R- ggplot和corrplot产生完全不同的图(相关图/矩阵)
R- ggplot和corrplot是两个在R语言中常用的数据可视化包，用于绘制不同类型的图形，包括相关图和矩阵。
- ggplot是一个基于图层（layer）的绘图系统，它提供了一种简洁而强大的方式来创建各种类型的图形。ggplot可以用于绘制散点图、折线图、柱状图、箱线图等各种统计图形。它的优势在于可以通过添加不同的图层来定制图形，例如添加标签、调整颜色、添加趋势线等。ggplot的应用场景非常广泛，适用于数据分析、统计建模、数据可视化等领域。
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- corrplot是一个专门用于绘制相关矩阵的R包。相关矩阵是用于展示变量之间相关性的矩阵，常用于数据分析和统计建模中。corrplot可以根据相关系数的大小和方向来展示相关矩阵，常用的展示方式包括颜色编码、数字标签、图形符号等。corrplot的优势在于可以直观地展示变量之间的相关性，帮助分析人员快速理解数据的关联关系。
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总结：ggplot和corrplot是R语言中常用的数据可视化包，用于绘制不同类型的图形。ggplot适用于绘制各种统计图形，而corrplot适用于展示相关矩阵。腾讯云提供了相关的产品和服务，可以满足数据处理和分析的需求。
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1回答
关联图的输入自相关矩阵
、、、
我想画一个相关矩阵图，类似于什么是用corrplot输出。
然而，我使用一个带有MCMCglmm的多元混合模型来估计我的相关矩阵(因为我想要考虑一些固定的影响和一些缺失的数据点)，所以我希望能够输入我自己的相关矩阵估计(以及相关的置信区间)供corrplot使用。据我所知，corrplot从您的数据中为您估计相关矩阵--我不希望这样做。
作为corrplot的替代方案，我知道我可以使用ggplot和geom_tile构建相关热图。但我真的很喜欢corrplot附带的‘省略’选项。
library(reshape2)
library(corrplot)
library(ggplot2)
#my
浏览 0提问于2018-01-22得票数 0
1回答
我有两个关于相关图的问题。 问题1:我可以在相关图中突出显示特定变量吗？例如，当我使用下面的代码，并特别想要突出显示mpg、cyl、disp和hp在其他剩余变量上的相关性时，我是否可以像在我的手动示例中那样，在这些变量周围添加一个框架？ M<-cor(mtcars)
library(corrplot)
corrplot(M, type="lower", order="original", diag=FALSE) ? 问题2:我可以制作一个只包含突出显示区域的“相关图”吗？所以我的图应该只包含我选择的变量的相关性，而不是10x10矩阵，所以是7x4的矩
浏览 18提问于2019-12-05得票数 2
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2回答
我正在尝试使用corrplot包在R中绘制一个相关矩阵。
我的问题是整个矩阵的最小和最大相关系数的范围是(-0.2,0.2)。我使用corrplot绘制矩阵，并使用自定义的colorRampPalette
col1<-colorRampPalette(c('red','yellow','green','blue'))
对于图例的色彩映射表，所以我设置了col=col1(10)，我设置了cl.lim=c(-0.2,0.2)。
当我看到这个图时，颜色图例出现在-0.2到0.2之间，但只有2种颜色，相反，我想要的是一个颜色图例，在
浏览 106提问于2015-01-23得票数 5
1回答
如何在R中的矩阵内画半圆？
、、、、
我正在使用R来绘制一个向上/向下调节的基因计数矩阵，其中y轴是类别，x轴是每个处理中的计数。下面是我用corrplot绘制的矩阵结构的示例： 由corrplot绘制的矩阵 ? 我希望每个单元格都有一个分割圆图，而不是像上图那样在每个单元格中绘制完整的圆。其中一半包含类型"up“值，另一半包含"down”值。 使用这篇文章作为圆圈图的example，我已经能够绘制圆圈，但我正在努力将其转换为矩阵状的图形。以下是一些示例数据： df <- data.frame(category = rep(c("A", "B"), each = 2)
浏览 28提问于2021-04-14得票数 1
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1回答
R相关图-得到小的压缩图
、、、
