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数据分析|R-缺失值处理

本版块打算分享一些数据分析过程中用到的数据清洗,统计分析,建立简单模型等。 拿到数据后,在清楚了分析需求后,别急着各种统计、模型一块上,先给数据做个“清洁”再说。...数据中往往会有各种缺失值,异常值,错误值等,今天先介绍一下如何处理缺失值,才能更好的数据分析,更准确高效的建模。...载入R包及内置数据集 library(VIM) #VIM包的sleep数据集示例 data(sleep,package="VIM") 1)查看数据集整体有多少缺失值及百分比 sum(is.na(sleep...2.2 VIM包展示数据缺失情况 1)展示sleep数据集的整体缺失情况 library("VIM") aggr(sleep,prop=FALSE,numbers=TRUE) ?...三 处理缺失值 当充分了解了缺失值的情况后,可以根据数据量的大小,以及某一列是否为重要的预测作用变量,对数据集中的NA行和某些NA列进行处理。

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laravel实现按月或天或小时统计mysql数据的方法

在PHP里怎么比较简单的实现按时间(如按月,按天,按小时)来统计表里的数据呢?...如:要实现获取下图曲线图数据(ps:当然也可能是柱状图等,数据都是一样的),默认获取七天内的数据,点击今天,7天,15天,30天可任意切换,其中今天是按小时统计....不过我的实现方法有一个小缺点,当某个小时内是没有数据的,那么该小时不会出现,不过这个应该可以通过前端的形式弥补 好了,废话不多说,上图上代码! ? 1....,strtotime($end)); } $data = $query- get(); return $data; } 以上这篇laravel实现按月或天或小时统计mysql...数据的方法就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考。

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如何让你的数据对象say I do(R-数据索引)

数据进行索引之前,我们要先了解自己的数据对象 这里我们拿实物进行展示,关键词点到为止,不进行名词解释 数据对象类型结构 这里我们只介绍用得比较多的对象类型结构:向量、矩阵和数据框: #####建议大家在...dim(b)<-c(5,10) ####矩阵也可以有自己的行名和列名,用rownames和colnames进行设置 rownames(b)<-c('a','b','c','d','e') b ####数据框用得比较多...,可以是不同模式的数据,但每列元素个数需一致,这种方式创建的数据框,行名和列名已经设置好了,不喜欢的话,可以通过rownames和colnames进行更改 date<-c('21','22','23')...plan<-c('library','home','library') April<-data.frame(date,plan) April 数据索引 下面是个糟糕的例子,Ross婚礼现场把Emily...要用合理的唤醒(索引),才能有效 1.都可按元素位置进行索引 2.有行名和列名的数据类型可以根据行名和列名进行索引,逗号左边是行,右边是列 3.数据框有$符号可以通过列名进行提取 4.中括号[],冒号:

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Trimmomatic 数据过滤

Trimmomatic 是一个很常用的 Illumina 平台数据过滤工具。支持 SE 和 PE 测序数据。...:1:TRUE LEADING:20 TRAILING:20 SLIDINGWINDOW:4:15 -threads 8 MINLEN:50 done 处理步骤及主要参数: Trimmomatic 过滤数据的步骤与命令行中过滤参数的顺序有关...,通常的过滤步骤如下: ILLUMINACLIP: 过滤 reads 中的 Illumina 测序接头和引物序列,并决定是否去除反向互补的 R1/R2 中的 R2。...SLIDINGWINDOW: 从 reads 的 5’ 端开始,进行滑窗质量过滤,切掉碱基质量平均值低于阈值的滑窗。...MAXINFO: 一个自动调整的过滤选项,在保证 reads 长度的情况下尽量降低测序错误率,最大化 reads 的使用价值。 LEADING: 从 reads 的开头切除质量值低于阈值的碱基。

