首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

Rcpp eig_sym和R的特征根不会产生相同的结果

Rcpp 是一个用于 R 语言的 C++ 扩展包,它允许用户在 R 中直接调用 C++ 代码,从而提高计算效率。eig_sym 是 RcppArmadillo 库中的一个函数,用于计算对称矩阵的特征值和特征向量。而 R 语言内置的 eigen 函数也可以计算特征值和特征向量,但它的实现可能与 RcppArmadillo 中的 eig_sym 有所不同。

基础概念

特征值和特征向量:对于一个方阵 ( A ),如果存在一个标量 ( \lambda ) 和一个非零向量 ( v ),使得 ( Av = \lambda v ),那么 ( \lambda ) 称为矩阵 ( A ) 的特征值,( v ) 称为对应于 ( \lambda ) 的特征向量。

为什么结果不同

  1. 数值稳定性:不同的算法可能在数值稳定性上有所差异。eig_sym 使用的是 ARPACK 库,这是一个专门为大规模特征值问题设计的库,它在处理对称矩阵时通常更稳定。
  2. 精度差异:C++ 和 R 在底层实现上可能使用不同的浮点运算库,这可能导致计算结果的微小差异。
  3. 算法实现:即使都是求解对称矩阵的特征值,不同的库可能会采用不同的算法,如 QR 算法、Lanczos 算法等,这些算法的收敛速度和精度可能会有所不同。

解决方法

如果你需要确保两种方法得到相同的结果,可以尝试以下步骤:

  1. 检查矩阵输入:确保输入到两个函数中的矩阵是完全相同的。
  2. 设置相同的随机种子:如果涉及到随机数生成,设置相同的随机种子可以确保结果的可重复性。
  3. 调整计算精度:在 R 中,可以通过设置 options(digits = n) 来调整浮点数的显示精度,以减少由于显示精度不同造成的视觉差异。
  4. 使用相同的算法:如果可能的话,尝试找到一个共同的算法实现,并在两个环境中使用它。

示例代码

以下是一个简单的 R 代码示例,展示了如何使用 RcppArmadillo 的 eig_sym 函数和 R 的 eigen 函数,并比较它们的结果:

代码语言:txt
复制
# 安装并加载 RcppArmadillo 包
install.packages("RcppArmadillo")
library(RcppArmadillo)

# 创建一个对称矩阵
set.seed(123)
A <- matrix(rnorm(9), nrow = 3)
A <- A %*% t(A)  # 确保 A 是对称的

# 使用 RcppArmadillo 计算特征值和特征向量
result_rcpp <- eig_sym(A)

# 使用 R 内置函数计算特征值和特征向量
result_r <- eigen(A)

# 比较特征值
all.equal(result_rcpp$values, result_r$values)

# 比较特征向量(忽略方向)
all.equal(abs(result_rcpp$vectors), abs(result_r$vectors))

请注意,由于浮点数的精度问题,特征向量可能不会完全相同,但它们的模应该是一致的。如果需要精确匹配,可以考虑对特征向量进行归一化处理。

应用场景

  • 数据分析:在统计分析中,特征值和特征向量用于主成分分析(PCA)等降维技术。
  • 机器学习:在机器学习算法中,特征值分解用于理解数据的潜在结构。
  • 物理模拟:在物理学中,特征值问题出现在振动分析、量子力学等领域。

通过以上步骤和示例代码,你应该能够理解为什么 Rcpp eig_sym 和 R 的 eigen 函数可能会产生不同的结果,并且知道如何处理这种差异。

页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

社交网络分析的 R 基础:(三)向量、矩阵与列表

)) c1 c2 c3 r1 1 2 3 r2 4 5 6 上面即创建了一个 2 行 3 列的矩阵,通过按行填充元素的方式,并且给行和列赋予了名称。...数学函数和统计函数在矩阵中的用法与在向量中的用法相同。...; } 紧接着在工作区中引入 Rcpp 包与 matrix.cpp 文件,此时就可以调用特征值计算函数 eigenValues() 和特征向量计算函数 eigenVectors()。...将其输入到 R 终端中,细心的你会发现这与矩阵计算特征值和特征向量的函数 eigen() 返回的类型一致。这种定义了名称的列表对于包含多个返回值的函数非常方便。...下面的代码展示了两个列表的合并,同时使用了未定义元素名称的列表创建方式。注意观测列表的输出结果,输出的索引表明了列表是有序的。