我试图用corrplot函数从相关矩阵中绘制一个相关图。
但我得到了一个压缩和不可读的情节。此外，在窗口的最右端生成了这个图。扩展ggplot图的方法在这里行不通。
> col <- colorRampPalette(c("#BB4444", "#EE9988", "#FFFFFF", "#77AADD", "#4477AA"))
> corrplot(correlation_matrix, method="color", col=col(200),
typ
浏览 2提问于2016-11-16得票数 3
全
我试图拟合几个变量的线性模型，并报告所有的R平方值。
不过，我想问的是，是否有办法一蹴而就，而不是双管齐下呢？
例如，我知道如何使用两个变量来实现它，如：
data(mtcats)
fit<-lm(formula = mtcars[,1] ~ mtcars[,2])
summary(fit)$r.squared
，我的意思是，既然有11个变量，我们要记录所有的r-平方值？我们想要一个11乘11的矩阵，它是0的对称和对角线?。
浏览 6提问于2014-11-01得票数 1
我有一个数据范围的数据透视表(data_wide2)，它是我使用tidyr的spread()为一列生成的，然后保留所有其余的(data_wide用于另一个脚本)。
然后，我根据另一个变量('Start')对我的数据级别进行了重新排序，这说明了索引不整洁(83,35,86等)。
我使用下面的代码生成了一个带有corrplot的相关矩阵(这是成功的，除了标签之外，它适合这个图)。第一个图显示了两个明显较暗的正方形。
heatmap <- function(){
data_wide2 <- data_wide
data_wide2$Protein <
浏览 0提问于2016-08-06得票数 0
1回答
假设计算数据集mtcars的相关性，我们可以使用corr <- round(cor(mtcars), 1)，也可以用corrplot(cor(mtcars)计算和绘制相关矩阵。然而，产品是成对相关的。是否可以计算列1:3 (mpg, cyl, disp)与列4:8 (hp, drat, wt, qsec, vs)之间的非成对相关。
请提出任何方法。
我有一个包含120列的数据集。我希望计算/绘图相关矩阵(Spearman相关)的列1:50与其余的列(即51-120)。请告诉我解决方案，如果可能的话，通过使用cor，或包，即corrplot，ggcorrplot。
感谢你的期待。
浏览 5提问于2020-12-03得票数 0
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我遵循了这个网站的说明，在R中绘制了相关矩阵和相关图，这个网站和例子真的很好。但是，我想在相关矩阵的上部绘制相关图的上半部分。
下面是代码：
library(PerformanceAnalytics)
chart.Correlation(mtcars, histogram=TRUE, pch=19)
这应该给我使用散点图的相关矩阵，以及我想要维护的直方图。但是对于图的上部，我希望从这个代码中获得相关图：
library(corrplot)
corrplot(cor(mtcars), type="upper", order="hclust", tl.col=
浏览 2提问于2015-07-29得票数 3
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我正试着给我的corrplot热图添加一个第二色的标签键。我已经使用r值生成了热图。我有两个数据集，其中一个包含我用来构建相关矩阵的数据。第二个是基因及其来源的列表。我想在图的左边加一个颜色标签，表明每个基因的来源。下面是我想要添加的类别： 基因来源 X人类 Y HumanMouse Z鼠标 ? 谢谢 编辑:这是我的热图的代码 corrplot(upreg_cor$r, type = "upper", tl.col = "black", tl.srt = 90, tl.cex = 0.5) 我用来创建相关矩阵的数据，然后热图如下所示 Gene1 Gen
浏览 27提问于2019-01-29得票数 0
3回答
使用相关图的错误
、、、
我需要帮助解释一个错误信息使用corrplot。
这是我的剧本
install.packages("ggplot2")
install.packages("corrplot")
install.packages("xlsx")
library(ggplot2)
library(corrplot)
library(xlsx)
#set working dir
setwd("C:/R")
#read xlsx data into R
df <- read.xlsx("TP_diff_frame.xlsx",1
