首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

How to gnu parallel此脚本计算CSV文件列中出现的非数字

GNU Parallel是一个用于并行执行命令行任务的工具。它可以帮助用户在多个CPU核心或远程计算机上同时运行任务,从而提高任务的执行效率。

要使用GNU Parallel计算CSV文件列中出现的非数字,可以按照以下步骤进行操作:

  1. 确保已经安装了GNU Parallel。可以通过在终端中运行以下命令来检查是否已安装:
  2. 确保已经安装了GNU Parallel。可以通过在终端中运行以下命令来检查是否已安装:
  3. 如果未安装,可以根据操作系统的不同,使用适当的包管理器进行安装。
  4. 创建一个包含CSV文件列的文本文件,每行一个值。假设文件名为input.txt。
  5. 创建一个用于处理每个值的脚本文件,假设文件名为script.sh。在脚本中,可以使用适当的命令和工具来判断每个值是否为数字。以下是一个示例脚本,使用awk命令来判断值是否为数字:
  6. 创建一个用于处理每个值的脚本文件,假设文件名为script.sh。在脚本中,可以使用适当的命令和工具来判断每个值是否为数字。以下是一个示例脚本,使用awk命令来判断值是否为数字:
  7. 在终端中运行以下命令,使用GNU Parallel并行执行脚本:
  8. 在终端中运行以下命令,使用GNU Parallel并行执行脚本:
  9. 这将逐行读取input.txt文件,并将每行的值作为参数传递给script.sh脚本进行处理。GNU Parallel将自动并行执行脚本,并将结果输出到终端。

在上述步骤中,GNU Parallel提供了并行执行任务的能力,而脚本文件则用于处理每个值并判断其是否为数字。这样,您可以计算CSV文件列中出现的非数字。请根据实际需求修改脚本文件以满足您的具体要求。

关于腾讯云的相关产品和产品介绍链接地址,可以参考腾讯云官方文档或网站,以获取最新和详细的信息。

页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

一起来学shell bash编程(2)

第二,代码不断在文件添加扩展名,每个生成文件现在都以我们不期待结尾 .fastq.trimmed.fq。...当我们用编程语言编写一个 forloop时,我们正在构建一个迭代命令式:我们要求计算机首先完成一个工作,然后循环到最后。但通过GNU Parallel编写命令时,我们遵循所谓描述性功能编程。...就是,我们尝试用模式描述我们想要内容,然后让计算机填写该模式并输入完整命令。 GNU Parallel极简介绍 GNU Parallel 是一个非常好用文件并行工具。...假设有一个名为文件 ids.txt,其中包含: ABC 假设我们要输出: Hello AHello BHello C 多种方法指定GNU并行输入 通过文件输入: cat ids.txt | parallel...A and 1Hello B and 2 更多详细关于GNU parallel内容,可以查阅我之前推文: 生信小技巧:并行运行秘密 更加高级shell编程 自带manualbash脚本

2K50

命令行上数据科学第二版:八、并行管道

在这一章,我将介绍一个非常强大工具,叫做parallel,它可以处理好这一切。它使您能够对一系列参数(如数字、行和文件)应用命令或管道。另外,顾名思义,它允许您在并行运行命令。...8.2.1 数字循环 假设您需要计算 0 到 100 之间每个偶数平方。有一个叫做bc工具,这是一个基本计算器,你可以用管道把一个方程。...图 8.3: GNU Parallel 使用--results选项将输出存储在单独文件 当您并行运行多个作业时,作业运行顺序可能与输入顺序不一致。因此,工作产出也是混杂。...8.2.1 数字循环 假设您需要计算 0 到 100 之间每个偶数平方。有一个叫做bc工具,这是一个基本计算器,你可以用管道把一个方程。...图 8.3: GNU Parallel 使用--results选项将输出存储在单独文件 当您并行运行多个作业时,作业运行顺序可能与输入顺序不一致。因此,工作产出也是混杂

