我们使用纯文本写代码，有了Markdown又可以使用纯文本写文档，那么对于更直观的信息表达方式——图片，能不能使用纯文本描述呢？
kubernetes底层yaml也是这个库，但是自己又封装了 sigs.k8s.io/yaml, 再往上又定义了kustomize
俗话说：三句不离本行，对于程序员这个可爱的群体来说也是一样，即使面对无休无止的编程工作，程序员们依旧任劳任怨的埋头苦干，梦想着用自己码下的代码改变世界。
在我们编写代码的时候，我们经常需要知道两个文件之间，或者同一个文件不同版本之间有什么差异性。在 Windows 下有个很强大的工具叫作 BeyondCompare ，那在 Linux 下需要用到什么工具呢？
你也可以针对特定的路径配置某些设置项，这样 Git 就只对特定的子目录或子文件集运用它们。 这些基于路径的设置项被称为 Git 属性，可以在你的目录下的 .gitattributes 文件内进行设置（通常是你的项目的根目录）。如果不想让这些属性文件与其它文件一同提交，你也可以在 .git/info/attributes文件中进行设置。
Perl，全称为“Practical Extraction and Report Language”，是一种功能强大的编程语言，广泛应用于文本处理、系统管理、网络编程、CGI编程以及生物信息学等多个领域。其灵活性和丰富的内置功能库使得Perl成为解决复杂问题时的首选工具之一。本文旨在为初学者提供一个Perl语言入门学习的概览，包括Perl的基本语法、变量与数据类型、控制结构、函数与模块、以及如何在实践中应用Perl。
信息超负荷问题解决方案: 新的用户接口/智能代理 Lucene是一个高性能,可伸缩的信息搜索库,可以为应用程序添加索引和搜索能力. 版本: java/Perl/Python/C++/net 搜索引擎的核心是索引 搜索的质量用精确度和召回率来描述,召回率衡量系统搜索到相关文档的能力,精确度描述过滤不相关的能力
正则表达式(Regular Expression)描述字符串结构模式的形式化表达方法,正则(Regex)表达式处理的对象的字符串或者抽象地说是一个对象序列(计算机体系的本质数据结构) 正则表达式是一种文本模式包括普通字符（例如a 到 z 之间的字母）和特殊字符（称为”元字符”）,用事先定义好的一些特定字符、及这些特定字符的组合，组成一个“规则字符串”；
大家知道，通过python可以很容易实现各类数据结构，例如列表。但在bash中，实现一个列表相对来说会比较复杂。
在 Linux 中，你可以使用多种命令来统计文件的行数。以下是其中一些常用的命令：
# 包名 use Cow; Cow->speek; # 变量 my $beast = 'Cow'; $beast->speek;
Perl 是 Practical Extraction and Report Language 的缩写”实用报表提取语言”是一种功能强大功能丰富的脚本编程语言，最初的设计者为拉里·沃尔（Larry Wall）诞生于20世纪80年代末期并由他不断更新和维护的编程语言。
虽然本系列文章开篇会简单介绍正则表达式的一些基础知识，但主要限于本系列文章所想强调的要点，因此本系列文章并不适合用于入门。
相信用过htseq-count的朋友都知道，它是分开对每个样本计算所有的基因表达量，所以会生成一个个独立的文件，我用perl脚本模仿它的结果如下： $ head a.txt gene_1 178 gene_2 692 gene_3 486 gene_4 666 gene_5 395 gene_6 48 gene_7 926 gene_8 733 gene_9 660 gene_10 578 第一列是基因，第二列是该基因的counts值，共有a~z这26个样本的counts文件，需要合并成一
