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GEO2R:对GEO数据库中的数据进行差异分析

GEO数据库中的数据是公开的,很多的科研工作者会下载其中的数据自己去分析,其中差异表达分析是最常见的分析策略之一,为了方便大家更好的挖掘GEO中的数据,官网提供了一个工具GEO2R, 可以方便的进行差异分析...从名字也可以看出,该工具实现的功能就是将GEO数据库中的数据导入到R语言中,然后进行差异分析,本质上是通过以下两个bioconductor上的R包实现的 GEOquery limma GEOquery...用于自动下载GEO数据,并读取到R环境中;limma是一个经典的差异分析软件,用于执行差异分析。...在网页上可以看到GEO2R的按钮,点击这个按钮就可以进行分析了, 除了差异分析外,GEO2R还提供了一些简单的数据可视化功能。 1....第一个参数用于选择多重假设检验的P值校正算法,第二个参数表示是否对原始的表达量进行log转换,第三个参数调整最终结果中展示的对应的platfrom的注释信息,是基于客户提供的supplement file

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【数据链路层】循环冗余码CRC、后退N帧协议GBN、选择重传协议SR、CSMACA

-1 例如:由3比特来编号,窗口总数为8,编号0到7 如果把7号也用了,那么当全部发送0-7号的所有帧的时候,发送方看自己设置的超时的记录表,如果显示超时了,那我们重新发0-7号。...如果收到后面的帧,就会重复返回刚才正式接受的帧的ack—重复返回 直到收到正确的 发送窗口最大值是 2^n-1 ,接收窗口1 ---- 选择重传协议SR CSMA/CA—针对无线局域网 最小帧长=...对CSMA/CD进行了修改。 局域网不使用碰撞检测,一旦开始发送就会完整发送,但是碰撞存在的时候,仍然发送整个数据帧,会严重降低网络的效率,因此要采用碰撞避免技术降低碰撞的可能性。...为了解决该问题,802.11允许发送站对信道进行预约。源站在发送数据帧之前要广播一个很短的请求发送控制帧(RTS)该帧包含有本次通信所需维持的时间,能够被其范围内包括AP在内的站点听到。...如果信道空闲,则AP广播一个允许发送CTS帧,它包括这次通信所需的持续时间(从RTS中复制的),该帧也能够被AP范围内包括A和B在内的站点听到。

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    简单聊聊电商系统的订单号生成规则

    对订单进行操作,如线下收款,订单核销 我们在第三方平台上购买了某一个店铺的线下优惠券的时候,工作人员需要对我们提供的优惠券进行核销,核销的依据一般来说就是订单编号。...商家ID 对电商系统中,可以把商家ID脱敏后也作为一个变量设计到编号规则中。 6....手机号 使用用户的手机号中的某些位数作为编号中的一个变量;使用类似于手机号部分号码这种重复度较高的属性设计订单编号的时候,切记不能只有一个变量,否则很容易出现订单编号重复。 7....数据库数据的自增ID 每条数据录入系统时候,一般情况都有一个唯一的ID,这个ID也可以作为编号的一种变量进行使用。 四、编号实践方案分享 1....UUID 通⽤唯⼀识别码,是⼀种软件建构的标准,亦为开放软件基⾦会组织在分布式计算环境领域的⼀部分。其⽬的是让分布式系统中的所有元素,都能有唯⼀的辨识信息,⽽不需要通过中央控制端来做辨识信息的指定。

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    Mybatis深入了解(六)----关联查询(高级映射)

    -- id:指定查询列中的唯 一标识,订单信息的中的唯 一标识,如果有多个列组成唯一标识,配置多个id column:订单信息的唯 一标识 列 property...---- resultType 如果使用resultType实现一对多的查询的话,需要自己处理,使用双重循环遍历,去掉重复记录,并将订单明细放到orderdetails中。...-- 订单明细信息 一个订单关联查询出了多条明细,要使用collection进行映射 collection:对关联查询到多条记录映射到集合对象中 property...总结 resultMap使用association和collection完成一对一和一对多高级映射(对结果有特殊的映射要求)。 association:将关联查询信息映射到一个pojo对象中。...list属性中,这样的作的目的也是方便对查询结果集进行遍历查询。

