论文 关于永久群内容的说明 ❝给予长期支持我们的忠实读者们一个特别待遇：凡是购买过小编2022年或2023年VIP会员文档的朋友们，「将自动获得2024年及以后更新的绘图文档代码，无需额外付费。」...目前这两年的会员文档已累记卖出1500+，质量方面各位无需担忧。简要概括就是只要购买任意1年的会员内容，2024及后期公众号所更新的绘图文档均会在已经加入的会员群内分享。...❞ 加载R包 library(tidyverse) library(ggtree) library(treeio) library(ape) library(magrittr) library(ggtreeExtra...6.xlsx") %>% column_to_rownames(var="Tissue") %>% t() %>% dist() %>% ape::bionj() 按行进行聚类
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝最近有朋友需要绘制环状热图叠加多层注释，本节来通过一个例子来简单介绍一下如何实现，主要通过「ggtreeExtra」来实现，聚类分析使用「ape」包来进行更加适用于生物信息相关的数据...「数据代码已经整合上传到2023VIP交流群」，加群的观众老爷可自行下载，有需要的朋友可关注文末介绍加入VIP交流群。...❞ 关于永久群内容的说明 ❝给予长期支持我们的忠实读者们一个特别待遇：凡是购买过小编2022年或2023年VIP会员文档的朋友们，「将自动获得2024年及以后的绘图资料和代码更新，无需额外付费。」...目前这两年的会员文档已累记卖出1500+，质量方面各位无需担忧**。简要概括就是只要购买任意1年的会员内容，2024及后期公众号所更新的绘图文档均会在已经加入的会员群内分享。...❞ 加载R包 library(tidyverse) library(ggtree) library(treeio) library(ape) library(magrittr) library(ggnewscale
解决方案 定义一个惰性属性最有效的方法就是利用描述符类来完成它，示例如下: class lazyproperty: def __init__(self, fun): self.fun...为什么会这样 如果类中定义了 __get__()、__set__() 、__delete__() 中的任何方法，那么这个就被成为描述符(descriptor)。...__dict__['x']，再继续通过 type(a) 的基类开始。 而如果查找的值是一个描述符对象，则会覆盖这个默认的搜索行为，优先采用描述符的行为，这个行为会因为如果调用而有些不同。...__get__ 这种惰性求值的方法在很多模块中都会使用，比如django中的 cached_property： 使用上与例子一致，如表单中的 changed_data : 讨论 在大部分情况下，让属性具有惰性求值能力的全部意义就在于提升程序性能...所有的 get 操作都必须经由属性的 getter 函数来处理，这比直接在实例字典中查找相应的值要慢一些。
UML 从目标系统的不同角度出发，定义了用例图、类图、对象图、状态图、活动图、时序图、协作图、构件图、部署图等 9 种图。 这里简单介绍下设计模式种经常用到的类图，以及类之间的关系。...类、接口和类图 类（Class）是指具有相同属性、方法和关系的对象的抽象，它封装了数据和行为，是面向对象程序设计（OOP）的基础，具有封装性、继承性和多态性等三大特性。...https://gitee.com/zxxfire/blogImags/raw/master/img/20200831222751.png 3.类图 类图（ClassDiagram）是用来显示系统中的类...根据类与类之间的耦合度从弱到强排列，UML 中的类图有以下几种关系：依赖关系、关联关系、聚合关系、组合关系、泛化关系和实现关系。其中泛化和实现的耦合度相等，它们是最强的。 1....在代码中，某个类的方法通过局部变量、方法的参数或者对静态方法的调用来访问另一个类（被依赖类）中的某些方法来完成一些职责。
最近有朋友问R中绘制冲积图的代码，其本质仍然是条形图只是添加了样本间的连线；案例要求按列计算每个样本的相对丰度跟往常有所不同。...加载R包 library(tidyverse) library(ggsci) library(magrittr) library(reshape) library(RColorBrewer) library...,read_tsv("group.xls"),by=c("name"="sample")) 绘制冲积图 ggplot(plot, aes(name, value, alluvium = Genus, stratum...、大小，颜色为黑色 axis.title.y = element_text(margin = margin(r = 10), size = 11, color = "black"), # 设置...= element_blank() # 设置图例框背景为空白 ) 图片 绘制组间冲积图 plot %>% select(1,3,4) %>% group_by(Genus,group) %>%
