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如何随意截断ggplot2图像的y轴?

gg.gap诞生记 “站长,小站工具qPCR在线分析功能非常好,但有些基因的表达量太高了,图做出来值非常大,能否想prism那样把y轴做个截断呢?”...面对的疑问,站长最开始并没有想到去开发一个R包解决。 ggplot2以及依赖它开发的包已经丰富,原以为在网络搜索一下肯定有解决方案,但谁曾想这样的需求真的没有找到完美的解决方案。...不管三七二一,画个草图先: 思路很简单,就是先按照y轴切,然后用cowplot去拼接。...一顿野路子代码操作,beta版出来了:gg1gap和gg2gap这两个包只能完成bar图y轴切割,而截断数最多也就只能两段。...小站VIP群中的树神(微信ID:一棵树)精通R包制作,为了让野路子出来的代码更完善,拉上树神一起干,不仅实现截取多个截断,还可以对任意ggplot2对象进行截断,再不断测试修补bug之后,gg.gap终于在今天这个有意义的日子正式上线

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    小站R包gg.gap正式上线CRAN|随意截断ggplot2图像的y轴~

    gg.gap诞生记 “站长,小站工具qPCR在线分析功能非常好,但有些基因的表达量太高了,图做出来值非常大,能否想prism那样把y轴做个截断呢?”...面对的疑问,站长最开始并没有想到去开发一个R包解决。 ggplot2以及依赖它开发的包已经丰富,原以为在网络搜索一下肯定有解决方案,但谁曾想这样的需求真的没有找到完美的解决方案。...不管三七二一,画个草图先: 思路很简单,就是先按照y轴切,然后用cowplot去拼接。...一顿野路子代码操作,beta版出来了:gg1gap和gg2gap这两个包只能完成bar图y轴切割,而截断数最多也就只能两段。...小站VIP群中的树神(微信ID:一棵树)精通R包制作,为了让野路子出来的代码更完善,拉上树神一起干,不仅实现截取多个截断,还可以对任意ggplot2对象进行截断,再不断测试修补bug之后,gg.gap终于在今天这个有意义的日子正式上线

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    R语言ggplot2作图的时候给坐标轴添加文本π

    image.png 今天用ggplot2作图y轴的标题想实现上图红框里的形式,查了一下如何实现 记录一下代码 首先是构造一份数据集 dfy=1) R语言ggplot2...散点图并添加文本 library(extrafont) fonts() library(ggplot2) ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_text(label=...www.rapidtables.com/code/text/unicode-characters.html 查看 设置横坐标的标题 library(ggstar) ggplot(data=df,aes(x=x,y=...y))+ geom_text(label="\u03c0",size=30, family="Times New Roman", fontface="...小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子;2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记;3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记

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    R tips:调整ggplot2的坐标轴或legend的label长度

    但是使用clusterProfiler包进行富集分析并绘图有时会遇到一个情况:一个富集分析的Terms的长度太长,会导致图片的轴标题或者legend很长,就会压缩了主绘图区域的显示。...由于dotplot绘图的图像是一个ggplot2对象,其实使用scale系列函数就可以达到目的。...对y轴标题进行操作,则使用scale_y系列函数,由于y是离散变量,因此使用scale_y_discrete函数,相应的如果y轴是连续变量,比如此时的x轴,就使用scale_x_continuous函数调整...有的时候,ggplot2图是经过坐标轴变换的,如使用coord_flip进行x、y轴反转。此时竖直的坐标轴实际上是x轴,需要使用scale_x系列函数控制。...= TRUE) 这个图直接使用scale_color_discrete进行修改是不会有任何改变的,因为这个图的color映射并不是ggplot2的默认情况,而是使用ggraph的geom_edge

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    R语言ggplot2画柱形图展示GO富集分析结果—给坐标轴文本添加框线

    image.png 有朋友问到这个GO富集分析的柱形图坐标轴文本的框线是怎么实现的。...我目前的思路是用geom_text()函数添加文本代替原来的坐标轴文本,然后用geom_rect()函数添加矩形框线。...(这个框线是一个平行四边形,geom_rect()函数画的是矩形,如果要画平行四边形可以借助geom_polygon()这个函数实现,但是平行四边形四个顶点的的坐标不太好确定)整体试下来虽然能够实现,但稍显麻烦...今天的推文介绍一下自己尝试的代码,如果目的是学习ggplot2可以尝试一下,如果目的是着急要出图结果,还是建议不添加框线,然后借助其他编辑图的工具去添加框线。...",vjust=-1) 最后出图 image.png 但是这个有一个问题是:如果改变图片的长和宽的话,框线和文本的位置就会乱掉,暂时想不到原因是啥了;这里还有一个问题是怎么给文本的长度设定一个阈值