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    3.4.2 单帧滑动窗口与停止等待协议

    为了对付这种可能发生的情况,源站装备了计时器,在一个帧发送之后,源站等待确认,如果在计时器计满时仍未收到确认,则再次发送同样的帧。如此重复,直到该数据帧无错误地到达为止。  ...{丢弃的数据帧就是重复帧} 5.将收到的数据帧中的数据部分送交主机。 6.V(R)R)]。{更新接受状态变量,准备接受下一个数据帧} 7.发送确认帧ACKn,并转到2。...{n=V(R),表明期望收到V(R)} 由以上算法可知,对于停止-等待协议,由于每发送一个数据帧就停止并等待,因此用1bit编号就够。...在停止-等待协议中,若连续出现相同发送序号的数据帧,表明发送端进行了超时重传。连续出现相同序号的确认帧,表明接收端收到了重复帧。...此外,为了超时重发和判定重复帧的需要,发送方和接受方都需设置一个帧缓冲区。发送端在发送完数据帧时,必须在其发送缓存中保留此数据帧的副本,这样才能在出差错时进行重传。

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    计算机网络:流量控制与可靠传输机制

    发送窗口用来对发送方进行流量控制,而**发送窗口的大小 W_T **代表在还未收到对方确认信息的情况下发送方最多还可以发送多少个数据帧。 接收窗口是为了控制可以接收哪些数据帧和不可以接收哪些帧。...一方面因连续发送数据帧而提高了信道的利用率,另一方面在重传时又必须把原来已传送正确的数据帧进行重传,这种做法又使传送效率降低。...另外,该协议使用了比上述其他协议更有效的差错处理策略,即一旦接收方怀疑帧出错,就会发一个否定帧NAK给发送方,要求发送方对NAK中指定的帧进行重传....在选择重传协议中, 接收窗口和发送窗口的大小是相同的, 且最大值都为序号范围的一半, 采用 n 比特对帧编号, 则需要满足: W_{\operatorname{Tmax}}=W_{R \max }=2...选择重传协议可以避免重复传送那些本已正确到达接收端的数据帧,所需缓冲区的数目等于窗口的大小。 信道的效率,也称信道利用率。

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    计算机网络 3 -数据链路层

    但对于误码率较高的点对点链路, 为使发送方尽早重传,也可给发送方发送NAK 分组。 为了让接收方能够判断所收到的数据分组是否是重复的, 需要给数据分组编号。...由于停止等待协议的停等特性, 只需1个比特编号就够了, 即编号0和1。 为了让发送方能够判断所收到的ACK分组是否是重复的, 需要给ACK分组编号,所用比特数量与数据分组编号所用比特数量一样。...时隙编号达到 255 (第 6 次退避) 就不再增加 image.png CSMA/CA 协议的信道预约和虚拟载波监听 为了减少碰撞概率和降低碰撞的影响, 802.11 标准允许要发送数据的站点对信道进行预约...MAC 地址记录到自己的帧交换表中 将该帧进入自己的接口号记录到自己的帧交换表中 之后, 交换机对该帧进行转发 若帧交换表中找到了目的 MAC 地址, 把帧由对应的接口转发出去 否则对该帧进行盲目转发...端口可以属于多个 VLAN 用户可以设置 Trunk 的 PVID 值, 默认情况下Trunk 端口的 PVID 值位 1 发送 对 VID 等于 PVID 的帧, 去标签再转发.

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    M2DP:一种新的三维点云描述子及其在回环检测中的应用

    在每个bin内,签名方法计算一个或多个几何测量值,例如点数、法线,并对bin中的信息进行编码。直方图生成每个点或点子集上特征值的计数,并将这些计数与描述子连接起来。...对点云进行主成分分析,利用第一和第二个主成分来定义描述子参考坐标系的x轴和y轴。...以投影后的中心点为中心,生成l个同心圆,半径为[r, 22r, …, l2r],另外,最大半径与最远点到中心点距离相等;上面的一系列圆环,每个圆环都分成t个bin,并按照x轴把这些bin编号;这样就把一个平面分成了...图2:二维平面中的Bin编号示意图 D 多视角二维投影描述子 通过使用p个不同的方位角θ和q个不同的俯仰角Φ,生成pq个不同的二维平面;方位角的步幅为π/p,俯仰角的步幅为π/2q;对于每一个二维平面,...,如果两者之间距离小于阈值,则认为是闭环;为避免相邻帧匹配,把当前帧的前后50帧排除在外;利用召回率-精确度曲线来评估各算法性能; 本文设计三个实验进行比较:实验一使用原始点云作为输入;实验二采用不同下采样网格大小处理后的点云作为输入

