学完R语言的基本操作后,我们还可以继续学习R的几大著名而且使用强大的包,今天讲其中的一个,就是ggplot2,至于这个包的评价和地位,我就不多说了,感兴趣可以百度,它绝对是数据可视化的利器,好了,我们先来开始简单介绍一下这个包...先说说我们人手工作图的方式,1,先画一个坐标轴,2,然后根据数据在图上画图形3,在基础的图形上加一些注释,或加一些对比.基本上这就是我们作图的方式,那么ggplot2就跟这差不多了,1.先设定坐标轴和数据...(pressure, aes(x=temperature, y=pressure)) + geom_line() + geom_point() #绘制点线图,相当于图层一个个叠加上去 2.画条形图 基础绘图系统...:barplot(BOD$demand, names.arg=BOD$Time) #当变量为数值型,绘制条形图 barplot(table(mtcars$cyl))...ggplot(mtcars, aes(x=factor(cyl))) + geom_bar() #当变量为因子型,绘制频数条形图,而且不用指定y 3.画直方图 基础绘图系统: hist(mtcars$mpg
本教程介绍如何使用R软件和ggplot2包创建带有误差棒的图形。...使用三种剂量水平的维生素C（0.5mg,1mg和2 mg）和两种递送方法[橙汁（OJ）或抗坏血酸（VC）]中的每一种： > library(ggplot2) > df <- ToothGrowth >...标准差用于绘制图形上的误差线。首先，使用下面的辅助函数将用于计算每组感兴趣变量的均值和标准差。...groupnames=c("supp", "dose")) # Convert dose to a factor variable df2$dose=as.factor(df2$dose) head(df2) 向条形图添加误差线...函数geom_errorbar（）可用于生成误差棒： library(ggplot2) # Default bar plot p<- ggplot(df2, aes(x=dose, y=len, fill
ggplot2 Extension 转自：生信宝典(Bio_Data)，不一样的生信学习平台。 “ ggplot2自从2007年推出以来，成为世界范围内下载最频繁、使用最广泛的R包之一。...，尤其是适用于杂志期刊等出版物的图形，对于那些没有深入了解ggplot2的人来说就有点困难了，而ggpubr可轻松绘制出符合出版物要求的图形。...www.rdocumentation.org/packages/ggmap 简介：ggmap包整合了四种地图资源，分别是Google、OpenStreetMaps、Stamen，它使gplot2的所有geoms都可以用于地图可视化，可以在地图上绘制等高线图或散点图...可以使用GGally快速绘制模型的系数，或者在地图上绘制网络，如下面的图片所示。 ?...条形图、散点图、方框图、地图等，并在悬停时显示数据信息(例如数据值或标签)，如下图所示。
5.8 ggplot2简介 5.8.1 什么是ggplot2 ggplot2是由Hadley Wickham设计的R软件包，它有助于数据绘图。在本实验中，我们将简要介绍该软件包的一些功能。...5.8.2 ggplot2的原理 如果要使用ggplot2绘制数据，则数据必须是数据框。 使用aes映射函数来指定数据框中的变量如何映射到图上的要素 使用geoms来指定数据在图表中的表示方式，例如。...散点图，条形图，箱形图等。 5.8.3 使用aes映射功能 该aes函数指定数据框中的变量如何映射到绘图上的要素。...现在我们已经解决了这个问题，我们更容易在一个图上绘制来自所有10个细胞的数据。 ggplot(counts,aes(x=Cell_ID, y=Counts)) + geom_boxplot() ?...任务3：使用更新的counts数据框绘制条形图，其中Cell_ID为x变量，Counts为y变量。提示：您可能会发现阅读很有帮助?geom_bar。
第一部分：点图 在R语言里我们可以利用dotchart(x, labels=, groups=, gcolor=, cex=)函数来绘制点图，参数x是一组数值型向量，labels这个参数则是代表x中每个值的标签...在这里我们仍将使用R内置的mtcars数据集来演示。...第二部分：条形图 在R中我们可以使用barplot(height)函数来绘制条形图，这里height可以是一个向量或者矩阵。如果是一个向量的话，则它的值就决定了每一个条带的高度。...这个图上横坐标指的是挡数，每一个条带均按照发动机类型切割成两部分。因此上述条形图生动展示出不同挡数的汽车数目，并揭示各个挡数内发动机类型的占比情况。...条形图的绘制不必非得是计数或者频数类数据。你可以使用均值、中位数和标准差等来绘制条形图，将aggregate()函数的结果传递到条形图barplot()里。 2.
