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「R」数据可视化21: Edge Bunding图

什么是Edge Bunding图 Edge Bunding图是一种数据可视化的方式,用于展示不同节点之间的联系。...Force-Directed Edge Bundling for Graph Visualization 如何作Edge Bunding图 代码来源:https://www.r-graph-gallery.com.../310-custom-hierarchical-edge-bundling.html (感觉原网站就做的挺好看,所以主要会讲解一下所需要的数据) 1)需要什么样的数据 本次的绘制我们使用igraph和...其实,基本上,构建各种网络图所需要的数据无外乎:起始节点(from)、终止节点(to)和连线属性(比如相关性的强度等)。...Edge Bundling 我们可以来比较一下修改一些设定之后的区别: 参数tension的影响 ? 不同tension值对网络图的影响 参数width的影响 ?

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数据可视化基本套路总结

当节点很多的时候,各种弧线交叉得就非常密密麻麻,这种情况下,要么交互,要么考虑别的图形。 hierarchical edge bundling ?...hierarchical edge bundling hierarchical edge bundling也表示节点间的网络关系,不过它把边扭曲成曲线,这样就适合节点比较多的可视化。 矩形树图 ?...有条件的话最好找设计师参考,没有的话最简单的方法就是参考比较成功的可视化作品的配色风格。 配色方案没有具体的规律总结,主要靠感觉。下面贴一些配色方案自行体会即可。 ? 调色板 ?...ggplot2 R最擅长的除了统计建模就是可视化了,而ggplot2是最流行、最强大的绘图包(应该没有之一)。对于静态图,只要你有足够的创意,ggplot2基本都可以通过其系统完备的画图语法实现。...echarts echarts在江湖上被称为”百度为数不多的良心产品“,这个库跟d3相反,它离应用层更近,提供了许多示例模板,把代码copy过去改改数据就行了。

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    python数据可视化从入门到实战_大数据可视化概念

    hierarchical edge bundling hierarchical edge bundling hierarchical edge bundling也表示节点间的网络关系,不过它把边扭曲成曲线...,这样就适合节点比较多的可视化。...有条件的话最好找设计师参考,没有的话最简单的方法就是参考比较成功的可视化作品的配色风格。 配色方案没有具体的规律总结,主要靠感觉。下面贴一些配色方案自行体会即可。...ggplot2 R最擅长的除了统计建模就是可视化了,而ggplot2是最流行、最强大的绘图包(应该没有之一)。对于静态图,只要你有足够的创意,ggplot2基本都可以通过其系统完备的画图语法实现。...echarts echarts在江湖上被称为”百度为数不多的良心产品“,这个库跟d3相反,它离应用层更近,提供了许多示例模板,把代码copy过去改改数据就行了。

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    D3动画

    D3 动画 D3.js提供了多种工具支持数据可视化的交互,其中d3.transition让简单而高效的为图像添加动画成为了可能。...举一个简单的例子: 假设目前已有数据['a', 'b', 'c'....]等字母序列,现在希望通过D3,使用SVG将其呈现在页面上 V4 通过selection.enter(), selection.exit...} V5 d3 V5.8.0 引入了一个新的API, selection.join 这个API的优势在于,对于一些比较简单、不需要特殊定义enter\exit过程的动作的d3图形,可以简化代码,以上的代码...Update Pattern下的动画 回到最开始的例子,这里用V4版本的Update Pattern举例 因为transition是应用在selection上的,所以为了方便使用,我们可以先定义好动画..., color2)来产生颜色插值等,具体的插值函数用法可查阅相关API。

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    算法金 | D3blocks,一个超酷的 Python 库

    易用性: 提供详细文档和示例,让用户能够快速上手。可定制性: 支持各种图表的自定义设置,满足不同需求。更新及时: 提供Pypi安装和GitHub克隆安装方式,并支持强制更新。...浅浅的感受一下:2 初学乍练 - 快速入门首先,使用pip安装d3blockspip install d3blocks 然后就是通过d3blocks库来创建一个粒子图。...from d3blocks import D3Blocks​# 初始化 D3Blocks 对象d3 = D3Blocks()​# 导入示例数据集 'energy'df = d3.import_example...'] = 20d3.D3graph.node_properties['Thermal_generation']['edge_color'] = '#000fff' # 设置节点边缘颜色为蓝色d3.D3graph.node_properties...['Thermal_generation']['edge_size'] = 3 # 设置节点边缘大小​# 调整边 'Solar' 到 'Solar_Thermal' 的属性d3.D3graph.edge_properties

