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多个基因集富集结果泡泡图绘制展示

多个基因集富集结果展示 通常我们会同时对多个基因集分别进行富集分析,结果放在一起展示。这时我们需要在富集结果后面加一列,标记该结果是哪个基因集的富集,在Excel中可以很方便地操作。...与单组富集结果相比,最大的改动就在: 新增的Group列而非 log_odds_ratio列作为横轴(X-axis)信息 提交后获得结果。图中每个点代表一个富集的条目,在Y轴有对应标记。...每一列是一组基因的富集结果。三组共有的富集在最上面,2组共有的富集在中间,每组特有的富集在底部。每个点的大小代表用于分析的基因集中匹配到该通路的基因数目,颜色代表富集程度。...提交后获得结果。...点的形状则代表其所属的组信息。 但是这个图出现了一个问题,图例显示不全。最简单的解决办法就是把图的宽度和高度调大。 结果就正常了,可以下载PDF版、PPT版(如果选了参数)和对应的R代码

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    Struts2学习---result结果集 result type:全局结果集:动态结果集带有参数的结果集

    这一章节主要介绍如何配置结果集,分为以下几个知识点: 结果集类型(result type) 全局结果集(global types) 动态结果集(dynamic type) 带有参数的结果集(type with...全局结果集: 全局结果集,顾名思义就是全局的,就像java代码里面的全局变量一样,可以在整个程序里面被调用。...当其他包的action也想要获得这个全局结果集的时候只需要在它package extends属性里面继承含有全局属性的包就行了。...result里面包含一个ognl表达式,用来取得值栈里面r的数据。 这样就完成了动态的结果集。...带有参数的结果集 当客户端发送了一个请求,这个请求含有参数,我们将这个请求重定向到其他页面,那么我们怎么将这个参数继续带到其他页面呢?

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    mysql语句根据一个或多个列对结果集进行分组

    MySQL GROUP BY 语句 GROUP BY 语句根据一个或多个列对结果集进行分组。 在分组的列上我们可以使用 COUNT, SUM, AVG,等函数。...2 | +--------+----------+ 3 rows in set (0.01 sec) 使用 WITH ROLLUP WITH ROLLUP 可以实现在分组统计数据基础上再进行相同的统计...例如我们将以上的数据表按名字进行分组,再统计每个人登录的次数: mysql> SELECT name, SUM(singin) as singin_count FROM employee_tbl GROUP...7 | | NULL | 16 | +--------+--------------+ 4 rows in set (0.00 sec) 其中记录 NULL 表示所有人的登录次数...我们可以使用 coalesce 来设置一个可以取代 NUll 的名称,coalesce 语法: select coalesce(a,b,c); 参数说明:如果a==null,则选择b;如果b==null

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    多个单词的命名规范有哪些优缺点?

    嘿嘿~我写这篇文章主要还是想向大家请教的,我们今天聊三个最常用的吧:横杠 - 连接、下划线 _ 连接、驼峰。...首先我们不讨论哪个命名规范最好,这没什么意义,因为不同的编程语言和开发环境中使用的是不一样的规范,我们只讨论这三个规范在哪些方面是有优缺点的,包括文件的命名。...横杠方式命名的网址在 SEO 优化中的一个优点: 在国外的英文网站中,网址是建议使用横杠的。...以 Django 框架为例,Django 使用路由系统来实现 URL 与实际网页的渲染程序的关联,所以不管项目文件名如何,只需要修改路由系统中的 URL 字符串便可以实现网址中的英文使用横杠连接的效果,...听说横杠方式有一些缺点? ? 这是在网上看到的一些讨论,但本人没试过,所以也不知道是不是真的,你是否有遇到过类似的情况?欢迎你的留言~

