R- distinct值列按组dplyr_dplyr按值组采样_R- dplyr -按列分组，如果给定的组只有NA，则计算NA's的和 - 腾讯云开发者社区

第 1 列是分组列，之后是N个数据列。...1003A101-10-2004A102201-1045A991993006B1000110013007B10041200-9008C2000-210022009C1900-2090-2180现在要按第 1 列分组...，每组横向的2N个列，依次是组内每个数据列的最大值和最小值。

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数据处理|数据查重怎么办？去重，就这么办！

数据清洗过程中的典型问题：数据分析|R-缺失值处理、数据分析|R-异常值处理和重复值处理，本次简单介绍一些R处理重复值的用法：将符合目标的重复行全部删掉；存在重复的行，根据需求保留一行数据准备使用...删除了ID_REF列和GSM74876列均重复的行，Done！择“优”录取存在重复，但是不想完全删除，根据数据处理的目的保留一行。...保留其最大值如下即可： data3 <- aggregate( . ~ ID_REF,data=data, max) 2 dplyr函数 A : ID_REF重复行，保留其均值，同aggregate函数结果一致...library(dplyr) data4 % group_by(ID_REF) %>% summarise_all(mean) ?...[grep("GSM", names(.))])) %>% #表达量均值从大到小排序 arrange(desc(rowMean)) %>% # 选择第一个，即为表达量最大值 distinct

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UseGalaxy.cn生信云|零代码使用Tiverse优雅地处理数据集

TIDYVERSE Dplyr Arrange rows Dplyr Count the observations Dplyr Distinct keep unique rows Dplyr Join...Dplyr Count the observations count 函数用于统计数据框中各个组的频数，可以对指定变量进行计数，得到每个类别的观测数目，支持根据需要对结果进行排序。...Dplyr Distinct keep unique rows distinct 函数用于去除数据框中的重复观测，仅保留唯一的观测。它可以基于指定的列对数据框进行去重操作，确保每个观测都是唯一的。...Dplyr Slice select rows by position slice 函数用于按行数进行切片，能够从数据框中提取特定的行，支持根据行数或行号选择需要的行，也支持使用负数表示从末尾开始计算的行数...Tidyr Pivot Longer from wide pivot_longer 函数用于将宽格式数据转换为长格式数据，能够根据用户指定的列将数据框中的多个列整理成一对 “名-值” 对，便于进一步的分析和处理

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两个神奇的R包介绍，外加实用小抄

、Dplyr能实现的小动作1.arrange 排序2.fliter3.distinct4.select5.mutate6.summarise7.bind_rows8.交集、并集、全集9.关联 ?...separate：按列分割 sparate_rows：按行分割 ?...二、Dplyr能实现的小动作 1.arrange 排序按某一/两列值的大小，按照升/降对行排序。...3.distinct 去除重复行（其实就是列出某一列所有的不同值） distinct（frame1，geneid） distinct（frame1，geneid，Sampleid）#列出这两个值都重复的行...") 两种办法拼起来~ 一个是R自带的rbind，一个是dplyr里的bind_rows 按行拼接时，列数、列名需要一致 rbind(frame1,frame4)# frame1 %>%bind_rows

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R 数据整理（七：使用tidyr和dplyr处理数据框 2.0）

2.3 distinct 用来去除重复行，有时我们希望得到一个或若干个变量组合的所有不同值。...dplyr 包的 distinct() 函数可以对数据框指定若干变量，然后筛选出所有不同值，每组不同值仅保留一行。...=TRUE，默认distinct 后只会返回选定的列。...按列号 select(test,1) select(test,c(1,5)) 按列名如果想要用向量来存放希望筛选的列名，需要使用函数 one_of 来存放该向量。...extract 除了seperate 外，函数 extract() 可以按照某种正则表达式表示的模式从指定列拆分出对应于正则表达式中捕获组的一列或多列内容。

