均值mean 方差var和标准差std 最值max/min 极差range 中位数median 分位数quantile/prctile 众数mode 变异系数std/mean k阶原点矩 mean(score.^2) k阶中心距moment(score,k) 偏度skewness 峰度kurtosis
分布是描述一个样本数据最核心、最重要的方式。R内嵌了很多常用的统计分布,提供了四类函数:概率密度函数(density),累积分布函数(probability)、分位数(quantile)和伪随机数(random)。在R中分别用d,p,q,r表示这4个项目,后面接分布的英文名称或缩写。
Kolmogorov-Smirnov是比较一个频率分布f(x)与理论分布g(x)或者两个观测值分布的检验方法。其原假设H0:两个数据分布一致或者数据符合理论分布。D=max| f(x)- g(x)|,当实际观测值D>D(n,α)则拒绝H0,否则则接受H0假设。 KS检验与t-检验之类的其他方法不同是KS检验不需要知道数据的分布情况,可以算是一种非参数检验方法。当然这样方便的代价就是当检验的数据分布符合特定的分布事,KS检验的灵敏度没有相应的检验来的高。在样本量比较小的时候,KS检验最为非参数检验在分析两组数据之间是否不同时相当常用。
无论你是在与高管开会,还是在与数据狂人开会,有一件事是可以肯定的:总会看到一个直方图。
1.Tab键可以补全函数、变量名、指定数据框的行名列名等,能够有效避免错误输入与提高效率
这里记录下这本书里我之前不了解的内容,欢迎一起交流!向量的模式作者写了个函数来干这件事,我学习下,登上巨人的肩膀。我的理解,这个是相当于motif,计数最多的元素的意思。
原文链接是 https://benjaminlmoore.wordpress.com/2014/04/06/author-inflation-in-academic-literature/
上次可视化系列说了瀑布图(可跳转)。它可以用于展示拥有相同的X轴变量数据(如相同的时间序列)、不同的Y轴离散型变量(如不同的类别变量)和Z轴数值变量。
问题类型1:参数估计 真实值是否等于X? 给出数据,对于参数,可能的值的概率分布是多少? 例子1:抛硬币问题 硬币扔了n次,正面朝上是h次。 参数问题 想知道 p 的可能性。给定 n 扔的次数和 h 正面朝上次数,p 的值很可能接近 0.5,比如说在 [0.48,0.52]? 说明 参数的先验信念:p∼Uniform(0,1) 似然函数:data∼Bernoulli(p) import pymc3 as pmimport numpy.random as nprimport numpy as
ECOD首先以非参数方式估计变量的分布,然后将所有维度的估计尾部概率相乘,得出观测值的异常得分。ECOD假设变量独立,并且可以估算出每个变量的经验累积分布。虽然变量独立的假设可能过于严格,但这并不是新的假设,因为前一章中的HBOS也做了同样的假设,并且已被证明是有效的。
任何数据产品的第一步都应该是理解原始数据。对于成功和高效的产品,这一步骤占据了整个工作流程的很大一部分。
这里我主要使用 ggridges 包中的 stat_density_ridges()。这个包的介绍,小编以前做过一期内容,可见:ggridges包—峰峦图详细介绍。读者需要进一步阅读课件这篇博文[1],以及一些案例[2]。
本文主要是seaborn从入门到精通系列第3篇,本文介绍了seaborn的绘图功能实现,本文是分布绘图,同时介绍了较好的参考文档置于博客前面,读者可以重点查看参考链接。本系列的目的是可以完整的完成seaborn从入门到精通。重点参考连接
ECDF:Empirical cumulative distribution function,用于描述数据的分布,横坐标为指标,纵坐标为累计概率
本文是其中第一篇,介绍了图的一些基础知识并给出了 Python 示例。更多文章和对应代码可访问:https://github.com/maelfabien/Machine_Learning_Tutorials。
提起 「肥」与「瘦」不由的想起了苏轼 老人家的诗词《孙莘老求墨妙亭诗》其中一句传为经典:“短长肥瘦各有态,玉环飞燕谁敢憎”,促成 “环肥燕瘦”一词。苏轼诗词韵味无一,但诗意却有点武断,不可否认“短长肥瘦各有态”,但“玉环飞燕谁敢憎”有点主观异端。今天我们把“谁”代指财富,看 “富” 是憎肥?还是憎瘦。也巧妙的证伪本文主题。
更多参考用python的matplotlib包绘制热度图,pyHeatMap:使用Python绘制热图的库。
最简单的方法,不适用其他自定义函数,使用原生 JS 数组中内置的 sort 方法。
除了函数,减少重复代码的另一种工具是迭代,它的作用在于可以对多个输入执行同一种处理,比如对多个列或多个数据集进行同样的操作。
他想把第一列变成行号,就加了一个参数:row.names=1 结果报错了。 有趣的是他的提问:行是基因号,怎么会有重复的行呢? 我的回答,当然是标题啦:你肉眼能看几万个基因名字判断有没有重复的基因?