： library(readxl) Bar <- read_excel("Bar.xlsx", col_types = c("text", "text", "numeric")) library(ggplot2...绘制图形 先打开图形设备，然后将绘图代码放在showtext_begin()和showtext_end()之间。...从图上可以看出指定字体已经成功输出到图上了。...showtext包 在R中使用基本字体以外的字体并不是一件简单的事情，特别是PDF图形设备中，而showtext包就可以使我们更轻松的使用其他字体。...建议在原始R控制台中运行代码。 如果想在RStudio中运行代码则手动打开图形设备，如x11()和windows()。
p=22537 在本文我们在ggplot2中制作的饼实际上是一个条形图转换为极坐标。如果我们想制作一个像上面截图那样的地图，这就很困难了。 相关视频 但在地图上绘制饼图时，它也有自己的缺点。...首先，当我们绘制大量的饼图时，它以光栅图像的形式渲染，使得它的渲染速度很慢。 本文创建了一个封装函数，使其更容易绘制一组饼图。 例如，假设我们有以下数据。...set.seed(123) long <- rnorm(50, sd=100) lat <- rnorm(50, sd=50) 在地图上绘制饼图。...ggplot(map_data('world'), aes(long, lat) +pie(aes(x=long, y=lat, group=region, r=radius 这是一个简单应用，我发现很多人喜欢它
第一层次降维聚类分群后简单的统计了一下每个单细胞亚群的数量，绘制条形图如下所示： 就很迷惑，8个单细胞亚群为什么就使用了4个颜色呢？...R语言配色大全 我比较喜欢下面的4个r包，简单快捷： RColorBrewer 由Cynthia A....ggsci ggsci（ggplot2 scientific）包允许用户在ggplot2的绘图中使用科学期刊的颜色方案，如《Nature》、《Science》等。...以下是使用R语言和ggplot2包绘制一个简单的条形图的示例代码，并测试上面提到的四个R包（RColorBrewer、ggsci、randomcoloR 和 paletteer）的配色功能。...= c(23, 45, 32, 50, 18, 27, 42, 55) ) 接下来，我们将使用不同的颜色方案来绘制条形图。
比如对于正态分布，就是以标准正态分布的分位数为横坐标，样本值为欸纵坐标的单点图，如果Q-Q图上的点近似在一条直线附近，则说名样本服从正太分布，而且该直线的斜率为标准差，截距为均值。...P-P图：是根据变量的累积比例与指定分布的累计比例之间的关系绘制的图形。通过P-P图可以检验数据是否符合指定的分布，当符合是，图中各点近似的呈现一条直线。...通过R自带的函数画Q-Q图 > x <- rnorm(250 , mean=10 , sd=1) #Compare the numbers sampled with rnorm...() against normal distribution > qqnorm(x) > qqline(x) image.png 通过CircStats包绘制P-P图 library(CircStats...) pp.plot(x) image.png 用ggplot2绘制Q-Q图 library(ggplot2) df <-data.frame(x=rnorm(250 , mean=10 , sd=1)
一、简介 ggplot2是R语言中四大著名绘图框架之一，且因为其极高的参数设置自由度和图像的美学感，即使其绘图速度不是很快，但丝毫不影响其成为R中最受欢迎的绘图框架；ggplot2的作者是现任Rstudio...、形状或大小等图形属性的一个映射，其中还可能包含对数据进行统计变换（如求均值或方差），最后将这个映射绘制在一定的坐标系中就得到了我们需要的图形。...geom='density', colour=color) 传入fill来控制每个曲线下的填充颜色： 2.2.6 条形图 设置geom='bar'可以绘制条形图，当传入单个离散类别型数据时...geom='path'： qplot(unemploy/pop, uempmed,data=data, geom=c('point','path')) 2.2.9 分面 有时候，我们希望绘制的不是同样样式的不同分组图像在一幅图上反复绘制的情况...中绘制的通常为2D图像，即图像的位置信息由(x,y)决定，且通常为笛卡尔坐标系，用得较少的是极坐标系和各种地图坐标系； 坐标系最大的特点是，它可以同时影响所有的位置变量，譬如说，条形图在笛卡尔坐标系中是规规矩矩的条形