4.5K10
  • 15分钟并行神器gnu parallel入门指南

    GNU Parallel是一个shell工具,为了在一台或多台计算机上并行执行计算任务。本文简要介绍GNU Parallel使用。 ? 这个cpu是多核。 一般两核是这样工作: ?...本文主要目的是安利(lure)你使用这个工具,并且告诉你为啥(why)使用和如何(how)使用。 why 使用gnu parallel目的只要一个,就是为了快!...其实就是一个1万多行perl单文件脚本(是的,你没看错,所有模块都在这个文件里,这是一个特色~)。我之后都是写fabric脚本直接拷贝到各个节点机。再chmod一下执行权限。...一般情况下,parallel第一种模式,就是替换掉 xargs -P. 比如压缩一下所有的html文件。 find ....在云计算操作,经常有批量操作,比如建立10个云硬盘 seq 10 | parallel cinder create 10 --display-name test_{} 建立50个云主机 复制代码

    2.3K30

    生信技巧 | GNU 并行操作

    数据并行情况 当文件每一行都可以单独处理时 基因组每条染色体都可以单独处理 组件每个脚手架都可以单独处理 处理并行 压缩或解压缩 10 到 100 个文件 计算文件行数 将许多样本原始测序数据文件与基因组进行比对...获取读取子集会导致低质量组装结果。 GNU 并行 我们用来并行化生物信息学问题程序是 GNU 并行。它是“一种使用一个或多个计算节点并行执行作业 shell 工具”。.../us-counties.csv 这是一个逗号分隔文件,所以让我们将其转换为制表符分隔文件 more us-counties.csv | tr ',' '\t' > us-counties.tab...County-state.tab 文件。...在本例,“command”为 gzip {},其中 {} 是占位符,用于替换分隔符后定义文件列表 ':::' 分隔符 *.tab 文件列表,对以 tab 结尾任何文件使用 * 运算符 parallel

    24810

    五分钟shell系列第三节-海量数据topk问题

    因为在真实环境 一般方式: 首先通过脚本,excel等工具,(很多公司也是excel完成事情) 可以快速验证,出结果. 利用strom等大数据分析平台,通过写对应jobs来统计指标。...第一题 问: 从一亿个数据找出 出现次数最多前10个值?...: 这需要统计每个单词出现次数,并且按照次数,数值排序 sort -n: 对数字进行排序 按照从小到大顺序 uniq -c: 统计数字出现次数 ,uniq命令只能对相邻行进行去重复操作 sort...split -l 10 visit.log new 2 统计小文件ip出现次数(8个进程并行处理124个任务,输出结果写到各自文件) find ./ -name visit.log...可以代替xargs If you use xargs and tee today you will find GNU parallel very easy to use as GNU parallel

    93640

    GNU Parallel具体使用

    GNU Parallel是一个shell工具,为了在一台或多台计算机上并行执行计算任务,一个计算任务可以是一条shell命令或者一个以每一行做为输入脚本程序。...通常输入是文件列表、主机列表、用户列表、URL列表或者表格列表;一个计算任务也可以是一个从管道读取一条命令。GNU Parallel会把输入分块,然后通过管道并行执行。...GNU Parallel可以替代大部分shell循环,并且用并行方式更快完成计算任务。...GNU Parallel保证它输出与顺序执行计算任务时是一样,这样就可以方便GNU Parallel输出做为其它程序输入。...使用 –colsep 把文件行切分为,做为输入参数。

    3.3K10

    如何用 awk 删除文件重复行【Programming】

    visited[$0]++' your_file > deduplicated_file 工作原理 该脚本会保留一个关联数组,其索引等于文件唯一行,而值等于它们出现次数。...对于文件每一行,如果行出现次数为零,则将其增加一并打印该行,否则,它仅增加出现次数而无需打印该行。 我对awk并不熟悉,所以我想了解它是如何通过这么短脚本来实现这一点。...值:在awk,任何数字值或任何空字符串值均为true 。默认情况下,变量被初始化为空字符串,如果转换为数字则为零。...换言之:如果visit [[0]]返回大于零数字,则否定结果为false 。如果visit [[0]]返回一个等于零数字或一个空字符串,则该否定结果将解析为true 。...abc ghi def xyz klm 参考资料 Gnu awk 用户指南 awk 数组 Awk真值 Awk 表达式 如何在Unix删除文件重复行? 删除重复行而不排序 awk '!