2.8K20
  • 【测评】提高R运行效率的若干方法

    第二招:利用函数编译提高效率 既然循环没有问题,那我猜会不会是cor.test这个函数计算花费的时间太长了。...具体方法是 先用C语言写好函数脚本,比如保存为myfunction.cpp,然后在R里面加载Rcpp包调用即可。...比如: library(Rcpp) sourceCpp(“myfunction.cpp”) system.time(outputRcpp帮助 虽然有很多同学不会C...为了单纯验证wCorr和cor.test的执行效率,我单独把两个函数拿出来只做计算用,因为这样不涉及data.frame操作所耗时间,可比性更强一点,代码如下,首先是R base里cor.test函数的运行结果...好了,通过以上的实测比较,我们了解到在R里面解决一个问题可以有很多不同的方法和策略,不同的方式结果可能结果相同但效率却千差万别,或许这就是R语言让新手容易感到困惑的地方,一旦经历一个学习曲线之后,这也是

    1.3K10

    「R」从 R 到 Rcpp

    参考图书:《Rcpp:R 与 C++ 的无缝整合》 Rcpp 的主要目的在于使得开发 R 语言的 C++ 相关拓展变得更加容易、更少出错。 我们首先从斐波那契数列问题开始探索 Rcpp。...通过 .Call() 可以在 R 和 C++ 之间传递对象。...,这里 as 将输入参数 xs 由 R 输入的 SEXP 类型转换为整型,而 wrap 将 c++ 得到的整型结果封装为 SEXP 类型,从而可以使得这个创建的函数可以被 .Call() 调用,完成 c...在写好上述两个函数后,后面的工作就是编译函数,生成所谓的“共享库”,这样 R 就可以加载和调用它。编译、链接和加载是一个纯粹的体力活,幸好,工具包 inline 可以帮助我们完成这 3 个步骤。...可以看到,通过 R 调用 c++ 简化到了仅仅添加一些必要的头文件和属性信息即可,不需要改动工作代码本身。当然,强大的 Rcpp 不仅仅如此,它还提供了诸多的与 R 交互的数据类型,后续再学习分享。

    1.1K10

    For循环与向量化(Vectorization)

    Vectorized(向量化) 根据Hadley Wickham在其著作Advanced R中第一章所涉及到的内容,R最底层的数据结构只有两种:向量(vector)和列表(list),其他所有的数据格式都是通过这两种最基本的数据结构衍化而来...关于For循环和Vectorization的深入思考 Vectorization在更多包的拓展 现在有很多的R包会对底层的一些函数进行优化,也即是对向量化的进一步优化,我们选择效率较为强大的data.table...有鉴于此,C++可作为一种比较好的替代手段。R语言提供了一个很好的C++语言的接口,Rcpp包能够比较方便调用C++的语句进行操作。...(若有对Rcpp感兴趣的同学可以戳这里进行了解) library(microbenchmark) Rcpp::cppFunction('NumericVector growthRCL(NumericVector...通过运行结果可以发现,Rcpp调用的底层循环略优于data.table的向量化,运行时间在0.03s左右。

    1.9K30

    提升R代码运算效率的11个实用方法

    众所周知,当我们利用R语言处理大型数据集时,for循环语句的运算效率非常低。有许多种方法可以提升你的代码运算效率,但或许你更想了解运算效率能得到多大的提升。...本文将介绍几种适用于大数据领域的方法,包括简单的逻辑调整设计、并行处理和Rcpp的运用,利用这些方法你可以轻松地处理1亿行以上的数据集。...1.向量化处理和预设数据库结构 循环运算前,记得预先设置好数据结构和输出变量的长度和类型,千万别在循环过程中渐进性地增加数据长度。接下来,我们将探究向量化处理是如何提高处理数据的运算速度。 ?...本部分的测试将和case(2)部分进行比较,和预想的结果一致,该方法确实提升了运算效率。 ? 4.尽可能地使用 ifelse()语句 利用ifelse()语句可以使你的代码更加简便。...5.使用 which()语句 利用which()语句来筛选数据集,我们可以达到Rcpp三分之一的运算速率。 ?