ggplot2提供了绘制直方图和条形图的功能，分别为geom_bar()和geom_histogram()。...如何绘制直方图/条形图 1）需要什么格式的数据 本次我们来看一个新的R提供的数据，就是闪闪发光的钻石?Diamonds。 ?...所以前者我们做直方图，后者我们做条形图。 2）如何使用ggplot2做直方图 首先我们来看看钻石重量的直方图。...就是把所有的数据按照相同间隔分成了30组，图上有30个柱子。（如图） ? 从图上我们可以看到大部分的钻石都是1克拉以下，较少的钻石是2克拉以上。那用geom_bar()会怎么样呢？我们来看一看。...3）如何使用ggplot2做条形图 然后我们来瞧瞧条形图。
用四分位数绘制箱形图的是一个公认的惯例：永远不应使用箱子或线来显示平均值、标准差或标准误。中位数不一定在箱子中心，两边延伸的线也不一定是对称的。...1.5×IQR1.5乘数对应±2.7σ（其中σ是标准差），覆盖了99.3％的正态分布数据。 延伸线之外的异常值可以单独绘制。 箱形图构造需要至少n = 5（越多越好）的样本，尽管某些软件不检查这一点。...其次，一些软件如R使用铰链hinges而非四分位数来作为箱边界，下铰链和上铰链分别是数据下半部分和上半部分的中位值，这种箱线图与基于四分位数的箱线图略有不同。...柱状图/条形图只能比较数据标准差或标准误的异同，箱线图可以反映数据分布的集中趋势，小提琴图和豆图是对数据分布的真正反映，尤其是Biomodal数据集。 ?...图b是直方图和箱线图、几种类箱线图可视化的比较，条形图通常仅展示了平均值和标准差，箱线图从下往上，依次展示了数据集的五个指标：最小值，小四分位数，中位数，上四分位数和最大值。
例如，条形图使用条形图，折线图使用线条图，箱形图使用箱形图格栅等。 散点图打破了这一趋势; 他们使用点geom。 如上所述，您可以使用不同的geom来绘制相同的数据。...一行描述具有4值的点，一行描述具有f值的点，并且一行描述具有r值的点。 这里，4代表四轮驱动，f代表前轮驱动，r代表后轮驱动。...我们将很快学会如何在同一个地块中放置多个geoms。ggplot2提供超过30个geoms，扩展包提供更多（请参阅https://www.ggplot2-exts.org）。...许多geom，如geom_smooth（），使用单个几何对象来显示多行数据。对于这些geoms，您可以将组审美设置为分类变量以绘制多个对象。 ggplot2将为分组变量的每个唯一值绘制一个单独的对象。...实际上，每当您将美学映射到离散变量时，ggplot2都会自动将这些geoms的数据分组（如线型示例中所示）。依靠这个特征很方便，因为群体aesthetic本身并没有增加传说或区别特征与geoms。
www.rdocumentation.org/packages/ggmap 简介：ggmap包整合了四种地图资源，分别是Google、OpenStreetMaps、Stamen，它使gplot2的所有geoms都可以用于地图可视化，可以在地图上绘制等高线图或散点图...可以使用GGally快速绘制模型的系数，或者在地图上绘制网络，如下面的图片所示。 ?...条形图、散点图、方框图、地图等，并在悬停时显示数据信息(例如数据值或标签)，如下图所示。...火山图 R语言 - 富集分析泡泡图 R语言 - 散点图绘制 R语言 - 韦恩图 R语言 - 柱状图 R语言 - 图形设置中英字体 R语言 - 非参数法生存分析 R语言 - 绘制seq logo图 WGCNA...R语言可视化学习笔记之ggridges包 利用ComplexHeatmap绘制热图(一) ggplot2学习笔记之图形排列 R包reshape2，轻松实现长、宽数据表格转换 不写代码，用下高颜值在线绘图