    8.7K00

    使用Ubuntu 18.04 LTS开启机器人开发愉快历程

    CSV”场景允许基于存储在逗号分隔值文件轨迹机器人动画,其中每行对应于一个时间步,并由逗号分隔数字组成,指定该时间步机器人配置。“CSV”场景没有联合限制。...在每个场景,都有一个叫做线程子脚本 Lua 脚本。当场景第一次运行时,会有一个被调用函数来设置GUI并创建稍后在模拟需要变量。...path.csv:该文件指定图中解决方案路径,它是单行,格式为ID1,ID2,...第一个数字是解决方案路径第一个节点ID,最后一个数字是解决方案路径中最后一个节点ID。...但是,为了向后兼容,仍旧支持调用脚本旧方式(但请确保不要混合使用这两种方法)。新联合回调函数已经实现并且在线程子脚本和定制脚本得到支持。...)新联系人回调函数已实现,并且在线程子脚本和自定义脚本受支持。

    3.3K20

    Linux parallel 命令使用手册

    Parallel配置文件通常位于用户主目录下“~/.parallel/config”文件。...Parallel会自动将数字序列分成多个块,并并行地处理它们。   Parallel还支持使用管道和输入文件来处理数据。...,我们使用Parallel将作业发送到hosts.txt文件列出多个计算机上。...2.从文件读取命令行参数   除了使用:::符号和{}符号传递参数外,GNU Parallel还可以从文件读取命令行参数。这可以帮助您处理大量参数,而无需在命令行手动输入每个参数。...可能存在并发问题: 由于GNU Parallel是一个并发计算工具,可能存在一些并发问题,例如竞争条件、死锁和资源争用等。这需要您在使用时进行注意和处理,以避免出现问题。

    13010

    【DB笔试面试446】如何将文本文件或Excel数据导入数据库?

    至于EXCEL数据可以另存为csv文件csv文件其实是逗号分隔文本文件),然后导入到数据库。 下面简单介绍一下SQL*Loader使用方式。...在CONTROL文件load data前边加一行:UNRECOVERABLE,选项必须要与DIRECT共同使用。...CSV格式文件默认定界符就是双引号,可以根据实际情况修改OPTIONALLY参数值 4 数据文件比要导入多 SMITH CLEAK 3904ALLEN SALESMAN...2、对于第一个1,还可以被更换为COUNT,计算记录数后,加1开始算SEQUENCE3、还有MAX,取表该字段最大值后加1开始算SEQUENCE 16 将数据文件数据当做表进行加载...导入后再通过SQL语句更新到真实字段 10 Illegal combination of non-alphanumeric characters 非法字母数字字符组合 环境变量NLS_LANG设置和文件字符集保持一致

    4.6K20

    好用parallel命令 「纯干货」

    命令并发执行curl,-j10表示最多10个并发进程,-C '\s+' 表示使用空白来拆分每行(注:\s+是表示空白正则表达式),这样就可以使用{1}表示第1,{2}表示第2了,如我们所预期,10...有用--tag选项 上例接口很简单,直接返回ok,但在有大量数据需要处理时,有可能出现部分数据处理失败,像上面的执行结果,就很难知道是哪些数据处理失败了,还好parallel提供了--tag选项,...其中--bar适合待处理数据量确定场景,因为parallel需要读取所有数据后才能根据数据总量计算进度条。...true 10 u10 true 复制代码 --semaphore选项 parallel既然提供了并发,那么必然会遇到并发冲突问题,比如sed命令就不支持并发修改同一文件,不过parallel...命令还能很方便处理csv文件数据,比如将data.txt改为data.csv,如下: $ cat data.csv user_id,user_name 1,u1 2,u2 3,u3 ... # 使用-