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    数据库基础

    事务并发问题当多个线程同时对数据库进行操作,就难免会遇到并发问题。事务并发问题有三类:脏读、不可重复读和幻读。脏读:脏读是指在⼀个事务处理过程⾥读取了另⼀个未提交的事务中的数据。...不可重复读:不可重复读是指对于数据库中某个数据,⼀个事务范围内多次查询返回了不同的数据值,这是由于在多次查询之间,有其他事务修改了数据并进⾏了提交。...幻读:指⼀个事务中执⾏两次完全相同的查询时,第⼆次查询所返回的结果集跟第⼀个查询不相同。与不可重复读的区别在于,不可重复读是对同⼀条记录,两次读取的值不同。...索引索引分类Mysql中的索引可以分为以下几种:唯⼀索引:就是索引列中的值必须是唯⼀的,但是允许出现空值。...这种索引⼀般⽤来保证数据的唯⼀性,⽐如保存账户信息的表,每个账户的id必须保证唯⼀,如果重复插⼊相同的账户id时会MySQL返回异常。 主键索引 :是⼀种特殊的唯⼀索引,但是它不允许出现空值。

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    Pandas学习笔记02-数据合并

    第一章可前往查看:《Pandas学习笔记01-基础知识》 pandas对象中的数据可以通过一些方式进行合并: pandas.concat可以沿着一条轴将多个对象堆叠到一起; pandas.merge可根据一个或多个键将不同...混合数据合并 若Series未进行命名,则合并后的列名为连续的编号。...Series未命令则连续编号 我们同样可以通过使用ignore_index = True删除并重新进行列名称编号。...字典数据追加到数据帧 2.merge merge可根据一个或多个键(列)相关同DataFrame中的拼接起来。...inner内连接 2.2.validate检查重复键 validate参数可以指定一对一、一对多、多对一和多对多的情况,若不满足对应情况则在合并时会发生异常。

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    计算机网络-可靠传输的实现机制

    那么R就收到了重复数据,那么这种问题如何解决?...(ACK)]回退N帧协议(GBN Go-Back-N)和停止等待协议类似,不过我们采用分组发送,对于每个分组,我们称之为窗口在S端,窗口尺寸我们成为W_T,在R端,窗口尺寸成为W_R如果我们采用n个比特来对分组进行编号...,而是在收到几个数据分组后,对按需到达后的最后一个分组进行确认,ACK_N表示序号为n及以前的所有数据分组都已正确接收了。...,会导致多组数据超时重传,对通信资源产生极大的浪费那么能否直冲穿出现误码的分组呢?...S针对2号数据分组的重传定时器超时了,那么进行重传2到达后,理所应当S & R 窗口超限引发的问题最大值$$W_T = W_R = 2^{(3-1)}=4$$如果我们设置为5的话呢?

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    谷歌开源、高性能RPC框架:gRPC 使用体验

    HTTP 每次网络传输会携带通信的资源、浏览器属性等大量冗余头信息,为了减少这些重复传输的开销,HTTP/2 会压缩这些头部字段: 基于 HTTP/2 协议的客户端和服务器使用"头部表"来跟踪与存储发送的键值对...,对于相同的键值对数据,不用每次请求和响应都发送; 头部表在 HTTP/2 的连接有效期内一直存在,由客户端和服务器共同维护更新; 每个新的 HTTP 头键值对要么追加,要么替换头部表原来的值。...举个例子,有两个请求,在 HTTP/1.x 中,请求 1 和请求 2 都要发送全部的头数据;在 HTTP/2 中,请求 1 发送全部的头数据,请求 2 仅仅发送变更的头数据,这样就可以减少冗余的数据,降低网络开销...由客户端发起的 Stream 数据流用奇数编号 ID 的流标识符;由服务器发起的数据流使用偶数编号 ID 的流标识符。...下面对调用过程中的每个帧做简要分析。 1)客户端发送 Magic 帧Magic 帧的为固定内容:PRI * HTTP/2.0\r\n\r\nSM\r\n\r\n。