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    Mybatis的结果集处理 顶

    此时我们已经可以把整段的SQL语句取出,但还并没有在数据库中去执行,我们可以先来分析一下配置文件中SQL语句执行后的结果集是如何处理的。...Mybatis会将结果集按照映射配置文件中定义的映射规则,例如,resultType属性等,映射成相应的结果对象。...该方法不仅可以处理Statement,PreparedStatement产生的结果集,还可以处理CallableStatement调用存储过程产生的多结果集。...resultMap属性中配置多个节点的id,它们之间通过","分隔,实现对多个 //结果集的映射 List resultMaps = mappedStatement.getResultMaps...} //如果结果集的类型为只前进类型 } else { //依次访问结果集直到分页对象的偏移量处 for (int i = 0; i < rowBounds.getOffset(

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    多个数据集的整合分析

    今天是平平无奇的整合分析,是数据挖掘中经常用到的一部分~ 参考文献在这里⬇ A robust 6-mRNA signature for prognosis prediction of pancreatic...ductal adenocarcinoma DOI: 10.7150/ijbs.32899 文章的故事是从这句话开始的:prognostic gene signature by generating...,然后用RMA函数获取表达矩阵,分别对三个数据集进行了差异分析,然后对差异分析取交集作了后续的分析。...source("step2_check.R") source("step4_DEG.R") source("step5_degVisualise.R") } 完事了呢,我们来比较一下我们的差异分析和文章的差异分析结果...之前的推文也介绍过这种算法,相较于简单的取交集,RRA会根据logFC值对交集基因再排个序: rm(list = ls()) library(RobustRankAggreg) library(clusterProfiler

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    50多个有用的Docker工具集

    它由多个内置组件组成,可以简化Docker集群,任务或服务的调度和部署。...其他功能还包括活动流,IDE,问题跟踪和存储库管理。GitLab CI还有一个内置的容器注册表来扫描和存储Docker存储库。...Prometheus由SoundCloud开发,是一个开源的系统监控和警报工具包。它包含许多方面的监控,例如度量标准生成和收集,结果可视化以及发生异常时的警报功能。...专为Kubernetes而设计的Flannel是一种简单易用的方法,可通过在群集中的多个节点之间使用第3层IPv4网络来配置安全的网络结构。...构建多数据中心感知,Consul支持多个区域,没有复杂的配置。主要功能包括:服务发现,健康检查和密钥/值存储等。

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    Oracle给Select结果集加锁,Skip Locked(跳过加锁行获得可以加锁的结果集)

    for update wait和select for update nowait的区别 2、Skip Locked(跳过加锁行获得可以加锁的结果集) Skip locked是oracle 11g引入的...通过skip locked可以使select for update语句可以查询出(排除已经被其他会话加锁了的数据行)剩下的数据集,并给剩下的数据集,进行加锁操作。...根据结果集,我们发现ID=1的数据行被排除了 b、测试二 新建SQL窗口1(相当于新建一个会话)代码如下:执行如下语句 select * from test8 for update ?...根据测试一的结果得出推论:如果使用skip locked的话将查询不出任何结果 新建SQL窗口2(相当于新建一个会话)代码如下:执行如下语句 select * from test8 for update...没有查出任何结果集,ok,推论正确!

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    SQL语句执行与结果集的获取

    数据源在执行完SQL语句后会返回一个结果集对象,将SQL执行的结果返回到结果集对象中,应用程序在执行完SQL语句后,解析结果集对象中的结果,得到具体的结果,这次的主要内容是如何解析结果集对象并获取其中的值...这些属性必须在执行SQL语句得到结果集的操作之前定义好。因为在获得数据源返回的结果集的时候数据源已经设置了对应的属性。...command对象的属性集ID是PROPSET_ROWSET.该属性集中有很多能够影响结果集对象的属性。...结果集对象 结果集一般是执行完SQL语句后返回的一个代表二维结构化数组的对象。这个结构化对象可以理解为一个与数据表定义相同的一个结构体。...列信息的获取 取得结果集对象后,紧接着的操作一般就是获取结果集的结构信息,也就是获取结果集的列信息(有些材料中称为字段信息)要获取列信息,就需要QueryInterface出结果集对象的IColumnsInfo

