SimpleITK读取io.ByteIO
SimpleITK是一个用于医学图像处理的开源库，它提供了一种简单且高效的方式来读取、处理和分析医学图像数据。它是ITK（Insight Segmentation and Registration Toolkit）的一个简化接口，旨在使医学图像处理更加易于使用。
io.ByteIO是SimpleITK中的一个类，用于从内存中读取和写入二进制数据。它可以将二进制数据加载到内存中，并将其解析为SimpleITK图像对象，或者将SimpleITK图像对象保存为二进制数据。
使用SimpleITK的io.ByteIO，可以实现以下功能：
- 从内存中读取二进制数据并解析为SimpleITK图像对象。
- 将SimpleITK图像对象保存为二进制数据，并存储在内存中。
io.ByteIO的优势：
- 灵活性：io.ByteIO允许从内存中读取和写入二进制数据，而不需要将数据存储在磁盘上。这种灵活性使得处理大量医学图像数据更加高效。
- 高效性：由于数据存储在内存中，io.ByteIO可以快速读取和写入数据，减少了磁盘IO的开销。
- 简化接口：io.ByteIO是SimpleITK库的一部分，提供了简化的接口来处理二进制数据。它使得读取和写入医学图像数据变得更加容易。
应用场景：
- 医学图像处理：io.ByteIO可以用于读取和写入医学图像数据，方便进行各种图像处理操作，如分割、配准、重建等。
- 科学研究：io.ByteIO可以用于处理科学研究中的图像数据，如地质图像、天文图像等。
- 计算机视觉：io.ByteIO可以用于处理计算机视觉领域的图像数据，如图像分类、目标检测等。
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- 腾讯云对象存储（COS）：用于存储和管理医学图像数据的云存储服务。链接地址：https://cloud.tencent.com/product/cos
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以上是对SimpleITK读取io.ByteIO的完善且全面的答案。
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我在这里再次提出另一个关于python中的SimpleITK的问题。我想绘制一个.mhd图像，但是我不知道怎么做。我正在尝试这里描述的函数
load_itk('/home/bianca/Documents/PythonProcessing/result-Edep.mhd')
但它并没有读取图像：
RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK ReadImage: /tmp/SimpleITK-build/ITK/Modules/IO/Meta/src/itkMetaImageIO.cxx:483:
itk::ERROR: MetaIma
浏览 100提问于2017-07-25得票数 2
我有一个代表上传图片(.nii)的io.ByteIO对象，有没有办法从它获取simpleITK对象？一种糟糕的解决方法是先写入文件，然后使用simpleITK读取它
浏览 30提问于2020-06-25得票数 1
回答已采纳
如何使用适用于C#的SimpleITK读取原始文件？
我在Windows (64位)上使用SimpleITK C# 0.5.1版
我的代码是：
String fileName = @"d:\Temp\MRI\t1_icbm_normal_1mm_pn3_rf20.rawb";
ImageFileReader reader = new ImageFileReader();
reader.SetFileName(fileName);
Image image = reader.Execute();
例如，它适用于.png或分析图像，但不适用于原始图像。
我得到以下错误：
System
浏览 9提问于2012-10-27得票数 1
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我想将.mnc文件从BrainWeb (https://brainweb.bic.mni.mcgill.ca/brainweb/anatomic_normal_20.html)转换为.mha文件格式，以便在TumorSim (https://www.nitrc.org/projects/tumorsim/)中使用。 我尝试使用nibabel和mnc2nii将文件从.mnc转换为.nii，然后将.nii文件转换为.mha格式。 然而，这一过程会导致文件大小急剧增加(根据输出体素格式，从56.9MB .mha增加到56.9~227.5 MB .nii ) 在此基础上，将.nii文件转换为.mha
浏览 137提问于2019-10-14得票数 0
回答已采纳
我想在Python中处理*.mha文件。但是它需要依赖于ITK包的MedPy包。我目前在安装ITK包时遇到问题。我在想是否有一种方法可以将*.mha文件转换为*.nii文件(使用其他方法，可能是C++)，因为这样我就可以使用Python读取*.nii文件。任何相关的指针都是受欢迎的。
浏览 10提问于2015-04-20得票数 4
我正在尝试使用SimpleITK 0.5.1 C#版本加载MINC 2.0镜像
