1、R中重复值的处理 unique函数作用：把数据结构中，行相同的数据去除。...<- unique(data) 重复值处理函数：unique，用于清洗数据中的重复值。...2、R中缺失值的处理 缺失值的产生 ①有些信息暂时无法获取 ②有些信息被遗漏或者错误处理了 缺失值的处理方式 ①数据补齐（例如用平均值填充） ②删除对应缺失值（如果数据量少的时候慎用） ③不处理 na.omit...<- na.omit(data) 3、R中空格值的处理 trim函数的作用：用于清除字符型数据前后的空格。...') 使用R.studio的小伙伴，在下载包很慢的的时候，可以使用R的官网站点，在中国地区会快很多，以解决此问题。
我们在训练神经网络的时候，超参数batch_size的大小会对模型最终效果产生很大的影响，通常的经验是，batch_size越小效果越差；batch_size越大模型越稳定。...如何在有限的计算资源下，采用更大的batch_size进行训练，或者达到和大batch_size一样的效果？...结果爆显存了，那么不妨设置batch_size=16，然后定义一个变量accum_steps=4，每个mini-batch仍然正常前向传播以及反向传播，但是反向传播之后并不进行梯度清零，因为PyTorch中的...通过这种延迟更新的手段，可以实现与采用大batch_size相近的效果 References pytorch中的梯度累加(Gradient Accumulation) Gradient Accumulation...in PyTorch PyTorch中在反向传播前为什么要手动将梯度清零？
将DNA序列看作是只包含['A', 'C', 'G', 'T']4个字符的字符串，给一个DNA字符串 ，找到所有长度为10的且出现超过1次的子串。...序列进行整数编码: [‘A’, ‘C’, ‘G’, ‘T’]4个字符分别用[0, 1, 2, 3](二进制形式(00, 01, 10, 11)所表示，故长度 为10的DNA序列可以用20个比特位的整数所表示...1.设置全局整数哈希int g_hash_map[1048576]; 1048576 = 2^20，表示所有的长度为10的 DNA序列。...3.从DNA的第11个字符开始，按顺序遍历各个字符，遇到1个字符即将key右移2位 (去掉最低位)，并且将新的DNA字符s[i]转换为整数后，或运算最高位(第19 、20位)，g_hash_map[key...4.遍历哈希表g_hash_map，若g_hash_map[i] > 1，将i从低到高位转换为10个字符的DNA 序列，push至结果数组。
在NGS的数据分析中，去除PCR重复序列是一个常见的分析步骤，无论是WES/WGS的snp calling，还是chip_seq, ATAC_seq，都需要对原始的bam文件进行过滤，去除其中的PCR重复序列...在samtools中也提供了去除PCR重复的命令markdup, 该命令对输入的bam文件有以下两点要求 必须是经过samtools fixmate命令处理之后的文件 必须是按照比对上染色体坐标位置排序之后的文件...另外，由于fixmate命令要求输入的bam文件为按照read name,即序列名称排序之后的文件，所以在使用markdup命令时，需要以下4步转换过程 # 第一步，按照read name排序bam文件...2. picard MarkDuplicates picard的MarkDuplicates命令称得上是使用的最广泛的去除PCR重复的工具了，要求输入的bam文件为按照比对位置排序之后的文件，用法如下...input.bam # 第二步，运行markdup命令 sambamba markdup positionsort.bam markdup.bam 除了这三种方法之外，还有很多的工具可以去除PCR重复序列
我的博客即将同步至腾讯云开发者社区，邀请大家一同入驻：https://cloud.tencent.com/developer/support-plan?...在研究 DNA 时，识别 DNA 中的重复序列有时会对研究非常有帮助。 编写一个函数来查找 DNA 分子中所有出现超多一次的10个字母长的序列（子串）。...方法返回true和false来判断子串是否出现超多一次，但是字符串保存的空间消耗大。...复习一下位运算中的按位与或非 按位或规则： 1｜1=1 1｜0=1 0｜1=1 0｜0=0 按位与规则： 1&1=1 1&0=0 0&1=0 0&0=0 非运算规则： ~1=0 ~0=1 再复习一下十六进制...class Solution { public List findRepeatedDnaSequences(String s) { //ACGT的SCII码的二进制表示
