R中两个范围的重叠量[DescTools?] - 腾讯云开发者社区 - 腾讯云

开发者社区

文档建议反馈控制台

最新优惠活动

文章/答案/技术大牛

发布

「R」R检验中的“数据是恆量”问题

所遇到的问题：分析两个样本之间是否存在差异，每个样本三个重复。现在用的是t.test，但有些样本三个重复的值一样（比如有0,0,0或者2,2,2之类的），想问下像这种数据应该用什么检验方法呢？...举个例子： > t.test(c(0,0,0), c(2,2,2)) Error in t.test.default(c(0, 0, 0), c(2, 2, 2)) : 数据是恆量这就是最简单的一个重复例子了...以下是我的回答：数据是恒量是无法做t检验的，因为计算公式分母为0（不懂的看下统计量t的计算公式，一般标准差/标准误为分母，所以恒量是不能算的）。...最后提供两个参考函数： 1是判断恒量： zero_range <- function(x, tol = .Machine$double.eps ^ 0.5) { if (length(x) == 1...9508518/why-are-these-numbers-not-equal https://stackoverflow.com/questions/23093095/t-test-failed-in-r

4.8K1 0

跟着Nature Communication学作图：R语言ggplot2话点线图展示基因表达量的范围

022-29144-4#code-availability 对应代码链接 https://github.com/ucassee/Challenger-Deep-Microbes 论文里提供了大部分图的数据和代码...，很好的学习材料，感兴趣的同学可以找来参考，今天的推文重复一下论文中的Figure3b 示例数据集部分截图 image.png 读取数据 dat01<-read.delim("data/20220602

3581 0

您找到你想要的搜索结果了吗？

是的

没有找到

记录单细胞学习过程中的两个R包报错

下面是记录单细胞学习过程中的两个R包报错 (生信技能树学员周现在) 1.SeuratData包，因为学习单细胞测序的很多示例数据全在这个包里，所以这个包的出镜频率其实是比较高的，但是我在成功下载后library...在帅气的Nickier助教的提示下，我卸载了R和Rtools，重启电脑后，重装了R和Rtools，之后就可以成功安装harmony包了。...但是因为在R语言学习的过程中，我一般都不会管Warning的信息只要不Error就接着跑。...3.总结和反思我们在学习的过程中难免会遇到很多问题，但是小洁老师在课上曾经展示的一张遇见报错怎么办的图让我印象深刻，也让我意识到要早日跳脱学生思维，要学会自己解决问题，其实我遇到的大部分问题都有前人遇见并解决过了...，可以先自己搜索并试着解决(就比如其实我遇见的这个Warning in system(cmd) : 'make' not found，输入到检索引擎，其实是有解决方案的，但是因为我在学习的过程中形成了一个思维定式就是只管

2.9K2 0

R语言线性趋势检验：Cochran Armitage 检验

注意和Cochran-Mantel-Haenszel检验区分，CMH检验是研究两个分类变量之间关联性的一种检验方法。...但有时数据除了我们研究的变量外，还混杂或隐含了其它的变量，如果将这些变量纳入分析中，则有可能得出完全不同的结论，著名的Simpson悖论就是这个问题的典型案例。...关于CMH检验的内容可以参考之前的推文：R语言卡方检验方法总结换句话说，在2 x 2表格数据的基础上，引入了第三个分类变量，称之为混杂变量。...使用DescTools包中的CochranArmitageTest()函数进行检验： DescTools::CochranArmitageTest(df) ## ## Cochran-Armitage...下面是CMH检验的一个补充。默认的CMH检验只能进行3个变量的检验，vcdExtra中的CMHtest()可以进行两个变量的CMH检验。

1.1K2 0

DBCA静默建库中的两个小问题 (r9笔记第28天)

