R与RStudio的详细安装教程 （如果下面的博客没有能解决你的问题或者你还有其他关于计算机方面的问题需要咨询可以加博主QQ：1732501467） R是RStudio的前提，首先安装R，才能安装RStudio...4.点击“base” 5.点击“Download R 4.1.1 for Windows”（不要去担心这儿的版本和老师说的版本不一样，其实现在的不同版本之间的差异很小，不影响使用）...8.点击下图箭头所指的方向。 二、安装R 9.点击“是” 10.点击“确定” 11.点击“下一步” 12.点击“浏览”，选择软件安放在电脑的那个盘里面。...（自己选择位置） 14.点击“下一步” 15.点击“下一步” 16.点击“下一步” 17.点击“下一步” 18.点击“下一步” 19.之后，便是等待安装...(安装路径自己设置，第一次安装的朋友，也可以不用修改安装路径。直接使用默认的安装路劲。) 7.点击“下一步” 8.点击“安装”。
以下代码把数据框转化成了一个列表 gt %>% t() %>% as.data.table() %>% unclass() -> gt.list class(gt.list) 计算等位基因频率...n% length() for(i in 1:length(gt.list)){ p[[i]] <- table(gt.list[[1]])/n } 自定义计算...} } return(R2) }) 整个函数的逻辑还看不明白 这里自定义函数还用到了compiler这个R包，有什么作用暂时不太明白 函数是输入两个位点的等位基因和等位基因频率 calcLD(...gt.list[[1]],p[[1]],gt.list[[3]],p[[3]]) gt.list 的格式 p的数据格式 以上是本期推文的内容 一个R语言的零散知识点：pivot_longer()函数把多列的数据转换成长格式...小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记；3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记
云计算和安全两个问题在很多人的观念中是相对立的，云计算首重速度和敏捷性，而传统的安全性则是减缓了业务的发展；云计算为用户提供无处不在的网络接入，这将带来很大的风险，而安全性则是最小化访问和风险。...事实上，如果用户能够找到云计算和安全性的平衡点，云和安全性可以共同促进产业的发展。 ?...风险的管理 要实现安全性往往意味着会阻碍生产力，它所面临的挑战在于用户愿意接受多大的风险，以及在如何实现运营和安全性的平衡。...了解云共享责任模型 云服务提供商正在向企业销售云服务，其重点是帮助用户转移云计算资产和资源，而不是降低用户的安全性。...从传统安全的角度来看，实现云计算困难重重，因为云计算体量非常庞大且是动态的，有很多快速移动的组件。
https://github.com/YaoZhou89/TGG 在代码部分并没有找到关于计算ld的代码，论文中也没有找到相关方法的描述。...论文中提供了SNP Indel 和 sv数据集。...+ pos + "_SV”的形式，把INFO列的内容都去掉，把 alt 和 ref 都改成 单碱基的形式 基因型只保留前三个字符 python 20240524_01.py chr3.sv.vcf chr3...(这个计算起来非常快) 利用输出数据作图 R语言代码 library(data.table) library(tidyverse) dat.ld的R2和论文中的图的分布还是挺像的，SNP和SV的分布还是不一样的，如果用上所有染色体的数据可能还会有变化
大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。 已经下过好几次了，现在还是忘了。就把过程直接放上面了。下次再换电脑就直接可以看。。。...0.下载之前需要把JDK安装和配置好，点这里：https://blog.csdn.net/Youngist/article/details/106975537 1.先到官网下载 下载地址：https:/...，这里我选择的是java Development， 2.2 点击install安装 2.3 点击accept接受，然后就在安装了，有一段时间，静静等待 2.4先点记住选择，再点accept接受...2.5 接下来点击LAUNCH 2.6 选择worksspace的地址(是用来存放java程序的)，我就直接选的默认地址，然后直接点击launch，不要选那个小方框，以后可能会创建多个workspace...3 现在就可以食用啦，赶紧写下你的第一个程序吧！
正式开始介绍神经网络正向计算，反向传导。
我们在做表达谱数据分析的时候，经常需要检测基因两两之间表达的相关性。特别是在构建ceRNA网络的时候，我们需要去检查构成一对ceRNA的mRNA和lncRNA之间的表达是否呈正相关。...前面给大家分享过R计算多个向量两两之间相关性，今天小编就给大家分享一个实际的应用案例，用R去批量的检测大量mRNA跟lncRNA之间表达的相关性，并绘制散点图。...RNA的名字 rownames(rnaExpr) <- genes #设置表达谱的列名为样本的名字 colnames(rnaExpr) <- samples #构建所有mRNA和lncRNA的组合 combination...<- expand.grid(deLNC, dePC) #第一列为lncRNA，第二列为mRNA names(combination)=c("lnc","pc") #通过循环来计算所有lncRNA和...参考资料： R计算多个向量两两之间相关性