我得到以下错误：
System.ApplicationException : Exception thrown in SimpleITK ImageFileReader_Execute: ..\..\..\..\..\ITK\Modules\IO\HDF5\src\itkHDF5ImageIO.cxx:883:
itk::ERROR: HDF5ImageIO(000000001DBE7AE0): H5Dopen2 failed
我的代码如下：
String fileName = @"d:\Temp\MRI\
浏览 1提问于2012-10-28得票数 0
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我知道SimpleITK可以读取Nifty (.nii)格式的3d图像，而且它还支持nii.gz压缩版本。但是，我无法加载nii.zip文件。如果我试图直接解压缩/解压缩，这些文件会抛出错误，而且也不会被SimpleITK识别为可读的格式之一。
参考数据集可在：中找到
浏览 1提问于2019-08-27得票数 1
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1回答
对于在SimpleITK程序中使用C++的任何人来说，这都是一个问题。
我下载了SimpleITK代码，并按照SimpleITK指令(Superbuild)使用CMake生成了VS2008 .sln文件。
在SimpleITK-build\lib\Debug中，我得到了一些SimpleITK库，例如：SimpleITKCommon-0.8.lib。在SimpleITK-build\ITK-build\lib\Debug中，我得到了许多ITK库，例如：ITKCommon-4.5.lib
在代码中，我使用：#include "SimpleITK.h"
问:我要链接到什么？
我可以一
浏览 2提问于2014-09-18得票数 0
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我有如下代码，它给了我一个SimpleITK错误
"ERROR: The file in the series have unsupported 3 dimensions."
打印路径结果为
['C:/DataLuna16pred\\subset0\\1.3.6.1.4.1.14519.5.2.1.6279.6001.100225287222365663678666836860.mhd'];
如何正确使用它？
import os
import pandas as pd
import glob
import SimpleITK as sitk
import num
浏览 9提问于2018-01-10得票数 0
1回答
我是python编程的新手，当然也是simpleITK的新手。我正在试着组合一个分割过滤器，可以从3D图像中分割出肝脏。因为我对编程还很陌生，所以我不知道从哪里开始。我看过simpleITK笔记本，它们对一些过滤器进行了分割，但总的来说，我相当困惑，主要是，如果我想使用多个过滤器，是否所有内容都放在一个.py文件中……？我希望有人能引导我走向一个起点，或者告诉我一个我可以通读的教程，以弄清楚该怎么做。
谢谢!
浏览 2提问于2016-04-11得票数 0
我已经成功地安装了SimpleITK并使用ctest进行了测试。然后，我将该库作为export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:~/softwares/vtk-itk/SimpleITK-build/lib包含在.bashrc中。为了进行安装，我在~/softwares/vtk-itk/SimpleITK-build/SimpleITK-build中运行了make install，并成功安装了它。但是，当我尝试包含#include <SimpleITK.h>时，似乎确实知道安装路径。 ? 我正在尝试在Clion IDE中编写代码，即使它没
浏览 26提问于2019-08-22得票数 0
多亏了SimpleITK in Python，我已经开始与SimpleITK合作一周了。尽管目前我对SimpleITK很满意，但我注意到Powell optimization scheme或OnePlusEvolutionary one这样的特性在SimpleITK中是不可用的。以地标为基础的注册方法似乎也是如此。
因此，我想知道是否有一种方法可以检索ITK (在C++中)在SimpleITK中可用的所有功能，还是有必要执行自己的包装？
如果不是，我以后将学习C++这样做！
谢谢!
浏览 6提问于2015-07-08得票数 2
回答已采纳
我正在使用Python3.7.7。
我正在尝试使用SimplyITK和Numpy从BraTS 2019年数据集加载大量的NIFTI图像。
这是我用来将图像加载到numpy数组中的代码。
import SimpleITK as sitk
def read_nifti_images(images_full_path):
"""
Read nifti files from a gziped file.
Read nifti files from a gziped file using SimpleITK library.
