运行最后library代码,报错提示缺啥就安装啥,安装方法有 BiocManager::install('xx') 或 install.packages('xx'),逐一尝试,没有明显的 ERROR 关键词就不要管。
Rstudio Server 是Rstudio开发的基于R语言的网页版(只能在Linux),你在手机上都可以运行R,还是挺方便的。就是配置起来有点麻烦。 官方下载链接:https://www.rstudio.com/products/rstudio/download-server/
这是专门为具有 R 和 RStudio 知识的朋友设计的 Docker 教程。该介绍旨在帮助需要 Docker 进行项目的人们。我们首先解释 Docker 是什么以及为什么有用。然后,我们将详细介绍如何将其用于可复制的分析项目。
R语言是用于统计分析,图形表示和报告的编程语言和软件环境;Rstudio是编辑、运行R语言的最为理想的工具之一。
安装R和Rstuido软件 R语言是用于统计分析,图形表示和报告的编程语言和软件环境;Rstudio是编辑、运行R语言的最为理想的工具之一。
现如今,R语言是统计领域广泛使用的工具,是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,是用于统计计算和统计绘图的优秀工具。而RStudio是R的集成开发环境,用它进行R编程的学习和实践会更加轻松和方便。下面就教大家如何下载并安装R和RStudio,比较简单。R的维护工作由一个国际化的开发者团队负责。R软件的官方下载页面叫作The Comprehensive R Archive Network,即CRAN。 一、官网下载R安装包 下载地址为:https://cran.r-project.org
现如今,R语言是统计领域广泛使用的工具,是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,是用于统计计算和统计绘图的优秀工具。而RStudio是R的集成开发环境,用它进行R编程的学习和实践会更加轻松和方便。下面就教大家如何下载并安装R和RStudio,比较简单。R的维护工作由一个国际化的开发者团队负责。R软件的官方下载页面叫作The Comprehensive R Archive Network,即CRAN。
R语言是比较常用的统计分析和绘图语言,拥有强大的统计库、绘图库和生信分析的Bioconductor库,是学习生物信息分析的必备语言之一。 Rstudio是编辑、运行R语言的最为理想的工具之一,支持纯R
从Python、R等编程语言到以Git为例的版本控制系统甚至Unix Shell等命令行工具,数据科学家的武器库现在越来越丰富了,在个人计算机上同时使用这些武器可能会对新入门的数据科学家们造成不小的困扰,本文就将带你学习这些数据科学武器的配置方法。
RStudio是一款功能强大的自由和开源编程语言和环境,提供了大量的图形和统计方法统计计算和图形。RStudio支持多系统MOX OS X,Linux和Windows系统,软件可以对代码进行整理,方便您的观看。
世界上最好的 Python 编辑器或 IDE 是什么?炫酷的界面、流畅的体验,我们投 PyCharm 一票,那么你呢?本文介绍了 PyCharm、Jupyter Notebook 和 Spyder 在内的 5 种主流 Python IDE,每一种都各有优缺点。不过结合经验教训,不论是纯文本编辑器还是集成开发环境,总有一款是你的最爱,那么快在文末为你最爱的 IDE 投上一票吧。
(如果下面的博客没有能解决你的问题或者你还有其他关于计算机方面的问题需要咨询可以加博主QQ:1732501467)
如果压根就下载不了,可能是网络的问题,或者是下载设置的问题,包括http和https的区别,下载协议的区别。
选自 KDnuggets
今天是我们的系统教程《R语言从入门到精通》的第一讲,前面的背景讲解中《从今天开始,每天学点R语言~》,已经深入探讨过R语言的重要性以及学习R语言的必要性,今天我们就按照课表来讲解:如何在自己的PC中安装R语言的运行环境。还没有领取《学习R》书籍教材的同学,赶紧联系文末的客服小姐姐吧~
安装 R 现在最新版的 R 语言是 3.6.2 版本 (2019 年 12 月 12 日发布),该发行版的名字是 Dark and Stormy Night (漆黑暴风夜 ??),事实上只要用 3.0
有一些基础R包是不能清除的。想重新安装,把我们给学员准备工作的代码从第一行开始运行即可。
NGS系列文章包括NGS基础、高颜值在线绘图和分析、转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析 (重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘(典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step))、批次效应处理等内容。
连续两次求贤令:曾经我给你带来了十万用户,但现在祝你倒闭,以及 生信技能树知识整理实习生招募,让我走大运结识了几位优秀小伙伴!大家开始根据我的ngs组学视频进行一系列公共数据集分析实战,其中几个小伙伴让我非常惊喜,不需要怎么沟通和指导,就默默的完成了一个实战!