    1.2K30

    在命令行进行sort排序【Linux-Command line】

    在大多数Linux系统上,sort命令捆绑在GNU组织一组实用程序。 在其他POSIX系统(例如BSD和Mac)上,默认sort命令不是来自GNU,因此某些选项可能有所不同。...在本文中,我将尝试说明GNU和BSD实现。 按字母顺序对行排序 在默认情况下,sort命令查看文件每一行第一个字符,并以字母升序输出每一行。 如果多行两个字符相同,则会考虑下一个字符。...这是电子表格导出一种通用数据格式,CSV(逗号分隔值)文件扩展名可以识别此类文件(尽管CSV文件不必以逗号分隔,分隔文件也不必使用 CSV扩展名以确保有效且可用)。...可读数字排序(仅GNU) 人与计算机之间另一个常见混淆点是数字组。...只要确定自己数字是一致,“--human-numeric-sort”可以以计算机友好方式帮助解析人类可读数字。 随机排序(仅GNU) 有时,实用程序提供了执行相反操作选项。

    2.4K00

    OLAP 数据平台 Druid 第一步,编写 Spec 配置

    在quickstart/ 目录下创建 ingestion-tutorial-index.json 文件,将以下内容写入文件: "dataSchema" : {} 随着教程进行,我们将不断修改 spec...我们数据时间戳是"ts",它是一个 ISO 8601 规范时间戳,我们将配置字段 timestampSpec信息加到 dataSchema 下: "dataSchema" : { "dataSource...下面章节我们将看到这些类型如何被使用。 在我们讲如何定义其他时间之前,先讨论一下 rollup。 Rollup 在摄入数据时,我们需要考虑是否需要 rollup。...维度是 rollup grouping (用于 group by,filtering),指标是被聚合计算。 如果不开启 rollup,所有都被视为维度,将不会进行预聚合。...Strings vs Numbers 数字类型数据应该作为数字维度还是字符串维度? 数字维度相对于字符串维度有以下优势和劣势: 优势:数字需要更小存储空间,并且在读取该时需要更小开销。

    1.1K20

    -Pandas 清洗“脏”数据(一)

    Pandas 是 Python 很流行类库,使用它可以进行数据科学计算和数据分。.../data/tmdb_5000_credits.csv') 注意,确保已经下载数据集,如果你代码和数据集存放结构与我一样,直接运行就可以 否则,要根据实际情况,修改 read_csv() 文件路径...删除任何包含 NA 值行是很容: data.dropna() 当然,我们也可以删除一整行值都为 NA: data.dropna(how='all') 我们也可以增加一些限制,在一行中有多少空值数据是可以保留下来...(在下面的例子,行数据至少要有 5 个空值) data.drop(thresh=5) 比如说,我们不想要不知道电影上映时间数据: data.dropna(subset=['title_year'...规范化数据类型 有的时候,尤其当我们读取 csv 中一串数字时候,有的时候数值类型数字被读成字符串数字,或将字符串数字读成数据值类型数字

    3.8K70

    Shell文本处理编写单行指令诀窍

    模式信息可以在数据库元表里找到。 CSV文本文件也是有模式数据,只不过它信息只存在于用户大脑里。文件里只有纯粹数据和数据分隔符。...CSV文本文件记录之间使用换行符分割,之间使用制表符或者逗号等符号进行分隔。 数据表行记录等价于CSV文本文件一行数据。...数据表一行数据可以使用名称指代,但是CSV数据只能用位置索引,表达能力上相比要差一截。...如果输入不是文件而是由一串命令生成动态文件怎么办呢?也许你会想到先将这一串命令输出到临时文件再将这个临时文件名作为指令输入,处理完毕后再删除这个临时文件。...推荐资源 《Unix Shell编程》 《The AWK programming language》 《Sed & Awk 101 Hacks》 GNU Parallel http://www.gnu.org