浏览 10提问于2014-01-15得票数 14
我在R中进行了Spearman秩相关系数分析:我成功地绘制/可视化了相关矩阵，并将矩阵表导出为csv文件。
corr <- cor(q.dat.cor, y = NULL, use = "everything", method = c("spearman"))
# corrplot visualisation
install.packages("corrplot")
library(corrplot)
# rcorr() computes the p-value
rcorr <- rcorr(corr)
浏览 11提问于2022-08-03得票数 0
2回答
我有一个包含9个变量的dataframe subs，我希望得到日志和变量的平方根之间的相关性。
所以我首先计算了两个矩阵：
library(corrplot)
logs = log(subs)
sqroots = sqrt(subs)
然后我替换无限值(如果有的话)：
logs = do.call(data.frame,lapply(logs, function(x) replace(x,
is.infinite(x),NA)))
sqroots = do.call(data.frame,lapply(sqroots, function(x) replace(x,
is.infinit
浏览 0提问于2018-02-19得票数 0
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我有一个散射矩阵(点矩阵)
p1 = plotmatrix(M);
但是，我需要绘制一条回归线，每个子图中的R-平方在图的上段。对怎么做有什么想法吗？？
有点像corrplot.m，但是我有一个老版本的Matlab.
谢谢!
浏览 5提问于2013-12-06得票数 2
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我想知道是否有可能使用corrplot (来自biokit包)拥有一个带有模式的柱状图。在下面的例子中，对于柱状图，我希望有5个不同大小的气泡与矩阵的值相关联(-1，-0.5，0，+0.5，+1)。 想法？非常感谢 import numpy as np
import pandas as pd
from biokit.viz import corrplot
from matplotlib import pyplot as plt
import string
letters = string.ascii_uppercase[0:15]
df = pd.DataFrame(dict(( (k,
浏览 23提问于2020-01-23得票数 0
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当你有一个包含很多因素和相互作用的多级模型时，固定效果矩阵的相关性就会变得相当大和不明确。
我可以在print方法中使用symbolic.cor=T参数来更清晰地打印摘要，如下所示：
ratbrain <-
within(read.delim("http://www-personal.umich.edu/~bwest/rat_brain.dat"),
{
treatment <- factor(treatment,
labels = c("Basal", "Carbachol"))
region <- factor(region
浏览 10提问于2013-04-26得票数 5
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1回答
当我使用corrplot::corrplot()绘制相关矩阵时，y轴上的底部标签(1)被切掉了一半，因为绘图的底部位于绘图区域的最底部，而1在底轴上居中。我想把这张图用来出版。如何在底部多留一点空间，这样底部的y轴标签就不会被切掉？提前感谢你的剧情和上面的帮助。除了上面的问题，这是一个非常好的图。拉里·亨瑟瑟
浏览 19提问于2017-01-16得票数 4
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我有一个数据集，其中包含许多不同的变量，每个变量都有自己的组子集。我还有一个目标变量。我想确定哪些组与响应相关，并成功地为每个变量和响应创建了一系列相关矩阵，还分别使用R中的cor函数和corrplot函数绘制了相应的相关图。 对于我正在做的事情，我对变量之间是否相互关联不感兴趣，我只对它们是否与响应变量相关感兴趣。有没有一种方法可以在绘制之前过滤相关矩阵，以便只包含目标变量的变量
浏览 7提问于2021-01-10得票数 0
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2回答
