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    Nat. Commun. | Metal3D: 一种用于准确预测蛋白质中金属离子位置的通用深度学习框架

    今天为大家介绍的是来自Ursula Rothlisberger研究团队的一篇关于金属离子位置预测的论文。金属离子是许多蛋白质的重要辅因子,在酶设计、蛋白质相互作用设计等许多应用中发挥关键作用,它们在生物体中丰富存在,并通过强烈的相互作用与蛋白质结合,并具有良好的催化特性。然而,生物相关金属(如锌)的复杂电子结构限制了金属蛋白质的计算设计。在这项工作中,作者开发了两个工具——基于3D卷积神经网络的Metal3D和仅基于几何标准的Metal1D,以改进蛋白质结构中锌离子的位置预测。与其他当前可用的工具进行比较显示,Metal3D是迄今为止最准确的锌离子位置预测器,其预测结果与实验位置相差在0.70 ± 0.64 Å范围内。Metal3D为每个预测位置输出置信度指标,并可用于在蛋白质数据库中具有较少同源物的蛋白质上工作。Metal3D可以预测全局锌密度,用于计算预测结构的注释,还可以预测每个残基的锌密度,用于蛋白质设计工作流程中。Metal3D目前是针对锌进行训练的,但通过修改训练数据,该框架可以轻松扩展到其他金属。

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    AMD Zen-2 物理设计总结

    Last year AMD introduced the Zen 2 microarchitecture, the company’s second major iteration of its Zen design. Zen 2 brought significant architectural changes at both the core level and the full SoC level. Undoubtedly, a big part of this success can be directly attributed to the company’s decision to dive headfirst into TSMC’s leading-edge 7-nanometer node. The move to TSMC 7-nanometer is a pretty big aggressive move, not only because it’s such a large technology shift, but also because of the new physical challenges it brings along with it – challenges that required the entire ecosystem – such as the foundry and CAD and EDA vendors – to collaborate on resolving those issues. At the recent ISSCC 2020 conference, AMD delved into some of those challenges in a little more detail.

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    新知 | 腾讯云视立方特效引擎优秀实践——终端篇

    新知系列课程第二季来啦!我们将为大家带来全真互联时代下新的行业趋势、新的技术方向以及新的应用场景分享。本期我们邀请了腾讯云音视频技术导师——张伟男,为大家分享腾讯特效引擎在终端的应用和实践。 本次分享会为大家介绍腾讯特效引擎的架构方案设计和特效处理流程,跨平台开发过程中遇到的一些实际问题以及特效引擎SDK集成过程中可能遇到的问题和解决方案。 特效引擎架构设计 考虑到特效引擎SDK有支持多平台的需求,团队在设计的过程中既要保持各端能力的统一,又要支持很好的平台可扩展性以便未来能接入更多的平台。因此,我们设计

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    领券