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【R语言】因子在临床分组中的应用

前面给大家简单介绍了 ☞【R语言】R中的因子（factor）今天我们来结合具体的例子给大家讲解一下因子在临床分组中的应用。我们还是以TCGA数据中的CHOL（胆管癌）这套数据为例。...关于这套临床数据的下载可以参考 ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) 前面我们也给大家介绍过一些处理临床数据的小技巧 ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper...*","stage I/II",stage) #转换成因子 stage=factor(stage) stage 可以得到下面这个两分组的因子方法二、直接使用factor函数 #删除组织病理学分期末尾的...参考资料： ☞【R语言】R中的因子（factor） ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper ☞R生成临床信息统计表...☞玩转TCGA临床信息 ☞TCGAbiolinks获取癌症临床信息 ☞肿瘤TNM分期 ☞R替换函数gsub

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R中如何用ifelse进行数据分组

数据分组，根据数据分析对象的特征，按照一定的数值指标，把数据分析对象划分为不同的区间部分来研究，以揭示内在的联系和规律性；在R中，我们常用ifelse函数来进行数据的分组，跟excel中的if函数是同一种用法..."(20,40]" "(0,20]" "(60,80]" "(80,100]" [15] "(0,20]" > newData <- data.frame(data, level) 数据分组后的结果

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「R」逻辑回归

问题你想要运用逻辑回归分析。方案逻辑回归典型使用于当存在一个离散的响应变量（比如赢和输）和一个与响应变量（也称为结果变量、因变量）的概率或几率相关联的连续预测变量的情况。...它也适用于有多个预测变量的分类预测。假设我们从内置的mtcars数据集的一部分开始，像下面这样，我们将vs作为响应变量，mpg作为一个连续的预测变量，am作为一个分类（离散）的预测变量。...（就像直线回归中x可以预测y一样，只不过是两个连续变量，而逻辑回归中被预测的是离散变量），逻辑回归可能适用。...下面例子中，mpg是连续预测变量，vs是离散响应变量。..... # 执行逻辑回归 —— 下面两种方式等效 # logit是二项分布家族的默认模型 logr_vm <- glm(vs ~ mpg, data=dat, family=binomial) logr_vm

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WPF 探索任务管理器的进程分组逻辑

在看到 Win10 或 Win11 的 Task Manager 任务管理器时，不知大家是否有一个疑问，在进程标签里的应用进程是如何分组的。为什么有些组能包含很多个不同的进程，有些只能包含一个。...本文将使用 WPF 写一个简单的应用来告诉大家任务管理器的进程分组策略如下图，这是任务管理器看到的 VisualStudio 的界面，可以看到这个进程组里面包含很多个进程那任务管理器将这些进程放在一个组里面的依据是什么...要是微软想不开，改了行为，那本文给出的分组策略也许就不对任务管理器的分组依据是：前台进程所直接启动的后台进程，将会放入到此前台进程所在的组里面这里的前台进程指的是应用里面可以看到的进程，也是有带主窗口且显示的进程...前台进程所直接启动的后台进程的逻辑含义是此前台进程和对应的后台进程有父子进程关系而后台进程指的是没有前台主窗口的进程，和是否控制台应用没有很大的关系，如果是控制台应用且有前台控制台窗口主机，依然不会被加入组内...为了更好的控制应用的逻辑，这里删除了 App.xaml 和 App.xaml.cs 文件，更改为自己编写 Main 函数添加 Program 类，代码如下，用来在没有传入参数的时候，显示 MainWindow

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Python中的groupby分组

写在前面：之前我对于groupby一直都小看了，而且感觉理解得不彻底，虽然在另外一篇文章中也提到groupby的用法，但是这篇文章想着重地分析一下，并能从自己的角度分析一下groupby这个好东西~...OUTLINE 根据表本身的某一列或多列内容进行分组聚合通过字典或者Series进行分组根据表本身的某一列或多列内容进行分组聚合这个是groupby的最常见操作，根据某一列的内容分为不同的维度进行拆解...one) (('b', 'two'), data1 data2 key1 key2 3 -1.125619 -0.836119 b two) 通过字典或者Series进行分组...(mapping,axis=1).mean() solution2：通过Series分组 mapping2 = pd.Series(mapping) # mapping2 橘子水果眼影...，在groupby之后所使用的聚合函数都是对每个group的操作，聚合函数操作完之后，再将其合并到一个DataFrame中，每一个group最后都变成了一列（或者一行）。