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝最近有朋友问R中绘制冲积图的代码，其本质仍然是条形图只是添加了样本间的连线；案例要求按列计算每个样本的相对丰度跟往常有所不同。...下面小编就来简单介绍一下代码 ❞ 加载R包 library(tidyverse) library(ggsci) library(magrittr) library(reshape) library(RColorBrewer...,read_tsv("group.xls"),by=c("name"="sample")) 绘制冲积图 ggplot(plot, aes(name, value, alluvium = Genus,...、大小，颜色为黑色 axis.title.y = element_text(margin = margin(r = 10), size = 11, color = "black"), # 设置...= element_blank() # 设置图例框背景为空白 ) 绘制组间冲积图 plot %>% select(1,3,4) %>% group_by(Genus,group) %>%
❝在R中创建sina图使用geom_sina函数，sina图是一种用于显示单个分类变量的每个观测值的图形。它与箱线图和小提琴图类似，但是它显示了每个单独的数据点，这可以提供关于数据分布的更多信息。...❞ 「sina图的主要优点是它可以清楚地显示每个数据点，而不是简单地显示数据的总体分布。这使得sina图特别适用于小样本大小的数据集，其中每个数据点的值都很重要。」...gas_day_started_on)) 数据可视化 df %>% ggplot(aes(x=mth, y=gas_in_storage_t_wh,group=mth)) + # 使用ggforce包中的...), lab=c("2","4","6","8TWh")), aes(x=x, y=y, label=y),inherit.aes = FALSE)+ # 使用scico包中的...month.abb[1:12]) + scale_y_continuous(breaks=c(seq(0,8,2))) + coord_polar() + # 使用极坐标系 # 使用cowplot包中的
类图 UML（Unified Modeling Language，统一建模语言）中的类图（Class Diagram）是一种静态结构图，它用于展示系统中的类（class）、接口（interface）、协作...画类图的好处 类图是面向对象设计中的重要工具，它的主要优点包括： 提供系统的视觉表示：类图提供了系统的静态视图，可以清晰地展示系统中的类以及它们之间的关系。...在学习设计模式的过程中，一定要自己画类图，这样可以更好地理解设计模式的实现原理，并且在实际开发中能够更好地应用设计模式。 类图三元素 类（Class）：类是类图的主要元素，通常用一个矩形表示。...在这个例子中，Dog类继承自Animal类，因此Dog类具有Animal类的eat方法。...注意： 在这个例子中，Dog类继承自Animal类，因此Dog类具有Animal类的eat方法。 5.
p=13546 ---- 变量重要性图是查看模型中哪些变量有趣的好工具。由于我们通常在随机森林中使用它，因此它看起来非常适合非常大的数据集。...大型数据集的问题在于许多特征是“相关的”，在这种情况下，很难比较可变重要性图的值的解释。 为了获得更可靠的结果，我生成了100个大小为1,000的数据集。...顶部的紫色线是的可变重要性值 ，该值相当稳定（作为一阶近似值，几乎恒定）。红线是的变量重要性函数， 蓝线是的变量重要性函数 。例如，具有两个高度相关变量的重要性函数为 ?...实际上，我想到的是当我们考虑逐步过程时以及从集合中删除每个变量时得到的结果， apply(IMP,1,mean)} 在这里，如果我们使用与以前相同的代码， 我们得到以下图 plot(C,VI[2,]...然而，当我们拥有很多相关特征时，讨论特征的重要性并不是那么直观。