General_Purpose.dbc -gdbname testdb -sid testdb -characterSet ZHS16GBK -nationalCharacterSet AL16UTF16 看起来简单的命令使用范围比较有限...不过今天的重点是两个小问题。...通过这个小例子也可以看出，我们在拷贝一套环境的时候还是需要注意网络的设置，如果默认存在，建库时还是会参考这些配置，会或多或少产生一些影响。...使用sqlplus登录的显示却有些奇怪，而且查看数据目录下，没有生成任何的文件。唯一的文件就是/etc/oratab的记录了。...而问题的原因也很明显，就是/etc/hosts中的记录不全，只需补充主机IP的信息即可。

1.2K4 0

Receptive field(感受野)

感受野的计算可以看到在Conv1中的每一个单元所能看到的原始图像范围是3*3，而由于Conv2的每个单元都是由 2*2范围的Conv1构成，因此回溯到原始图像，其实是能够看到5*5的原始图像范围的...对于卷积两个感受野为3的上层单元，下一层最大能获得的感受野为 3*2=6，但因为有重叠，因此要减去(kernel_size - 1)个重叠部分(取kernel_size大小的区域，按顺序从左到右相邻两个会存在重叠部分...)，而重叠部分的计算方式则为感受野减去前面所说的偏移量，这里是2....3，第二层是在第一层的基础上偏移3，因此为2*3)，而且是累积相乘的关系（例如，在fmap3中，偏移量已经累积到4了），也就是说 r_3应该这样求 ?...，空隙共有k_n-1个，比如说：第一层和第二层有重复，第二层和第三层也有重复等等，然后就要计算每两个之间重复的量有多少，首先每层共有r_n-1个数字，需要减去往右偏移的量，即stride，第1卷积层的stride

9292 0

R语言卡方检验方法总结

因为最近又有一批临床数据要进行统计，所以趁机把卡方检验的R语言实现再重新梳理一遍。这篇文章涵盖了孙振球，徐勇勇《医学统计学》第4版卡方检验章节中的所有内容。...课本中关于四格表资料的卡方检验的方法选择以及R x C表资料的检验方法选择做了非常好的总结，在这里一并和大家分享一下：四格表资料的方法选择：当 n(样本量)≥40 且所有的T(期望频数)≥5时，用χ2...双向无序R×C表资料 R×C表资料中两个分类变量皆为无序分类变量对于该类资料，若研究目的为多个样本率（或构成比）的比较，可用行×列表资料的χ2检验：若研究目的为分析两个分类变量之间有无关联性以及关系的密切程度时...双向有序属性不同的R×C表资料 R×C表资料中两个分类变量皆为有序的，但属性不同。...频数分布拟合优度卡方检验使用课本例7-13的数据。 R语言做卡方拟合优度检验非常简单，关键是概率的计算，这里我们直接用课本中的概率。

3.7K3 0

R语言有序logistic回归-因变量为等级资料

“医学和生信笔记，专注R语言在临床医学中的使用、R语言数据分析和可视化。主要分享R语言做医学统计学、临床研究设计、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物信息学等。...R语言二项逻辑回归： R语言logistic回归的细节解读 R语言多项逻辑回归：R语言多项逻辑回归-因变量是无序多分类有序逻辑回归 ordinal logistic regression适用于因变量为等级资料...使用孙振球版医学统计学例16-4的数据。随机选取84例患者做临床试验，探讨性别和治疗方法对该病的影响。...模型整体的显著性检验： # 先构建一个只有截距的模型 fit0 <- polr(Y ~ 1, data = df,Hess = TRUE,method = "logistic") # 两个模型比较 anova...： DescTools::PseudoR2(fit, which = "all") ## McFadden CoxSnell Nagelkerke AldrichNelson

1.9K3 0

Soft-NMS – Improving Object Detection With One Line of Code

该建议网络为卷积特征图中每个像素处的多尺度、高宽比锚盒生成分类分数和回归偏移量。...当使用高NMS阈值时，在重叠阈值范围内测量的平均精度会下降。Soft-NMS的资源函数：衰减与M重叠的其他检测盒的分数，似乎是改善NMS的一种很有前途的方法。...然而，Soft-NMS是一种广义的非最大抑制，传统的NMS是一种特殊的情况，具有不连续的二元加权函数。除了这两个函数外，还可以利用考虑重叠和检测分数的Soft-NMS来探索参数更多的函数。...这两个检测器都使用0.3作为默认的NMS阈值。在灵敏度分析部分，我们也改变了这个参数，并显示结果。我们还训练了具有相同设置的Deformable R-FCN。...注意，AP在0.3到0.6之间是稳定的，并且在这两个检测器的范围之外显著下降。对于传统的NMS，AP在这个范围内的变化约为0.25%。在0.1 ~ 0.7范围内，Soft-NMS的性能优于NMS。

