想象有一张空白的画布，在画布上我们需要定义可视化的数据（data），以及数据变量到图形属性的映射（mapping）。 下面使用数据集 mtcars 作图。...( )保存图形 函数 ggsave( )专门用于保存 ggplot2 包绘制的图形，该函数可以导出多种不同格式的图片。...上面的命令先创建了一幅散点图并把结果保存为 p，然后用函数 ggsave( )分别把这幅图形保存为 png 和 pdf 格式的文件。...例如，把上面的图形对象 p 保存为 tiff 格式，并设置图片的长和宽分别为 12cm 和 15cm，分辨率为 500 dpi，代码如下： ggsave("myplot.tiff", width = 15...2.2 横向堆栈条形图 在做流行病学调查时，经常需要在问卷上设置很多选择题。对于一组问题，可以使用 sjPlot 包里的函数 plot_stackfrq( ) 对不同选项的比例进行可视化。
熟悉 R 绘图的朋友肯定知道，在普通绘图中，图片的大小可以直接在 png() 和 pdf() 中指定，而绘图区大小则可以用 par() 中的 mar 或 mai 来指定。...factor(cyl))) + guides(color=F) p <- p + theme_solarized(light=FALSE) + scale_colour_solarized('blue') ggsave...theme_solarized(light=FALSE) + scale_colour_solarized('blue') p <- p + theme(plot.margin=unit(rep(1,4),'cm')) ggsave...theme_solarized(light=FALSE) + scale_colour_solarized('blue') p <- p + theme(plot.margin=unit(rep(3,4),'cm')) ggsave...，从而在图片上留出更多空白区域。
请返回他们的全名，电子邮件，头衔和简述。 在本教程中，我们将讨论如何在Ubuntu 16.04上安装和配置OpenLDAP服务器。...准备 在开始本教程之前，您应该使用Apache和PHP设置Ubuntu 16.04服务器。...但我们不应该设置phpLDAPadmin页面为可公开访问。 我们最后调整控制某些phpLDAPadmin警告消息的可见性的设置。默认情况下，应用程序将显示有关模板文件的大量警告消息。...请务必将您的域名替换为以下高亮显示的区域： https://example.com/phpldapadmin 加载phpLDAPadmin登录页面。单击页面左侧菜单中的Login链接。...我们还在两台服务器上设置了SSL加密。我们设置的系统非常灵活，您可以根据需要设计自己的组织架构并管理资源组。感谢你的阅读，更多Linux教程请前往腾讯云+社区学习更多知识。
首先利用线性变换，将数据变换到一个新的坐标系统中；然后再利用降维的思想，使得任何数据投影的第一大方差在第一个坐标(称为第一主成分)上，第二大方差在第二个坐标(第二主成分)上。...legend，但是 units = 'cm', width = 8, height = 6 就可以调整为适合浏览的 # ggsave('.....这里应该使用AI或者PS直接进行拼图。 我下面展示第二种方案：借助ggforce这个包里的facet_zoom()函数。不过还是原文有些出入，我还是很喜欢R语言+AI美化，这才是王道！...# install.packages("ggforce") library(ggforce) # 通过xy设置聚焦区域 plt+facet_zoom(y=pcaScores$PC2上是散点图的PCA图仍然是不够美观，其实仅仅是因为分辨率问题，调整输出的pdf大小和像素即可