cumsum 可以实现整体的累加 > cumsum(1:10) [1] 1 3 6 10 15 21 28 36 45 55 向量中第一个元素为起始，后面是其需要加的数。...cumprod(x) 累乘 > cumprod(1:5) [1] 1 2 6 24 120 cummax 保留出现的最大的那个数，并不断输出 > cummax(c(3:1, 2:0, 4...格式为： by(data, INDICES, FUN) 其中data是一个数据框或矩阵；INDICES是一个因子或因子组成的列表，定义了分组；FUN是任意函数。...通过INDICES 定义的因子，对data 内容进行分组，即将整个data大数据框，划分为了若干个小的数据框，而函数则定义了对这些分组数据处理的方式。...，其将exp 按照symbol 中的信息划分为若干个矩阵，而function 则定义了在同一组（同一symbol）中的列名筛选其中平均值最大的那一列（ which.max(rowMeans(x)) ）。
}else{ mapnew2.put(k,v); } }); System.out.println("不重复的值...："+mapnew); System.out.println("重复的值："+mapnew2);
前言 在[[15-R编程01-基本数据类型及其操作之向量]] 中，我就已经简单的提过，可以通过unique 或duplicated 非常暴力的实现去重。 那么我们可不可以有更好的策略呢？...比我测量的数据中的a 对应了多个连续值，我可不可对这些连续值进行一定的处理呢？ 当然可以。...，按照Unique_Name 中的内容分组，对其对应的fdr 与G_Score 连续数据取中位数。...：[[35-R数据整理07-使用tidyr和dplyr处理数据框2]] 将重复名称进行顺序标记 比如给重复的这三个名称加上1:n,n 是重复的次数： 思路如下： 将表格元素按照是否重复拆分； 将重复元素的表格...，按照名称进行拆分为列表； 利用lapply 遍历列表中的每个数据框，按照顺序给数据框添加1:n 标记，并加上名称列中； 合并先前的内容； ## duplicated or not duplicated_label
基因组注释包括基因组结构注释和基因组功能注释 结构注释的核心是基因识别，为了提高基因识别效率需要首先寻找并标记去除 重复的和低复杂性的序列。 什么是重复序列？...重复序列（repetitive sequence）是在基因组中不同位置出现的相同或对称性序列片段，一般不编码多肽。组织形式有两种：串联重复序列和分散重复序列。...分类 大致分三类： 低度重复序列 中度重复序列 高度重复序列 特点 GC含量低，AT含量高，3'和5'端有直接重复序列存在，有利形成环形结构。...常用数据库 GIRI的RepBase：常用的真核生物DNA重复序列数据库 RepeatMasker:常用的重复序列分析工具 ALU数据库：人和灵长类Alu重复片段 LINE-1数据库...： STR数据库：短的串联重复序列数据库，不再提供服务 ---- 1 RepeatMasker工具 这个工具有webserver版本和命令行版本 Using and Understanding
keep：对重复值的处理方式，可选{'first', 'last', 'False'}。默认值first，即保留重复数据第一条。...二、加载数据 加载有重复值的数据，并展示数据。...导入数据处理的库 os.chdir('F:/微信公众号/Python/26.基于多列组合删除数据框中的重复值') #把路径改为数据存放的路径 name = pd.read_csv('name.csv...从结果知，参数为默认值时，是在原数据的copy上删除数据，保留重复数据第一条并返回新数据框。 感兴趣的可以打印name数据框，删重操作不影响name的值。...但是对于两列中元素顺序相反的数据框去重，drop_duplicates函数无能为力。 如需处理这种类型的数据去重问题，参见本公众号中的文章【Python】基于多列组合删除数据框中的重复值。 -end-