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    计算机网络原理梳理丨清晰认识 TCPIP 协议

    TCP 数据包示意图 ACK:确认位,当它的值为1时,确认号才是有效的 SYN:同步请求,TCP连接中连接双方协商初始的序号 RST:复位,TCP连接中数据传输发生异常需要重新发送 FIN :通信结束后...第二个数据包传输时,SEQ数值 = R,主机B收到后立即回传ACK,此时ACK = R + N + 1,之后数据包传输的过程持续此流程,需要注意的是发送方只有收到目标方的确认包后才会清除缓冲区中的数据...,最后由具体的物理网络(以太网)完成数据报的真正传输) IP 转发数据 路由器接收到主机A的数据帧后,去掉帧头并对其进行处理,发现此数据报的目的地非本地,需要将其转发,由路由选择算法及本地路由表确定下一跳路由器地址...重复此步骤直到第N个路由器与目的地直连,通过ARP地址解析确定目的主机的IP地址与MAC地址的映射关系,利用该MAC地址作为帧的目的地址,将IP数据报封装成帧,并由以太网实现数据的真正传递 IP 接收数据...主机B接收到数据帧后,解封该帧并对其进行处理,确定本机即为目的地址后,将数据报中封装的数据交由上层协议进行处理,随即逐层处理并上交直到应用层,完成此次通信 ---- 更多协议工作原理 移步至我的博客主页

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    HDLC与PPP协议原理与配置_路由交换基础内容

    同步传输是以帧为单位来传输数据,在通信时需要使用时钟来同步本段和对端的设备通信。DCE即数据通信设备,它提供一个用于同步DCE设备和DTE设备之间数据传输的时钟信号。...; 所有帧均采用CRC校验,并对信息帧进行编号,可防止漏收或重收,传输可靠性高; 传输控制功能与处理功能分离,具有较大的灵活性和较完善的控制功能; HDLC有三种类型的帧: 信息帧:用于传送有效信息或数据...,通常简称为I帧 监控帧:用于差错控制和流量控制,通常称为S帧 无编号帧:用于提供对链路的建立、拆除以及多种控制,简称U帧 [RTA]int S0/0/1 [RTA-Serial0/0/1]link-protocol...相对来说PAP的认证方式安全性没有CHAP高。PAP在传输password是明文的,而CHAP在传输过程中不传输密码,取代密码的是hash(哈希值)。...而CHAP则是主叫发出请求,被叫回复一个数据包,这个包里面有主叫发送的随机的哈希值,主叫在数据库中确认无误后发送一个连接成功的数据包连接。

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    SAE J1939 协议简介(二)

    在简单介绍完J1939协议后,今天我们来讲讲J1939的数据链路层,熟悉数据链路层是开发任何一种协议软件的基础,数据链路层中的协议数据单元(PDU)格式是非常重要的。...参数组编号用来确定或标识命令、数据、请求、确认和否定等参数组编号所确定或标识的信息需要一个或多个 CAN 数据帧进行通信。若消息长于 8 字节,必须将消息分包发送。...Data 数据域 如果给定参数组用于表示不多于 8 字节的数据时, 可使用 CAN 数据帧全部的 8 个字节。通常,建议对所有的参数组进行分配时,将 8 个字节分配或保留以备今后扩展之用。...当数据长度不多于 8 字节时,将预定义的参数组数据长度值赋予 CAN 数据长度码( DLC);否则,如果参数组的数据长度大于 8,将 CAN 数据长度码( DLC)赋值为 8。...长度从 9 字节到 1785 字节的数据 如果一个给定的参数组数据长度为 9 至 1785 字节时,数据通信是通过多个 CAN 数据帧实现的。因此,用“多包“来描述这种类型的参数组编号。