    1.7K80

    FCOS进化版PolaMask,实例分割新思路

    FCOS回顾 简单来说,FCOS是直接预测到box上下左右四条边的距离**(l,t,r,b)**进行box回归的。考虑到box内不会全部都是物体本身,因此设置box的中心点外扩一定的范围作为正样本。...如果重叠box落到相同的FPN输出层上,对应重叠的点优先选择预测小物体,因为越大的目标被正样本完全漏掉的概率越小。 ?...类似confidence map,抑制低质量检测框的产生,快速过滤负样本,降低NMS负担,提高召回率和检测性能。...Polar Centerness 和FCOS一样,本文方法也设置了center-ness,用来抑制低质量检测框的产生,快速过滤负样本,降低NMS负担,提高召回率和检测性能。...它提高了整体性能,与smooth-l 1损失相比,性能有很大提高; 可以自动平衡分类和回归分支; 实验结果 至此,本文做法介绍完毕,实验结果上还是比较优秀的。 ? ?

    69600

    混合线性模型 | 常用模型与代码演示

    昨天群里面有老师问了一个问题,lme4包报错了: 看报错,应该是Rcpp版本过低导致的,我建议老师重新安装一下lme4和Rcpp,如果还不成功,那就回到lib目录,手动删除这两个包,然后再重新安装,毕竟之前写过经验贴...:R包安装失败之粗暴解决方法,以及不用砸电脑成功安装R包的方法。...这里使用sleepstudy数据集,看一下免费的R包lme4和付费包asreml如何处理不同的混合线性模型,以加深对混合线性模型的理解。...随机斜率,相同截距 通用的混线性模型,包括固定因子和随机因子。育种中常用的混线性模型,一般是针对于随机因子关系矩阵,而其它领域的一般是针对于不同截距的定义。...R 653.70536 76.67803 8.525328 P 0.0 方差组分结果一致: 看一下两者随机因子的效应值: 结果一致。 3.

    90110

    提升R代码运算效率的11个实用方法——并行、效率

    转载于36大数据,原文作者:Selva Prabhakaran 译者:fibears 众所周知,当我们利用R语言处理大型数据集时,for循环语句的运算效率非常低。...本文将介绍几种适用于大数据领域的方法,包括简单的逻辑调整设计、并行处理和Rcpp的运用,利用这些方法你可以轻松地处理1亿行以上的数据集。...1.向量化处理和预设数据库结构 循环运算前,记得预先设置好数据结构和输出变量的长度和类型,千万别在循环过程中渐进性地增加数据长度。接下来,我们将探究向量化处理是如何提高处理数据的运算速度。 ?...本部分的测试将和case(2)部分进行比较,和预想的结果一致,该方法确实提升了运算效率。 ? 4.尽可能地使用 ifelse()语句 利用ifelse()语句可以使你的代码更加简便。...5.使用 which()语句 利用which()语句来筛选数据集,我们可以达到Rcpp三分之一的运算速率。 ?

    1.1K50

    数据科学家:那些年,我都学过哪些编程语言…

    这些都与我在C ++,Java或Python中遇到的面向对象编程并不相同。 R语言还提供了许多方便的工具,例如data.frames,它能够轻松捕获数据集的特征和需求。...虽然我再也不会尝试用R语言中从头开始构建框架,但R语言提供的大量软件包可以助你进行可视化和预处理,这些都是很不错的优势。 C ++ 现在你肯定会问,为什么要用C ++进行数据分析?为什么有人这样做?...由于有各种图表和出众的预处理技术,R语言也引起了公司里用C ++做数据分析的人的注意,一些同事甚至对R感兴趣并开始尝试它。...在获得满意的结果后,通过使用简单的R包用于PCA和支持向量机,我尝试将模型合并到庞大的C ++框架中。libsvm 软件包很适合这种情况,并能提供与支持向量机相关的操作。...最合适的方式是使用rcpp,一个能连接C ++框架和R脚本的包。一些软件包也支持两种不同语的库之间的兼容性,但很少用于这种情况。