同样打智慧社区主意的还有IT企业和AI创业者，前者希望以安防为入口扩展主航道，后者盘算着依靠计算机视觉、机器学习等技术分一杯羹。在各方势力掀起的“圈地运动”中，智慧社区在资本市场中可谓风头无两。...海纳云的聪明之处在于，利用NPU在内的计算单元带来了每秒200万亿次计算的性能，不仅降低了算力的硬件成本，并且能够满足视觉、语音和自然语言处理在内的多种计算场景。...诸如“天神一号”等AI超融合一体机的出现，背后隐藏的是一股新的思潮：不是传统的单一IT架构，也不是纯粹的云计算，而是扩展到了云、网、边、端全场景，“计算”本身开始超脱工具属性和物理属性，演进为一种泛在的能力...海纳云的成功突围，预示着智慧社区正在驶离印象中的瓶颈。 进一步延伸的话，智慧社区就像是微缩版的智慧城市。...或许这样的目标还有很长的一段路要走，至少海纳云在内的行动派和破局者，正在一步一步搭起通往“理想国”的台阶。
各位小伙伴，大家好，我是邓飞，今天介绍一下，如何使用R语言进行logistic分析，并且计算OR值和置信区间。...一般情况下，OR 值越大表示基因变异和疾病间的关联程度越强。 在二分类 GWAS 分析中，通过计算每个基因变异的OR值，可以评估其与疾病之间的关联程度，从而推断基因变异对疾病风险的贡献。...plink的Logisitic模型的GWAS分析计算结果如下： R语言的解决方案： m1 = glm(phe.V3 ~ rs3131972_A,family = "binomial",data=dd...) summary(m1) # 计算OR值 exp(coef(mod)) ## 置信区间 exp(confint(mod)) # 一步到位：OR值和置信区间 library(questionr) odds.ratio...(mod) 结果： 手动计算OR值： 一步到位的OR值和置信区间：
只需要某个月的交易数据。 A3：=A2.group(Code)，按股票代码分组。这和R语言中的split函数功能类似。点击该单元格可以在右边看到计算结果： ? ...分组前就排序代码会更简单，但我考虑到最直观的思路是：分组前数据是混在一起的，看不出是否排序；分组后经过观察才发现顺序混乱，不排序则无法进行下一步的行间运算。 ...08：增加一个列INC，计算”当日收盘价”-“前一日收盘价”。R不支持行间运算，所以这里巧妙的将收盘价整体下移一行，再和原来的收盘价相减。...10行的A3[[i]]$CID[[1]]和避免后面运算报空指针错误。集算器中不需要做类似的检查，看来它对非专业技术 人员更友好些。11-17：计算连涨天数。...使用R来完成股票分析需要一定的编程技巧和数学知识，这样才能灵活运行R的各项功能。R还具备优秀的扩展性，比如有针对股票的第三方库函数和统计图;再比如完全可以自己写一个更高效的读取Excel的函数。
在我国，人民银行规定每个季度月末的20号为银行结息日，每一年四次结息，因此每年需要非常频繁的计算付给储户的利息。在计算利息时，小数点如何处理就变得很重要，并成为决定利润多少的关键细节。...小于5的数字被舍去，大于等于5的数字进位后舍去，由于所有位上的数字都是自然计算出来的，按照概率计算可知，被舍入的数字均匀分布在0到9之间。...我们不妨以10笔存款利息计算作为模型，以银行家的身份来思考这个算法： 四舍，舍弃的值包含： 0.000、0.001、0.002、0.003、0.004，对银行而言舍弃的内容就不再需要支付，所以舍弃的部分我们可以理解为...因为舍弃和进位的数字是在0到9之间均匀分布的，所以对于银行家来说，每10笔存款的利息因采用四舍五入而获得的盈利是： 0.000 + 0.001 + 0.002 + 0.003 + 0.004 - 0.005...- 0.004 - 0.003 - 0.002 - 0.001 = -0.005 总体来讲每10笔的利息，通过四舍五入计算就会导致0.005元的损失，即每笔利息计算损失0.0005元。
其中，AlphaFold3的问世尤为引人注目，它不仅能够预测单个生物分子的三维结构，还能准确预测生物分子复合物的结构，为解码分子行为和生物计算提供了强有力的工具。...此外，AlphaFold 2还利用了多序列比对（MSA）和蛋白质数据库（PDB）中的结构模板，通过Evoformer转换器实现了两者之间的有效交互，进一步提升了预测能力。...AlphaFold 3的出现，无疑为生物计算和结构生物学领域注入了新的活力。 图 1：解码分子生物学编程语言 a, 分子生物学的 “计算教条”。...然而，实验测定的构象组合目前仅限于几十个。因此，尽管通过AlphaFold 3从序列预测生物分子自由和相互复合的三维结构是理解分子行为和生物计算的重要一步，但实验人员不必担心自己会被淘汰。...参考资料： Roy, R., Al-Hashimi, H.M.