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    7-数据链路层-逻辑链路控制子层

    位,16位… 其余各位均是数据位,如3,5,6,7,9… 每一个校验位的设置规则:包括自己在内的一些位的集合的奇偶值(奇偶校验) 如何决定每个数据位的校验位: 将某一位数据位的编号展开成2的次幂的和(例如...如发现某一校验位和它所检测的集合的奇偶性不正确,就将该检验位的编号加到差错计数器中。 Counter=0,无差错。...0 ~ 2^n-1(n位字段) 发送窗口 顺序接收来自网络层的分组->成帧->赋予序列号 最多保存W个已经发送、等待确认的帧 窗口达到最大值W时强制关闭网络层 接收窗口 对进入窗口的帧顺序提交网络层...ack=0, A1)–发送1帧,收到0帧,期望收到1帧 协议帧的差错控制 可以看到在发生错误后,由于计时器时间设置不合理,接收方收到重复帧,这种情况下接收方会发送同样的确认帧返回发送方,但不会接收当前传过来的重复帧...不是返回2号帧,而是返回错误帧的上一位帧的确认帧,因为1号帧成功被接收,发送方借此可以判断是从2号帧开始需要重传的) 累计确认 在滑动窗口中采用了累计确认的方式来对帧进行确认 也就是说在收到对于5号帧确认时

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    5G LTE窄带物联网(NB-IoT) 10

    值1表示子帧对DL传输有效 indexToMidPRB [-15 54] 用于带内的下行链路子帧配置超过40ms。...值1表示子帧对DL传输有效 ack-NACK- NumRepetitions r1, r2, r4, r8, r16, r32, r64, r128 指示用于NB-IoT的物理资源块(PRB)相对于可用...通过RNTI对计算的CRC进行加扰,在CRC中隐式编码RNTI。图7.20说明了如何使用RNTI对NPDCCH进行加扰。 可以在子帧中发送一个或两个NPDCCH。...子帧重复次数 3 确定DCI(NPDCCH)重复的次数 如果使用临时C-RNTI对CRC进行加扰,则它指示DCI格式N1,其包括包含Msg4的NPDSCH,如第6.3.3节中所述。...ACK / NACK复用 如果UE要在NPUSCH上发送ACK或NACK而没有UL-SCH上的任何数据,则根据表7.30对它们进行编码。

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    【笔记】Mysql 数据库操作规范

    索引规范: 单张表中索引数量不超过 5 个。 单个索引中的字段数不超过 5 个。 索引名必须全部使用⼩写。 ⾮唯⼀索引按照“idx_字段名称 [字段名称]”进⾏命名。...[FAQ-7-02] 对同⼀个表的多次 ALTER 操作必须合并为⼀次操作。[FAQ-7-03] 不要在 MySQL 数据库中存放业务逻辑。[FAQ-7-04] 8....所有数据库账号的密码均不能为空,密码采用 16 位大小写字母和数字的组合。 数据库账号 / 密码不允许在邮件、企业微信群、家信群中公开,一经发现,DBA 有权立即进行重置。...覆盖索引能从索引中获取需要的所有字段,从⽽避免回表进行⼆次查找,节省 IO。...SQL 语句中 IN 包含的值不应过多,应少于 1000 个。IN 是范围查找,MySQL 内部会对 IN 的列表值进行排序后查找,⽐ OR 效率更⾼。

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    计算机网络——网络层知识点

    小王同学 小王的gitee:小王同学 小王的github:小王同学 ​ 虚拟机局域网VLAN的实现机制 IEEE802.1Q帧(也称 Dot One Q帧 )对以太网的MAC帧格式进行了扩展,...根据接收帧的端口PVID给帧打"标签" 即插入4字节VLAN标记字段,字段中的VID取值与端口的PVID的取值相等 Access端口发送处理方法: 若帧中的VID与端口的PVID相等,则“去标签”并转发该帧...默认情况下,Trunk端口的PVID值为1 Trunk端口端口发送的处理方法: 对VID等于PVID的帧,"去标签"再转发 -对VID不等于PVID的帧,直接转发 Trunk端口处理的接收处理方法 接收...“未打标签”的帧,根据接收帧的端口的PVID给帧"打标签" 即插入4字节VLAN标记字段,字段中的VID取值与端口PVID取值相等。...这种通信方式所带的分组可能误码、丢失、重复和失序 由于网络本身不提供端到端的可靠性传输服务,这就使网络中的路由器可以- 做的比较简单,而且价格低廉(与电信网的交换机相比较) 因特网采用了这种设计思想

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