2.1K2 0

官方突然揭秘V3R1推理系统，成本全透明

_inference_system_overview.md DeepSeek 的推文中写到，DeepSeek-V3/R1 的推理系统采用了跨节点 EP 驱动的批量扩展、计算 - 通信重叠、负载平衡来实现对吞吐量和延迟的优化...然而 EP 增加了系统的复杂性，主要表现在两个方面： EP 引入了跨节点通信。为了优化吞吐量，必须设计适当的计算工作流，shi 通信与计算重叠。...为了缓解这一问题，DeepSeek 采用了「dual-batch」重叠策略，通过将一个 batch 请求拆分为两个 microbatch 来隐藏通信成本并提高整体吞吐量。...在预填充阶段，这两个 microbatch 交替执行，一个 microbatch 的通信成本被隐藏在另一个 microbatch 的计算过程中。...因此，DeepSeek 将注意力层细分为两个 step，并使用一个 5 阶段的 pipeline 来实现无缝的通信 - 计算重叠。

480 0

计算机视觉方向简介 | 图像拼接

特征点提取特征是要匹配的两个输入图像中的元素，它们是在图像块的内部。这些图像块是图像中的像素组。对输入图像进行Patch匹配。...$M$，离散二维零均值高斯函数为$$Gauss = exp(-u^2 v^2)/2delta^2$$ 计算每个像素点(x,y)的角点度量，得到$$R=Det(M)-k*trace(M)$$，$k$ 的范围是...$xi=(xi,y_i)$ 是窗口的像素坐标，$u=(u,v)$ 是通过NCC系数计算出的位移或偏移。NCC系数的范围为$[-1,1]$。 NCC峰值相对应的位移参数表示两个图像之间的几何变换。...最后，需要计算指定参考图像原点相对于输出全景图的偏移量的偏移量xoffset和偏移量yoffset。...当输出拼接图像中至少有两幅重叠图像时，我们将使用如下的alpha值来计算其中一个像素处的颜色：假设两个图像 $I1,I2$,在输出图像中重叠；每个像素点$(x,y)$在图像$I_i(x,y)=(alpha

1.4K4 0

ubiome数据分析流程学习笔记1

一般Next-Seq等illumina机器的最具性价比的测序读长是2＊150（150PE），而16S-V4区的长度是806R－515F＝291bp。...其实这个问题，有两个方向可以解决，都已经发表了论文，一个是使用16S－V4区的通用引物来取代illumina的p5，p7测序引物，这样有效测序长度就变为300bp左右（不算上正反20bp左右的引物），重叠区域就变为...1)数据库准备 a.首先从SILVA-16S数据库中找出能用V4通用引物扩出的序列，允许两个错配。...健康队列的参考范围为了确定28个种属的健康参考范围，我们建立了897健康个样本的队列。对于897个样本中的每一个，测定了微生物种群中每个目标的相对丰度。...这些数据用来定义一个健康参考范围，例如艰难梭状芽孢杆菌在健康队列的~2%中发现，因此我们为其定义了一个相对丰度为0%到0.18%的健康范围。

4623 0

基于Fast R-CNN的FPN实现方式及代码实现细节(未完待续)

