的变化都可以通过HVG设置标准化来解决,并相应地调整PCA。接下来,这些软件在SNN图的生成上有很大的不同。...这些版本之间的logFC计算和调整后的p值没有差异。比较使用默认设置的Cell Ranger软件v7和Cell Ranger v6生成的计数矩阵也揭示了所有DE指标之间的差异。...跨Cell Ranger版本的分析显示,pipeline的所有步骤都存在相当大的差异。这些命令之间的主要区别在于v7中默认包含基因计数矩阵中的内含子计数,而v6中默认排除内含子计数。

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    TP5和TP6版本之间的差异,以及TP6新特性

    TP5和TP6版本之间的差异: ThinkPHP6.0运行环境要求PHP7.1+,不支持5.1的无缝升级 ThinkPHP6.0基于精简核心和统一用法两大原则在5.1的基础上对底层架构做了进一步的优化改进.../psr 6 TP6组件的独立 ORM 模板引擎 7 TP6中间件改进 TP6开始使用了管道模式来实现中间件,比起之前版本的实现更加简洁,有序 8 TP6引入Filesystem TP6新特性: 采用...PHP7强类型(严格模式) 支持更多的PSR规范 多应用支持 ORM组件独立 改进的中间件机制 更强大和易用的查询 全新的事件系统 支持容器invoke回调 模板引擎组件独立 内部功能中间件化...SESSION机制改进 缓存及日志支持多通道 引入Filesystem组件 对Swoole以及协程支持改进 对IDE更加友好 统一和精简大量用法 ———————————————— 版权声明...原文链接:https://blog.csdn.net/sangkaixin1/article/details/120172522 未经允许不得转载:肥猫博客 » TP5和TP6版本之间的差异,以及TP6

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    这些常用的Git命令清单,你都知道吗?

    查看信息 # 显示有变更的文件 $ git status # 显示当前分支的版本历史 $ git log # 显示commit历史,以及每次commit发生变更的文件 $ git log --stat...=format:%s # 显示某个commit之后的所有变动,其"提交说明"必须符合搜索条件 $ git log [tag] HEAD --grep feature # 显示某个文件的版本历史,包括文件改名... blame [file] # 显示暂存区和工作区的差异 $ git diff # 显示暂存区和上一个commit的差异 $ git diff --cached [file] # 显示工作区与当前分支最新...commit之间的差异 $ git diff HEAD # 显示两次提交之间的差异 $ git diff [first-branch]......git diff HEAD^                                            # 比较与上一个版本的差异 git diff HEAD -- .

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    一份简简单单的git命令手册(附带备忘清单)

    这个版本库的配置、存储等信息会被保存到git 文件夹中 # 初始化当前项目 $ git init # 新建一个目录,将其初始化为Git代码库 $ git init [project-name] #...--oneline # 显示所有提交过的用户,按提交次数排序 $ git shortlog -sn # 显示指定文件是什么人在什么时间修改过 $ git blame [file] # 显示暂存区和工作区的差异...$ git diff # 显示暂存区和上一个commit的差异 $ git diff --cached [file] # 显示工作区与当前分支最新commit之间的差异 $ git diff HEAD...# 显示两次提交之间的差异 $ git diff [first-branch]......# 比较暂存区和版本库差异 $ git diff --cached # 仅仅比较统计信息 $ git diff --stat # 显示某次提交的元数据和内容变化 $ git show [commit

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    Git常用命令

    Git常用命令 Git是一个开源的分布式版本控制系统,用于敏捷高效地处理任何或小或大的项目,Git擅长的是程序代码的版本化管理,对程序源代码进行差异化的版本管理,代码库占极少的空间,可以说Git是目前世界上最先进的分布式版本控制系统...git log --follow [file]: 显示某个文件的版本历史,包括文件改名。 git log -p [file]: 显示指定文件相关的每一次diff。...git blame [file]: 显示指定文件是什么人在什么时间修改过。 git diff: 显示暂存区和工作区的差异。...git diff --cached [file]: 显示暂存区和上一个commit的差异。 git diff HEAD: 显示工作区与当前分支最新commit之间的差异。...git diff [first-branch]...[second-branch]: 显示两次提交之间的差异。

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    常用 Git 命令总结

    系统级的配置文件:在 Git 的安装目录下(Mac 系统下安装目录在 /usr/local/git)的 etc 文件夹中的 gitconfig。 git diff 用于显示提交和工作树等之间的更改。...此命令比较的是工作目录中当前文件和暂存区域快照之间的差异,也就是修改之后还没有暂存起来的变化内容。...# 比较当前文件和暂存区中文件的差异,显示没有暂存起来的更改 $ git diff # 比较暂存区中的文件和上次提交时的差异 $ git diff --cached $ git diff -...-staged # 比较当前文件和上次提交时的差异 $ git diff HEAD # 查看从指定的版本之后改动的内容 $ git diff # 比较两个分支之间的差异...# 初始化本地仓库,在当前目录下生成 .git 文件夹 $ git init git log 显示提交的记录。

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    【linux命令讲解大全】014.Git:分布式版本控制系统的先驱和常用命令清单(三)

    git blame 文件名:显示文件的每一行是在那个版本最后修改。...git whatchanged 文件名:显示某个文件的每个版本提交信息:提交日期,提交人员,版本号,提交备注(没有修改细节) 打造自己的git命令 git config --global alias.st...之间的差异 git diff --cached # 比较Index和HEAD之间的差异 git diff HEAD # 比较Worktree和HEAD之间的差异 git diff branch #...比较Worktree和branch之间的差异 git diff branch1 branch2 # 比较两次分支之间的差异 git diff commit commit # 比较两次提交之间的差异...git diff master..test # 上面这条命令只显示两个分支间的差异 git diff master...test # 你想找出'master'、'test'的共有父分支和'test

