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基于R的竞争风险模型的列线图

以往推文我们已经详细描述了基于R语言的实现方法,这里不再赘述。那么,您如何看待竞争风险模型呢?如何绘制竞争风险模型的列线图?在这里,我们演示如何绘制基于R的列线图。...mstate包中crprep()函数的主要功能是创建此加权数据集,如下面的R代码所示。然后,我们可以使用coxph()函数拟合加权数据集的竞争风险模型,再将其给regplot()函数以绘制列线图。...可以看出,竞争风险模型和Cox比例风险模型计算的累积复发风险略有不同,31号患者的竞争风险模型计算的累积复发风险略低。...实际上,这是一种灵活的方法,即首先对原始数据集进行加权处理,然后使用Cox回归模型基于加权数据集构建竞争风险模型,然后绘制列线图。本文并未介绍对竞争风险模型的进一步评估。...R中的riskRegression包可以对基于竞争风险模型构建的预测模型进行进一步评估,例如计算C指数和绘制校准曲线等。

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    RStuido Server 选择不同的 R 版本(conda 中的不同 R 版本)

    所以我就用资深数据分析师那意味深长的语气劝他(而且一定要营造出分析结果不理想是他数据的问题),R包有很多,为何不换一个呢?...头脑风暴 我有一个设想: 用root权限,新建一个环境R4.1,然后在里面安装R4.1 在R4.1中安装那几个包 将Rstudio的R版本设置为新建环境的R4.1 我的顾虑: 不确定我用root新建的环境...用'contributors()'来看合作者的详细情况 用'citation()'会告诉你如何在出版物中正确地引用R或R程序包。...其它人用Rstudio-server安装R包 因为现在Rstudio-server用的是conda环境中的R4.1,它会在conda环境中有一个library,普通用户没有写入的权限,安装R包时会在自己的路径下自动新建一个...5,没有安装不了的R包,折腾一下总能实现。

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    惊艳 | RStuido server选择不同的R版本(conda中的不同R版本)

    所以我就用资深数据分析师那意味深长的语气劝他(而且一定要营造出分析结果不理想是他数据的问题),R包有很多,为何不换一个呢?...头脑风暴 我有一个设想: 用root权限,新建一个环境R4.1,然后在里面安装R4.1 在R4.1中安装那几个包 将Rstudio的R版本设置为新建环境的R4.1 我的顾虑: 不确定我用root新建的环境...用'contributors()'来看合作者的详细情况 用'citation()'会告诉你如何在出版物中正确地引用R或R程序包。...其它人用Rstudio-server安装R包 因为现在Rstudio-server用的是conda环境中的R4.1,它会在conda环境中有一个library,普通用户没有写入的权限,安装R包时会在自己的路径下自动新建一个...5,没有安装不了的R包,折腾一下总能实现。

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    R语言列筛选的方法--select

    我们知道,R语言学习,80%的时间都是在清洗数据,而选择合适的数据进行分析和处理也至关重要,如何选择合适的列进行分析,你知道几种方法? 如何优雅高效的选择合适的列,让我们一起来看一下吧。 1....r$> library(learnasreml) r$> data(fm) r$> head(fm) 「我们的目的:」 ❝提取fm的TreeID,Rep,dj,dm,h3,并重命名为:ID,...使用R语言默认的方法:列选择 这一种,当然是简单粗暴的方法,想要哪一列,就把相关的列号提取出来,形成一个向量,进行操作即可。...> names(d1) = c("ID","F1","y1","y2","y3") r$> head(d1) 结果: 「缺点:」 这种方法,需要找到性状所在的列号,然后还要重命名,比较麻烦。...而且,后面如果想要根据列的特征进行提取时(比如以h开头的列,比如属性为数字或者因子的列等等),就不能实现了。 这就要用到tidyverse的函数了,select,rename,都是一等一的良将。

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    不同安装R语言的R包的方法

    当你需要执行特定的统计测试、可视化或其他任务时,你可能会发现相应的功能已经被封装在一个或多个R包中。然而,对于新手或需要一次性安装多个R包的用户来说,这个过程可能会有些繁琐。...为了大规模安装所需要的R包,你可以使用几种不同的方法。...以下是两种常见的方法:常用安装install.packages函数是我们常用的安装R包的方式,需要注意的是这些R包必须是在CRAN仓库中,否则安装将会失败。...该项目是存放了大量用于生物研究的R包,很多做生物信息分析的人都会使用里面提供的R包。它的安装包是通过BiocManager包提供的install函数实现的。...构建函数,使其具有如下功能:判断未安装R包;使用 install.packages或BiocManager::install函数安装来源你不同的R包;用lapply分别加载R包,并不输出加载过程中产生的信息