在loss中w是需要学习的，w乘在Conv5的特征上进行特征的组织和变维，*的含义是x，y，w，h个需要学习一个参数w，x和y是直角坐标系下的比例关系，w和h是极坐标下的比例关系，最终计算出的是变化，或者说是校准量而不是原本的输出结果...，有可能就是多个猫，分散在不同位置上，缩小范围后进行Bounding box回归。? ...2、从R-CNN到SPP-Net?R-CNN计算量很大导致网络的速度很慢。...RoI池化的梯度回传：费重叠的区域和max pooling的梯度回传一样，对于重叠区域x23，重叠了一个像素，对r0来说是贡献到右下角的像素，对r1来说是贡献到左上角的像素。...回传的时候用r0右下角和r1左上角的梯度相加。求偏导的时候有两个维度，一个是对xi求偏导就是对重叠的区域求偏导，多个区域偏导求和，一个和的维度是位置，一个和的维度是区域。

2.2K0 0

R语言多项逻辑回归-因变量是无序多分类

“医学和生信笔记，专注R语言在临床医学中的使用、R语言数据分析和可视化。主要分享R语言做医学统计学、临床研究设计、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物信息学等。...R语言二项逻辑回归：R语言logistic回归的细节解读多项逻辑回归因变量是无序多分类资料（＞2）时，可使用多分类逻辑回归（multinomial logistic regression）。...不过也是两个模型的结果，分别是社区宣传和传统大众传媒比，网络和传统大众传媒比。...value 344.964259 ## final value 338.603448 ## converged # 两个模型比较,Likelihood ratio tests anova(fit0...2： DescTools::PseudoR2(fit, which = "all") ## McFadden McFaddenAdj CoxSnell Nagelkerke

9643 0

快速了解 Faster R-CNN

一、Fast R-CNN解释 Fast R-CNN 有两个网络：建议窗口网络（RPN）生成建议窗口并使用这些窗口检测物体。...在Fast R-CNN 的默认配置中，图像位置有9个锚点。下图显示了尺寸为（600,800）图像的位置（320,320）的9个锚点。 ?...绝对的尺寸不小于滑动窗和金字塔的组合。或者你可以推断这就是为什么它的覆盖范围和其他最先进的方法一样好。这里的好处是我们可以使用建议窗口网络，Fast R-CNN 中的方法来显着减少数量。...这里的基本思想是我们想要将具有较高重叠的锚点标记为准确值框作为前景，将具有较低重叠的锚点标记为背景。显然，它需要一些调整和妥协来分离前景和背景。你可以在实现过程中查看此处的详细信息。...本文使用左上方位置（x，y）的平滑L1损失，以及高度和宽度的对数，与Fast R-CNN 中的相同。 ?

7543 0

文心一言 VS 讯飞星火 VS chatgpt （199）-- 算法导论14.3 7题

请给出一个O(nlgn)时间的算法，来确定n个这种表示的矩形集合中是否存在两个重叠的矩形。你的算法不一定要输出所有重叠的矩形，但对于一个矩形完全覆盖另一个(即使边界线不相交)，一定能给出正确的判断。...对每个矩形，将其最小和最大的x坐标以及对应的y坐标添加到线段树中。遍历线段树，对于每个节点，检查其子节点是否存在一个矩形，该矩形的y坐标范围与当前节点的y坐标范围重叠。...注意：上述代码仅用于演示算法的实现，实际应用中，可以根据具体需求进行优化和扩展。 chatgpt，代码正常运行：要确定n个这种表示的矩形集合中是否存在两个重叠的矩形，可以使用扫描线算法。...如果在任何时候交叉计数器大于1，则说明存在两个重叠的矩形。运行以上示例代码，如果给定的矩形集合中存在重叠的矩形，则输出"存在重叠的矩形"；否则输出"不存在重叠的矩形"。...hasOverlap 函数用于检查两个矩形是否重叠。checkOverlap 函数用于检查 n 个矩形集合中是否存在重叠的矩形。请注意，这个实现假设矩形的边界是整数。

