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RNAseq纯生信挖掘思路分享?不,主要是送你代码!(建议收藏)

一 目的基因初 首先需要根据研究目的进行初步分析,比如入组样本有哪些?分析基因是什么? 然后确定是通过分组计算DEGs 还是 找hub gene 来完成完成基因。...GO富集柱形图 4,Hub基因 使用WGCNA方法获得和目标性状(分期,免疫,预后)等相关hub基因作为初结果。...ggrisk|高效绘制风险因子联动图 5 外部数据验证 涉及到模型构建,无疑需要外部验证,来源可以是GEO 或者 是其他文献数据。...文件)之间各种连接 Tidyverse|数据分分合合,一分合一 盘一盘Tidyverse| 只要你要只要我有-filter 筛选行 盘一盘Tidyverse| 行选之select,玩转列操作...R-rbind.fill|数不一致多个数据“智能”合并,Get!

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选Pandas还是选SQL

又是新一周,今天小编打算来讲一下Pandas和SQL之间语法差异,相信对于不少数据分析师而言,无论是Pandas模块还是SQL,都是日常学习工作当中用非常工具,当然我们也可以在Pandas模块当中来调用...SQL语句,通过调用read_sql()方法 建立数据库 首先我们通过SQL语句在新建一个数据库,基本语法相信大家肯定都清楚, CREATE TABLE 名 ( 字段名称 数据类型 ... )...= pd.read_sql("SELECT * FROM sweets_types;", connector) output 数据查 简单条件筛选 接下来我们来做一些数据查,例如筛选出甜品当中重量等于...300甜品名称,在Pandas模块代码是这个样子 # 转换数据类型 df_sweets['weight'] = pd.to_numeric(df_sweets['weight']) # 输出结果...,在Pandas模块当中,我们可以调用merge()方法,例如我们将df_sweets数据和df_sweets_types两数据进行合并,其中df_sweets当中sweets_types_id是该外键

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Oracle数据库学习

投影查询 ---- 使用SELECT * FROM WHERE 可以选出若干条记录。我们注意到返回二维结构和原是相同,即结果所有与原所有都一一对应。...例如,从students返回id、score和name这三: SELECT id, score, name FROM students; 这样返回结果就只包含了我们指定,并且,结果顺序和原可以不一样...SELECT语句可以对结果进行重命名。 排序 ---- 排序 我们使用SELECT查询时,细心读者可能注意到,查询结果通常是按照id排序,也就是根据主键排序。这也是大部分数据库做法。...小结 使用ORDER BY可以对结果进行排序; 可以对进行升序、倒序排序。...连接查询对多个进行JOIN运算,简单地说,就是先确定一个主表作为结果,然后,把其他行有选择性地“连接”在主表结果上。

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TCB系列学习文章——云开发云数据库篇(五)

一个数据库可以有多个集合(相当于关系型数据),集合可看做一个 JSON 数组,数组每个对象就是一条记录(或称为文档),记录格式是 JSON 对象。...('test').add(data)//对test数据新增数据data 2、小程序端或者小程序端云函数(wx-server-sdk) let data = {name:'name',age:18}...where条件筛选 age:_.gt(18)//筛选集合中年龄大于18所有数据对象 }).remove()//删除筛选出所有结果 改(修改行数据) 1、局部修改(修改数据对象中一部分列) db.collection...所有数据对象 ).set({//对筛选出数据进行更新操作 age: 16//将年龄修改为16 }) //同样,小程序端和小程序端云函数,请包一层data db.collection(...foreignField: 'b',//连接test2b字段 as: 'test2List'//关联到test2集合 }) //查询结果结构大概是这样 [ { ...

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MySQL自治平台建设内核原理及实践(下)

这个算法挑战在于如何为workload每个查询Q确定最佳索引呢?其实针对单个查询来确定最佳索引这个问题与根据整体基于workload来选择最佳索引这个问题,两者没有本质不同。...5)Multi-column Index Generation组件 索引选择有一个比较大挑战,就是候选索引实在太多,比如对于给定一组k,最多可能有k!...那么,具体是如何在单列基础上选择其他组成索引呢?这里有多种算法,先使用符号M (a, b) 来表示a和b上双列索引,其中a是双列索引前导。...,这种条件比较苛刻,业界相关测试表明效果明确不如MC_LEAD跟MC_BASIC,虽然索引搜索空间明显减少,提升了总体性能; MC_BASIC:则是把单列跟索引混在一个迭代周期里建立,而不是先根据单列建议一个索引...4.4.2 产品展示 根据审核规则,展示审核结果与建议,包括风险提示跟SQL索引优化建议等内容,审核规则包括是否全扫描、扫描行数过多等内容。