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R语言第二章数据处理③删除重复数据目录总结

主要用的到R base和dplyr函数： duplicated（）：用于识别重复的元素和 unique（）：用于提取唯一元素， distinct（）[dplyr package]删除数据框中的重复行...包删除数据框中的重复行函数distinct（）[dplyr package]可用于仅保留数据帧中的唯一行。...根据所有列删除重复的行（完全一样的观测值）： my_data %>% distinct() 根据特定列删除重复值 my_data %>% distinct(Sepal.Length, .keep_all...= TRUE) 根据多列删除重复值 my_data %>% distinct(Sepal.Length, Petal.Width, .keep_all = TRUE) 选项.kep_all用于保留数据中的所有变量...总结根据一个或多个列值删除重复行：my_data％>％dplyr :: distinct（Sepal.Length） R base函数从向量和数据帧中提取唯一元素：unique(my_data) R基函数确定重复元素

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2023.4生信马拉松day7-R语言综合应用

#按空格拆分x，注意没有赋值就没有发生过！..., Sepal.Length) #从小到大 arrange(test, desc(Sepal.Length)) #从大到小 2. distinct()去重复 # distinct，数据框按照某一列去重复...distinct(test,Species,.keep_all = T) 其中.keep_all = T表示“按'Species'列去完重复后保留所有列”，其默认设置是.keep_all = F，表示...“按'Species'列去完重复后只保留'Species'列”； 3....加载test1.Rdata，将两个数据框按照probe_id列连接在一起，按共同列取交集 #2.

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生信星球 Day 4 —— 橙子🍊

mpg #查看帮助文档查看每列的非重复值及每个值的重复次数(直接用base的table(mpg$manufacturer)感觉效果类似)#用dplyr包的distinct函数p<-mpglibrary...(dplyr)distinct(p,manufacturer) #manufacturer替换为其他列名。...仅显示非重复值，不显示重复次数。...hwy), color='blue', size=2, shape=16, alpha=0.8)图片映射：按data.frame...的某一列值来定义对应图的某属性（要是离散型变量）ggplot(data = mpg)+ geom_point(mapping = aes(x=displ,y=hwy,color=class))图片ggplot

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R&Python Data Science 系列：数据处理（1）

主要介绍如何使用R语言和Python中的两个程序包进行数据处理，R语言中的dplyr和Python中的dfply第三方包。 ?...注意：python中按比例抽样和抽样指定的几列，是通过参数限制的；R语言按比例抽样使用sample_frac()函数，抽样几列使用sample_n()函数 4.4 distinct函数选择唯一值...，这里需要注意的是，查看某列有几个唯一值，python中需要先select()函数选择这一列，然后再使用distinct,或者先distinct，再使用select；若直接使用distinct，则所有列全部输出...R语言实现 R语言中可以直接使用distinct函数，如果想输出其他列（全部输出），使用参数.keep_all = TRUE限制 ##查看cut类有几种类型 diamonds %>% distinct...(cut) ##查看cut类有几种类型,并显示其他列 diamonds %>% distinct(cut, .keep_all = TRUE) ?

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按列翻转得到最大值等行数（查找相同的模式，哈希计数）

题目给定由若干 0 和 1 组成的矩阵 matrix，从中选出任意数量的列并翻转其上的每个单元格。翻转后，单元格的值从 0 变成 1，或者从 1 变为 0 。...返回经过一些翻转后，行上所有值都相等的最大行数。示例 1：输入：[[0,1],[1,1]] 输出：1 解释：不进行翻转，有 1 行所有值都相等。...示例 2：输入：[[0,1],[1,0]] 输出：2 解释：翻转第一列的值之后，这两行都由相等的值组成。...示例 3：输入：[[0,0,0],[0,0,1],[1,1,0]] 输出：2 解释：翻转前两列的值之后，后两行由相等的值组成。...解题一开始想是不是动态规划看答案是找最多出现的模式，如11011，00100，反转第3列后变成11111,00000，都是1或者0 那把0开头的或者1开头的，选一种，全部翻转，用哈希表计数，找到最多出现的

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生信技能树Day9 GEO数据挖掘差异分析

差异分析表格二分组数据差异分析#差异分析 limmalibrary(limma)design = model.matrix(~Group) # 生成模型矩阵fit = lmFit(exp,design)...fit = eBayes(fit)deg = topTable(fit,coef = 2,number = Inf)分组多代码更复杂为deg数据框添加几列1.加probe_id列，把行名变成一列library...(dplyr)deg = mutate(deg,probe_id = rownames(deg))2.加上探针注释因为探针和基因注释不是一对一的关系，所以要去重# 随机去重ids = distinct(...#保留最大值exp2 = exp[ids$probe_id,]identical(ids$probe_id,rownames(exp2))library(dplyr)ids = ids %>% mutate...(exprowsum = rowSums(exp2)) %>% arrange(desc(exprowsum)) %>% select(-3) %>% distinct(symbol,.keep_all