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「R」绘制分组排序点图

在 R 包中，我有看到过 maftools 中可以绘制这样的图，用来表示新的数据队列与 TCGA 数据的比较，这也是应用于 TMB 分析。因为研究问题，我最近也想尝试使用改种图形来展示数据。...下面是一个使用示例，通过构建一个示例数据进行绘图，展示如何传入分组变量和值变量、分组标签位置、排序以及点的透明度等： set.seed(1234) data <- data.frame( yval...源代码目前该图的实现代码如下，代码通过 https://github.com/ShixiangWang/sigminer/blob/master/R/show_group_distribution.R...使用 ggplot2 实现这个图我遇到了不少难点，在实现的过程中除了深入理解了 ggplot2，我也同时感受到了它的灵活和限制。...难度有以下几点，感兴趣的读者不妨带着这些问题阅读源代码：怎么对点排序，构建绘图坐标？怎么对不同的 panel 展示不同的背景颜色？theme() 中的选项都不支持向量化，所以必须另辟蹊径。

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SQL中的分组集

分组集的定义是多个分组的并集，用于在一个查询中，按照不同的分组列对集合进行聚合运算，等价于对单个分组使用"UNION ALL"，计算多个结果集的并集。...分组集种类 SQL Server的分组集共有三种 GROUPING SETS, CUBE, 以及ROLLUP，其中 CUBE和ROLLUP可以当做是GROUPING SETS的简写版 GROUPING...这样不仅减少了代码，而且这样的效率会比UNION ALL的效率高。通常GROUPING SETS使用在组合分析中。...，其作用是对每个列先进行一次分组，并且对第一列的数据在每个组内还进行一次汇总，最后对所有的数据再进行一次汇总，所以相比GROUPING SETS会多了个所以数据的汇总。...总结分组集类似于Excel的透视图，可以对各类数据进行组内计算，这里不止可以进行数量统计，也可以进行求和，最大最小值等操作。是我们在进行数据分析时候经常使用到的一组功能。

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R语言︱逻辑运算

R软件包含两个逻辑值，TRUE和FALSE。在其他编程语言中也称为布尔值（Boolean values）。布尔向量就是充满着逻辑值的逻辑向量。那么有如何的应用呢？...1、比较运算可以产生逻辑值 >、=、<=、==、!...= b=c(2,3,3,3,5,8,9,3,4,1) a=c(3,4,9) a==b#面对长度不相等的恒等比较，相当于补齐a=c(3,4,9,3,4,9,3,4,9,3)然后一一对比恒等比较的过程中...、&&、||、xor 注意：运算符“逻辑与”和“逻辑或”存在两种形式，“&”和“|”作用在对象中的每一个元素上并且返回和比较次数相等长度的逻辑值；“&&”和“||”只作用在对象的第一个元素上。...> x||y [1] TRUE 3、all()和any() 判断数据中是否存在TRUE值，其中all()是在全部为TURE时返回T，any是在存在任何一个TRUE时返回TRUE。

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R语言分组计算，不止group_by

最近在研究excel透视图，想到好像自己在R-分组操作并不是很流畅，顺便学习分享一下。R自带数据集比较多，今天就选择一个我想对了解的mtcars数据集带大家学习一下R语言中的分组计算（操作）。...目录 1 dplyr包中的group_by联合summarize 1.1 group_by语法 1.2 summarise语法 1.3 group_by和summarise单变量分组计算 1.4...$ carb: num 4 4 1 1 2 1 4 2 2 4 ... 1 dplyr包中的group_by联合summarize 1.1 group_by语法 data为数据集 ...为分组变量...分组变量一定要在“点+括号中”，例如"....“点+括号中”，例如".