R语言可视化—饼图 今天开始进行R语言可视化的练习，主要参照的是文献《Preoperative immune landscape predisposes adverse outcome in hepatocellular...今天复现文章中的Fig.1A，即饼图绘制。...具体来说： position_stack：这是一个位置调整函数，用于在堆叠的条形图或饼图中调整元素的位置。对于堆叠的条形图，它将标签按照条形的高度依次堆叠。...在饼图中，position_stack(vjust = 0.5)用于将标签（如百分比）放置在每个饼图扇形区域的中间位置，从而使得标签更清晰地显示在每个部分的中心。.../results/Figure 1A.pdf') 其中如何在饼图外加分组名称暂未研究明白。
本章主要帮助我们从基础绘图过度到ggplot2之中。 2.1绘制散点图 Q: 如何绘制散点图？...*使用ggplot时会经常使用+将命令分割成很多行，使R知道代码还没有结束 2.3 绘制条形图 Q: 如何绘制条形图？...) 2.使用ggplot2绘制条形图 #变量值的频数表，使用BOD数据，时间为x值，demand为y值，使用geom_col()函数 ggplot(BOD,aes(x=BOD$Time,Y=BOD$demand...使用geom_bar(stat='identity')创建条形图 新版可使用geom_col()代替 2.4绘制直方图 Q: 如何绘制直方图查看一维数据的分布特征？...异常值为大于以及小于箱线图上下边缘IQR*1.5的位置。若notch = TRUE则更重视中位数之间的比较，公式为： 2.6绘制函数图像 Q: 如何绘制函数图像？
4.6 ggplot2程序包 ggplot2是R中用于绘图的高级程序包，它将绘图视为一种映射—数学空问到图形元索空间的映射，例如将不同的数值映射为不同的颜色或其他图形属性。...，如直方图、箱线图等。...如点、线、多边形等，还可以用来绘制. ? 上面函数内部的基本参数都是一样的。...例如用stat_smooth对数据作loess平滑，在carat-price散点图上添加非线性回归线。...R绘制好的图可以保存成多种格式，对应的生成函数名即它的扩展名。
在R语言的ggplot2包中，读者可以借助于geom_bar函数轻松地绘制条形图。对于条形图大家对其的印象是什么呢？又见过哪些种类的条形图呢？在本篇文章我将带着各位网友说道说道有关条形图的哪些品种。...ggplot2的语法讲解 ---- 如果读者对R语言比较熟悉，一定听过或使用过ggplot2的绘图体系了。...y轴（前提是绘图数据已做了统计汇总）； position：用于设置条形图的摆放位置，默认为'stack'，表示绘制堆叠条形图；如果指定为'dodge'，表示绘制水平交错条形图；如果为'fill'，表示绘制百分比堆叠条形图...：用于设置条形图的其他属性信息，如统一的边框色、填充色、透明度等； width：用于设置条形图的宽度，默认为0.9的比例； binwidth：该参数在条形图中已不再使用，但可以使用在绘制直方图的geom_histogram...单离散单数值变量的条形图 # 加载第三方包 library(ggplot2) library(gridExtra) # 已汇总数据--单离散变量条形图的绘制 df <- data.frame(Province
R有几种不同的系统用来产生图形，但ggplot2是最优雅而多变的那一种。ggplot2实现了图形语法，一种描述和构建图形的逻辑系统。通过ggplo2，我们能够快速学习，多处应用。...几何对象是用以呈现数据的几何图形对象，如条形、线条和点。 图形属性是几何对象的视觉属性，如x坐标和y坐标、线条颜色、点的形状等。 数值的值和图形属性之间存在着某类映射。...用几何函数指定图的类型 ggplot()函数指定要绘制的数据源和变量，几何函数则指定这些变量如何在视觉上进行表示。目前，有37个几何函数可供使用。以下列出常用的函数。...geom_vline() 垂线 color, alpha, linetype, size 关于几何函数的常见选项 选项 详述 color 对点、线和填充区域的边界进行着色 fill 对填充区域着色，如条形和密度区域...虚线，3=点，4=点破折号，5=长破折号，6=双破折号） size 点的尺寸和线的宽度 shape 点的形状（和pch一样，0=开放的方形，1=开放的圆形，2=开放的三角形，等等） position 绘制诸如条形图和点等对象的位置
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