    75010

    Shell文本处理编写单行指令诀窍

    模式信息可以在数据库元表里找到。 CSV文本文件也是有模式数据,只不过它信息只存在于用户大脑里。文件里只有纯粹数据和数据分隔符。...CSV文本文件记录之间使用换行符分割,之间使用制表符或者逗号等符号进行分隔。 数据表行记录等价于CSV文本文件一行数据。...数据表一行数据可以使用名称指代,但是CSV数据只能用位置索引,表达能力上相比要差一截。...如果输入不是文件而是由一串命令生成动态文件怎么办呢?也许你会想到先将这一串命令输出到临时文件再将这个临时文件名作为指令输入,处理完毕后再删除这个临时文件。...推荐资源 《Unix Shell编程》 《The AWK programming language》 《Sed & Awk 101 Hacks》 GNU Parallel http://www.gnu.org

    76920

    【Rust日报】 2019-06-26: DigitalBridge: 为什么我们在云渲染中使用Rust?

    Read More tokio master分支正在切换到std::future #tokio Read More Reddit 讨论 parallel:Rust实现GNU Parallel工具...GNU Parallel,它是一个shell工具,可以在一台或多台计算机上并行执行计算任务,一个计算任务可以是一条shell命令或者一个以每一行做为输入脚本程序。...GNU Parallel会把输入分块,然后通过管道并行执行 parallel aljabar: 基于 const generics 实现n维线性代数库 #const #LinearAlgebra 不过目前是实验性...自成立以来,构建和维护服务一直很困难,我们初始生产版本包括: 复杂CUDA层; 成千上万C++代码来准备和运行渲染; C库上C++包装器; C封装在C++库上; Cython为渲染器提供可调用接口以进行集成...现在他们产品,每天可以处理1000多个渲染定制服务。 Read More Rust 类型语言 #type 本文简要地介绍了Rust类型系统。

    62550

    ETL (Extract-Transform-Load) with Kiba(1)

    自动处理数据以生成报表 将多个系统所有数据或部分数据同步到一个来 将数据处理得易于搜索(导入到Elasticsearch 或 Solr ) 多个数据库数据进行聚合处理后将结果保存到一个数据一致...time, it is common to execute the three phases in parallel....kiba gem 可以很容易地实现轻量级 ETL 这里分享一下 kiba 简单使用,详细可以参考 官方文档 和 How to reformat CSV files with Kiba (in-depth...to reformat CSV files with Kiba (in-depth, hands-on tutorial) 实验一步步来体验一下 Kiba 简单使用方法 ---- 源数据与目标数据...FA1988,2015-03-08,6.41 它们之间差别 使用 ; 作为分割,要转化为 , 价格使用 , 作为分割,要转化为 .

    62510

    pandas用法-全网最详细教程

    1、首先导入pandas库,一般都会用到numpy库,所以我们先导入备用: import numpy as np import pandas as pd 2、导入CSV或者xlsx文件: df = pd.DataFrame...#默认后5行数据 三、数据表清洗 1、用数字0填充空值: df.fillna(value=0) 2、使用prince均值对NA进行填充: df['prince'].fillna(df['prince...levels︰ 列表序列,默认为无。具体水平 (唯一值) 用于构建多重。否则,他们将推断钥匙。 names︰ 列表,默认为无。由此产生分层索引名称。...[:3,:2] #冒号前后数字不再是索引标签名称,而是数据所在位置,从0开始,前三行,前两。...df_inner.sample(n=6, replace=True) 5、 数据表描述性统计 df_inner.describe().round(2).T #round函数设置显示小数位,T表示转置 6、计算标准差

    6K31
    领券