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R语言在逻辑回归中求R square R方

也许第二种最常见的回归模型是逻辑回归，它适用于二元结果数据。如何计算逻辑回归模型的R平方？麦克法登R平方在R中，glm（广义线性模型）命令是用于拟合逻辑回归的标准命令。...700 1 为了使逻辑回归模型适合R中的数据，我们可以将响应传递给glm函数，： Call: glm(formula = cbind(s, f) ~ x, family = "binomial",...伯努利数据，并适合相同的逻辑回归模型。...deviance: 2443.5 on 2 degrees of freedom AIC: 2447.5 Number of Fisher Scoring iterations: 4 正如所料，我们从分组数据框中获得相同的参数估计和推论...R平方为0.96，而单个数据模型的R平方仅为0.12。

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R语言·如何实现分组&有序累计求和

Alt+- 管道符号“%>% ” Ctrl+Shift+m 多行注释，例如：# library(tidyverse)# getwd()# setwd("C:/Users/Desktop") 选中需要注释的行...问题：依据group分组，按照dat（日期）升序对num列数据累计求和并生成cum_num列 ? ? 实现过程 ?...geom_point(aes(color=as.factor(group))) + geom_text(aes(label=paste0(num,";",cum_num)))+ labs(title="如何实现分组

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【DB笔试面试524】在Oracle中，逻辑结构由哪几个部分组成？

♣ 题目部分在Oracle中，逻辑结构由哪几个部分组成？ ♣ 答案部分 Oracle中逻辑结构包括表空间（TABLESPACE）、段（SEGMENT）、区（EXTENT）和块（BLOCK）。...逻辑结构图简单如下图所示： ? 图 3-4 Oracle逻辑结构图 Oracle数据库在逻辑上将数据存储在表空间中，在物理上将数据存储在数据文件中。...Oracle中逻辑结构包括表空间、段、区和块。...内 C、TABLE中的数据，通过HASH算法分布在TABLESPACE中的各个DATAFILE中 D、DATAFILE是逻辑上的概念，TABLESPACE则在物理上储存了数据库的种种对象答案：D。...TABLE中的数据，通过HASH算法分布在表空间中的各个数据文件中。表空间是Oracle数据库中最大的逻辑单位与存储空间单位，数据库系统通过表空间为数据库对象分配空间。

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django中app分组

08.13自我总结 django中app分组一.django路由系统app进行分组 1.创建app 使用pycharm创建django的时候，加上app的名字,后续多个app只需复制粘贴之前app整个文件即可...:注册文件 models.py:写表生成的代码 tests.py:测试文件 views.py:视图文件,一般业务逻辑会写在其中 urls.py:格式与主urls.py一样复制过来即可 3.include...正则表达式匹配 urlrouters: url(r'^test/(\w+)/(\w+)/', views.test), url(r'^test1/(?...P的约束，传参的时候，会根据顺序来获取参数对应的值而如果有约束的话，传参的时候，会固定的将获取的值传给所对应的的约束自定制404notfound的页面： url(r'^', views.notfound...form表单的url会自动变成login 如果url(r'^login11', views.login, name='xxx'),上form表单的url会自动变成login11

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分组后合并分组列中的字符串如何操作？

一、前言前几天在Python最强王者交流群【IF】问了一个Pandas的问题，如图所示。...下面是他的原始数据：序号需求处理人 1 优化 A 2 优化 B 3 运维 A 4 运维 C 5 需求 B 6 优化 C 7 运维 B 8 运维 C 9 需求 C 10 运维 C 11 需求 B...如果不去重，就不用unique，完美地解决粉丝的问题！后来他自己参考月神的文章，拯救pandas计划（17）——对各分类的含重复记录的字符串列的去重拼接，也写出来了，如图所示。...这篇文章主要盘点了一个pandas的基础问题，文中针对该问题给出了具体的解析和代码实现，帮助粉丝顺利解决了问题。...最后感谢粉丝【IF】提问，感谢【月神】、【瑜亮老师】给出的思路和代码解析，感谢【dcpeng】等人参与学习交流。

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用R语言做逻辑回归

用R语言做逻辑回归 jmzeng(jmzeng1314@163.com) 回归的本质是建立一个模型用来预测，而逻辑回归的独特性在于，预测的结果是只能有两种，true or false 在R里面做逻辑回归也很简单...其中GRE成绩是连续性的变量，学生可以考取任意正常分数。而GPA也是连续性的变量，任意正常GPA均可。...而我们想做这个逻辑回归分析的目的也很简单，就是想根据学生的成绩排名，绩点信息，托福或者GRE成绩来预测它被录取的概率是多少！...最后第二名的同学比第一名同学在其它同等条件下被录取的优势对数(log odds)小了0.675，看来排名非常重要啊！！！...两者的差值正好是0.675，就是模型里面预测的！