重复，特别是针对一些样本名称的重复问题的处理，是我在进行生信分析时经常遇到的。一种常见的解决策略是先找到重复之处，然后去重。但如果我们想要保留全部的重复ID呢？...一个简单的例子 生成一个非常简单的带重复的序列： r$> data = c("a", "b", "c", "d", "a")...保留唯一值 r$> unique(data)...解决的思路是对重复ID添加标记，可以是前缀或者后缀，这样既能视觉上识别，也能够通过编程的手段识别或者后续对前后缀裁剪。后缀才容易操作，更为推荐。...如果我们仅想要标记出第二次及以后出现的ID，这样能保留大部分的数据不做改动，怎么操作呢？ R自带了make.unique()解决这个问题！
如果需要把一台MySQL中的数据定期归档到另外一台MySQL历史库中，那么很可能会发现会有重复值的问题，导致数据导入会失败，而这个问题其实是和自增列的重复值有关，我们来简单看看。...int, primary key (id)) engine=innodb; Query OK, 0 rows affected (0.02 sec)然后插入3条数据，第一条指定id为1，后面两条id值自增...这个时候使用show create table查看，定义信息中自增列的值为4，即再插入一条记录，id值为4....，它是根据max(id)+1的方式来计算的。...导出数据 mysqldump test t1 > t1.sql 导出的sql文本如下，可以看到里面是指定id值的方式，而非空。 LOCK TABLES `t1` WRITE; /*!
${qiu[*]}" exit fi #不能超过数组长度 if [ $1 -ge ${qiu_chang} ];then echo "不能超过数组长度" exit fi #根据下标来删除数组中的元素...RANDOM%qiu_chang]` #输出一下 echo ${qiu[$shu]} shuzu let qiu_chang-- done 日期：2018/6/12 介绍：从数组里随机抽一个，但不会重复
min_val, length # 测试 seq = [1, 2, 3, 4, 5] max_val, min_val, length = get_sequence_info(seq) print("最大值：...", max_val) print("最小值：", min_val) print("元素个数：", length) 解释一下代码： 第1行定义了一个名为get_sequence_info的函数，输入参数是一个序列...第2~4行在序列上使用内置函数max、min、len分别求出序列的最大值、最小值和元素个数。 第5行使用元组以逗号分隔的方式返回以上三个结果。...第811行创建一个序列`seq`，并在第1315行调用get_sequence_info函数，将返回元组中的值赋给对应的变量max_val、min_val和length。 最后输出相关信息。...使用元组作为函数返回值的好处是可以方便地在函数返回多个数值，而不需要显式构建字典或列表等数据结构。
Excel中同时删除多行合并重复值的问题不复杂，但也有人会犯错，以下对其具体操作方法以及容易犯的错误分别进行描述。...一、删除重复值操作方法 选中所有列，单击“删除重复值”，在弹出窗口中，仅勾选A列和B列（即去掉C列前的勾），然后确定即可，如下图所示： 操作结果如下，可以看出，相应的C列的内容也已被一并删除...： 二、删除重复值容易犯的错误 有些用户在操作删除重复项时，由于Excel的使用习惯是想对什么操作就选什么，于是仅选择了A列和B列（没有连C列一起选中），然后单击“删除重复项”，如下图所示...在线M函数快查及系列文章链接（建议收藏在浏览器中）： https://app.powerbi.com/view?...r=eyJrIjoiZDVhZDBlMTYtNDkzNC00YWFjLWFhMmMtMmI3NTk2Y2ZhMzc3IiwidCI6ImUxMTAyMjkxLTNkYzUtNDA1OC1iMDc3LWQ0YzU4YWJkMWRkOCIsImMiOjEwfQ