p=13546 ---- 变量重要性图是查看模型中哪些变量有趣的好工具。由于我们通常在随机森林中使用它，因此它看起来非常适合非常大的数据集。...大型数据集的问题在于许多特征是“相关的”，在这种情况下，很难比较可变重要性图的值的解释。...例如，具有两个高度相关变量的重要性函数为 看起来 比其他两个 要 重要得多，但事实并非如此。只是模型无法在 和 之间选择 ：有时会 被选择，有时会被选择 。...实际上，我想到的是当我们考虑逐步过程时以及从集合中删除每个变量时得到的结果， apply(IMP,1,mean)} 在这里，如果我们使用与以前相同的代码， 我们得到以下图 plot(C,VI[2,],type...关联度接近1时，与具有相同 ，并且与蓝线相同。 然而，当我们拥有很多相关特征时，讨论特征的重要性并不是那么直观。
它的特点是简单、统一、图形化、能表达软件设计中的动态与静态信息。 统一建模语言能为软件开发的所有阶段提供模型化和可视化支持。...类图 类（Class）是指具有相同属性、方法和关系的对象的抽象，它封装了数据和行为，是面向对象程序设计（OOP）的基础，具有封装性、继承性和多态性等三大特性。...在 UML 中，类使用包含类名、属性和操作且带有分隔线的矩形来表示。 首先讲解关系先来看一个例子： ?...下面具体介绍各个箭头符号的作用 首先介绍图形 类 类一般是用三层矩形框表示，第一层表示类的名称，第二层表示的是字段和属性，第三层则是类的方法。第一层中，如果是抽象类，需用斜体显示。图片来源[3] ?...UML中用实心菱形头的实线来表示组合，菱形头指向整体。 ? 类符号 以上就是类图之间的关系符号，还有就是在类中+号是什么意思，其实不光有+号。 ?
而在 SpringBoot 开发中，统一返回类型 R 类则是我们手中的一把利剑，帮助我们在这场战斗中取得胜利。 定义和作用 那么，什么是 R 类呢？...让我们继续这段令人兴奋的开发之旅，共同提升 SpringBoot 应用的质量和用户体验。 R 类的设计 在 SpringBoot 开发中，R 类不仅仅是一个工具类，它是我们与前端沟通的桥梁。...状态码和消息的设置 状态码和消息是 R 类中至关重要的两个属性。...使用 R 类的最佳实践 R 类作为 SpringBoot 开发中的一个重要工具，可以帮助我们统一和规范后端 API 的响应格式。...为了支持多语言国际化，我们可以在 R 类中添加一个 locale 属性，用于指定当前响应的语言环境，并在消息的获取过程中根据语言环境返回相应的消息内容。
韦恩图（venn）又称文氏图，是科研文章中最常见的图，可以用来表示多个数据集之间的关系。当然也可以进行集合运算。一般用于展示2-5个集合之间的交并集关系。...集合数目更多时，将会比较难分辨，更多集合的展示方式一般使用upSetView。绘制韦恩图的工具有很多，这里小编先给没有任何编程基础的人推荐几款比较好用的网络工具。 1....=========华丽的分割线============ 对于掌控性要求比较高的同学，可以试着自己写R代码来绘制韦恩图。...今天我们就来重现下面这篇学术论文里面的韦恩图 Fig3为韦恩图 下面我们用R里面的VennDiagram包来重现这个图 我们这里就不用原文作者的数据了，而是随机产生了4个gene list，这四个...R的UpSetR包来画Upset plot，如下
T给定排放超标之间的平均间隔（年） R是POT系列中的流量等级（最大流量是等级1） n是数据的年数。 请注意，这是记录的年数，而不是峰值数。...因此，我们不能使用绘图位置公式来计算阈值峰值序列中的数据的AEP。取而代之的是，方程式1的逆可以解释为EY，即每年的预期超出次数。 ARR示例将指数分布拟合为概率模型。...图2：河流的部分序列显示契合度和置信区间 我个人更希望该图向右增加，这通常是洪水频率曲线的绘制方式。这仅涉及使用ARI作为纵坐标（图3）。...图3：河流部分序列显示契合度和置信区间 ---- 参考文献 1.R语言基于ARMA-GARCH-VaR模型拟合和预测实证研究 2.R语言时变参数VAR随机模型 3.R语言时变参数VAR随机模型 4.R...语言基于ARMA-GARCH过程的VAR拟合和预测 5.GARCH（1,1），MA以及历史模拟法的VaR比较 6.R语言时变参数VAR随机模型 7.R语言实现向量自动回归VAR模型 8.R语言随机搜索变量选择