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算法工程师-SQL进阶:集合之间较量

一、概念篇 所谓集合运算,就是对满足同一规则记录进行加减等四则运算。通过集合运算,可以得到两张记录集合或者公共记录集合,又或者其中某张记录集合。...并集运算可以用UNION实现,比如求两个: SELECT * FROM table_a UNION SELECT * FROM table_b; UNION运算会将两个集合结果进行排序并去重,...用集合运算符时注意事项: 作为运算对象记录数必须相同; 作为运算对象记录类型必须一致; 注:这些注意事项不仅限于 UNION,之后将要学习所有集合运算符都要遵守这些注意事项。...a和集合b元素后,其他所有元素集合。...这种方法通用且灵活,可以在实际尝试使用并根据具体情景加以扩展。 三、总结 本节,我们学习了SQL中集合运算使用方法。

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又快又准sql瓶颈诊断方法

4.mysql根据优化器生成执行计划,调用存储引擎API来执行查询。 5.将结果返回给客户端。...MySQL在解析SQL语句时,会生成套执行方案,然后内部会进行一个成本计算,然后通过优化器选择一个最优方案执行,然后根据这个方案会生成一个执行计划。...开发者通过查看SQL语句执行计划,可以直观了解到MySQL是如何解析执行这条SQL语句,然后再针对性进行优化。 如何查看SQL语句执行计划?...Using temporary :看到这个时候,查询需要优化了。这里,mysql需要创建一个临时来存储结果,这通常发生在对不同进行ORDER BY上,而不是GROUP BY上。...,为什么我说那个未添加索引extra显示了using index呢,这是我之前留一个破绽,接下来我们引出另外一个概念索引最左前缀规则; 索引通俗来讲就是一个索引可以定义在多个列上,

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Mysql优化-索引

: 字段 含义 id id数字越大越先执行,如果说数字一样大,那么就从上往下依次执行,id列为null是这是一个结果,不需要使用它来进行查询。...如果是尖括号括起来,与类似,也是一个临时,表示这个结果来自于union查询id为M,N结果。...其他数据库也叫做唯一索引扫描 eq_ref 出现在要连接过个查询计划,驱动只返回一行数据,且这行数据是第二个主键或者唯一索引,且必须为not null,唯一索引和主键是时,只有所有的都用作比较时才会出现...创建一个临时来存储结果,这通常发生在对不同进行ORDER BY上,而不是GROUP BY上。...查询条件中分为限制条件和检查条件,5.6之前,存储引擎只能根据限制条件扫描数据并返回,然后server根据检查条件进行过滤再返回真正符合查询数据。

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带您理解SQLSERVER是如何执行一个查询

,包括: the CLR managed SqlClient OleDB ODBC JDBC PHP Driver for SQL Server 开源 FreeTDS 实现 当你应用程序命令数据库如何去做时候会通过...JVM bytecode 不过,这里会产生用于访问数据执行计划(query plans),这些执行计划描述了如何去访问和索引, 如何去搜索和定位表里面的行数据,如何根据SQL批处理里SQL语句去做数据操作...考虑一下,如果你有一个简单涉及到两个join查询,每个都有额外索引, 这里就有4种可选执行方案,去访问数据 因为有这麽可选方案,查询复杂度已经比较高了,如果这时候索引继续增多的话...里查询就会显示ASYNC_NETWORK_IO类型等待 有趣是,OUTPUT参数返回,OUTPUT参数值会被插入到返回给客户端结果网络数据流。...执行计划知道那些未完成运算符需要多少内存 根据运算符类型,预估行记录,运算符必须要处理统计信息提供给他字段大小。 那些在执行计划里运算符所需要内存我们通常称为内存赋予。

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【干货原创】Pandas&SQL语法归纳总结,真的太全了

