其中第一讲我提到了一个简单的索引产生方式，因为是课堂就半个小时想的，很多细节没有考虑到，对病毒那种几K大小的基因组来说是很简单的，速度也非常快，但是我测试了一下酵母，却发现好几个小时都没有结果，我只好kill...掉重新改写算法，我发现之前的测序最大的问题在于没有立即substr函数的实现方式，把一个5M的字符串不停的截取首尾字符串好像是一个非常慢的方式。...首先第一列就是我们的BWT向量，也就是BWT变换后的尾字符 第二列是之前的顺序被BWT变换后的首字符排序后的打乱的顺序。...] 由于之前就简单的看了看bowtie作者的ppt，没有完全吃透就开始敲代码了，写了十几个程序最后我自己都搞不清楚进展到哪一步了，所以我现在整理一下，从新开始！！！...最后我讲一下，这个BWT矩阵索引如何还原成原字符串，这个没有算法的差别，因为就是很简单的原理。 [perl] #first read the tally !!!
假如没有这个前提，建议学习Python作为主要工具，Perl可初步学习作为辅助。...\n"; } elsif ($n =~ /^\d+$/) { print "The value is an integer.\n"; } elsif ($n =~ /^\d*\....\n"; } elsif ($n =~ /^\s*$/) { print "The value is empty....\n"; } 理论上来说，中间elsif模块的数量是没有限定的。...home/tengwenkai/perl5/lib 不过一般不建议这么做，除非默认安装路径（可以使用perl-V查看，在@INC数组中）没有写入权限，否则在模块使用时就得添加完整的路径或者修改默认搜索路径
可操作性与可扩展性问题 OpenFlow的终端用户以及市场人员明确指出其技术问题：操作复杂，很难测试以及扩展。 这不是OpenFlow的核心技术问题，但确是其...
删除该目录下的.git目录，一般是隐藏状态,注意让他显形[ 删除git中的code-demo，删除之后重新添加 git rm -r --cached code-...
接手以前别人做的项目，发现SVN里的ignore里并没有对*.db处理，导致图片的缓存缩略文件都被提交了，而我只要打开图片文件夹，就意味着Thumbs.db发生了改变。...要做的事情有两个： 一、更改svn的设置，以后不再提交Thumbs.db文件 二、批量删除指定目录下的Thumbs.db文件 所以用perl写了一个，代码是在之前的 perl遍历目录 做了一些修改，主要有两点自己注意了...而linux下则是”/”， 所以统一改为”/” 二、比较两个字符串相等需要使用eq 而不是 == (==返回数值相等，而eq返回的是字符串相等) 三、unlink删除文件，需要指定文件的完整路径 四、perl...中的else if 写法为elsif 没有那个“e” 五、perl正则匹配方式为 =~ 或 !...if (-d $p) { parse_env($p); } elsif
.; }elsif(...){ ...; }else{ ...; } 数值关系运算符 ==,>,=,perl。 练习： 输入1测真假，输入2比大小，输入exit退出。 #!.../usr/bin/perl -w while(1){ print qq(Input exit/1/2/...: ); $s=; chomp...[abc@localhost tmp]$ vi f31.pl [abc@localhost tmp]$ perl f31.pl Input exit/1/2/...: 2 Input a: H.../1/2/...: 2 Input a: Happy Input b: h Happy < h Input exit/1/2/...: exit [abc@localhost tmp]$ perl
defined ($spid)) { die "can't put server into background - fork failed"; } elsif ($spid) { # parent...exit (0); } 自己写示例发现这种方法可以使程序进入后台执行状态，大概原理是 fork 子进程，退出主进程，使得程序被 1 号父进程接管，在终端表现则是进入了后台执行状态。.../usr/bin/perl sub mainThread() { print "---------- Main Thread!...defined ($spid)) { die "can't put server into background - fork failed"; } elsif ($spid)...-9 3300 参考文献# functions / exit (source, CPAN) functions / fork (source, CPAN) 在linux中如何关闭或者停用守护进程 关于perl