是什么区分开普通的Linux用户和超级极客的呢？很简单：用在学习那些使长时工作转变为一瞬间工作的技巧、诀窍、秘诀和技术上的时间。如果你想提高效率而又不用做这些搜集资料的跑腿活儿，那我们已经收集了50多条简单易学的Linux技巧，以帮助你更潇洒地工作，并且最大限度的利用你的电脑。开始享受吧！ 1：检查不是由你运行的程序 难度：高级 应用程序：bash（译注：UNIX或者LINUX的shell） 想象下这个场景-你已经准备好了要和同事在办公室里对战一局快速的Crack Attack（译注：一款免费的OpenGL
从1991年问世以来，《Perl语言编程》很快成为无可争议的Perl宝典，如今仍是这种高实用性语言的权 Wei 指南。Perl只是作为一个功能强大的文本处理工具，不过很快发展成为一种通用的编程语言，可以帮助成千上万的程序员、系统管理员，以及像你一样的技术爱好者轻松完成工作。
正则表达式萌芽于1940年代的神经生理学研究，由著名数学家Stephen Kleene第一个正式描述。具体地说，Kleene归纳了前述的神经生理学研究，在一篇题为《正则集代数》的论文中定义了“正则集”，并在其上定义了一个代数系统，并且引入了一种记号系统来描述正则集，这种记号系统被他称为“正则表达式”。在理论数学的圈子里被研究了几十年之后，1968年，后来发明了UNIX系统的Ken Thompson第一个把正则表达式用于计算机领域，开发了qed和grep两个实用文本处理工具，取得了巨大成功。在此后十几年里，一大批一流计算机科学家和黑客对正则表达式进行了密集的研究和实践。在1980年代早期，UNIX运动的两个中心贝尔实验室和加州大学伯克利分校分别围绕grep工具对正则表达式引擎进行了研究和实现。与之同时，编译器“龙书”的作者Alfred Aho开发了Egrep工具，大大扩展和增强了正则表达式的功能。此后，他又与《C程序设计语言》的作者Brian Kernighan等三人一起发明了流行的awk文本编辑语言。到了1986年，正则表达式迎来了一次飞跃。先是C语言顶级黑客Henry Spencer以源代码形式发布了一个用C语言写成的正则表达式程序库（当时还不叫open source），从而把正则表达式的奥妙带入寻常百姓家，然后是技术怪杰Larry Wall横空出世，发布了Perl语言的第一个版本。自那以后，Perl一直是正则表达式的旗手，可以说，今天正则表达式的标准和地位是由Perl塑造的。Perl 5.x发布以后，正则表达式进入了稳定成熟期，其强大能力已经征服了几乎所有主流语言平台，成为每个专业开发者都必须掌握的基本工具。
相信大家对于正则表达式都不陌生，在文本处理中或多或少的都会使用到它。但是，我们在使用linux下的文本处理工具如awk、sed等时，正则表达式的语法貌似还不一样，在awk中能正常工作的正则，在sed中总是不起作用，这是为什么呢？
简短的perl程序能够实现大功能。 perl是如何做到的呢？ 1. 默认变量 如果没有向函数提供参数值，则默认参数为$_； 如果没有变量用于接收一个表达式的值，则默认接收变量为$_。 perl语言每条语句可像管道那样运行，通过默认变量$_串接起来。 2. 特殊语法 利用一些正常情况下没有含义的语法，如while(<>){}. 如果按照正常的语法，这个定法的意义是：读取一行文本，然后丢弃。 由于正常情况下没有人会这么用，perl语言将这一语法利用起来了。在实际中写起来非常方便。 3. 变量值不用给定初值，不用提前声明 perl会自动为变量选择合适的初值，如果没有给定的话。 对于数值，初值为0；对于字符串，初值为““，也就是空字符串。 4. 对于一些常用语法的简洁写法 如通过qw定义一个字符串list,可避免写引号。 简短的好处？ 简短，再加上perl与shell结合非常好，可以在命令行上直接写出简短又功能强大的代码。 一个常用用法：
Perl是一种通用的高级开源编程语言，具有简洁易读的语法，可用于完成各种任务，从处理文本文件到语音识别。它具有出色的文本处理能力，可用于文本操作、基于正则表达式的模式匹配、原地文件编辑、日志文件分析以及将文件转换为PDF、HTML或XML格式。Perl还可用于编写通用网关接口（CGI）程序，因为它可以处理二进制文件。