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    Rstudio关联本地不同版本的R

    前面提到过Rstudio是一个很好的R集成开发环境,但实际上Rstudio本身是没有太多功能的,它只提供一个可视化的环境,实际上背后还是要调用你本地装的R和R包。...那么Rstudio是如何跟本地的R关联起来的呢?...这里x64表示是64位的电脑,i386是32位的电脑。现在32位的电脑应该已经很少了。 4.点击OK,点击apply,点击OK,然后重启Rstudio。就跟你本地的R关联好了。...你本地的R里面装了什么包,Rstudio就能够调用什么包了。...做个测试,我本地安装了做GO和KEGG富集分析用的包,叫做clusterprofiler,当我敲出前四个字母,Rstudio就已经提示匹配到的包的名字了,证明跟我本地的R已经关联起来了。

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    基于业务设计数据表的总结

    前言 这是一篇日常开发中根据产品需求去设计数据表的总结。 抛去测试、架构来说,数据表设计是指定功能开发的一个起点,如果出现失误将会对未来开发以及运行都会有很大的影响。...接下来我们聊聊应该如何根据需求去设计数据表。...原型图 首先产品递交的绝笔是份原型图或者需求文档,这里先看原型图,根据原型图上的任意label、input汇总,再根据逻辑不同去划分为不同的块(也就意味着不同的表)。...扩展 大概的以张图来说明所说的扩展字段。 通过以自己的日常生活经验和开发经验对具有局限性的原型图进行扩展。是一个业务程序员最起码的技能。 在之后,将要面临一些性能的考虑了。...性能 本章并不会详细将数据表的设计上,就大概的根据优惠券的功能讲解下思路。 – 批量发放应该考虑的技术问题 – 考虑频繁被查询的字段设置索引,例如优惠券功能?

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    基于不同视角的安全管理

    不同时期指标与侧重点是不一样的,这是个容易走弯路的地方。另外,在运营态下,在线、离线能力的运用、串并联方式的合理布局以及”查““杀”手段的使用也是非常关键的地方。...常常出现的问题是数据貌似都在,但可能由于格式不同、记录字段不同甚至细微的类型差异都可能导致数据无法进行归集、串联,最终变成一个个的数据片段,导致整个证据链的断裂缺失,从而无法勾勒出事件的本来面目,也就谈不上有效的处置与根源问题复盘改进...,可以是不同类型产品的比对,可以是在线、离线方式的比对,也可以是部署方式如终端侧、网络侧的比对,总之战略性纵深开始形成(对应于如果把多个产品技术不同区域布防称为战术纵深的话)。...比如50人的团队,全部招高阶的,看似很厉害但这个不现实,可能没这么高阶可以招,资金预算也不允许,因此CSO们要合理规划团队层级,可以基于工作技能集的分布,也可以基于考虑资金限制后的职级测算等很多方法,所以推荐...3.高优业务场景应用 除了为企业实际开展的业务保驾护航以外,基于价值链分析的方法与战略一致性要求可以使安全更为主动的布局与准备,这里不多说了。

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    体验R和python的不同绘制风格

    随着科技的发展,我们生活中生产的数据日益增加,数据可视化变得至关重要!通过大数据的可视化,使我们更能读懂其中的奥秘! 目前r和Python是数据分析领域最常见的两个编程语言,尤其适合于统计可视化。...下面是ggplot2绘图体系的一些关键概念: 数据:ggplot2使用数据框作为数据输入的基本单位。数据框是一个二维表格,其中每一列代表一个变量,每一行代表一个观察值。...它的语法和风格与MATLAB相似,因此对于熟悉MATLAB的用户来说,上手很容易。 多种绘图风格:matplotlib支持多种绘图风格,包括面向对象的绘图和基于pyplot模块的绘图。...尽管不同的包或库的绘制风格不同,但它们的绘制过程是一致的,如下图所示: 先画出图的大致轮廓,再根据需求,添加更多的细节和细节调整,一张完美的图就出来了啊!...那我们接下来体验一下使用R的ggplot2和Python的matplotlib绘制一张饼图吧!