目录 在 Windows，Mac，Linux 和 Unix 上安装 Perl 第一个 Perl 计划 Perl 语法 Perl 中的数据类型 Perl 变量 my关键字 - Perl 中的本地和全局变量...Perl 中的标量 Perl 中的use strict和use warnings Perl - 列表和数组 Perl 中的哈希 Perl 运算符 - 完整指南 Perl 中的条件语句 Perl 中的...if语句 Perl 中的if-else语句 perl 中的if-elsif-else语句 Perl 中的unless语句 Perl 中的unless-else语句 Perl 中的unless-elsif...语句 Perl 中的Switch Case Perl 中的given-when-default语句 Perl 中的循环和循环控制语句 Perl 中的for循环 Perl while循环 Perl -...do-while循环 Perl - foreach循环 Perl 中的until循环 Perl 中的子程序 Perl - 字符串 Perl 字符串转义序列 另见 C 语言教程 C 语言示例 C++ 教程
所以当事务失效时，可以手动查询下当前数据库的存储引擎，具体的SQL语句如下： SHOW VARIABLES LIKE 'default_storage_engine%'; 类没有被Spring管理 /...@Transactional public void saveUser(User user){ // do something... } } 对于上面的例子，类没有被...@Service注解修饰，意味着当前类没有被Spring管理，事务自然就失效了。...数据源没有配置事务管理器时，事务将不生效，可通过以下方法进行配置。...总结 好啦，以上就是事务失效的几种常见的场景，不知道小伙伴们搞明白没有？在日常开发的过程中需要注意哦！
new = A: ---- user::rw- group::r-- other::--- ---- D: 如果没有...日志文件[/var/log/aide/aide.log]每次都更新，如果没有区别，它将用零字节更新，因此如果你想保存日志文件，它需要创建一个shell脚本或发送结果通过电子邮件或其他。...当文件现在的数字签名与保留的数字签名不一致时，那么现在这个文件必定被改动过了。.../usr/bin/perl # Tripwire Policy File customize tool # -----------------------------------------------...( /^{/ ) { $INRULE=1 ; } elsif ( /^}/ ) { $INRULE=0 ; } elsif ($INRULE
memcahced perl管理工具 memcached-tool #!.../usr/bin/perl # # memcached-tool: # stats/management tool for memcached. # # Author: # Brad Fitzpatrick...($mode eq 'dump') { ; } elsif ($mode eq 'stats') { ; } elsif ($mode eq 'settings') { ; }...查看memcached状态 [root@node1 ~]# perl Mem.pl 127.0.0.1:11211 # Item_Size Max_age Pages Count Full... 0 0 0 2 120B 0s 1 0 yes 0 0 0 [root@node1 ~]# perl
/usr/bin/perl print "\$a's value restore after the cycle:"; $a=1; print "$a\n"; foreach $...continue { (print (":$a in continue:"),$f=0) if ($f==1); } [root@windriver-machine test]# perl...1 1 1 2 2 2 2 3 $i=3 continue test 1234:5 in continue:678910[root@windriver-machine test]# Perl...1） 条件语句，使用if(){} elsif(){} …else{},需要注意这里是elsif ，另外可以使用unless() {} 单选if 语句也是只有perl才有，() if() 或者() unless
Perl脚本的主要用途 最重要的就是处理文本，和一些Hash类的config数据； 因为Perl也支持类操作（简单的继承，貌似没有虚函数功能-就是类函数的重定义），因此，一些in-house的EDA...铺垫了很多Perl如何语法不严谨，但是，看完这篇文章，你会觉得Perl也就那么回事。注意，本文并没有提供特高级的Perl套路，仅仅用于普通IC工程师的普通操作。...套路1：变量 Perl语言其实没有数据类型的区别，任何数据（整数、浮点数、字符、字符串）都一视同仁，随便处理。...Perl的子函数，没有C那样的参数列表， # 想传什么就传什么 # 具体例子在函数套路中讲解 die / unless die # 其实就是强制异常退出 # 比如 die ("Error happened...第一，Perl使用elsif, 而不是elseif ！ # 注意这里用的是eq ! # 对于字符串的相等，只能用eq (equal) 和 ne (not equal)。