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Perl是一种高效、功能强大的脚本语言，自20世纪80年代以来在系统管理、文本处理和Web开发领域得到了广泛应用。作为一门灵活且成熟的语言，Perl以其简洁的语法、丰富的模块库和强大的正则表达式支持著称。本文将详细介绍Perl的基本概念、语法特点、常用模块以及实战应用，帮助读者快速入门并掌握这门语言。
神经机器翻译（Neural Machine Translation，NMT）借助深度神经网络对不同语言的文本进行翻译，本文主要介绍机器翻译数据集WMT16 en-de的预处理过程。
准备用3-5篇文章的篇幅，将一些必备的技能cover一遍，期望对于入职IC的新同学有一些帮助。这些东西，每一项其实在网络上的介绍资源都非常丰富，但是IC新同学常常面对的问题是，并不知道“原来这个事情是这么做的”。所以，长话短说。
效率神器，搜索和快速启动的功能，以及工使用自定义插件的工作流功能。让你的效率提升N的档次。
网络爬虫是一种强大的工具，用于从互联网上收集和提取数据。Perl 作为一种功能强大的脚本语言，提供了丰富的工具和库，使得编写的爬虫程序变得简单而灵活。在使用的过程中大家会遇到一些问题，本文将通过问答方式，解答一些关于使用 Perl 脚本编写爬虫程序的常见技术问题。
主从复制模型，数据更新符合顺序性原则，即若同一字段有多个更新，则最后一个写操作将决定该字段最终值。
YAML 是 “YAML Ain’t a Markup Language”（YAML 不是一种标记语言）的递归缩写。在开发的这种语言时，YAML 的意思其实是：”Yet Another Markup Language”（仍是一种标记语言）。
1.安装依赖 yum -y install perl perl-devel libaio libaio-devel perl-Time-HiRes perl-DBD-MySQL libev-devel
多年以前，小编还在读博士的时候，实验室评选重点实验室。为了迎接教育部的检查，需要把实验室近10年发表的文章的首页都打印出来，因为首页上有作者和单位。你要知道小编的实验室是做生物信息学的，加上实验室人丁兴旺，因此相当的高产。我被分到了其中一年发表的文章，有三四十篇。
OWASPJoomla！漏洞扫描器（JoomScan）是一个开源项目，其主要目的是实现漏洞检测的自动化，以增强Joomla CMS开发的安全性。该工具基于Perl开发，能够轻松无缝地对各种Joomla项目进行漏洞扫描，其轻量化和模块化的架构能够保证扫描过程中不会留下过多的痕迹。它不仅能够检测已知漏洞，而且还能够检测到很多错误配置漏洞和管理权限漏洞等等。除此之外，OWASP JoomScan使用起来非常简单，不仅提供了非常友好的用户界面，而且还能够以HTML或文本格式导出扫描报告。
因子（factor）是R语言中许多强大运算的基础，因子的设计思想来着统计学中的名义变量（分类变量），因子可以简单的看做一个附加了更多信息的向量。
YAML 是 “YAML Ain’t a Markup Language”（YAML 不是一种标记语言）的递归缩写。在开发的这种语言时，YAML 的意思其实是：“Yet Another Markup Language”（仍是一种标记语言）。
Perl是典型的脚本语言，短小精悍，非常容易上手，尤其适合处理文本，数据，以及系统管理。它在老一辈的生物信息学分析人员中非常流行，出于历史遗留原因大家肯定会或多或少地接触 Perl，即使你再怎么推崇P
在我们的实际开发中，一般应用都部署在Linux上，为了后期方便排查bug或者记录代码执行的流程。对于开发者而言，遇到问题经常需要去看log文件（或者使用Kibana这样的工具），这里介绍几个开发常用而又重要的日志查找技巧。