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R语言入门（一）之数据处理

= dplyr::distinct(a1, Species) #将species这一列中所有项均显示一遍（只显示这一列），重复的只显示第一个 a2 = a1[!...duplicated(a1$Species) #duplicated函数是一个可以用来解决向量或者数据框重复值的函数，它会返回一个TRUE或FALSE的向量，以标注该索引所对应的值是否是前面数据所重复的值...#数据列的选择 dplyr::select(a2.2, Species, contains("Sepal")) #筛选a2.2数据中标题包括"Sepal"、标题为"Species"的列 ?...", stringsAsFactors = F) #指的是读入的数据中的字符串数据是否要变成属性数据，stringsAsFactors=FALSE就是不变成属性数据，按字符串读入。..." = "Journal")) #merge 函数类似于 Excel 中的 Vlookup，可以实现对两个数据表进行匹配和拼接的功能；by.x，by.y：指定依据哪些行合并数据框，默认值为相同列名的列

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ggalluvial|炫酷桑基图（Sankey），你也可以秀

也可后台回复“R-桑基图”获得示例数据以及R代码。...#install.packages("ggalluvial") library(ggalluvial) library(ggplot2) library(dplyr) #读入LIHC临床数据 LIHC...绘制桑基图 1 宽数据示例对临床数据进行简单的处理，得到后四个变量的频数，整理成宽数据：以下处理过程可参考数据处理|R-dplyr，数据处理|数据框重铸 #分组计算频数 LIHCData <-...axis参数设置待展示的节点信息（柱子）； geom_alluvium参数设置组间面积连接，此处按生存状态分组； 2 长数据示例 ggplot2通常处理的都是长表格模式，使用to_lodes_form...函数即可转换 #to_lodes_form生成alluvium和stratum列，主分组位于key列中 LIHC_long <- to_lodes_form(data.frame(LIHCData),

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tidyverse|数据分析常规操作-分组汇总（sumamrise+group_by)

使用tidyverse进行简单的数据处理：盘一盘Tidyverse| 筛行选列之select，玩转列操作盘一盘Tidyverse| 只要你要只要我有-filter 筛选行 Tidyverse|数据列的分分合合...一 summarize汇总汇总函数 summarise()，可以将数据框折叠成一行 ,多与group_by()结合使用 1.1 summarise完成指定变量的汇总统计均值，标准差，最小值，个数和逻辑值...library(dplyr) iris %>% summarise(mean(Petal.Length), #无命名 sd_pet_len = sd(Petal.Length...5.843333 3.057333 3.758 1.199333 1.3，summarise_at完成指定变量的汇总 summarise_at配合vars，可以更灵活的筛选符合条件的列，...is.na(x)) ：返回非缺失值的梳理； n_distinct(x)：返回唯一值的数量。

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十二、R语言的综合应用

1.3.按位置提取字符串 str_sub(x,5,9) ###提取x字符串的第5位到第9位，空格也算一个。...arrange(test, Sepal.Length) #从小到大 arrange(test, desc(Sepal.Length)) #从大到小 2.2 distinct，数据框按照某一列去重复...distinct(test,Species,.keep_all = T) 2.3 mutate，数据框新增一列 mutate(test,new= Sepal.Length * Sepal.Width...length(x)){ s=s+x[[i]] result[[i]] = c(x[[i]],s) } result do.call(cbind,result) ###cbind是按列拼接....Rdata中存放的两个数据框连接在一起，按共同的列取交集 x=merge(dat,ids,by = "probe_id") x2=inner_join(dat,ids,by = "probe_id")