Pa
浏览 0提问于2020-08-11得票数 2
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在Python或任何其他语言中是否有一种方法可以将. .raw/mhd图像数据转换为Nifti/nii？
我可以通过SimpleITK在python中加载. .raw/mhd文件，如下文所示：
import skimage.io as io
img = io.imread('file.mhd', plugin='simpleitk')
我很难出口有合适尺寸的nii .在理想情况下使用原始mhd文件中的头信息..。
谢谢
浏览 0提问于2019-01-19得票数 0
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这不是副本，请花几秒钟阅读我的问题，我会很高兴的。
我目前使用的是的RegistrationMethodClass。由于固定图像中有许多噪声(然后可以在度量中选择比较点，从固定图像中选择点)，我想尝试以另一种方式注册，使用干净的蒙版图像作为固定图像，然后使用transform类中的方法将返回的变换的逆变换应用到这个非常相同的蒙版上。
有点像：
Resample(
img_mv, img,
Reg.Execute(img, img_mv).GetInverseTransform(), Linear, 0.0, img.GetPixelIDValue()
)
然而，当我遇到这一行时
浏览 1提问于2017-08-07得票数 0
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我知道如何在C++中实现itk图像和SimpleITK图像之间的转换，这是SimpleITK (Examples/ITKIntegration.cxx)中的一个示例。
//
// Extract the itk image from the SimpleITK image
//
InternalImageType::Pointer itkImage =
dynamic_cast <InternalImageType*>( image.GetITKBase() );
...
//
// Return to the simpleITK setting
浏览 2提问于2014-01-27得票数 3
语言:爪哇
paltform:eclipse
套餐: simpleITK 0.9.0
我想创建一个窗口来显示dicom图像，所以我使用函数：
SimpleITK.show(image);
但是，结果是：
Exception thrown in SimpleITK show: ..\..\..\..\..\SimpleITK\Code\IO\src\sitkShow.cxx:463:
sitk::ERROR: Error in administrating child process: [参数错误]
中文的意思是参数错误
我可以得到图像的大小和病人的名字，但我不能显示图像。我的代码有什么问题吗？
浏览 1提问于2016-04-27得票数 1
1回答
我是ITK的新手。我写了一个小程序，用sitk读取图像，用imageJ显示图像。
import os
import SimpleITK as sitk
pathDicom = 'C://Users//clouds.png'
input = sitk.ReadImage(pathDicom)
sitk.Show( input , debugOn=True)
要将simpleITK链接到imageJ，我设置了环境变量。但是对于sitk.Show()，我得到了以下错误：
return _SimpleITK.Show(*args, **kwargs)
RuntimeError: Ex
浏览 3提问于2018-10-06得票数 1
2回答
我已经把CT扫描加载到SimpleITK了。我想做一些在NumPy中非常简单的事情，但还没有想好如何在SimpleITK中做到这一点。为了提高速度，我想用SimpleITK来完成它们。
# NumPy: Changes all values of 100 to now become 500
nparr = nparr[nparr == 100] = 500
# SimpleITK:
???
SimpleITK image==100将生成相同尺寸的二进制图像，其中所有intensities==100都为1/True。这是我们想要的。但不幸的是，我不相信SimpleITK支持布尔索引。实现这一目
浏览 25提问于2017-03-07得票数 1
回答已采纳
我需要在我的Python代码中使用一个库，我在Google上运行它。MyOS Windows 10
我安装了那个软件包
!pip install SimpleITK==1.1.0
但是，它仍然显示了错误：
AttributeError:模块“SimpleITK”没有属性“ElastixImageFilter”
有解决这个问题的指南吗？
浏览 17提问于2022-02-20得票数 1
我想从源代码构建SimpleITK，并为Python3.4安装它(在Ubuntu14.04上)。
我跟踪了。
git clone http://itk.org/SimpleITK.git
mkdir SimpleITK-build
cd SimpleITK-build
cmake ../SimpleITK/SuperBuild
而且效果很好。我能够使用SimpleITK为Python2.7安装sudo python setup.py install。然后，我尝试使用sudo python3.4 setup.py install为Python3.4安装它，尽管它的安装似乎是正确的，但是当我试图在
浏览 11提问于2014-06-14得票数 3
回答已采纳
1回答
在SimpleITK中向索引数组分配值或切片的最佳方法是什么？
示例(1)：在3D卷中将2D片分配给索引的2D片
在NumPy中，我们可以对索引数组执行以下赋值：
import numpy as np
nda = np.ones((64, 256,256))
nda[0,:,:] = 2*nda[0,:,:]
在SimpleITK中同样的操作，
import SimpleITK as sitk
image = sitk.GetImageFromArray(nda)
