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R画图y轴范围太大时,如何局部压缩坐标轴?

用 R 画图的时候,如果 y 轴存在个别非常大或非常小的值,或者当中的数值存在非常大差异的时候,画出的图很容易产生误导效果,使人忽略当中某一部分信息。...图中存在非常多显著的 SNPs,当中最显著的 -log10(P) 甚至达到了 150 左右。不过,这样画图的话,红线附近会有很多显著的 SNPs 会因为 y 轴太大而显得不怎么显著。...针对这种 y 轴范围太大、有一部分点与其他点差距非常大的情况,可以考虑压缩/压扁 y 轴。删除 y 轴中没有点的部分也是可以,但个人更倾向于直接对 y 轴进行缩放,把偏离比较大的区域压扁。...value)) + geom_point() 得到的图是这样的,不同组别的值差别非常大,y 轴范围很大: 接下来构建一个 squash_axis 函数来实现坐标轴压缩功能,这个函数需要使用 scales...(y = squash_axis(5, 95, 10)) 这样画出的图,就能看清每个组别中各个点的分布: 把 1 到 99 范围的 y 轴压缩 30 倍: ggplot(shiyanhe,aes(x

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    R语言ggplot2作图离散变量更改坐标轴范围

    首先是示例数据 image.png 使用R语言的ggplot2做一个热图 #install.packages("see") df<-read.csv("20210809_example.csv") library...() image.png 增加y轴的上下空白 ggplot(data=df,aes(x=gene_name,y=variable))+ geom_tile(aes(fill=value))+...(expand=expansion(mult=c(1,0))) image.png 如果是要更改x轴左右的间距把scale_y_discrete()换成scale_x_discrete()就可以了...这个有啥用,其中一个用途是画环状热图的时候可以增加中间的空白区域 比如默认环状热图 ggplot(data=df,aes(x=gene_name,y=variable))+ geom_tile(aes...小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子;2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记;3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记

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    matlab绘制figure的x y轴特殊标签数据

    做数据分析的Matlab用户最常见的问题之一是如何在日期轴上绘制数据。很多时候,分析师最初会使用Excel处理数据,然后用相应的工具去处理数据,分析数据。...Excel有一种在日期轴上绘制数据的简单方法,但在Matlab中使用日期轴需要麻烦一点。...但matlab针对这种特殊情况也有对应的一些函数,使用Matlab完成这项任务并不难,而且和大多数Matlab函数一样,它具有相当大的通用性。...Matlab用户应该熟悉的几个函数是datenum、datevec和datestr。Matlab将每个日期编码为数字,从1月1日开始,0000作为数字1。...Matlab将datenum的输出用于绘图上的x轴数据。 例如,假设用户希望以6个月的间隔绘制3年的数据。首先要创建要绘制的日期、月份和年份的矢量。

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    如何随意截断ggplot2图像的y轴?

    gg.gap诞生记 “站长,小站工具qPCR在线分析功能非常好,但有些基因的表达量太高了,图做出来值非常大,能否想prism那样把y轴做个截断呢?”...面对的疑问,站长最开始并没有想到去开发一个R包解决。 ggplot2以及依赖它开发的包已经丰富,原以为在网络搜索一下肯定有解决方案,但谁曾想这样的需求真的没有找到完美的解决方案。...不管三七二一,画个草图先: 思路很简单,就是先按照y轴切,然后用cowplot去拼接。...一顿野路子代码操作,beta版出来了:gg1gap和gg2gap这两个包只能完成bar图y轴切割,而截断数最多也就只能两段。...小站VIP群中的树神(微信ID:一棵树)精通R包制作,为了让野路子出来的代码更完善,拉上树神一起干,不仅实现截取多个截断,还可以对任意ggplot2对象进行截断,再不断测试修补bug之后,gg.gap终于在今天这个有意义的日子正式上线