大家好，每N周一坑栏目又来啦? 今天的坑是一个很简单但很实用的小程序： 房贷计算器 因为是“刚需”，所以网上早有无数的版本。有人已经用过，有人以后可能会用。...输入： 贷款金额 贷款期限 标准年利率 利率浮动倍数 输出： 两种贷款方式 等额本息 每月还款 总利息 等额本金 首月还款 每月递减额 总利息 效果： ?...看别人程序写得好，是因为你看到的也许是人家第几十万行代码。 不光是房贷计算器，类似的一些小工具，都可以作为初级练手的小程序，甚至写成网页/App/小程序还可能赚钱。...r + 1) * rowheight) i = img.crop(box) i.save('pic_%d.jpg' % (r*3+c)) @GS、@凌烟、@sociopath...其中 @凌烟 处理了长方形图片的裁剪，@GS 更进一步，用填白的方式保证了长方形图像裁剪后的完整性。 感谢各位同学的参与。 期待在下一期中看到你的代码！
这个设计的优点如下： •贷方（lenders）不需要等待对手借方(borrower)出现在参与（如获取利息）；•采用资金池能让协议通过不同的激励平衡资金的供给与需求，例如当借款需求较少时，也会可以影响到贷方利率...这是行业标准解决方案的一个很好的开始，它可以替换每个Defi协议中的各自的预言机，从而消除了操控这些价格预言机的风险。 利息(Interest)是如何计算的？ Defi中的利息和银行中的概念是一样的。...不过在Defi中利息的计算要更复杂一些，因为以太坊交易需要依赖外部触发，Defi协议通常需要依赖于用户的操作才进行利息的计算。...例如Compound是根据每个区块时间来计算利息，但是它并不是自动在后台完成计算的，而是依赖于用户行为（例如存款、贷款、清算等）来触发利息计算。...触发后，函数将统计自上次利息计算以来过去了多少个块，并在其之上应用最新的利息。换句话说，如果不采取任何用户动作，则协议将不会计算利息。
复利率法（英文：compound interest），是一种计算利息的方法。按照这种方法，利息除了会根据本金计算外，新得到的利息同样可以生息，因此俗称“利滚利”、“驴打滚”或“利叠利”。...此时，我们可以换个角度这样看：即，每个结算（增长）周期为半年，每半年的利率是50%（或者说100%/2），一年结算两次利息，且第一次结算完后，立马将利息存入。此时我们的计算公式和结果如下： ?...继续，假设现在银行为了和其他银行抢生意，短期不想赚钱了，每四个月就付一次利息！...而机智的你依然一拿到利息就立马存入，与半年结算一次利息类似：即，每个结算周期为四个月，每四个月的利率是33.33%（或者说100%/3），一年结算三次利息，且前两次结算完后，都立马将所有利息存入。...当然可以啦～如果把取钱存钱的这个时间缩短到每4个月操作一次，获得的利息还可以进一步增长，也就是这个式子： ? 甚至如果你能够做到月月取、周周取甚至天天取，还能获得更大的收益哦！
信贷风控的目标是「利益最大化」，而不是没有风险，在风险和利润之间找到平衡，是信贷风控的核心。...风险&利润博弈 我们先了解下贷款的利润是怎么计算的，有这么个公式：利润 = 还款金额 - 逾期未还金额 - ( 资信成本 + 其他成本 )。...这里头还款金额代表企业收入，逾期未还金额代表客户风险，资信成本和其他成本代表企业成本，也即是利润由企业收入、客户风险、企业成本三个要素决定，其中企业收入和企业成本是可以明确的，唯独客户风险具有不确定性。...下面我们来看个例子，详细了解下如何在利润和风险中找到平衡。...10% 4% 1% 6.0% -10000000 E 20000 50000 10% 4% 1% 7.0% -20000000 合计 65000000 我们简单描述下上面风险等级 A 的利润计算方式