对于数据分析师而言,Pandas与SQL可能是大家用比较多两个工具,两者都可以对数据进行深度分析,挖掘出有价值信息,但是二者语法有着诸多不同,今天小编就来总结归纳一下Pandas与SQL这两者之间在语法上到底有哪些不同...当中,我们用SELECT来查找数据,WHERE来过滤数据,DISTINCT来去重,LIMIT来限制输出结果数量, 输出数据 ## SQL select * from airports ## Pandas...airports 输出数据前三行数据,代码如下 ## SQL select * from airports limit 3 ## Pandas airports.head(3) 对数据进行过滤查...对于筛选出数据进行去重 ## SQL select distinct type from airport ## Pandas airports.type.unique() 多个条件交集来筛选数据...调用统计函数 对于给定数据,如下图所示 runways.head() output 我们调用min()、max()、mean()以及median()函数作用于length_ft这一上面,代码如下

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两万字图文 SQL 零基础入门,不怕你学不会,就怕你不收藏!❤️

Server、Oracle、Sybase 以及其他数据库系统。...SELECT – 查询数据 SELECT 语句用于从中选取数据,结果被存储在一个结果(称为结果)。...ORDER BY – 排序 ORDER BY 语句用于根据指定结果进行排序,默认按照升序对记录进行排序,如果您希望按照降序对记录进行排序,可以使用 DESC 关键字。...VIEW – 视图 在 SQL ,视图是基于 SQL 语句结果可视化。 视图包含行和,就像一个真实。视图中字段就是来自一个或多个数据库真实字段。...GROUP BY – 分组 GROUP BY 语句用于结合合计函数,根据一个或多个结果进行分组。

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PostgreSQL基础知识整理

语法如下: -- 现有添加一个新 ALTER TABLE table ADD column datatype; -- 现有删除一个新 ALTER TABLE table DROP COLUMN...VALUES子句或查询值都与显式或隐式列表从左到右。 如果要添加所有值,可能不需要在SQL查询中指定(次)名称。但要确保是在相同顺序顺序。...condition] EXCEPT [EXCEPT ALL] SELECT column1 [, column2 ] FROM table1 [, table2 ] [WHERE condition] 注:在其他数据库求差关键字是...子查询只能有一个在SELECT子句中,除非在主查询查询来比较其选定。 ORDER BY不能使用在子查询,虽然主查询就可以使用ORDER BY。...EXISTS内部有一个子查询语句(SELECT … FROM…),我将其称为EXIST内查询语句。其内查询语句返回一个结果。EXISTS子句根据其内查询语句结果空或者非空,返回一个布尔值。

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想学数据分析但不会Python,过来看看SQL吧(下)~

,就返回数据,结果是两。...自链接 自链接经常用于对子查询简化,如下示例: 假如要获取与Allen同一公司所有顾客信息,那就需要你先筛选出Allen所在公司,然后再根据该公司筛选出所有的顾客。...使用UNION场合情况: 在一个查询从不同返回结果; 对一个执行多个查询返回结果。 示例: 如下三个语句结果是一致。...),ELSE(其他不符合条件一结果),END语句设立了两个条件,即当standard_qty为0或者不存在时我们返回0,当standard_qty不为0时进行计算,并储存为新unit_price。...缺失值处理 之前有提到过如何选出缺失值,即使用WHERE加上IS NULL或者IS NOT NULL。 那么如何对缺失值进行处理呢?

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想学数据分析但不会Python,过来看看SQL吧(上)~

与select甚至是SeLect效果是相同,但是要对命令和变量进行区分,所以默认命令需要大写,其他内容如变量等则需要小写; 和变量名不要出现空格,可使用下划线_替代; 查询语句中,使用单一空格隔开命令和变量...SELECT col_name FROM table_name; 检索 从table_name检索col_1,col_2和col_3。...其可以根据指定单列或结果进行排序; 默认按照升序进行排序(从小到大,从a到z),使用DESC关键字可以改为降序; 在使用ORDER BY时,请确保它是SELECT语句中最后一条子句。...使用示例: 在table_1col_1选出满足条件col_1 运算符 value值。...ORDER BY ORDER BY Col 根据Col对查询结果排序(顺序),可与 DESC 一起使用实现逆序。