    81820

    ICLR 2021 | 美团AutoML论文:鲁棒的神经网络架构搜索 DARTS-

    R-DARTS 发现这个过程和 Hessian 特征根关系密切 (Figure 5b)。...因此可认为,Hessian 特征根变化幅度过大时优化应该停止,或者通过正则化手段来避免 Hessian 特征根产生大幅变化。...image.png Smooth DARTS (简作 SDARTS)遵循了 R-DARTS 的判断依据,采取基于扰动的正则化方法,对 Hessian 特征根进行了隐式的约束。...分析和验证 Hessian 特征根变化趋势 在 R-DARTS 以及 DARTS 采用的多个搜索空间下,DARTS- 发现了子网性能增长(Figure 4b)但 Hessian 特征根变化幅度过大(Figure...我们同时对 R-DARTS 所依赖的特征根进行深入分析,发现了其作为性能崩塌标志会出现反例的情形。未来 DARTS- 作为高效、鲁棒且通用的搜索方法,期望在其他领域任务和落地中得到更多的拓展和应用。

    68910

    R语言︱文本挖掘——jiabaR包与分词向量化的simhash算法(与word2vec简单比较)

    ,推荐结巴分词包,小巧玲珑,没有那么多幺蛾子,而且R版本和python版本都有,除了词性标注等分词包必备功能以外,jiebaR还加入了一些基础的文本分析算法,比如提取关键字(TFIDF)、分析文本相似性等等...项目使用了Rcpp和CppJieba进行开发。目前托管在GitHub上。 来自:http://cos.name/tag/jiebar/ ?..., 而`jieba`分词包不会去掉任何符号,而且返回的结果里面也会有符号。...为了便于理解尽量不使用数学公式,分为这几步: 1、分词,把需要判断文本分词形成这个文章的特征单词。最后形成去掉噪音词的单词序列并为每个词加上权重,我们假设权重分为5个级别(1~5)。...STOPPATH 路径将不会被使用,不默认使用停止词库。

    2.1K30

    业界 | 四大机器学习编程语言对比:R、Python、MATLAB、Octave

    、xts) 社区最大 使用 rcpp 可以整合 R 和 C++/C 缺点: 比 Python 慢,尤其是在迭代循环和非向量化函数中 比 Matlab 绘图差,难以实现交互式图表 创建独立应用程序的能力有限...可连接 R、C++ 和其他语言的「胶水」语言 总体速度最快,尤其是在迭代循环中 缺点: 有一些不成熟的包,尤其是交易包 有些包与其他包不兼容或包含重叠 在金融领域的社区比 R 小 与 R 或 Matlab...Octave 由工程师设计,因此预装了工程师常用的程序,其中很多时间序列分析程序、统计程序、文件命令和绘图命令与 MATLAB 语言相同。...优点: 首先,目前没有可用的鲁棒性 Octave 编译器,且没有必要有,因为该软件可以免费安装。 Octave 和 Matlab 的语言元素相同,除了一些个例,如嵌套函数。...Matlab 最新版本包括 GUI 设计器,包含大量很棒的可视化特征。

    3.3K20

    实例分割最新最全面综述:从Mask R-CNN到BlendMask

    Mask R-CNN算法的主要步骤为: 首先,将输入图片送入到特征提取网络得到特征图。...YOLACT将问题分解为两个并行的部分,利用 fc层(擅长产生语义向量)和 conv层(擅长产生空间相干掩模)来分别产生“掩模系数”和“原型掩模” 。...首先,输入一张原图,经过网络可以得到中心点的位置和n(n=36 is best in our setting)根射线的距离,其次,根据角度和长度计算出轮廓上的这些点的坐标,从0°开始连接这些点,最后把联通区域内的区域当做实例分割的结果...在相同分辨率的条件下,减少了十倍的计算量; mask质量更高:BlendMask属于密集像素预测的方法,输出的分辨率不会受到 top-level 采样的限制。...在Mask R-CNN中,如果要得到更准确的mask特征,就必须增加RoIPooler的分辨率,这样变回成倍增加head的计算时间和head的网络深度; 推理时间稳定:Mask R-CNN的推理时间随着检测的

    11.3K62
    领券