image[:,:,0] = 2*image[:,:,0]
给出以下错误：
IndexError
浏览 3提问于2020-04-22得票数 1
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我正在使用macOS sera10.12.6，试图安装SimpleITK的SimpleElastix扩展。我一直在遵循的指示。当我使用Python2.7时，我发现这个扩展似乎只包含在SimpleITK中，但当我使用Python3.6时，就不是这样了
import SimpleITK as sitk
resultImage = sitk.Elastix(sitk.ReadImage("fixedImage.nii"), sitk.ReadImage("movingImage.nii"))
我得到了错误
AttributeError: module 'Sim
浏览 4提问于2017-11-14得票数 2
为了运行代码，我正在使用PyCharm最新版本的Windows764位与16 on的内存和... Python version: 3.7.7 (default, May 6 2020, 11:45:54) [MSC v.1916 64 bit (AMD64)] 我正在尝试从BraTS 2019 dataset中使用SimplyITK和Numpy加载大量的NIFTI图像。 这是我用来将图像加载到numpy数组中的代码。 import SimpleITK as sitk
def read_nifti_images(images_full_path):
"""
浏览 27提问于2020-08-11得票数 0
我的Python代码是：
import SimpleITK as sitk
resultImage = sitk.Elastix(sitk.ReadImage("fixedImage.nii"), \
sitk.ReadImage("movingImage.nii"), \
"translation")
sitk.Show(resultImage, 'test', debugOn=True)
我知道这个错误：
回溯(最近一次调用)：
文件
浏览 6提问于2017-10-09得票数 1
我正在尝试用imshow显示一个图像，它是用simpleItk读取的。镜像详情如下： size = fusedImage.GetSize()
(120, 120, 155)
type(fusedImage)
SimpleITK.SimpleITK.Image
im = fusedImage[:,:,76]
im.GetSize()
(120,120)
plt.imshow(im) 但是我得到了以下错误：TypeError: Invalid shape (14400,) for image data 有人能告诉我我哪里做错了吗？
浏览 84提问于2021-08-24得票数 0
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1回答
如果我想在numpy中用2D切片逐平面乘一个3D体积平面，我可以使用广播： import numpy as np
vol = np.random.rand(10, 20, 30)
slc = np.random.rand(10, 30)
new_vol = vol * slc[:, None] 如果我在SimpleITK中尝试类似的操作，我会得到一个错误 import SimpleITK as sitk
vol_img = sitk.GetImageFromArray(vol)
slc_img = sitk.GetImageFromArray(slc[:, None])
new_vol_im
浏览 39提问于2019-02-06得票数 0
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我正在处理一组DICOM文件，其中一些包含图像信息，而另一些则没有。 file_reader = sitk.ImageFileReader()
file_reader.SetFileName(fileName)
file_reader.ReadImageInformation() 但是，如果文件没有图像信息，我会得到以下错误。 Traceback (most recent call last):
File "<ipython-input-61-d187aed107ed>", line 5, in <module>
file_reader.
浏览 378提问于2020-06-12得票数 1
回答已采纳
我目前正在开发一个医学图像跟踪系统，它需要使用SimpleElastix版本的SimpleITK (修改的SimpleITK 2.0.0)中提供的注册功能，但是，我也只需要在SimpleITK 2.2.0中使用一些功能。
SimpleElastix：
是否有任何方法可以将SimpleElastix版本构建为不同的名称，以便导入两个版本？
浏览 7提问于2022-10-03得票数 0
我正在尝试让一些python代码在基于Amazon Linux的EC2服务器上运行。代码在我运行ubuntu的本地机器上运行得很好。
其中一个依赖项是SimpleITK模块。我将其安装为
easy_install -U SimpleITK
并且它安装成功，我可以导入REPL中的模块。但是，它的所有函数都是不可访问的，我得到
AttributeError: 'module' object has no attribute 'ReadImage'
我需要的所有函数都有类似的错误。经过调查，easy_install似乎以某种方式搞乱了设置。在我的本地机器上，当我执行h
浏览 7提问于2015-06-08得票数 1
1回答
我最近开始尝试从ipython笔记本转向冠层，我从MATLAB转到了它。我正致力于获得类似matlab的开发和研究经验。
我正在做这些跨平台的设置，但我是从OS开始的。
我一直在尝试安装用于天篷的软件包，其中有些需要编译，如SimpleITK和VTK6.0。我已经在我的常规python2.7安装中成功地安装了这些，但是我在安装天篷时遇到了一些困难。现在，我正在用CMAKE重新编译SimpleITK/Superbuild，以便重新创建python包装器。它要求您的python可执行文件，包括dir和python位置。我从冠层内部的sys.executable中找到了可执行的python，包含di