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    小站R包gg.gap正式上线CRAN|随意截断ggplot2图像的y轴~

    gg.gap诞生记 “站长,小站工具qPCR在线分析功能非常好,但有些基因的表达量太高了,图做出来值非常大,能否想prism那样把y轴做个截断呢?”...面对的疑问,站长最开始并没有想到去开发一个R包解决。 ggplot2以及依赖它开发的包已经丰富,原以为在网络搜索一下肯定有解决方案,但谁曾想这样的需求真的没有找到完美的解决方案。...不管三七二一,画个草图先: 思路很简单,就是先按照y轴切,然后用cowplot去拼接。...一顿野路子代码操作,beta版出来了:gg1gap和gg2gap这两个包只能完成bar图y轴切割,而截断数最多也就只能两段。...小站VIP群中的树神(微信ID:一棵树)精通R包制作,为了让野路子出来的代码更完善,拉上树神一起干,不仅实现截取多个截断,还可以对任意ggplot2对象进行截断,再不断测试修补bug之后,gg.gap终于在今天这个有意义的日子正式上线

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    数据可视化 | 双Y轴可视化绘制方法(Python、R两种方法)

    最近有很多小伙伴私信我关于双Y轴图的绘制方法?...这里给出Python-matplotlib绘制方法和R-ggplot2的绘制方法 Python语言 这里我们直接就给出数据预览和可视化设计的代码,图中部分代码我们再做详细解释,数据预览如下: 自定义的颜色字典...: 总结:Python-matplotlib 绘制双Y轴的关键就是使用Axes.twinx()方法再次添加一个绘图对象,再把要绘制的对象在此绘图对象上绘制即可,其他和正常的matplotlib语法一样。...R语言 在介绍完Python-matplotlib 绘制双Y轴后,我们再次介绍R-ggplot2如何绘制双Y轴,由于绘制上面的可视化结果较为繁琐,这里我们直接生成样例数据进行双Y轴的讲解。...*coeff, name="Price ($)") ) + 最终可视化代码如下: 总结 本期推文我们简单介绍了Python-matplotlib和R-ggplot2 绘制双Y轴的绘制方法,希望可以帮助到有需要的小伙伴

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    excel双坐标图表的做法(两个Y轴)

    前言 所谓双坐标图表,就是左右各一个Y轴,分别显示不同系列的数值。该图表主要用于两个系列数值差异较大的情况。如下例。...示例 如下图所示表中,数量列和金额列数值差异较大,如果直接做成图表会造成数量系列的图形无法在图表上显示(太小了),那么我们就需要把数量和金额分成两个Y轴分别显示数值,即双坐标图表。 ?...步骤2:金额列设置坐标轴为次坐标轴。 ? excel2003版:在金额系列柱上右键 菜单 - 数据系列格式 - 坐标轴 - 次坐标轴。 ?...步骤3:在金额系列上右键 - 图表类型(excel2010版是更改图表类型) - 设置为折线图即可。 设置后的效果如下图所示。 ?...来源:兰色幻想-赵志东 Excel精英培训 数据的力量:分享有趣、有价值的内容,打造微型知识管理平台。

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    2024-02-28:用go语言,有一个由x轴和y轴组成的坐标系, “y下“和“y上“表示一条无限延伸的道路,“y下“表示这个道

    2024-02-28:用go语言,有一个由x轴和y轴组成的坐标系, "y下"和"y上"表示一条无限延伸的道路,"y下"表示这个道路的下限,"y上"表示这个道路的上限, 给定一批长方形,每一个长方形有(x1..., x2, y1, y2),4个坐标可以表示一个长方形, 判断这条道路整体是不是可以走通的。...像素点是水平或竖直方向连接的。 给你两个整数 x 和 y 表示某一个黑色像素的位置。 请你找出包含全部黑色像素的最小矩形(与坐标轴对齐),并返回该矩形的面积。...灵捷3.5 大体步骤如下: 1.定义一个辅助函数minArea(image [][]byte, x int, y int) int,用于计算包含全部黑色像素的最小矩形的面积。...8.在main函数中,定义一个示例图片image和给定的点(x, y),调用minArea函数并将结果打印出来。

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