摘要：从人类反馈中强化学习（RLHF）已被证明是将预训练的大型语言模型（LLM）与人类偏好相匹配的有效方法。但是，使用 RLHF 训练模型的计算成本很高，而且整个过程也很复杂。在这项工作中，我们研究的 RLHF 是使用 Hu 等人[2021]提出的参数高效的低库自适应（Low-Rank Adaptation，LoRA）方法来训练底层模型的。我们研究了 "参数高效强化学习"（PERL）的设置，其中我们使用 LoRA 进行奖励模型训练和强化学习。我们比较了 PERL 和传统微调（完全微调）在 7 个基准（包括 2 个奖励建模和强化学习的新数据集）中的不同配置。我们发现，PERL 的性能与传统的 RLHF 设置相当，同时训练速度更快，占用内存更少。这使得 RLHF 的高性能得以实现，同时减少了限制其作为大型语言模型对齐技术的采用的计算负担。我们还发布了两个新颖的向上/向下偏好数据集："Taskmaster Coffee "和 "Taskmaster Ticketing"，以促进围绕 RLHF 的研究。
为了更加方便、快捷的实现某些功能，Perl拥有很多其他的控制结构，这些结构也许不是必需的，但可以使程序更加简洁和具有逻辑性。
ed命令是文本编辑器，用于文本编辑，ed是Linux中功能最简单的文本编辑程序，一次仅能编辑一行而非全屏幕方式的操作。ed命令并不是一个常用的命令，一般使用比较多的是vi指令，但ed文本编辑器对于编辑大文件或对于在shell脚本程序中进行文本编辑很有用。如果使用文件名参数调用ed，则文件的副本将被读入编辑器的缓冲区，对该副本进行更改，而不是直接对文件本身进行更改。退出ed后，任何未使用w命令显式保存的更改都将丢失。编辑有两种不同的模式：命令和输入。第一次调用时，ed处于命令模式，在这种模式下，命令从标准输入中读取并执行以操作编辑器缓冲区的内容。
在宏基因组分析流程的开始阶段，首要任务是检查原始测序数据的质量。这一步包括对数据的完整性、文件格式、序列长度、测序质量（如Q值、GC含量等）以及潜在的测序错误或污染进行初步评估。通过这一步，研究人员可以确保后续分析的准确性和可靠性。
发布者：全栈程序员栈长，转载请注明出处：https://javaforall.cn/138429.html原文链接：https://javaforall.cn
Perl是一种动态的，高级的、通用的编程语言，它没有任何官方缩写。它是纯粹使用C编程语言开发和实现的；它支持跨平台操作系统；它是根据GNU通用公共许可证授权的。它具有不同的文件扩展名，如.pm，.pl，.pod，.t等。它具有灵活性和强大的功能，可用于许多应用程序。
前两篇介绍了4种靶基因预测软件的下载与安装，以及数据的准备过程。本篇将正式开始进行靶基因的预测, 并对4种个软件的结果进行整理,最终得到4软件结果的交集。
扩展 awk 中使用外部shell变量http://ask.apelearn.com/question/199 命令示例：A=44echo "ABCD" | awk -v GET_A=$A '{print GET_A}'
Perl5是一种全功能的编程语言。它用于所有类型的生产项目，包括世界各地的商业业务系统。Perlbrew是Perl5的安装和版本切换工具，您可以安装，删除，并在之间切换Perl版本。
正则表达式语言由两种基本字符类型组成：原义文本字符和元字符（metacharacter）。原义文本字符也即要匹配的实际文本字符或者空格，而元字符是一个或一组代替一个或多个字符的字符，可以用来进行模糊匹配。常用的元字符及其表达式的含义如下表所示：
正则表达式的分类 基本正则表达式（Basic Regular Expression 又叫 Basic RegEx 简称 BREs） 扩展正则表达式（Extended Regular Expression 又叫 Extended RegEx 简称 EREs） Perl正则表达式（Perl Regular Expression 又叫 Perl RegEx 简称 PREs） [www] grep,egrep正则表达式 grep支持BREs,EREs,PREs grep后面不跟任何参数,则表示使用BREs gre
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