Figure3c image.png 论文中对应的图注 Distribution of sequence identity values between genomic copies and consensus...re.compile(pattern01) pattern02 = "ID=\S+;" regexp02 = re.compile(pattern02) fr = open(input_txt,'r'...scale_color_manual(values = c("#2d2884","#c2a20c","#6497d0"), name="Element") image.png 和论文中的图并不能完全对应上...，不太清楚论文中是怎么来统计这个值的 怎么根据这个identity的值算插入时间暂时还没有搞明白 这个图的峰和binwidth的值设置是有关系，binwidth如果改动，line的第二个峰也会有影响，不太明白这个参数应该怎么设置...论文中对这个图的描述文字 To investigate the evolutionary history of TEs in the apple genome, we plotted the distribution
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍如何在R中绘制树状热图，通过「sourmashconsumr」 & 「metacoder」两个R包的案例来进行介绍，更多详细的内容请参考作者官方文档。..., groups = metadata) 设置随机种子 set.seed(1) 绘制树状图热图...metacoder后的结果，其对代码做了简化；下面来通过一个案例来介绍「metacoder」包 ❞ 载入metacoder包 library(metacoder) 解析分类数据 obj <- parse_tax_data...tax_data进行处理 obj$data$tax_data <- zero_low_counts(obj, dataset = "tax_data", min_count = 5) 检查没有reads的行...calc_n_samples(obj, "tax_abund", groups = hmp_samples$body_site, cols = hmp_samples$sample_id) 绘制树状图热图
cm(i,:),'MarkerSize',4); hold on; end plot(A2(1,:),A2(2,:),'o','MarkerFaceColor', 'r'
欢迎关注R语言数据分析指南 加载R包 library(tidyverse) library(ggthemes) library(magrittr) library(WGCNA) library(linkET...# 转置 datExpr0 <- t(gene_exp) # 缺失数据及无波动数据过滤 gsg 的缺失数据比例阈值...datExpr <- datExpr0[gsg$goodSamples, gsg$goodGenes] WGCNA绘制模块热图 MEs2 % dplyr::select(1:20)...zlim = c(-1,1), main = paste("Module-trait relationships")) 绘制模块热图...2)) + scale_colour_manual(values = color_pal(3)) + guides(size = guide_legend(title = "Mantel's r"
一.类 类（class）封装了数据和行为，是面向对象的重要组成部分，他是具有相同操作、属性、关系的对象集合的总称。...在软件运行时，类被实例化成对象（object），对象对应某个具体的事物，是类的实例（instance） 类图（class diagram）使用出现在系统中的不同类来描述系统的静态结构，它用来描述不同的类以及它们之间的关系...1）实体类：对应系统中的每个实体，它们通常需要保存在永久存储体中，一般使用数据库或文件表来记录，实体类既包括存储和传递数据的类，还包括操作数据的类。实体类来源于需求说明中的名词，如学生、商品等。...具有同生共死的关系。 在UML中用带实心菱形的直线表示。 比如，头是整体，嘴巴只是一个部分。...这种关系中，类实现了接口，类中的操作实现了接口中所做的声明。 在UML中类与接口之间的实现关系用带空心三角形的虚线来表示。
因为两个实体类的操作极为相似，我们可以提取出来一个接口，进行统一操作。这里只有两个实体类，可能优势不明显，但如果有八个十个呢？...现在XCoder新模版（2012年3月以后）生成的实体类都是分部类，都对应有一个分部实体接口。...由于XCode是充血模型，我们可以为这两个实体类做一个统一的基类来达到我的目的，但是这个统一的基类里面无法访问子类的字段，编码上很不方便。 这一次，我们用分部接口！...先来看看这两个实体类 image.png image.png 这两个实体类，就RentID和SaleID字段的不同，其它都一样，包括名字、类型、业务意义。...实际上也不应该修改原有的接口文件，因为原有的接口位于实体类的数据类文件中，那是随时会被新的代码生成覆盖。
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