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    Git Cheat 2

    git log [tag] HEAD --grep feature # 显示某个文件的版本历史,包括文件改名 git log --follow [file] git whatchanged [file...] # 显示指定文件相关的每一次diff git log -p [file] # 显示指定文件是什么人在什么时间修改过 git blame [file] # 显示暂存区和工作区的差异 git diff...# 显示暂存区和上一个commit的差异 git diff --cached [file] # 显示工作区与当前分支最新commit之间的差异 git diff HEAD # 显示两次提交之间的差异...diff # 只显示两个分支间的差异,如果你想找出‘master’,‘test’的共有 父分支和'test'分支之间的差异,你用3个‘.'...git diff master..test # 显示你当前的索引和上次提交间的差异;这些内容在不带"-a"参数运行 "git commit"命令时就会被提交。

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    Git命令大全

    # 查看本地仓库的状态 $ git status # 以简短模式查看本地仓库的状态 # 会显示两列,第一列是文件的状态,第二列是对应的文件 # 文件状态:A 新增,M 修改,D 删除,??...$ git merge git diff比较版本之间的差异 # 比较当前文件和暂存区中文件的差异,显示没有暂存起来的更改 $ git diff # 比较暂存区中的文件和上次提交时的差异...$ git diff --cached $ git diff --staged # 比较当前文件和上次提交时的差异 $ git diff HEAD # 查看从指定的版本之后改动的内容 $ git...diff # 比较两个分支之间的差异 $ git diff # 查看两个分支分开后各自的改动内容 $ git diff ......> --delete git log显示提交的记录 # 打印所有的提交记录 $ git log # 打印从第一次提交到指定的提交的记录 $ git log

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    在场景中使用Git

    /hello.git] 2、本地新建Git工程 现在打算将本地的工程,放到Git仓库进行托管了,并且远程Git仓库已经创建了该项目的工程 #本地初始化工程,会生成一个.git文件 git init...reset --hard [sha1值] 7、删除文件 保留副本操作 git rm --cache [文件名] 还原操作 git reset HEAD [文件名] 直接文件删除 git...git checkout -b [本地分支名] origin/[远程分支名] 9、Tag使用 我们在开发的时候,可能存在线上发布了一个版本,需要给这个版本代码打上一个标签,到时候可以方便回退到这个版本...git commit -m "v1.1" # bill分支合并到当前分支【分支名】 git merge [bill] 10、关于代码的比较 # 显示暂存区和工作区的差异 $ git diff # 显示暂存区和上一个...commit的差异【文件名】 $ git diff --cached [hell.txt] # 显示工作区与当前分支最新commit之间的差异 $ git diff HEAD # 显示两次提交之间的差异

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    git入门

    $ git init Initialized empty Git repository in E:/GitResp/.git/ add和commit命令 git只能管理暂存区和本地库中的文件。...master) $ git log --oneline 7e328f8 (HEAD -> master) 修改了demo.md中的内容 6df164a 这是我写的第一个文件 Demo.md $ git...这是我写的第一个文件 Demo.md HEAD@{1}为由当前版本回退到该版本需要回退一个版本。...使用diff命令后,发现暂存区和工作区中改文件的差异为:先删除了aaaaa这一行,再增加的aaaaabbb这一行,这是由于git是按行为单位来管理数据的。...,若不加文件名则比较多个文件之间的差异 git diff [文件名] 比较暂存区与本地库某个版本之间的文件差异 git diff [历史版本] [文件名] 分支 版本控制过程中,使用多条线同时推进多个任务

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    最全的Git常用命令速查-2021版

    七、查看信息 # 显示有变更的文件 $ git status # 显示当前分支的版本历史 $ git log # 显示commit历史,以及每次commit发生变更的文件 $ git log --stat...=format:%s # 显示某个commit之后的所有变动,其"提交说明"必须符合搜索条件 $ git log [tag] HEAD --grep feature # 显示某个文件的版本历史,包括文件改名...[file] # 显示暂存区和工作区的差异 $ git diff # 显示暂存区和上一个commit的差异 $ git diff --cached [file] # 显示工作区与当前分支最新commit...之间的差异 $ git diff HEAD # 显示两次提交之间的差异 $ git diff [first-branch]......九、撤销 # 撤销工作目录中所有未提交文件的修改内容 $ git reset --hard HEAD # 撤销指定的未提交文件的修改内容 $ git checkout HEAD #

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    史上最干货的Git命令整理,一文胜千言

    blame [file] 显示指定文件是什么人在什么时间修改过 git diff 显示暂存区和工作区的差异 git diff --cached [file] 显示暂存区和上一个commit的差异 git...diff HEAD 显示工作区与当前分支最新commit之间的差异 git diff [first-branch]......[second-branch] 显示两次提交之间的差异 git diff --shortstat "@{0 day ago}" 显示今天你写了多少行代码 git show [commit] 显示某次提交的元数据和内容变化...blame [file] 显示指定文件是什么人在什么时间修改过 git diff 显示暂存区和工作区的差异 git diff --cached [file] 显示暂存区和上一个commit的差异 git...diff HEAD 显示工作区与当前分支最新commit之间的差异 git diff [first-branch]...

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