https://r4ds.had.co.nz/transform.html#grouped-summaries-with-summarise
R包是多个函数的集合,具有详细的说明和示例,学习生信R语言必学的原因是丰富的图表和biocductor的各种生信分析R包,包的使用是一通百通的,以dplyr为例,讲解一下R包
6.简单合并:在相当于base包里的cbind()函数和rbind()函数;注意,bind_rows()函数需要两个表格列数相同,而bind_cols()函数则需要两个数据框有相同的行数
options("repos"=c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
dplyr是一个在R语言中非常流行的数据处理包,它提供了许多功能强大且易于使用的函数,包括 select、 filter、mutate、arrange和summarize 等。这些功能使得dplyr成为数据清洗、处理和分析的首选包。
列表书写顺序决定了最终合成列表中列的顺序,每列数值的类型必须相同;以"by"的列为标准,补齐列表,空值为"NA"
R包直接在Rstudio页面下载的3大来源:官网CRAN、Biocductor、github
R包安装命令是install.packages(“包”)#安装的包存在于CRAN网站
R包是多个函数的集合,R语言必学的原因是丰富的图表和Biocductor上面的各种生信分析R包。
还有一种像Linux一样直接修改R中的相当于Linux中的.bashrc/环境文件一样的R的环境文件.Rprofile即可
由于空气污染对公众健康的不利影响,人们一直非常关注。世界各国的环境部门都通过各种方法(例如地面观测网络)来监测和评估空气污染问题
由于空气污染对公众健康的不利影响,人们一直非常关注。世界各国的环境部门都通过各种方法(例如地面观测网络)来监测和评估空气污染问题。全球的地面站及时测量了许多空气污染物,例如臭氧、一氧化碳、颗粒物。EPA(环境保护署)提供了空气污染数据,本文选择了颗粒物2.5(PM2.5)和空气质量指数(AQI)这两个关键变量,以可视化和分析空气污染的趋势和模式。PM2.5代表直径小于2.5微米的颗粒物浓度,AQI是综合考虑所有主要污染物的空气污染状况的整体指标。具体来说,此工作的数据源列出如下:
为了保证可以自定义CRAN和Bioconductor的下载镜像,只需要运行这两行代码即可:
部分人可能会因为镜像的问题失败,解决方法https://mp.weixin.qq.com/s/XvKb5FjAGM6gYsxTw3tcWw
BiocManager::install(“包”)(R包来自Bioconductor)
教程:https://mp.weixin.qq.com/s/XvKb5FjAGM6gYsxTw3tcWw
一个新数据框,其中包含键、 x 值和 y 值。我们使用 by 参数告诉 dplyr 哪个变量是键:
(1)在Rstudio程序设置中设置,可以用options()$repos来检验,但有时候还是不能成功,也不能下载Bioconductor的包
今天的任务是学习R包。以dplyr包的安装加载和使用为例进行学习,因为R包之间的使用是相通的,掌握了一个,后面的可以通过具体代码的学习进行使用。dplyr这个包我以前没有接触过,从这个入手,又能学习到新东西真不错。
这部分介绍一下R语言中的聚合窗口函数,R语言中的聚合窗口函数与sql中的窗口函数有点差异,R语言中的相同记录的累计求和累计平均不再相同。
将 CRAN 镜像地址设置为了清华大学的镜像站点。这样,在使用 R 语言安装或更新包时,系统会优先从清华大学的镜像站点下载,从而加快下载速度
方法一:手动设置,Tools→Packages→Primary CRAN repository
除了选择已存在的列,另一个常见的操作是添加新的列。这就是mutate()函数的工作了。
在这篇文章中,我将对多元线性回归使用block的Gibbs采样,得出block的Gibbs采样所需的条件后验分布。然后,对采样器进行编码,并使用模拟数据对其进行测试 ( 点击文末“阅读原文”获取完整代码数据 )。
上述一串代码意思是新增一列列名为“new”、数值是Sepal.Length * Sepal.Width的列
豆花寄语:学生信,R语言必学的原因是丰富的图表和Biocductor上面的各种生信分析R包。
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #对应清华源
首先用file.edit('~/.Rprofile')打开.Rprofile文件;然后在.Rprofile文件内添加下列两行代码
转录组分析是一种用于研究细胞或组织中所有RNA分子的表达水平的高通量技术。完成转录组分析后,科学家们通常需要通过定量实时聚合酶链式反应(qRT-PCR)来验证二代测序(Next-Generation Sequencing, NGS)结果的可靠性。这是因为qRT-PCR是一种精确的定量方法,可以用来验证特定基因的表达水平。
首先用file.edit()来编辑文件:file.edit('~/.Rprofile')
为了保证我们可以自定义CRAN和Bioconductor的下载镜像,其实是可以在Rstudio中进行设置的,只需要运行这两行代码即可:
对于分类问题,通常根据与分类器关联的混淆矩阵来定义分类器性能。根据混淆矩阵 ,可以计算灵敏度(召回率),特异性和精度。
在这篇文章中,我将对多元线性回归使用block的Gibbs采样,得出block的Gibbs采样所需的条件后验分布。然后,对采样器进行编码,并使用模拟数据对其进行测试。
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An R package is a set of R functions. Using dplyr as an example to learn R packages.
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) 对应清华源
R包安装命令是install.packages(“包”)或者BiocManager::install(“包”)。取决于你要安装的包存在于CRAN网站还是Biocductor。
今天的内容在我刚看到的时候,觉得很难,看不懂每一步代码的意思,不知道是如何得到花花老师的结果的,但是在自己一步一步按照教程来进行操作,仔细比对前后的变化的时候,我对dplry包的使用有了更清晰的认识,这一部分内容需要自己多多练习,才能体会其中的含义。
菜单栏-Tools-Packages-Primary CRAN repository-选择国内镜像
之前写过一篇博文(汇总统计?一个函数全部搞定!),介绍R中编写一个函数,进行汇总统计。效果很不错。今天用tidyverse包实现一下,多角度尝试,然后尝试中学习。
箱线图展示的就是分位数,中间的线表示的是中位数,也就是50%分位数,如果非要在箱线图上画上表示平均值的线段也是可以实现的,今天介绍一下实现代码
大家好,前面通过实例介绍了查询设计的主要步骤,也介绍通配符和常用函数等,本节要介绍的是选择查询分类中的汇总查询。
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