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    SQL工具集-格式化结果的SQL

    无论是数据库,还是其他的领域,一些工具是方便了我们日常的工作需求,但同时由于其封装了一些细节,因此若只是知道用法,不知道实现原理,对于个人来说,浪费了一次锻炼的机会,因为往往这些经典的工具,蕴含着一些可以借鉴的逻辑...今天我们“SQL工具集”介绍的是一个存储过程,他的作者是大名鼎鼎的Tom,Oracle界最著名的一个网站AskTom,就是这个Tom,虽然现在Tom大叔已经退休了,但是网站还在被其他人运营,延续着Oracle...学习者的热情。...这个存储过程的名称是print_table,用于格式化打印SQL结果,为了做下对比,我们看下常规检索v$database视图的效果, ? 若不使用col格式化一些字段,输出是乱的,没有可读性。...当然存储过程中任何地方,均可以自定义,例如对于判断字段属性BLOB,可以设置任何自己需要的格式,包括日期格式,例如书中使用的是删除日期格式化参数的版本, ?

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    Python实现求多个集合之间并集的方法

    目的:求多个集合之前的并集,例如:现有四个集合C1 = {11, 22, 13, 14}、C2 = {11, 32, 23, 14, 35}、C3 = {11, 22, 38}、C4 = {11, 22..., 33, 14, 55, 66},则它们之间的并集应该为:C1 & C2 & C3 = {11}、C1 & C2 & C4 = {14}、C1 & C3 & C4 = {22}。...如下图所示:实现方法:Python自带了set数据类型,并且可以实现求集合的并集、交集、差集等,十分好用。...按照一般的数学方法实现,实现的步骤如下:(1)先求4个集合共有的成员;(2)每个集合减去所有集合的共有成员,在求其中任意3个集合共有的成员;(3)每个集合减去包含自己的任意三个集合的共有成员,最后求其中任意两个集合共有的成员...[[11, 22, 13, 14], [11, 32, 23, 14, 35], [11, 22, 38], [11, 22, 33, 14, 55, 66]] func(content)输出结果如下

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    用小数据集进行原型设计结果的小技巧

    在我的工作场所,我们为客户生产了许多功能原型。因此,我经常需要使用小数据。在本文中,我将分享 7 个改进使用小数据集进行原型设计结果的小技巧。 ? 1....这样,每个人都可以根据你的模型应该提供的结果,调整实际期望。它还创造了一个机会来提出一个新的有用的关键指标,以量化原型范围内外的模型性能。 ? 2....如果有时间的话,可以使用这个扩展数据集的绝妙技术。 ? 5. 小心「幸运的分割」 ---- 在训练机器学习模型时,通常将数据集按一定比例随机分割成训练集和测试集。通常情况下,这很好。...本质上,你将数据集拆分为 k 个「folds」,并为每个 k 训练一个新的模型,其中一个 fold 用于测试集,其余的用于训练。这可以控制你看到的测试结果,而不仅仅是由于幸运(或不幸运)的拆分。...幸运的是,有许多传统的机器学习算法,你可以考虑使用这些算法,它们对数据集的大小不太敏感。 当数据集较小,数据点维数较高时,支持向量机等算法是一种很好的选择。

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    Struts2之—实现自己的结果集的定义ajax

    但看上面提出的问题并不难。情况非经常见,都知道使用ajax实现。可是怎样在struts中自己定义结果集来实现ajax——这是这篇博客的重点。 (注:servlet要么转发要么重定向。...struts2能够自己定义结果集) 转发、重定向、action2action都会使页面刷新,满足不了页面无刷新的需求,因此,能够自定义一个结果集来解决(通过此结果集把server端(action)的数据回调到...username输入“张三那”,数据库中不存在,则提示“该username能够使用” 三,总结 自己定义结果集的缺点: 这样自己定义的结果集,写死了,不能做到client须要什么数据就传什么数据。...比方“部门管理”模块的一个功能也须要从server端返回数据到client,那是不是还要再写一个自己定义结果集,AjaxResult怎样做到复用。能不能做到复用,这是个问题。 基于以上问题。...下篇博客介绍——json类型的结果集——JSON插件是Struts2的Ajax插件,通过利用JSON插件,同意开发人员以很灵活的方式开发AJAX应用。 版权声明:本文博主原创文章。

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