而在诊断试验中，通常根据检验指标的判断结果和金标准诊断结果，整理成一个2×2的表格，如下表所示，并以此来计算诊断试验中两个比较重要的指标，即灵敏度和特异度。...NRI计算 如下两个表所示，表一为一般情况，表二为特定情况，（一共595个样本，其中180个位患者组，415个位非患者组），我们将研究对象按照真实的患病情况分为两组，即患者组和非患者组，然后分别在这两个分组下...NRI解释 若NRI>0，则为正改善，说明新模型比旧模型的预测能力有所改善；若NRI<0，则为负改善，新模型预测能力下降；若NRI=0，则认为新模型没有改善。 接着我们看看在R里面如何实现呢？...采用PredictABEL包，一行代码计算NRI值 主要的函数为reclassification，第一个参数为我们的数据集，第二个参数为二分类的列，此处21代表的event列，predrisk1和predrisk2...Ok，今天的推文就到这，我们主要分享了NRI的基本概念和基于R语言计算NRI，希望能对大家有所帮助，最后，欢迎大家留言，有不正确的地方，也请大家留言指正。
百度百科的解释：久期也称持续期，是1938年由F.R.Macaulay提出的。...以上的说法比较抽象，下面举例说明： 假设小明借给小红1000块钱，每年利息100块（年利率10%），约定4年后归还本金和利息，那回款=100*4+1000=1400元，为了计算方便，不算复利了。...1100 假设小红每两年还利息，即1400=0+200+0+1200 第一种方式的回款时间：（0 * 1年 + 0 * 2年 + 0 * 3年 + 1400 * 4年）/ 1400 = 4年 第二种方式的回款时间...其实这个时间还是不准的，因为我们忽略了一个重要的因素，钱是有时间价值的，也就是现在的1000块和一年以后的1000块是不相等的，所以要折成现值计算。...反过来，一年后的1020，相当于今天的1000，计算公式1000= 1020 / (1 + 2%)，同理，两年后=1020 / [ (1 + 2%) * (1 + 2%)] 再回到上面修改下回款时间
x0是不存在交易费的，这个x0是存在银行里面有利息的，所以我们可以直接加上对应的利息，相当于这个收益是前四个项目的收益加上我们这个时候剩下的资金存银行产生的利息）； 我们的目标函数还要求总体的风险尽可能小...）和3个约束条件（风险小于这个特定的常数，交易费和我们投入的资金两者的和等于总资金，每一项的投资都是非负数）-----这个就是单目标的线性规划模型； （也许看到这里，你会觉得，这个模型简化也太神奇了吧，...下面的就是这个函数进行调用的时候需要使用到的几个对应的参数： f:计算的就是pi-r1,这里一定要切记后面的百分号，例如，第一个就是银行的p1(交易费0）减去平均收益率（也就是利息0.05）就是图里面的...-0.05，第2个是1%-28%即，0.01-0.28=-0.27，依次计算； A：显然，这个是一个4行5列的矩阵，我们首先要清楚的是这个矩阵的行数和列数分别代表的是什么；A计算的就是对应的风险率；行数...4表示的是这4个项目，虽然有5个变量，但是银行存款生利息是没有风险的，所以我们只用这个矩阵的4行分别表示x1,x2,x3,x4;每一行有5个数据，这5个数代表的就是风险损失率，第一个项目的风险就是2.5%
正文 本篇描述了如何计算R中的数据框并将其添加到数据框中。一般使用dplyr R包中以下R函数： Mutate（）：计算新变量并将其添加到数据表中。 它保留了现有的变量。...Transmutate（）：计算新列但删除现有变量。...同时还有mutate（）和transmutate（）的三个变体来一次修改多个列： Mutate_all（）/ transmutate_all（）：将函数应用于数据框中的每个列。...Sepal.Width/Petal.Width ) 一次修改多个列 函数mutate_all（）/ transmutate_all（），mutate_at（）/ transmutate_at（）和mutate_if...tbl：一个tbl数据框 funs：由funs（）生成的函数调用列表，或函数名称的字符向量，或简称为函数。predicate：要应用于列或逻辑向量的谓词函数。
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