1192 0

python 画子图股票成交量图像

在技术分析时通常会将价格和成交量相结合来判断主力的动向，比如在主力拉高股价出货时，往往当日的股价会出现“过山车”的走势，同时成交量会出现近期的“天量”。...由于K线和成交量是两种类别的技术指标，我们不仅要将它们分别在两个子图上进行显示，而且需要协调两个子图的位置和比例。...此处导入matplotlib的gridspec模块创建子图，GridSpec可自定义子图的位置和调整子图行和列的相对高度和宽度，如下所示： # 成交量可视化 #绘制K线图+移动平均线+成交量 import...600797 浙大网新-日K线") graph_KAV.set_ylabel(u"价格") graph_KAV.set_xlim(0, len(df_stockload.index)) # 设置一下x轴的范围...graph_VOL.set_xlim(0,len(df_stockload.index)) #设置一下x轴的范围 graph_VOL.set_xticks(range(0,len(df_stockload.index

1.8K1 0

一文带你了解 Faster R-CNN

/@smallfishbigsea/faster-r-cnn-explained-864d4fb7e3f8 Fast R-CNN解释 Fast R-CNN 有两个网络：建议窗口网络（RPN）生成建议窗口并使用这些窗口检测物体...简而言之，RPN对区域框（称为锚点）进行排名，并提出最可能包含物体的框。结构如下。 ? Fast R-CNN 结构锚锚在Fast R-CNN 中扮演着重要角色。锚是一个盒子。...绝对的尺寸不小于滑动窗和金字塔的组合。或者你可以推断这就是为什么它的覆盖范围和其他最先进的方法一样好。这里的好处是我们可以使用建议窗口网络，Fast R-CNN 中的方法来显着减少数量。...这里的基本思想是我们想要将具有较高重叠的锚点标记为准确值框作为前景，将具有较低重叠的锚点标记为背景。显然，它需要一些调整和妥协来分离前景和背景。你可以在实现过程中查看此处的详细信息。...本文使用左上方位置（x，y）的平滑L1损失，以及高度和宽度的对数，与Fast R-CNN 中的相同。 ?

1.2K3 0

Single Shot MultiBox Detector论文翻译——中文版

我们的改进包括使用小型卷积滤波器来预测边界框位置中的目标类别和偏移量，使用不同长宽比检测的单独预测器（滤波器），并将这些滤波器应用于网络后期的多个特征映射中，以执行多尺度检测。...相比于最近备受瞩目的残差网络方面的工作[3]，在检测精度上这是相对更大的提高。而且，显著提高的高质量检测速度可以扩大计算机视觉使用的设置范围。...在每个特征映射单元中，我们预测单元中相对于默认边界框形状的偏移量，以及指出每个边界框中存在的每个类别实例的类别分数。...具体而言，对于给定位置处的kk个边界框中的每一个，我们计算cc个类别分数和相对于原始默认边界框形状的44个偏移量。...类似于Faster R-CNN[2]，我们回归默认边界框(dd)的中心偏移量(cx,cycx, cy)和其宽度(ww)、高度(hh)的偏移量。

1.2K0 0

【算法】双指针、位运算、离散化、合并区间

1.双指针双指针的算法可以优化时间复杂度,双指针，指的是在遍历对象的过程中，不是普通的使用单个指针进行访问，而是使用两个相同方向（快慢指针）或者相反方向（对撞指针）的指针进行扫描，从而达到相应的目的...现在，我们首先进行 n 次操作，每次操作将某一位置 x 上的数加 c。接下来，进行 m 次询问，每个询问包含两个整数 l 和 r，你需要求出在区间 [l,r][l,r] 之间的所有数的和。...输入格式第一行包含两个整数 n 和 m。接下来 n 行，每行包含两个整数 x 和 c。再接下来 m 行，每行包含两个整数 l 和 r。...接下来 n 行，每行包含两个整数 l和 r。输出格式共一行，包含一个整数，表示合并区间完成后的区间个数。...请你合并所有重叠的区间，并返回一个不重叠的区间数组，该数组需恰好覆盖输入中的所有区间。

2032 0

点击加载更多

扫码

添加站长进交流群

领取专属 10元无门槛券

手把手带您无忧上云

扫码加入开发者社群

相关资讯

热门标签

活动推荐

运营活动

活动名称

广告关闭