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illumina数据质控过滤

背景 我们拿到测序的原始数据后,其实并不是所有的都是能用的数据,我们需要先做质控与过滤。首先认识下碱基的指标Q20(百分之一出错率),质量值>=Q20:好碱基,质量值<Q20:坏碱基。...fastqc -f fastq -o illumina_qc/ illumina_1.fastq.gz illumina_2.fastq.gz 碱基质量分布图 碱基含量分布图 二、数据过滤...学习目标: 1、知道为何要进行数据过滤; 2、掌握数据过滤的内容; 3、掌握数据过滤软件 fastp 以及 SOAPnuke 的使用; 4、了解其他过数据滤软件...; 利用 fastp 进行数据过滤 fastp 数据过滤 fastp -i illumina_1.fastq.gz -I illumina_2.fastq.gz -o clean.1.fq.gz -O...1、不要求100%精确,原则是不影响后续分析 2、可以根据最终结果,重新过滤数据 三、过滤完质控 过滤完质控 mkdir illumina_clean fastqc -f fastq

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转录组数据过滤-4

生信技能树学习笔记 数据过滤条件 测序得到的原始序列含有接头序列或低质量序列,为了保证信息分析的准确性, 需要对原始数据进行质量控制,得到高质量序列(即Clean Reads),原始序 列质量控制的标准为...: (1) 去除含接头的reads; (2) 过滤去除低质量值数据,确保数据质量; (3) 去除含有N(无法确定碱基信息)的比例大于5%的reads;(可以根据实际情况) 数据过滤-trim_galore...前台运行命令 暂停命令 Ctrl+Z 查看命令ID 前台转后台 杀程序 后台:Kill -9 %1 前台:Ctrl+C 如何检查脚本内容:echo命令 使用echo将命令打印出来查看是否变量等有错误 数据过滤数据过滤...-trim_galore运行结果 第二种数据过滤软件——fastp https://github.com/OpenGene/fastp 特点:快 fastp常用参数 注意大小写 小技巧:\的妙用 表示手动换行...cleandata}/${id}.fastp.jsondone # 运行fastp脚本nohup bash fastp.sh >fastp.log & 报告解读 总结 去掉的接头 过滤前后的碱基质量

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python过滤 Kubernetes api数据

default/endpoints services api地址 http://ip地址:端口/api/v1/namespaces/default/services 下面主要展示 endpoints api的部分数据...                        "protocol": "TCP"                     }                 ]             }         ]     }, ] } 需要提取以下数据...二、数据结构 上面的api需要提取6个字段信息,最终的数据结构如下: {     "voucher-center-master":[         {             "ip":"192.169.167.105...python3 # coding: utf-8 import sys import json import socket import ipaddress import requests """ 要求的数据格式...那么有了这些数据,就可以做端口的健康检测了!

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1.状态数据过滤隔离

在Fabric中,一般来说我们有四种隔离方法,从软到硬分别是: 1.状态数据过滤隔离 我们知道状态数据都存储在一个KV数据库,而我们可以通过构建特定的前缀实现数据存入和数据查询时的过滤。...如果是有区块链浏览器提供的话,我们也需要给浏览器进行改造,使得在浏览数据前用户必须选择租户ID,然后根据租户ID展示数据。...优缺点: 这样做可以实现一种逻辑上的数据隔离,实际上所有租户的链上数据都存在同一个区块链中,只是根据调解过滤而已,具有数据泄露的风险,还有因为某租户高频交易导致整个区块链交易大量堆积,排队等待打包的情况...而且以后想单独把某个租户的所有数据独立出来基本上是不现实的。 2.通道隔离 我们为每个租户都创建一个对应的通道,由于通道与通道之间是数据隔离的,所以可以实现租户之间的数据隔离。...优缺点: 我们这样做算的上是数据的所谓物理隔离(因为不同通道是不同数据库,或者是磁盘上不同文件夹位置),但是仍然要求各个通道的数据在同一个组织和节点下,所以还不能算真正的物理隔离。

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