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    如何通过R语言制作BBC风格的精美图片

    在BBC数据团队开发了一个R包,以ggplot2内部风格创建可发布出版物的图形,并且使新手更容易到R创建图形。 例如: ? 加载所有所需的R语言包 通常在R中创建图表需要安装和加载某些软件包。...更改轴 翻转图的坐标 添加coord_flip()使垂直分布变为水平: bars <- bars + coord_flip() ? 添加/删除网格线 默认主题的y轴具有网格线。...(类似地,通过panel.grid.major.y = element_blank()删除y轴上的网格线) bars <- bars + coord_flip() + theme(panel.grid.major.x...在轴标签中添加千位分隔符 可以指定轴文本具有千位分隔符,并带有scale_y_continuous的参数。...例如,如果要创建带有很多条形图的条形图,并要确保每个条形图和标签之间有一定的呼吸空间,则可能是这种情况。 如果您确实保留了较大高度图的边距,那么轴和标签之间的间隙可能会更大。

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    使用R语言ggplot2包绘制SCI论文配图密度散点图

    最近有一位小伙伴要发SCI论文,给我发了3w多条数据,问我可不可以画和下图基本相似的图。大家都知道论文的发表除了实验和数据以外,图片也非常重要。一般图画的越好,那么论文发表的问题也不大。...本次绘图所使用的R包:ggplot2和ggpointdensity ggplot2是R语言绘制图形一个十分重要也是非常基础的一个包,使用ggplot2再加上R自带的base画图基本可以完成所有图形的绘制...aod, y=pm25))+ geom_pointdensity(adjust=0.1,show.legend = TRUE) 得到基本图像: 5.接下来我们来美化图像 5.1.我们发现x和y轴不重叠...,我们使用这行代码来解决 scale_y_continuous(expand = c(0,0))+ #刻画x轴 scale_x_continuous(expand = c(0,0))+#刻画y...","#FF0000","red","darkred"))+ 得到下面的图像: 5.3为图像加上线性回归和对角线 geom_smooth(method = "lm",formula = y~x,color

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    Day7:R语言课程 (R语言进行数据可视化)

    映射的例子包括: 位置(即在x和y轴上) 颜色(“外部”颜色) 填充(“内部”颜色) 形状(点数) 线型 尺寸 首先,必须添加x轴和y轴的位置,因为geom_point需要有关散点图的最基本信息,即要在...x和y轴上绘制的内容。...ggscatter4 x轴和y轴上的标签也很小,难以阅读。要更改其大小,需要添加其他主题图层。...添加图层xlab()和ylab(),改变x轴和y轴的标签。将这些图层添加到当前图中,x轴标记为“年龄(天)”,y轴标记为“平均表达量”。 使用ggtitle图层为绘图添加标题。...以与更改轴文本大小相同的方式更改绘图标题的大小,使用plot.title。 提示:使用fill映射来观察每种基因型中细胞类型之间样本均值的差异。 最终图片看起来应该如下所示。 ?

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    R for data science (第一章) ②

    Genometric Objects 两个图包含相同的x变量,相同的y变量,并且都描述相同的数据。 但情节并不完全相同。 每个图使用不同的可视对象来表示数据。...ggplot2中的每个geom函数都有一个mapping参数。 然而,并非每一种aesthetic都适用于每个几何。 您可以设置点的形状,但无法设置线的“形状”。 另一方面,您可以设置线的线型。...geom_smooth()将为您映射到linetype的变量的每个唯一值绘制一个不同的线型,具有不同的线型。...在这里,geom_smooth()根据他们的drv值将汽车分成三行,描述汽车的动力传动系统。 一行描述具有4值的点,一行描述具有f值的点,并且一行描述具有r值的点。...image.png 然而,这在我们的代码中引入了一些重复。 想象一下,如果你想改变y轴来显示cty而不是hwy。 您需要在两个位置更改变量,并且可能忘记更新一个变量。

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    数据视化的三大绘图系统概述:base、lattice和ggplot2