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    05-Nebula Graph 图数据 可视化

    js就可以做, 但是我是一个后端呀, D3相对复杂, 但是需求刚在眼前还是要做的.....基于D3开发Nebula的关系可视化 前端 前端在网上找到了一个基于React+antd做的一个Demo, 为此我还特意去学习了React+Antd+D3 这个就可以用于做Nebula的可视化 于是我把这个代码从....append('g') .attr('transform', 'translate(' + margin.left + ',' + margin.top + ')') // 设最外包层在总图上的相对位置...最重只能在语法上进行处理, 通过两个函数和管道符循环,来完成, 但是会吧节点和关系拆开, 拆成两个列.., 不过也算是能返回结果了 然后在程序里面处理, 转为D3需要的数据结构 导入需要的模型类 package...这就是上面前端需要的数据结构 把这个数据直接放入前端的静态数据里面就能展示了 到此, 基于D3的图可视化完成, 当然了, 样式不是很好看, 前端大佬自行美化吧~

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    使用NetworkX绘制深度神经网络结构图(Python)

    NetworkX支持创建简单无向图、有向图和多重图,内置许多标准的图论算法,节点可为任意数据,支持任意的边值维度,功能丰富,简单易用。...接下来,引入坐标机制,即设置好每个神经元节点的坐标,使得它们的位置能够按照事先设置好的来放置,其Python代码如下: # -*- coding:utf-8 -*- import networkx as...node_size =300 # 顶点大小 ) # 显示图片 plt.show() 可以看到,在代码中,通过pos字典已经规定好了每个神经元节点的位置...可以看到,现在这个DNN模型的结构已经大致显现出来了。接下来,我们需要对这个框架图进行更为细致地修改,需要修改的地方为: 去掉神经元节点的标签; 添加模型层的文字注释(比如Input layer)..../DNN.png', image) 这样生成的图片就是文章最开始给出的DNN的结构示意图。

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    生信爱好者周刊(第 19 期):2022年值得关注的7大前沿技术

    在这里,详细介绍了其中的三个特征: (1)整个学习过程中神经可变性的不灵活性; (2)即使在简单任务中也使用多个学习过程; (3)存在与任务无关的大型活动变化。...2、Sankey Diagram in R[5] 本文介绍使用plotly绘制桑基图。 3、Tabby:这个开源的终端工具更酷炫 本文介绍Tabby的安装和使用。...3、multicolor - 丰富你的信息输出的R包[8] 4、edgebundle - edge bundling算法实现R包[9] 包含的算法实现: Force directed edge bundling...Stub bundling Hammer bundling Edge-path bundling TNSS flow map Multicriteria Metro map layout 资源 1、...2、Bioinformatics-training-collection[11] 这是一个学习生物信息学相关工具和语言的资源集合。

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    前端数据可视化之 --- (一)亿级关系图

    echarts应该是实现不了了(也可能是我对echarts的属性研究不深),D3?...(D3是肯定可以的了),与其用D3从零开始为什么不找到现有的开源的专门做关系图的库,来实现它,百度了半天也没搜出个一支半截,最终还是看了某查网,发现它们引入了一个叫cytoscape.js的文件,百度了一下...ok你的关系图做的很牛逼就够了,这正是我们想要的。使用方法很简单,一个div用于盛装画好的图,先引jquery,再引Cytoscape.js,然后就可以开始写你的代码了,还支持使用npm安装。...").removeClass("edgeActive"); c.neighborhood("edge").addClass("edgeActive");//鼠标经过某节点,与此节点有关的变高亮显示...//c.neighborhood("edge")表示:跟当前节点有关系的边 }) cy.on("mouseout", "node", function (a) {}) cy.on("click

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    Python 图_系列之基于实现无向图最短路径搜索

    图的常用存储方式有 2 种: 邻接矩阵 链接表 邻接矩阵的优点和缺点都很明显。优点是简单、易理解,对于大部分图结构而言,都是稀疏的,使用炬阵存储空间浪费就较大。...链接表的优点是能够紧凑地表示稀疏图。 在 Python 中可以使用列表嵌套实现邻接表,这应该是最简单的表达方式。..., ['D3', [('E4', 2)]], ['E4', [('B1', 7)]], ] 在此基础上,可以做一些简单的常规操作。...找到 A0 的 2 个后序顶点 B1 、D3 (或者说 B1、D3的前序顶点是 A0),压入队列中。除去起点 A0,B1、D3 顶点属于第一近压入队列的节点。...''' 添加节点与节点之间的关系(边), 如果是无权重图,统一设定为 1 ''' def add_edge(self, from_v, to_v, weight=1):