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记一次字符串末尾空白丢失排查 → MySQL 是会玩

他补充道:会不会是 MyBatis-Plus 做了什么骚操作,把 test  末尾空格给拿掉了   我:你直接把 SQL 语句到 MySQL 执行下试试   结果如下:   这看起来不够直观,我移动下光标...,会根据字符序来比较和排序     2、所有 MySQL 排序规则类型都是 PAD SPACE 。...2 所说规则 划重点,记笔记:在 MySQL5.7 及以下( <=5.7 )版本,排序规则都是 PAD SPACE ,末尾空格会忽略不考虑   那如何让末尾空格参与比较了,有三种处理方式   ... 、 TEXT ),字符序 pad 参数决定如何去处理字符串末尾空格 NO PAD 不会忽略末尾空格,会将其当做其他字符一样对待 PAD SPACE 会忽略末尾空格, LIKE 除外 SQL mode...PAD ,也就是不会忽略字符串末尾空格   所以在 MySQL8 , SELECT 'test' = 'test '; 默认情况下得到结果是 0 总结   1、非二进制字符串( CHAR 、 VARCHAR

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Navicat Premium 技巧介绍 + MySQL性能分析

3、MySQL性能分析及explain使用  用explain语句去查看分析结果:EXPLAIN关键字一般放在SELECT查询语句前面,用于描述MySQL如何执行查询操作、以及MySQL成功返回结果需要执行行数...其他数据库也叫做唯一索引扫描 C:eq_ref:出现在要连接过个查询计划,驱动只返回一行数据,且这行数据是第二个主键或者唯一索引,且必须为not null,唯一索引和主键是时,只有所有的都用作比较时才会出现...或者主键、唯一索引,使用第一个之外列作为等值查找也会出现,总之,返回数据不唯一等值查找就可能出现。...查询条件中分为限制条件和检查条件,5.6之前,存储引擎只能根据限制条件扫描数据并返回,然后server根据检查条件进行过滤再返回真正符合查询数据。...EXPLAIN关键字一般放在SELECT查询语句前面,用于描述MySQL如何执行查询操作、以及MySQL成功返回结果需要执行行数。

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这是我见过最有用Mysql面试题,面试了无数公司总结(内附答案)

它确保索引键值是唯一。 2.聚集索引:聚集索引对表物理顺序进行重新排序,并根据键值进行搜索。每个只有一个聚集索引。...存储过程是已创建并存储在数据库以执行特定任务SQL语句集合。 该存储过程接受输入参数并对其进行处理,并返回单个值, 例如数字或文本值或结果(行)。 55.什么是扳机?...在SQL Server,数据库每一都有一个名称和一种数据类型。 在创建SQL时,我们需要决定在每一存储哪种数据类型。 57.可以在BOOLEAN数据字段存储哪些可能值?...SQL聚合函数是什么? SQL聚合函数返回单个值,该值是根据值计算得出。...如果未与交叉联接一起使用WHERE子句,则交叉联接将产生一个结果结果是第一个行数乘以第二个行数。 这种结果称为笛卡尔积。

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SQL基础查询方法

SELECT 语句从 SQL Server 检索出数据,然后以一个或多个结果形式将其返回给用户。结果是对来自 SELECT 语句数据表格排列。与 SQL 表相同,结果由行和组成。...GROUP BY group_by_list GROUP BY 子句根据 group_by_list 值将结果分成组。...这使结果集中得以包含基不存在,但是根据存储值计算得到值。这些结果被称为派生。 表达式可以包含 $ROWGUID 关键字。它解析为对表具有 ROWGUIDCOL 属性引用。...Transact-SQL 具有扩展功能,支持在 FROM 子句中指定除或视图之外其他对象。这些对象返回结果,也就是 OLE DB 术语中所说,该结果构成了虚拟。...从 SQL Server 2005 开始,SQL Server 允许在 FROM 子句中指定对 SELECT 列表未指定进行排序。

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【MySQL】MySQL数据库进阶使用

如果select后面有,则会进行字段去重处理,也就是当字段同时重复时,才会去重。如果只有一,那就只针对该进行去重。 4....count函数除外,count括号内字段可以是数字,字段名,通配符等等,因为count只负责统计记录(一行数据成为记录)个数,所以count比较特殊,其他四个聚合函数括号内字段只能是值为数字字段名...,最后在select显示筛选后聚合结果字段以及其他字段。...通过嵌入到其他sql语句中select语句返回结果,子查询又可以细分为单行子查询,多行子查询,列子查询,子查询除了可以用在where子句充当筛选条件外,还可以用在from子句充当临时,作笛卡尔积...union:该操作符用于取得两个结果。当使用该操作符时,会自动去掉结果集中重复行。

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