它的主要功能包括以下三个方面： 映射变量：aes()函数可以将数据框中的列名或变量名映射到图形属性上，例如将x和y变量映射到点图的x轴和y轴上，或将fill变量映射到柱状图的填充颜色上。...ggplot ggpubr的画图可以赋值给变量 可以用于图上加p值 p <- ggboxplot() my_comparisons <- list() ggplot2::ggsave 图片保存 ggsave...dev.off() dev.new() dev.off()是一个用于关闭图形设备的函数。在R中，我们可以使用不同的图形设备来绘制图形，例如屏幕、PDF文件、PNG图像等。...切换图形设备：在R中，可以使用pdf()、png()、jpeg()等函数打开多个图形设备。使用dev.off()函数可以切换到之前开设的某个设备上，以便继续在该设备上进行图形绘制。...需要注意的是，在使用dev.off()函数关闭图形设备之后，如果还需要绘制图形，就需要重新打开一个新的图形设备。否则，所有的图形绘制将会输出到同一个设备中，可能导致图形重叠或其他问题。
上一次介绍了Python绘制svg的优秀可视化库Pygal，今天我们介绍一下一个优秀的R地图可视化绘制包-linemap包，顾名思义，该包是是为了绘制由线组成的地图，其官网如下：https://github.com...linemap()函数属性介绍 我们使用help(linemap)就可以获取该函数的介绍及用法，如下： help(linemap) Arguments:(设置参数) x :a data.frame,...总结 本期我们介绍一个用于绘制线地图的R可视化包，需要注意的是，这里保存图片都是基础R的方法，没有使用我们熟悉额ggsave()保存,主要代码如下: pdf("linemap_01.pdf") # 保存高分辨率的...ggsave#()相同的效果。...，大家也可以尝试下使用R基本函数保存图片哦~~
在Windows上：Shift + Alt + F 在Mac上：Shift + Option + F 在Ubuntu上：Ctrl + Shift + I 修剪行首尾空白 此命令消除开头和结尾的多余空白，...提示：在编辑完代码后使用这个。 或者，你可以在设置中启用空白剪除（white-space trimming）。 1 打开VS用户设置（偏好>设置>用户设置选项卡） 2 点击窗口右上方的{}图标。...4 保存用户设置文件 或者，如果你使用的是新版本，请按照设置1进行操作，然后查看下图。 ? 代码折叠 有时，如果文件很大，而你只是想大概浏览代码，则需要代码折叠。 ?...1 折叠光标处最内层的未折叠区域： 在Windows / Ubuntu上：Ctrl + Shift + [ 在Mac上：Command + Option + [ 2 展开显示光标处的折叠区域： 在Windows...网格编辑器布局 默认情况下，编辑器组在垂直列排列（例如，当你拆分一个编辑器以将其打开到侧面时）。你可以轻松按自己喜欢的任何布局在垂直和水平方向上排列编辑器组： ?
左边query数据集的一个锚点细胞能在reference数据集邻近区域找到多个配对锚点细胞，可以得到更高的锚点可靠性评分；右边一个锚点细胞只能在reference数据集邻近区域找到一个配对锚点细胞，锚点可靠性评分则较低...') dir.create('cluster2') dir.create('cluster3') set.seed(123) #设置随机数种子，使结果可重复 ##==合并数据集==## ##使用目录向量合并...数据集整合 #scRNAlist是之前代码运行保存好的seurat对象列表，保存了10个样本的独立数据 #数据整合之前要对每个样本的seurat对象进行数据标准化和选择高变基因 for (i in 1:...", plot = pearplot, width = 12, height = 5) ##设置质控标准 print(c("请输入允许基因数和核糖体比例，示例如下：", "minGene=500",...我们后续分析采用左图鉴定的结果 获取帮助 本教程的目的在于把常用的单细胞分析流程串起来，适合有一定R语言基础的朋友参考。