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    r和n不同系统的区别

    一、\r和\n的来源 1、回车和换行来源 在最初的电传打印机时代,每打完一行需要换行的时候,耗费的时间正好是打印两个字符的时间。那么如果这段时间内正好传来两个字符,就会打印不出来。...所以当时就在一行的最后增加了两个字符,一个叫做"回车",告诉打字机把打印头定位在左边界;另一个叫做"换行",告诉打字机把纸向下移一行。 2、关于字符 ASCII是基于拉丁字母的一套电脑编码系统。...\r 回车符:回到一行的开头,对应ASCII值13(缩写:CR) \n 换行符:另起一行,对应ASCII值10(缩写:LF) 二、\n和\r差异 当这两个概念也就被搬到了计算机上。...\r是回车,\n是换行,前者使光标到行首,后者使光标下移一格。通常用的Enter是两个加起来 有的编辑器只认\r\n,有的编辑器则两个都认。...所以要想通用的话,最好用\r\n换行 1、不同操作系统中的回车换行 Windows中,每行结尾是“回车+换行”,即\r\n Linux/Unix系统里,每行结尾用换行LF,即\n MacOS 1-9,每行结尾用回车

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    如何使用Python把数据表里的一些列下的数据(浮点)变成整数?

    一、前言 前几天Python铂金有个叫【Lee】的粉丝问了一个数据处理的问题,这里拿出来给大家分享下。 其实他自己也写出来了,效率各方面也不错,不过需求还远不如此。...二、实现过程 这里【(这是月亮的背面)】大佬先给出了个解决方法,使用applymap()方法,如下图所示: 运行结果如下,是可以满足粉丝的要求的。...不过这里给大家亮出一个好代码,来自【(这是月亮的背面)】大佬,如下图所示: 这个代码不可多得,下面是简单介绍: 如此,完美的满足了粉丝的需求。 总结 大家好,我是Python进阶者。...这篇文章基于粉丝提问,在实际工作中运用Python工具实现了数据批量转换的问题,在实现过程中,巧妙的运用了applymap()函数和匿名函数,顺利的帮助粉丝解决了问题,加深了对该函数的认识。...最后感谢粉丝【Lee】提问,感谢【(这是月亮的背面)】大佬给予的思路和代码支持,感谢粉丝【aVen】、【冫马讠成】、【水方人子】、【学习小白】等人参与探讨和学习。

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    R 案例|绘制不同分布的 QQ 图

    简介 论文中需要绘制数据对于不同分布假定下的 QQ 图。这里小编主要是使用 qqplotr 包进行绘制,参考的博客:An Introduction to qqplotr[1]。...stat_qq_point() + labs(x = "Theoretical Quantiles", y = "Sample Quantiles") gg 拓展 这里做一个简单拓展,如果你想使用不同的置信带构造置信区间...下面代码给出三种不同方法构造置信区间的结果。并且使用 viridis 包,对其进行配色修改。...具体如何拟合,读者自行搜索 R 包中的相关函数。 其他代码基本不变,主要是将 stat_qq_line() 和 stat_qq_point() 中的分布设定下,参数设定下。...小编对该包的介绍做过几期,可见:cowplot包:用R添加水印。其他合并的方式还有:R可视乎|合并多幅图形。

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    基于R软件的统计模拟

    赶火车问题 一列列车从A站开往B站,某人每天赶往B站上车。他已经了解到火车从A站到B站的运行时间是服从均值为30min,标准差为2min的正态随机变量。...+ Sys.sleep(1) + x + r > y + }) > mean(prb) [1] 0.4 三、R软件的统计模拟功能 1、R软件优秀的随机数模拟功能 生产某概率分布的随机数是实现统计模拟的前提条件...,而使用R命令可以生成以下常用分布的随机数 ?...2、优良的编程环境和编程语言 R所拥有的好的兼容性、拓展性和强大的内置函数有利于统计模拟的实现。 3、高效率的向量运算功能 使用R拥有的向量运算功能可以大大减少程序运行的时间,提高程序运行的效率。...应用R软件模拟验证大数定律 ?

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