下载地址为:https://cran.r-project.org 进入链接,如下图所示,在页面顶部提供了三个下载链接,分别对应三种操作系统:Windows、Mac和Linux。请选择自己操作系统对应的链接。
但是最近频繁看到粉丝留言表明安装clusterProfiler包失败,这个clusterProfiler是大名鼎鼎的Y叔开发,基本上是每个做生物信息学数据分析的人都会使用它的,做超几何分布检验(富集分析),而且内置了很多数据库,好用的函数。
RStudio Server是网页版的RStudio,部署在服务器上后,能够在从Web浏览器访问的Linux服务器上运行RStudio,可随时随地完成R语言的工作,并且能很方便的完成R项目的部署调试。使将RStudio IDE的强大功能和工作效率带到基于服务器的集中式环境中。
动态模板引擎是阿里巴巴优酷技术团队研发的一套轻量级的纯Native动态化卡片跨端解决方案。动态模板引擎是阿里巴巴优酷技术团队研发的一套轻量级的纯Native动态化卡片跨端解决方案。
最近需要在服务器上用Rstuido,奈何课题组的服务器尚未开通Rstudio server,经过曾老师和永和的指点,最终实现在Windows和MacOS双系统下打开基于服务器的Rstudio。
本文介绍对 R 的安装与配置,以 Windows 系统为对象进行操作,其他操作系统过程类似。本文算是一个老司机的经验之谈,初学者按照操作配置可以减少以后不必要的麻烦,对于其他读者,希望也有所启发。
打开R的菜单栏->Packages->“Install package from local zip file…”
一直以来我们学习、测试python都会提到 Pycharm,不仅好用,还支持使用 R 语言。
Rstudio Desktop for Windows/Mac 切换不同R版本非常简单,Tools→Global Options→General→Basic→R Sessions→R version→Change:
总所周知 1 【职业随想】我的电脑挂了,然后就不能使用服务器上的RStudio了 2,终端的R太丑了 3,而且不方便,就试一下radian这款编辑器 4,顺便写一下使用方法 5。
见Y叔的网络在线书籍《clusterProfiler: universal enrichment tool for functional and comparative study》的 Chapter 12 Visualization of Functional Enrichment Result , 自己简单搜索就可以直达这个在线书籍的链接:
R 语言在统计作图方面有独特优势,目前已成为许多数据科学团队最常用的语言之一。本章简要介绍 R 语言的基础知识,让读者能够开启 R 语言的学习,首先要做的是准备工作环境。
图 1 R软件下载页面 下载之后是.exe执行文件,不是zip压缩格式文件,可以直接点击安装。
但是我们常规的的教程都是基于Linux的conda的教程,比如各个用户里面安装自己的conda,每个用户独立操作,安装方法代码如下:
不使用下载速度会慢,甚至失败。如果你人在海外的话,在自己的电脑上安装,建议找一个离自己近的镜像地址。当然你也可以先试试看我们给大家推荐的这个,如果下载速度肉眼可见的非常慢,那再去找其他的镜像。
这里首推华为云:https://www.huaweicloud.com/pricing.html#/ecs
R语言和plink软件都是常用的软件,随着对软件的熟悉,就不用自己写代码了,直接改代码了,既然改代码,就在一个环境下运行就行了,不想来回切换R和Bash。问题来了:如何在R语言中运行plink软件。
第二个运行结果,为报错,需要注意,缺什么就安装缺的包。此处运行BiocManager::install('GO.db')。
作者 | Ajay Ohri 翻译 | 丁雪 校对 | ValaWong 如今,几乎所有领域或业务活动正在通过SMAC进行数据转换。SMAC指的是社交(Socia)、移动(Mobile)、分析(Analytics)和云服务(Cloud)。这个改变的影响已经涉及到包括组织、人员与产品在内的范围。在本文中,我们将通过使用云计算让你提高数据分析能力。 我们已经使用R语言和RStudio由浅入深地解释了云计算的相关概念(请参考大数据文章2015年9月21日发布的文章《如何在云计算平台使用R语言编程的快速入门指南
R语言的工作空间其实就是你当下R语言的工作环境,它包括任何你已经定义了的对象。当一个R进程结束时,用户可以将当前的工作空间保存下来,在下次启动R时就会自动加载,非常方便省事。R语言是一个交互式界面,上翻和下翻键可以用来查看历史指令。这里我建议大家使用RStudio,因为RStudio提供非常强大的R语言高度可视化操作界面,你可以在RStudio里写R代码,也可以写Python代码,同时可以使用Rmarkdown来写自己的文档。
不可以语音连线,可以打字提问。文字能梳理提问的思路,必要时还需要辅助图文并茂参考文献这样的话我们才能更好的回答学术问题
R语言是用于统计分析,图形表示和报告的编程语言和软件环境。 R语言由Ross Ihaka和Robert Gentleman在新西兰奥克兰大学创建,目前由R语言开发核心团队开发。
如果是 Windows 系统,需要按照 rstan 提供的教程给 R 安装一个编译器。其中,最为关键的一步就是先安装 Rtools 。
自从上一次服务器重装系统之后,总感觉缺少了一些东西,安装R包很多依赖库报错,也可以解决,但总是存在,烦。
编译|王婧 校对|丁一 前言 云计算正逐步成为适用于超出笔记本或台式机处理能力的问题或数据的一种自然延伸。然而,对于完全没有基础的初学者来说,学习使用云计算平台会显得比实际更难。 在本文中,我们用信息图的方式向大家介绍云计算的概念,它的重要性以及使用R语言和R studio的基本设置等几部分内容。由于本文只是一篇快速学习攻略,你可能会遗漏一些概念方面的详细解释。但是不用担心,你还可以参考另外一篇完整版攻略“如何在云端进行R语言编程?”(http://www.analyticsvidhya.com/blog/
R 语言官网:https://cran.r-project.org/,进入 R 语言官网,Downloade R for Windows。
不知不觉就第5讲了,本次视频没有干货,只是为了保证入门系列视频的完整性而录制的,没啥事就不用看了,反正你需要安装一些软件就可以了。
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