我正在尝试从数据框中按组/面绘制相关图。如果我对每个变量的数据进行子集，我就能做到这一点。如何一次对所有变量执行此操作，以根据每个变量生成刻面图？
###Load libraries
library(gdata)
library(corrplot)
library(ggplot2)
library(gtable)
library(ggpmisc)
library(grid)
library(reshape2)
library(plotly)
packageVersion('plotly')
##Subset ample data from the "iris"
浏览 0提问于2017-03-01得票数 3
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我正在尝试使用R中的corrplot来做相关图，其中包含100多个变量的高维数据。但该图不可读，因为单元格中的r值杂乱，因为它无法容纳图中的大型(121 * 121)矩阵。我如何做一个更大的图，以便数字是可读的。这就是我使用的corrplot(c, method="number", tl.cex = 0.6)命令。
。
浏览 23提问于2018-12-17得票数 1
我有一个数据矩阵，我想用背景颜色来显示矩阵元素的值，所以背景越暗，矩阵元素就越大。我使用了corrplot，如下所示：
corrplot(overlaps[[1]], method="number", is.corr=FALSE, type="full",
cl.lim=c(0,100), addgrid.col="red", addshade="positive")
矩阵如下所示：
但我希望背景显示的是强度，而不是这里的数字。我该怎么办？
提前谢谢你
浏览 1提问于2012-12-12得票数 2
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我有一个简单的8乘8矩阵
M <- matrix(rnorm(64), nrow=8, ncol=8)
我应该如何将它转换成用library(corrplot)绘制它呢？如果不进行转换，错误是：
corrplot.mixed(M)
关联图中的错误(corr，type =“not”，method =not，diag = TRUE，tl.pos = tl.pos )：矩阵不在-1，1！我猜这会假设矩阵应该是-1，1
浏览 6提问于2014-10-05得票数 12
我有>100个变量，我想了解它们是如何相互关联的。我想使用来自corrplot()包的corrplot函数来完成这个任务。
corrplot()提供了对显示变量排序的选项，以便在关联图的右上角显示最紧密相关的变量。为此，必须设置参数order="hclust"：
library(corrplot)
corrplot(cor(df), order="hclust", type="upper") # df = data.frame object
问题：-- corrplot将包含所有>100个变量，因此不可读。因此，我正在寻找一种方式来显
浏览 1提问于2018-07-23得票数 3
1回答
我正在使用仅具有正值的网络的连接矩阵，并且我希望在应用阈值之前和之后显示它。我已经使用过corrplot库，它允许对图例和颜色进行大量更改，但我决定使用ggcorrplot，因为当我试图通过grid.arrange将它们放在一起时，corrplot图形会发生变化。ggcorrplot的主要问题是我无法将图例值更改为仅介于0和1之间。
library(ggcorrplot)
library(ggplot)
ggcorrplot(prom_orig_sub, legend.title = "Coherencia")
您能推荐一些更改图例值的解决方
浏览 59提问于2019-08-01得票数 0
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1回答
我希望在ggcorrplot()输出中移动y轴标签，使其与右侧的每个圆相邻放置。这可能吗？我试过使用+theme(axis.text.y = element_text(hjust = ...)。我想要一个与corrplot()包返回的图类似的输出。 library(ggcorrplot)
library(ggplot2)
data(mtcars)
corr<-cor(mtcars)
cortest<-cor_pmat(mtcars, sig.level = 0.05)
ggcorrplot(
corr,
p.mat = cortest,
hc.order = F,
浏览 140提问于2021-11-17得票数 0
我想使用cprrplot进行可视化，但是有一个错误。