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阿榜的生信笔记7—R语言的综合运用1

然后将 x2 的值返回。 str_split(y," ",simplify = T)这段代码是用于将字符串 y 按空格进行分割，参数 simplify 设置为 T 表示结果直接返回成为一个数组。...3、str_sub():按位置提取字符串 ### 3.按位置提取字符串 str_sub(x,5,9) 4、字符检测 ### 4.字符检测 str_detect(x2,"h") str_starts(x2...str_starts函数检查x2字符串是否以字母"T"开头，返回一个逻辑值。 str_ends函数检查x2字符串是否以字母"e"结尾，返回一个逻辑值。...2、distinct()去重复 # distinct，数据框按照某一列去重复 distinct(test,Species,.keep_all = T) distinct(test,Species,.keep_all...* Sepal.Width)：这段代码使用了mutate函数，将test数据集中新增一个名为new的列，该列的值为Sepal.Length×Sepal.Width。

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R07-R语言的综合应用

str_length(x) # 1.检测字符串长度str_split(x," ") # 2.字符串拆分（以空格隔开的字符串拆分）拆分后以列表格式呈现str_sub(x,5,9) # 3.按位置提取字符串...中的o全部替换为Astr_remove(x," ") # 6.字符删除（只删除了第一个空格）str_remove_all(x," ") # 6.字符删除（删除全部空格）2.玩转数据框（dplyr...)) #从大到小(按照Sepal.Length列)distinct(test,Species,.keep_all = T) #数据框按照某一列去重复mutate(test, new = Sepal.Length...函数ifelse(x,yes,no)x：逻辑值或逻辑值向量yes：逻辑值为TRUE时的返回值no：逻辑值为FASLE时的返回值多个条件ifelse(i>0,"+",ifelse(i<0,"-","0")...:4中的每个元素进行循环输出批量画图par(mfrow = c(2,2))for(i in 1:4){ plot(iris,i,col = iris,5)}批量装包pks = c("tidyr","dplyr

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生信入门马拉松之R语言基础-脚本项目管理、条件循环、表达矩阵和一丢丢数据挖掘(Day 7)

数据框函数- 排序arrange()和desc参数、distinct()去重复、mutate()数据框新增列注意⚠️没有赋值就没有改变管道符号%>%-实现连续的步骤非常易读彩虹代码展现嵌套函数的逻辑。...yes：逻辑值T时返回的值no，逻辑值F时返回的值ifelse函数和str_detect()函数连用，王炸炸炸！！！...加载test1.Rdata，将两个数据框按照probe_id列连接在一起，按共同列取交集load("test1.Rdata")library(dplyr)merge1 <- merge(dat,ids,...基因表达芯片转录组单细胞突变、甲基化、拷贝数变异。。。7.4 怎么筛选基因？...7.5.3 箱线图的应用单个基因在两组之间表达量的差异可视化。分组信息：是一个有重复值的离散型的向量，分组向量的元素和表达矩阵的列是一一对应的。

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R语言小专题

)arrange(test, Sepal.Length) #从小到大arrange(test, desc(Sepal.Length)) #从大到小2）distinct（）去重复distinct(test...,Species,.keep_all = T) #把Species列的重复去掉3）数据框新增一列mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width)test$new...—将这些值的Sepal.Length和Sepal.Width列输出——从小到大排序三、条件语句和循环语句专题1）if 条件语句基本格式：if (i>1) {print("+")else{print( "...-")}2)‼️重点函数：ifelse（）ifelse(x,yes,no)x:逻辑值或逻辑向量yes：逻辑值为true时的返回值no：逻辑值是false时的返回值 x = rnorm(3) x [1]...3 Damon O group1 4.2 4 tony group2 4.54）full_join（）全连接（所有数据按命令列连接

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生信马拉松 Day7

simplify这个参数必不可少 # [,1] [,2] #[1,] "jimmy" "150" #[2,] "nicker" "140" #[3,] "tony" "152" 1.3 按位置提取字符串...，数据框按照某一列去重复 distinct(test,Species,.keep_all = T) #默认保留第一个 #不加.keep_all = T就只剩Species这列了 2.3 mutate，...数据框新增一列 mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width) #没赋值的情况下数据实际是不会新增的 #新增列名为new，值为Sepal.Length *...不可以是多个逻辑值组成的向量 } #if+else的格式 if (){ }else{ } #ifelse的格式 ifelse( , ,) #第一个逗号前是逻辑值 #for的格式 for(){...ggplot2) p = ggplot(pdat,aes(gene,count))+ geom_boxplot(aes(fill = group))+ theme_bw() p TIPS 1.如何看某一列是否有重复值

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按组计算每列最大最小值并横向填入格中

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