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    Python 图_系列之基于邻接炬阵实现广度、深度优先路径搜索算法

    以此可使用算法方便的计算出如航班线路中的最短路径、如火车线路中的最佳中转方案、如社交圈中谁与谁关系最好、婚姻网中谁与谁最般配…… 1.1 图的概念 顶点:顶点也称为节点,可认为图就是顶点组成的集合。...如上的图结构可以描述如下: # 5 个顶点 V={A0,B1,C2,D3,E4} # 7 条边 E={ (A0,B1,3),(B1,C2,4),(C2,D3,6),(C2,E4,1),(D3,E4,2)...add_vertex( vert ):向图中添加一个新节点,参数应该是一个节点类型的对象。 add_edge(fv,tv ):在 2 个项点之间建立起边关系。...使用广度搜索到的路径与候选节点进入队列的先后顺序有关系。如第 1 步确定候选节点时 B1 和 D3 谁先进入队列,对于后面的查找也会有影响。...= 0] 递归实现时,不需要使用全局栈,只需要获到当前节点的相邻节点便可。 4. 总结 图一种很重要的数据结构,因这个世界中万事万物之间的关系并不是简单的你和我,我和你的关系,本质都是错综复杂的。

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    一文读懂Python复杂网络分析库networkx | CSDN博文精选

    networkx支持创建简单无向图、有向图和多重图(multigraph);内置许多标准的图论算法,节点可为任意数据;支持任意的边值维度,功能丰富,简单易用。...G.edges();给定边 node_size: 指定节点的尺寸大小(默认是300,单位未知,就是上图中那么大的点) node_color: 指定节点的颜色 (默认是红色,可以用字符串简单标识颜色,例如...-无向图 如果添加的节点和边是已经存在的,是不会报错的,NetworkX会自动忽略掉已经存在的边和节点的添加。...{'index': '2/3th'}} 边的属性 1#边的属性 2import networkx as nx 3 4G = nx.Graph(day='manday') 5G.add_edge...输出: 1生成一个空的有向图 2为这个网络添加节点... 3在网络中添加带权中的边... 4给网路设置布局... 5画出网络图像: 6dijkstra方法寻找最短路径: 7节点0到7的路径: [0, 3

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    最短路径问题—Dijkstra算法详解

    3、Dijkstra算法示例演示 下面我求下图,从顶点v1到其他各个顶点的最短路径 首先第一步,我们先声明一个dis数组,该数组初始化的值为: 我们的顶点集T的初始化为:T={v1} 既然是求...: 然后,我们使用同样原理,分别确定了v6和v2的最短路径,最后dis的数组的值如下: 因此,从图中,我们可以发现v1-v2的值为:∞,代表没有路径从v1到达v2。...所以我们得到的最后的结果为: 起点 终点 最短路径 长度 v1 v2 无 ∞ v3 {v1,v3} 10 v4.../C++杂注, //只要在头文件的最开始加入这条杂注, //就能够保证头文件只被编译一次。...:((Vexnum*(Vexnum - 1)) / 2) edge bool check(int Vexnum, int edge) { if (Vexnum edge <=

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    后分布式时代: 多数派读写的’少数派’实现

    Hierarchical quorum 2xn 继续沿用hierarchical quorum 的定义, 但只选2行....首先最直观的结论是, quorum定义中所需的节点个数越少, 完成一次quorum-rw或paxos的消息量就越少, 如果可以选择到更近的节点, 那么整个系统的延迟就有可能会降低. quorum 决定了系统的可用性...如果宕机2个节点: hierarchical quorum 需要联系DC-3的条件是: 这2个宕机节点都集中在DC-1或都集中在DC-2时; majority quorum 需要联系DC-3的条件是:...在宕机2个节点时, hierarchical 只有 majority 40% 的几率延迟达到 60ms; 如果假设单个节点停机几率是p=0.01(1年有3, 4天不在线), 那么9节点宕机2个节点的几率大约是...这就对一致性算法提出了新的要求, 现代分布式系统都在尝试解决从1到100的问题: 将可用的系统打造成适应各种复杂场景的可靠系统(而不是简单的单机房几个服务器的单一场景): 系统在节点延迟/故障率/性能等变得越来越复杂的情况下

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