    数据可视化是数据分析过程中探索性分析的一部分内容,可以直观展示数据集数据所具有的的特征和关联关系等。...R语言不仅提供了基本的可视化系统graphics包,简单的图+修饰,例如:plot、 hist(条形图)、 boxplot(箱图)、 points 、 lines、 text、title 、axis(坐标轴...Split/position 数值型向量,在一页上绘制多幅图形 Type 字符型向量,设定一个或多个散点图的绘图参数,(如p=点,l=线,r=回归,smooth=平滑曲线,g=格点) xlab/ylab...(v=mean(x),h=mean(y), lty=2) # 加线,v是水平线,h是竖直线,线类型为2, panel.lmline(x,y,col="red") # 加线性回归线,...= FALSE) #在相同画布上打印graph2 ?

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    ggplot2--R语言宏基因组学统计分析(第四章)笔记

    然而,图形语法的翻译在ggplot2中没有对应关系(它的作用是由内置的R功能发挥的)。...因为即使我们使用了许多缺省值,ggplot2的显式语法语法也相当冗长,这使得快速尝试不同的绘图变得困难。它还模仿plot()函数的语法,使ggplot2对于熟悉Base R图形的用户更容易使用。...因为到目前为止,我们只告诉gglot()应该使用什么数据集,以及应该为x、y轴和颜色使用哪些列。但是我们还没有明确要求它画任何点或者一条线。...4.3.3.3 使用坐标系统来调节和限制X轴和Y轴 坐标系的用途是在计算机屏幕上调整从坐标到二维平面的映射。在ggplot2中可用的不同坐标系中,笛卡尔坐标系和极坐标系是最常用的坐标系。...函数按行拆分具有方向的绘图。公式也可以是.~y,用于按列拆分绘图;实现facet_grid(.~y)函数可以按列拆分具有方向的绘图。我们举例说明了facet_grid(x~.)。

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    ggplot2包图形参数(坐标轴、分面、配色)整理

    R具有强大的统计计算功能和便捷的数据可视化系统。目前R主要支持四套图形系统:基础图形(base)、网格图形(grid)、lattice图形和ggplot2。...其中ggplot2凭借强大的语法特性和优雅的图形外观,逐渐成为R中数据可视化的主流选择。...书中绝大多数的绘图案例都是以强大、灵活制图而著称的R包ggplot2实现的,充分展现了ggplot2生动、翔实的一面。...本文根据《R数据可视化手册》整理ggplot2包的图形参数(图形外观、注解、图例、坐标轴、分面、配色)。...y轴网格线,仅对连续型坐标轴有效 4.6.2 设置刻度线位置 调整参数breaks可以修改刻度线的位置 scale_y_continuous(breaks=c(4, 5, 6, 7,8)) # x轴同理

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    R语言ggplot2分组箱线图添加误差线的简单小例子

    ggplot2 更改图例的顺序 箱线图添加误差线这个自己老是记不住,每次作图都得现查,今天的推文记录一下实现代码,方便自己以后查看。...value,fill=Species))+ geom_boxplot() image.png 添加误差线 这里使用到的是stat_boxplot()函数 ggplot(data = dfa,...width=0.3) image.png 这样多了一个垂直线,不好看,我们把误差线的图层放到最下层,就是把代码写到boxplot的前面,然后加一些基本的美化 ggplot(data = dfa,...如果不加这两个参数,效果如下 image.png 这里还有一个疑问是 箱线图中间的线好像是中位数,如何把这个线更改为平均值呢?...暂时没有想明白 今天推文的示例数据和代码可以直接留言20210929获取 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子

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    R语言ggplot2做箱线图的时候如何添加表示平均值的线

    箱线图展示的就是分位数,中间的线表示的是中位数,也就是50%分位数,如果非要在箱线图上画上表示平均值的线段也是可以实现的,今天介绍一下实现代码 示例数据集我们用R语言的内置数据集PlantGrowth...image.png 首先是画一个最普通的箱线图 df<-read.csv("PlantGrowth.csv") library(ggplot2) library(tidyverse) p1<-ggplot...(data=df, aes(x=group,y=weight))+ geom_boxplot(aes(fill=group)) p1 image.png 通过ggplot_build...yend=mean_value), color="red") image.png 这里如果不想要中位数的线的话 找到一种办法是重新画一条线把原来的中位数的线给盖住...欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子;2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记

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