dataset1 <- read.csv(“win平等性-white.csv e.csv”)，header=T)视图(Dataset1)头(Dataset1) fixed.acidity volatile.acidity citric.acid residual.sugar free.sulfur.dioxide total.sulfur.dioxide pH total.sulfur.dioxide pH硫酸盐醇1 7.0 0.27 0.36 20.7 0.045 45 170 1.0010 3.00 0.45 8.8 26.3
浏览 1提问于2018-01-31得票数 0
我试图使用corr图，得到一个mxn矩阵的输出，而不是mxm矩阵。
我是一个80x20矩阵的数据框架，其中我想把2:6列和7:20列关联起来。因此，首选输出为5x14。不幸的是，我还没有找到解决办法。
有人能帮我吗？
浏览 2提问于2021-03-04得票数 1
1回答
我想用R创建并绘制一个相关矩阵。
我有三个用来创建dataFrame的向量。在2D-XY-Coordiante系统中，向量“索引”将在x轴上。然后我有两个变量"var1“和"var2”(y值)，具有相同向量索引的每个值都属于相同的索引(x)值。
我尝试绘制相关矩阵失败了，因为我不能以适当的方式准备我的数据。
如何为后续的相关图准备数据？
var2
900 800 700 600 500 400 300 200
900
800
700
600
浏览 7提问于2018-08-03得票数 0
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12回答
将相关矩阵绘制成图
、、、
我有一个矩阵，其中有一些相关值。现在我想把它画在一个看起来或多或少像这样的图中：
我怎样才能做到这一点呢？
浏览 4提问于2011-03-28得票数 95
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我有一个数据，其中有4个变量-铜，价格，数量和克拉。
除了削减，一切都是一个数值变量:我能够得到相关矩阵的价格，数量和克拉。这是下面的代码
Jewels_Input_Data_2 <- subset(Jewels_Input_Data,select = c(price,Volume,carat))
#Correlation Plot to examine the relationships between price, volume, caret
library(corrplot)
CorMatrix <- cor(Jewels_Input_Data_2)
上面的图显示了所
浏览 0提问于2017-10-30得票数 1
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2回答
我是编码和R的新手，我试图使用corrplot可视化相关矩阵，但不想显示所有的相关值。我希望隐藏/取消一大块选定的列和行相关值，以便只显示值的反转'L‘。
作为示例，请参阅此处编辑的示例corrplot图像：
浏览 1提问于2014-04-22得票数 6
1回答
我使用的是R corrplot库。它看起来很神奇，但是为了产生一个真正好的图，我想要改变相关矩阵的行和列的标签。
一种解决方案是这样做：
cbak <- colnames(my.data.frame)
colnames(my.data.frame) <- c("a", "set", "of", "labels")
corrplot(cor(my.data.frame))
colnames(my.data.frame) <- cbak
然而，这看起来既奇怪又丑陋。
我想我应该使用text()函数的labels参数，
浏览 0提问于2016-03-13得票数 9
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我有两个具有相同维度、列名和行名的矩阵，如下所示。
data(mtcars)
M <- cor(mtcars)
myMat<-matrix(runif(11*11), ncol=11)
colnames(myMat) <- colnames(M)
rownames(myMat) <- rownames(M)
我想使用一个矩阵图来可视化两个矩阵，如下所示
corrplot(M, method = "circle")
我想做一个新的图，其中圆的颜色基于M矩阵，大小基于myMat矩阵。有没有办法在R语言中实现这一点。
浏览 9提问于2016-09-15得票数 0
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我制作了一个corrplot图，给出了变量之间的关联。现在，我只想添加一个副标题/标题，在图的底部记录有关变量的内容。然而，因为它不像ggplot，我似乎无法使标签出现。我使用了参数main =来生成一个标题，但是sub =没有产生任何结果。