方法1 生成的值为从 0 开始，每次增加 1。实现如下： function getUniqId(){ getUniqId._id = '_id' in getUniqId ?..._id; } 方法2 生成的值为现在至格林威治时间 1970 年 01 月 01 日 00 时 00 分 00 秒(北京时间 1970 年 01 月 01 日 00 时 00 分 00 秒)的总毫秒数。...实现如下： function now(){ return (Date.now && Date.now()) || new Date().getTime(); } 方法3 生成的值为 GUID(全局唯一标识符...全局唯一标识符（GUID，Globally Unique Identifier）是一种由算法生成的二进制长度为128位的数字标识符。GUID主要用于在拥有多个节点、多台计算机的网络或系统中。...在理想情况下，任何计算机和计算机集群都不会生成两个相同的GUID。GUID 的总数达到了2128（3.4×1038）个，所以随机生成两个相同GUID的可能性非常小，但并不为0。
查找重复值、移除重复值，都是Excel中的经典问题，可以使用高级筛选功能，也可以使用复杂的公式，还可以使用VBA。...在VBA中，也有多种方式可以移除重复值，这里介绍RemoveDuplicates方法，一个简洁实用的方法。 示例数据如下图1所示，要求移除数据区域A1:D7中第3列（列C）中的重复值。...其中，参数Columns是必需的，指定想要移除重复值的列。注意，可以指定多列。...如果想要指定多个列，使用Array函数： Range("A1:E15").RemoveDuplicates Columns:=Array(3, 5), Header:=xlYes 此时，如果这两列中的值组合是重复的...示例：获取每个超市中销售量最多的区域 下面的数据是各超市在不同区域的销售量，已经按照销售量进行了统一排名，现在要获取每个超市销售量最多的区域，也就是说对于列C中重复出现的超市名称，只需保留第1次出现的超市名称的数据
最近公司在做关联图谱的项目，想挖掘团伙犯罪。在准备关系数据时需要根据两列组合删除数据框中的重复值，两列中元素的顺序可能是相反的。...本文介绍一句语句解决多列组合删除数据框中重复值的问题。 一、举一个小例子 在Python中有一个包含3列的数据框,希望根据列name1和name2组合(在两行中顺序不一样)消除重复项。...import numpy as np #导入数据处理的库 os.chdir('F:/微信公众号/Python/26.基于多列组合删除数据框中的重复值') #把路径改为数据存放的路径 df =...由于原始数据是从hive sql中跑出来，表示商户号之间关系的数据，merchant_r和merchant_l中存在组合重复的现象。现希望根据这两列组合消除重复项。...从上图可以看出用set替换frozense会报不可哈希的错误。 三、把代码推广到多列 解决多列组合删除数据框中重复值的问题，只要把代码中取两列的代码变成多列即可。
一、题目描述 所有 DNA 都由一系列缩写为 'A'，'C'，'G' 和 'T' 的核苷酸组成，例如："ACGAATTCCG"。在研究 DNA 时，识别 DNA 中的重复序列有时会对研究非常有帮助。...编写一个函数来找出所有目标子串，目标子串的长度为 10，且在 DNA 字符串 s 中出现次数超过一次。...L 的滑动窗口。...检查滑动窗口中的序列是否在 HashMap中。 如果是，则找到了重复的序列，将序列假如到HashSet中。 否则，将序列添加到 HashMap中。...在执行的循环中，有N−L+1 个长度为 L 的子字符串，这会导致 O((N−L)L) 时间复杂性。
一个需求，实现去除列表中的多个重复对象。 比如 a,b,c 在列表1 出现，bc 在列表2 出现，ad 在列表3 出现，那么仅仅保留1:abc, 2:空, 3:d。...这个列表中的对象可以是数据框，也可以是单个字符，也可以是列表，可以是任何类型的对象。...一个举例场景就是： 我有一个列表对象，这个列表对象里还有若干个列表，每个列表里面还有若干个对象，每个对象是一个存放基因名的向量。 这些不同的列表是不同的实验，而每个对象对应的是一个样本的富集基因。...我希望取出那些独立的不重复的基因集。比如去做后续的PPI网络分析。ps：这个例子只是我随便想的，可能不够严谨。就如同我后面的代码。...思路就是循环列表中的每一个子集中的所有内容，去和之前的所有内容进行比较（%in%）；并且子集本身也是去重的。
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