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Python中的分组分析groupby

分组分析根据分组字段，将分析对象划分成不同的部分，以进行对比分析各组之间差异性的一种分析方法。定性分组定量分组分组统计函数： groupby(by=[分组列1,分组列2,...])...参数说明： by 用于分组的列中括号用于统计的列 agg 统计别名显示统计值的名称，统计函数用于统计数据代码示例： import numpy import pandas data = pandas.read_csv

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Oracle中的分组查询与DML

1、Group by 进行分组查询, group by 子句可以将数据分为若干个组 1.1 分组查询注意: 出现在 SELECT 子句中的字段，如果不是包含在多行函数中，那么该字段必须同时在...1.2 带 where 的分组查询注意: group by 子句要写到 where 子句的后面 a) 查询每个部门的人数和平均工资, 排除 10 部门 select deptno, count(...*), avg(sal) from emp where deptno10 group by deptno order by deptno; 1.3 带 having 的分组查询注意: where...子句中不允许使用分组函数, 分组函数用于分组前过滤 having 用于过滤分组后的条件 a) 查询每个部门的总工资和平均工资, 排除平均工资低于 1600 的部门 select deptno...分组查询时相关关键词的顺序： from–>where–>group by–>select–>having–>order by a) 在 emp 表中，列出工资最小值小于 2000 的职位 select

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【逻辑】什么是前端开发中的业务逻辑？

业务逻辑？呵呵，许多前端新人很困惑这个话题。当他们在面试当中被问到“这个业务逻辑你是如何处理的”的时候，他们经常会不知如何回答。什么是业务逻辑？...其实一句话就能说的清，“客户想干什么”，这就是业务逻辑。许多同学搞不清业务逻辑，其实就是没搞清你的客户想要做什么。所以有那么句话说，业务逻辑是由客户的脑洞来决定的。哈哈哈。正经的说哈，什么叫逻辑？咱们不说那些概念哈，就只说普通人能听懂的白话。逻辑不就是有条理嘛。我们说一个人做事说话很有逻辑，很有条理。不就是说，这个人他的思路不混乱嘛。...这叫正常的很有逻辑。那，为什么业务逻辑需要分析呢？刚才我们说了，业务逻辑是由客户的需求决定的。那么客户的需求通常是不连贯的，是跳跃性的，也就是很可能是非逻辑的，并且是经常会变化的。...例如，刚才那个，也许客户的想法是，我要先看到热菜是什么样？再来决定我要不要买这个菜！觉得很不可理喻吧？这个需求是倒着的！！其实在日常开发中很多这种情况。

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shell 中的if逻辑判断

if判断语句，在shell脚本中几乎是每个脚本都会涵盖判断系列的内容，这时候if就会上场。...如果 filename为常规文件，则为真 [ -f /usr/bin/grep ] -L filename 如果 filename为符号链接，则为真 [ -L /usr/bin/grep ] -r...filename 如果 filename可读，则为真 [ -r /var/log/syslog ] -w filename 如果 filename可写，则为真 [ -w /var/mytmp.txt...1.txt中含有'123'的行时会怎么样 if [ !...-e file ]; then 表示文件不存在时会怎么样 if (($a<1)); then …等同于 if [ $a -lt 1 ]; then… [ ] 中不能使用,==,!

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R语言系列五：②R语言与逻辑回归建立

在上一篇文章里，我们给大家介绍了之前系列里提及的线性回归的扩展部分，详情点击：R语言系列五：①R语言与多元回归但医学工作者最常接触的结局预测变量多为二分类变量，比如阳性、阴性，病例、对照乃至生存、死亡这样的变量...我们这里按照数据的原始类型分类来讲解不同的原始数据应该怎样通过R语言建立逻辑回归模型。 ? A. 表格化数据的逻辑回归 ?...，第四个参数用来指定所生成的因子的水平名称。而把这些变量放到一个数据框中，输出更加直观好看。对于表格化的数据进行逻辑回归分析，在R中有两种途径。...Residual Deviance: 1.618 AIC: 34.54 或者： > glm(hyp.tbl~smoking+obesity+snoring,binomial) 另外一种建立逻辑回归模型的方法是给出每个水平组合中得病数的占比以及当前水平组合的总数...，这张表中给出了回归系数的估计、标准差以及每一个系数显著性的假设检验结果。

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