是否可以在corrplot呈现中添加一个字幕？如果没有，是否有一种方法可以将corrplot输出放到另一个对象中，从而允许我添加标题/字幕？
我的情节是这样的：
我的代码是：
correlation_plot <- corrplot(corr = cortable, method = "number", main = &#
浏览 8提问于2022-09-14得票数 0
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我想知道如何使用correlation在R中绘制1000x1000相关图。
我的尝试：
a <- replicate(1000, rnorm(1000))
library('corrplot')
png("Correlation_plot.png")
corrplot(cor(a))
dev.off()
Try 2:
a <- replicate(1000, rnorm(1000))
png("Correlation_plot.png")
heatmap(cor(a))
dev.off()
Try 3:
library(ggplo
浏览 12提问于2015-03-23得票数 2
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1回答
我在corrplot中使用了hclust来生成一个图。由于聚类的存在，列名称的顺序与矩阵的顺序有明显的不同。有没有一种方法可以让列名和行名按照它们在绘图上出现的顺序排列？我有超过625行。
corrplot(trait.matrix, tl.cex = 0.3, col = col12(400), method = "color",
cl.lim = c(0,1), order="hclust", addgrid.col = NA, tl.col = "black")
浏览 1提问于2017-07-11得票数 0
1回答
我写这封信是为了提个建议。我想要产生的图形，在图像，我附上的ggplot或其他一些R包。我尝试了ggplot和igraph，但都没有成功。我有多个零的邻接矩阵，连接值从-1到1。这个矩阵有行和列标签。这是一个无向图。我将矩阵转换为带有igraph包的图，但是当我试图用ggraph绘制它时，使用选项树状图循环，我会收到一条错误消息，建议我使用有向图。我也试着用和弦的情节，但在我的情况下没有用。从无向邻接矩阵开始，我应该如何用R生成我所附加的图像？
浏览 6提问于2022-09-29得票数 1
1回答
我试图用R中的Corrplot绘制一个可视化图，我的数据框架中有几个变量，但是当我试图绘制图表时，它显示为一个非常破旧的可视化。我不知道如何删除矩阵中变量的名称，只用数字来表示它们。我用了一个正常的代码来绘制图表。请原谅我在这里缺乏认识，我对R非常陌生，并且学习更多的知识。
Library(corrplot)
m <- cor(df)
corrplot(m, method = "circle")
浏览 0提问于2018-04-03得票数 6
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3回答
在corrplot矩阵中添加p值
、、、、
我计算了两个矩阵之间的Spearman相关性，并使用corrplot绘制r值。我怎样才能只画出显著的相关性(所以只有那些p值低于0.00的相关性，而删除那些p值较高的相关性，即使是强相关性-高r值)。我在psych包中使用corr.test生成了相关矩阵，因此在cor.matrix$p中已经有了p值
这是我使用的代码：
library(corrplot)
library(psych)
corr.test(mydata_t1, mydata_t2, method="spearman")
M <- corrplot(cor.matrix$r, method="squa
浏览 2提问于2014-01-16得票数 5
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2回答
我有大约20个关于不同城市的变量，标记为"Y“或"N”，它们是因子。变量就像“有合作伙伴”之类的。我希望找到一些相关性，并可能使用corrplot包来显示所有这些变量之间的联系。但是由于某些原因，我不能强制变量，让它们以corrplot甚至cor()喜欢的方式读取，这样我就可以将它们放入矩阵中。我试过了：
M <- cor(model.matrix(~.-1,data=mydata[c(25:44)]))
但是corrplot的结果真的很奇怪。有没有人有一个快速的方法把一堆Y/N答案转换成一个相关矩阵？谢谢!