ggridges包提供了geom_density_ridges_gradient()函数,用于画核密度估计峰峦图
在我今天参与的一个讨论中,提出了一个问题,即在具有单个连续预测器的线性回归模型中R平方如何/是否取决于预测变量的方差。这个问题的答案当然是肯定的。
昨天写的[[102-R数据整理12-缺失值的高级处理:用mice进行多重填补]],后台收到了一位朋友有意思的反馈。
前几天写的一篇介绍use这个新hook的文章中聊到React原生实现了一个缓存函数的方法 —— cache。
年初的时候我好像打算对ggplot2进行一个教程,后来因为其他事情耽搁了,今天打开以往的git日志,才发现有这么一个坑(ggplot2初探),虽然现在绘图的包层出不穷,但是ggplot真的是一个基础的绘图包了。
在实际的数据分析中,分析者往往需要花费大量的精力在数据的准备上,将数据转换为分析所需要的形式。遗憾的是,大多数统计学教材很少涉及这一重要问题。整理数据是统计学的任务之一。我们开始关注 R 中最常用的数据格式——数据框的基本操作。我们将首先使用基本包处理数据框。
分子分型也是生信灌水的常见知识点之一。可以用于分子分型的方法非常多,比如:一致性聚类、非负矩阵分解、PCA等等,当然这些方法不需要我们手动去计算,都是有成熟的R包帮我们做。
各位科研芝士的小伙伴,本站本着给大家提供科研便利的宗旨,继续给大家提供干货, 一般的临床研究,统计分析就“三把斧”:统计描述、差异性比较和回归建模。R语言完美解决了统计分析“三把斧”结果整理成规范三线表的麻烦。在统计描述上,R可以根据不同数据的特征给出不同的统计描述方法,在差异性比较方面,R可以给出不同数据比较的不同差异性比较方法,包括t、F、卡方、fisher法和秩和检验;在回归分析上,不仅是Cox回归,线性回归、logistic回归,R同样可以形成规范的表格。这些表格,如果人工来整理,不仅慢,而且不规范!今天我们就攻下这个高地,学习一下如何整理成三线表。
本文做SV模型,选取马尔可夫蒙特卡罗法(MCMC)、正则化广义矩估计法和准最大似然估计法估计。
R中的统计分析通过使用许多内置函数来执行的,这些函数大部分是R基础包的一部分,并且它们将R向量与参数一起作为输入,并在执行计算后给出结果。
Q-learning 是强化学习中的一种常见的算法,近年来由于深度学习革命而取得了很大的成功。本教程不会解释什么是深度 Q-learning,但我们将通过 Q-learning 算法来使得代理学习如何玩 tic-tac-toe 游戏。尽管它很简单,但我们将看到它能产生非常好的效果。
最近正好在探索[[管中窥rpca(ReciprocalProject)]] 函数以及seurat 家族里其他函数的用法,借此机会来总结一下。
函数var()应用在多组数据上,得到的计算结果是一个协方差阵,其每个元素是各个向量之间的协方差。使用指令cor(group)也得到相同结果。
如果需要计算有复杂后验pdf p(θ| y)的随机变量θ的函数f(θ)的平均值或期望值。
欢迎来到机器学习工程师纳米学位的第一个项目!在此文件中,有些示例代码已经提供给你,但你还需要实现更多的功能来让项目成功运行。除非有明确要求,你无须修改任何已给出的代码。以编程练习开始的标题表示接下来的内容中有需要你必须实现的功能。每一部分都会有详细的指导,需要实现的部分也会在注释中以TODO标出。请仔细阅读所有的提示!
在任何领域内,高手的一个特点是,它能在一瞬间对局面的好坏有一个比较准确的判断。例如对于围棋高手而言,假设当前棋盘有5处落子位置,像李世石和柯洁这样的高手,他们能在很快的时间内衡量这几个位置的好坏,而且衡量的准确度远比普通棋手高。
今天的推文给大家介绍一个我发现的比较优秀的一个可视化R包-ggdist包,这是一个非常优秀和方便的用于绘制 分布(distributions)和不确定性(uncertainty) 的可视化绘图包,详细介绍大家可以去官网查阅:ggdist官网。本期推文涉及的内容主要如下:
1、通常的for…in…循环中,in后面是一个数组,这个数组就是一个可迭代对象,类似的还有链表,字符串,文件。它可以是mylist = [1, 2, 3],也可以是mylist = [x*x for x in range(3)]。 它的缺陷是所有数据都在内存中,如果有海量数据的话将会非常耗内存。
最近我们被客户要求撰写关于Metropolis-Hastings采样的研究报告,包括一些图形和统计输出。
https://academic.oup.com/genetics/article/225/3/iyad161/7258327?login=false
如果使用过 android architecture 中关于 LiveData 部分的朋友,可能对于DiffUtils这个玩意儿并不陌生。
前文《R-概率统计与模拟》介绍了一些用 R 进行概率模拟的实验,本文继续上次的工作,并在此过程中回顾一些相关的概率统计知识。
https://www.cnblogs.com/poloyy/category/1676599.html
Python关键词筛选分类,使用Levenshtein模块进行关键词筛选及分类,使用编辑距离的算法,速度相当快。
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