vim 编辑器 Linux：使用文本文件来保存配置信息 文本编辑器：ASCII文件 emacs vi vi：Visual Interface（纯字符界面的编辑器） 全屏文本编辑,nano 模式化的编辑器...i：当前光标处输入内容 I:在当前光标所在行的行首 a：在当前光标所在处的后面 A:在当前光标所在行的行尾输入 o：在光标所在行的下方新增一行空白行 O:在光标所在行的上方新增一行空白行...r：替换光标所在处的字符 d:删除命令 结果光标跳转命令使用 d^ 光标删除至行首 d$ 光标删除至行尾（shift+d） %:全部 dd：删除一行 #dd：删除所在行后的...keyword n：往下翻查找的结果 N：往上翻查找的结果 支持正则表达式 vim的可视化模式 编辑模式： v:按照光标走过的区域选择 V：选择矩形行 vim可视化模式： v: 按光标走过的区域选择...： :set nu 输出行号 :set nonu :set ai 自动缩进(其他发行版本） :set shiftwidth=4 设置自动缩进空格数为4（ubuntu系统） :set softabstop
vi 编辑器 Linux：使用文本文件来保存配置文件 文本编辑器：ASCII文件 emacs vi vi：Visual Interface（纯字符界面的编辑器） 全屏文本编辑,nano 模式化的编辑器...i：当前光标处输入内容 I:在当前光标所在行的行首 a：在当前光标所在处的后面 A:在当前光标所在行的行尾输入 o：在光标所在行的下方新增一行空白行 O:在光标所在行的上方新增一行空白行...r：替换光标所在处的字符 d:删除命令 结果光标跳转命令使用 d^ 光标删除至行首 d$ 光标删除至行尾（shift+d） %:全部 dd：删除一行 #dd：删除所在行后的...keyword n：往下翻查找的结果 N：往上翻查找的结果 支持正则表达式 vim的可视化模式 编辑模式： v:按照光标走过的区域选择 V：选择矩形行 vim可视化模式： v: 按光标走过的区域选择...： :set nu 输出行号 :set nonu :set ai 自动缩进(其他发行版本） :set shiftwidth=4 设置自动缩进空格数为4（ubuntu系统） :set softabstop
准备 一台已经设置好可以使用sudo命令的非root账号的Ubuntu服务器，并且已开启防火墙。...对于我们的示例，我们将使用腾讯云DNS。 如果域（也称为区域）记录尚不存在，请立即创建一个。该主机名应该是你的域名，例如example.com，与IP地址应设置为您的Apache服务器的公网IP地址。...在Ubuntu上，默认配置文件位于/etc/apache2/sites-enabled/000-default.conf，所以我们将在我们的示例中使用它： sudo vi /etc/apache2/sites-enabled...} ^www\.(.*)$ [NC] RewriteRule ^(.*)$ http://%1/$1 [R=301,L] 保存并退出。...%{HTTP_HOST}/$1 [R=301,L] 保存并退出。变更应立即生效。请注意，如果您使用的是HTTPS，则应将该RewriteRule行中的“http”更新为“https”。
1.1 常用可视化R包和函数作图：base, ggplot2, ggpubr拼图：par里的mfrow, grid.arrange, cowplot, patchwork导出：经典三段论、ggsave、...，即comparisons比较的参数2 图片保存2.1 ggplot2系列：ggsave("iris_box_ggpubr.png")ggsave(p,filename = "iris_box_ggpubr2....png")#已赋值可使用绝对路径进行保存，但是更换设备无法从该路径进行导入绝对路径：按照储存路径各级文件夹进行溯源相对路径：”../...../“ggsave(p,filename = "fig/iris_box_ggpubr2.png")#保存至工作目录下的fig文件夹，若不存在该fig文件夹可新建文件夹。...2.2 通用：三段论pdf("test.pdf")#保存的函数及文件名...