浏览 1提问于2015-07-06得票数 6
3回答
R中的关联矩阵
、、、、
corrplot方法允许您在R中绘制相关矩阵
我想知道如何在R中绘制关联矩阵，其中关联方法使用任何用户指定的方法，如Cramer's V
浏览 0提问于2017-05-19得票数 1
我以前做了一个漂亮的，实用的，完美的贴图()。现在我必须得到相同的底层数据。因此，我的目标是有三角形的相似矩阵，在相同的颜色与我的凝聚图。想象一下，它就像excel中的条件格式。
我的数据：
它作为csv加载，并且可以很好地读取csv。
我的代码：corrplot(Phylogeny, is.corr=FALSE,method="number", cl.lim=c(0,1))
它抛给我的错误：Error in if (any(corr < cl.lim[1]) || any(corr > cl.lim[2])) { : Missing value, where
浏览 3提问于2020-09-17得票数 2
我试图生成R中数字的关联图，出现以下错误：“is.finite中的错误(Tmp)：未为类型‘list’实现的默认方法”
我试着把我的列表转换成数据框架，但我肯定做错了什么。
有人能帮我解决这个问题吗？
提前感谢
注:我放了一张显示"x“的图片。
在我的代码下面
library(corrplot)
x<-read.table("corrplot_2.txt")
x <- as.data.frame(x)
corrplot(x, method="number")
浏览 5提问于2022-07-02得票数 0
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我试图用R中的相关矩阵来绘制相关矩阵，怎样才能改变图的宽度和高度。目前它很小。
这是我的代码：corrplot(mydata.cor, method="number", addCoef.col = 1,number.cex = 0.3, tl.cex = 0.3)
浏览 3提问于2022-04-05得票数 0
我一直试图建立一个简单的关联矩阵。我有以下数据：
cormetric2 <- structure(list(rich = c(24.03017241, 22.3), spatial = c(20.16163793, 18.71), abund = c(13.69612069, 12.71),
rare = c(12.14439655, 11.27), div = c(8.265086207, 7.67), nature = c(8.006465517, 7.43 ),
other = c(7.747844828, 7.19)
浏览 0提问于2021-01-01得票数 0
1回答
是否有可能创建一个具有数字和分类变量的视觉相关图？
例如，使用以下值：
val1 <- rep(c(1:2),5)
val2 <- rep(c('a','b'),5)
val3 <- paste(val1,val2)
val4 <- c(1:10)^2
val5 <- paste('x',val4)
在问题之后，我可以将相关性看作一个表，如下所示：
table(val1,val2)
table(val1,val3)
etc...
这在某种程度上是有帮助的，但我希望生成类似于相关图的东西。
此外，它在数字&分类
浏览 0提问于2017-02-19得票数 0
我试图用correlation绘制一个相关热图。这里可以找到。但我的问题是，如果我想限制行和列的名称，我们需要修改？
行名
mpg cyl盘
列名
wt qsec对am齿轮卡比
数据M = cor(mtcars)
corrplot(M, p.mat = testRes$p, method = 'color', diag = FALSE, type = 'upper', sig.level = c(0.001, 0.01, 0.05), pch.cex = 0.9, insig = 'label_sig', pch.col = &
浏览 4提问于2021-08-17得票数 2
1回答
考虑以下数据，其中我们有几个组，每个组有10个观察值，我们进行pairwise.t.test() set.seed(123)
data <- data.frame(group = rep(letters[1:18], each = 10),
var = rnorm(180, mean = 2, sd = 5))
ttres <- pairwise.t.test(x=data$var, g=data$group, p.adjust.method = "none")#just to make sure i get some sig
浏览 23提问于2020-07-24得票数 1
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我注意到corrplot绘制的相关图与pheatmap绘制的不同。原始数据：enter link description here 相关矩阵在相关图中， count = read.csv('data_here.csv')
mtx = cor(count, method = 'kendall')
corrplot(mtx, method="color", tl.cex = .35,
order="hclust", hclust.method = 'complete') ? 我想在曲线
浏览 28提问于2021-07-04得票数 0
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我想要可视化60+属性的相关矩阵。我尝试过‘库(Corrplot)’，结果显示了警告：“重叠太多了”。然后我试了一试，它显示了一个凌乱的图形，标签太大，曲线重叠。
library(corrr)
data %>% correlate() %>% network_plot(min_cor = 0.4)
我试图在之后调整标签的大小和曲线宽度，它显示了错误：
network_plot中的错误(关联(数据)，min_cor = 0.4，nod_cex = 2，未用参数(nod_cex = 2，lab_cex = 1，lab_lwd = 2)
浏览 1提问于2021-05-17得票数 1
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