自己总结的shell、perl和python的简单对比，欢迎交流！...【输出】 Shell：echo "hello,world" Perl：print “hello,world” Python：print "hello,world" 【变量定义】 Shell： name=...oudemen echo $name perl: $name 标量 print $name @names 数组 %name 哈希变量 Python: name=oudemen ...表达式1：表达式2 [如果条件表达式为真，执行表达式1，否则执行表达式2] if(条件表达式1) { 条件表达式1为真时的语句块； }elsif...(条件表达式2){ 条件表达式2为真时的语句块； }elsif(条件表达式3){ 条件表达式3为真时的语句块； } …… else
今天处理一个zabbix收到磁盘容量不足的报警时，远程到agent执行脚本的问题。
/usr/bin/perl #!.../sge_cluster_queue.pl perl sge_cluster_queue.pl perl sge_cluster_queue.pl -queue general.q perl sge_cluster_queue.pl... -queue general.q -mem perl sge_cluster_queue.pl -queue general.q -mem -s vf =cut use Getopt::Long;..."=>\$Sort, "t=s"=>\$St, ); die `pod2text $0` if ($Help); if ($Sort eq "1") { $Sort="name"; }elsif...($Sort eq "2"){ $Sort="job"; }elsif($Sort eq "3"){ $Sort="vf"; }elsif($Sort eq "4"){ $Sort
尽管去年一度被调侃为「空气币」，不过不出两个月就开始重新暴涨。...Brock也是从游戏行业起家，其创建的公司ZAM在2012年1月被腾讯收购。...同时还不用担心被税务压身。天天吵着要买币，不知道币是要交税的吧？...同时它没有挖矿的成本，不用耗费大量的人力、电力，就能够支持这种量级的交易。这样一来，用户每次交易付出的矿工费就不存在了。...有人把这种稀释看做通货膨胀，其实这与通货膨胀还是有区别的，因为通证的持有者现在还没有获利。
QtCreator不是Qt，它运行起来只需要部分Qt库，所以QtCreator能运行，根本不代表Qt所有模块已经被完整安装了。...当你打开一个之前没有打开过的Qt项目，或者新建一个Qt项目时，QtCreator都会让你选择一个套件，而默认的就是这里显示的默认套件。...问题1： 用QtCreator打开项目时提示：Unknown module(s): XXXX 原因：提示的那个Qt模块（XXXX），你电脑上没有安装。...问题2： 引用一个Qt的头文件，结果提示：No such file or directory: QXXXX.h 原因：你没有在你的项目里引入这个模块。...如果没有加入的话，也不用自己敲键盘把文件名写到列表里，直接对项目名点击鼠标右键，再点击“添加已有文件”，选择报错的文件（包括没有加入sources列表的cpp文件）。
GATK 这么难用，为什么没有被淘汰？ 尽管 GATK 存在一定的挑战，但它在变异检测方面的卓越性能以及丰富的功能和工具使得它仍然是生物信息学家的首选工具之一。
最近，我打算对我们项目的代码进行清理，准备把一些没有被使用到的公用方法清理掉，但是我在网络找了一遍，像PMD，Findbugs等静态工具，都只能找到没有被使用的私有方法。...,0:被使用了，1：没有被使用，2：无法确定 * @param path * @param className * @param codeName * @return */ public...int checkUsed(String path, String className, String codeName) throws Exception { //没有被使用 int result... int usedType = checkUsed(path, className, codeName); //没有被使用 if (usedType !... unUsedCode.type = type; //类型为属性 if (usedType == 1) { unUsedCode.descript = "没有被使用
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