本系列内容来自github上面超级火爆的R语言可视化项目：tidyTuesday。是学习R语言数据分析和可视化极好的素材。...---- Tidy Tuesday 在 GitHub 上的传送地址：Thomas Mock (2022)....设置工作路径 wkdir R_workdir/TidyTuesday/2018/2018-04-09_NFL_Positional_Salaries/src-d' setwd...加载 R 包 library(tidyverse) library(ggbeeswarm) library(showtext) # 在 Ubuntu 系统上测试的, 不加这个我画出来的汉字会乱码 ~ showtext_auto...保存图片到 PDF 和 PNG gg 1 在这里插入图片描述 filename = '20180409-D-01' ggsave(filename = paste0(filename, ".pdf"
通过这张图可以看出，很多因子能与面部特征一一对应起来，例如鼻子、眼睛、嘴巴都能找到相应的因子。...NMF在单细胞研究中的优势 单细胞研究避免不了要回答两个问题：组织中有哪些细胞类型，每个细胞类型又有哪些表达模式？NMF解决这类问题具有天然的优势，因为它分解的因子很容易与细胞类型或表达模式对应起来。...替代办法是使用经验或先验知识指定，可以尝试略多于细胞类型或细胞状态（细胞亚群再聚类时）的一个数值，例如我在本帖的PBMC数据分解中就指定为rank=10。...为了减少seed的影响求得最优解，常规的办法是通过nrun参数设置运行100-200次矩阵分解选取最优值，也可以使用特殊的算法选择一个最佳的seed（设置seed='nndsvd'或seed='ica'...细胞在因子上的值 ? 细胞在PC轴上的值 ? 对比上下两张图，很容易发现NMF的因子比PCA的PC轴解释性更强。
ubuntu修改文件权限问题解决 当笔者使用ubuntu系统自带的火狐浏览器，尝试访问本地inis博客前端网站时，浏览器页面却显示“此网址使用了一个通常用于网络浏览以外目的的端口。...对于这个问题的解决，可以在浏览器地址栏输入“about:config”，打开浏览器底层设置页面。...要在ubuntu系统上安装cpolar，可以使用简便的一键安装脚本进行安装。...此时这个地址没有连接本地的软件输出端口，因此可以看做是一条空白的数据隧道。 在预留页面，我们可以保留使用多种协议的数据隧道，这里我们选择“保留二级子域名”栏位。...2.3.Cpolar稳定隧道（本地设置） 完成cpolar云端的设置，并保留了空白数据隧道后，我们回到本地的cpolar客户端，将云端生成的空白数据隧道与本地的测试页面连接起来。
从本周开始会每周推送1~2次高质量R可视化内容，本系列内容来自github上面超级火爆的R语言可视化项目：tidyTuesday。...tidyTuesday每周更新数据，大佬们会使用这些数据集自由创作出各种高质量的R语言可视化作品，是学习R语言数据分析和可视化极好的素材。...Tidy Tuesday 在 GitHub 上的传送地址：Thomas Mock (2022)....# 在 Ubuntu 系统上测试的, 不加这个我画出来的汉字会乱码 ~ showtext_auto() 4....保存图片到 PDF 和 PNG gg albert = '20180402-A-01' ggsave(filename = paste0(albert, ".pdf"), width = 8.6,
此时我们在ubuntu的浏览器地址栏输入设置好的tipask网站地址，就能进入tipask网站设置页面。我们继续根据网站显示页面的提示，进行具体的网站设置工作。...1.3 cpolar的安装和注册 完成网页的部署后，就可以转入cpolar的安装。想要在ubuntu系统上安装cpolar，可以使用简便的一键安装脚本进行安装。...此时这个地址没有连接本地的软件输出端口，因此可以看做是一条空白的数据隧道。 在预留页面，我们可以保留使用多种协议的数据隧道，这里我们选择“保留二级子域名”栏位。...在“保留二级子域名”栏位，需要进行几项信息的简单设置，即“地区”（服务器所在区域，就近选择即可）、“二级域名”（会最终出现在生成的公共互联网地址中，作为网络地址的标识之一）和“描述”（可以看做这条数据隧道的描述...2.3 Cpolar稳定隧道（本地设置） 完成cpolar云端的设置，并保留了空白数据隧道后，我们回到本地的cpolar客户端，将云端生成的空白数据隧道与本地的测试页面连接起来。
为了方便起见，笔者在ubuntu系统上安装了宝塔面板，方便快速安装和设置网站运行所需的各种程序。...此时我们在ubuntu的浏览器地址栏输入设置好的hadsky网站地址，就能看到haddsky的设置页面。我们继续根据网站显示页面的提示，进行具体的网站设置工作。...想要在ubuntu系统上安装cpolar，可以使用简便的一键安装脚本进行安装。...此时这个地址没有连接本地的软件输出端口，因此可以看做是一条空白的数据隧道。 在预留页面，我们可以保留使用多种协议的数据隧道，这里我们选择“保留二级子域名”栏位。...2.3 Cpolar稳定隧道（本地设置） 完成cpolar云端的设置，并保留了空白数据隧道后，我们回到本地的cpolar客户端，将云端生成的空白数据隧道与本地的测试页面连接起来。
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