浏览 2提问于2013-09-13得票数 0
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1回答
如何进行脱粒？
、、、
当我应用阈值处理时，我得到了一个错误：
import SimpleITK as sitk
img = sitk.ReadImage("Sub1.png")
img=img>20
错误是：
RuntimeError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-48-a1d4494dca15> in <module>()
1 #img = sitk.Image(img.GetSize(), sitk.sitkUInt8)
----
浏览 2提问于2018-06-28得票数 0
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我需要从2张标有标签的3d图像中提取一组度量，具有相同尺寸、数据类型的--一切都是相同的，除了一个是我的银色标准，另一个是管道的结果。
我的代码是：
reader = sitk.ImageFileReader()
reader.SetImageIO("NiftiImageIO")
reader.SetFileName(file1)
image1 = reader.Execute()
reader.SetFileName(file2)
image2 = reader.Execute()
labelstats = sitk.LabelOverlapMeasuresImageFil
浏览 5提问于2020-05-19得票数 1
刚刚安装了最新版本的SimpleITK，我试图以以下方式运行一个简单的代码：
im = sitk.ReadImage('img.nii.gz')
im_bin = sitk.ReadImage('img_bin.nii.gz')
im_bfc = sitk.N4BiasFieldCorrection(im, im_bin)
错误是
RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK N4BiasFieldCorrection: /scratch/dashboards/SimpleITK-OSX10.7-intel-pkg/Si
浏览 7提问于2016-10-12得票数 3
回答已采纳
我有一个从NIfTI文件读取到SimpleITK (使用python)的3D图像，取每个轴向切片，对其做一些操作，并将新的2D切片重新插入到具有(希望)适当尺寸的3D体积中。例如,
output = sitk.Image(original.GetSize(), sitk.sitkFloat32)
output.CopyInformation(original)
for z in numpy.arange(original.GetDepth()):
image = original[:,:,z]
<< Do Something in SimpleITK>>
浏览 1提问于2015-05-14得票数 3
我正在使用simpleitk和ipython笔记本进行图像处理，正如我们所知，imagej是SImpleITK中的默认图像查看器。但是我使用的图像类型是.mha，而.mha不受imagej的支持。为此，我必须使用斐济或imagej2。
我曾试图按照simpleitk常见问题中提到的指示，将斐济作为默认图像查看器，但没有成功，并显示了以下信息：
我想知道我犯了什么错误。
如何使斐济或imagej2成为所有类型图像的默认图像查看器，当我使用simpleitk和IPython记事本时
谢谢。
浏览 8提问于2016-03-07得票数 1
当我尝试用SimpleITK读取DICOM图像时，我得到以下错误：
RuntimeError:在Notlar ImageFileReader_Execute中抛出异常: SimpleITK ImageFileReader_Execute：：ERROR: Unable to open“C:/Users/egeoz/OneDrive/Masaüstü/Text/ Ders Notları/İmaging Ders notu/el.dcm”。
请帮帮我！
浏览 2提问于2020-11-18得票数 0
我正在使用SimpleITK库与C#进行MRI图像处理。我想在程序执行的各个阶段显示预处理过的图像。要显示图像，我使用以下代码
SimpleITK.Show(image);
看起来，在用ImageJ显示图像之后，执行过程就停止了。我想在一个接一个的运行中显示连续的图像。
系统SITK_SHOW_COMMAND变量设置为%a %f
我正在Windows 10上运行我的代码
这是一个与SimpleITK显示函数相关的错误，还是在我的环境中设置的错误？
浏览 2提问于2016-05-26得票数 1
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我正在做N4偏差校正在.nii文件中的python(视窗).For这我是使用SimpleITK.While的图像输入，我有问题在读取文件。 代码： print("N4 bias correction runs.")
inputImage =sitk.ReadImage("C/Users/LENOVO/Desktop/Brats18_2013_1_1_t1.nii")
maskImage = sitk.OtsuThreshold(inputImage,0,1,200)
sitk.WriteImage(maskImage,"C/Users/LEN
浏览 172提问于2019-01-16得票数 0
回答已采纳
1回答
我试图翻转图片1中显示的图像，以匹配图像2的方向，但我不确定如何。
这就是如何以形象为导向：
有什么想法吗?例如，我如何在Python中使用SimpleITK或nibabel来实现这一点？
浏览 24提问于2022-09-21得票数 2
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1回答
当我使用Python3( SimpleITK 3)中的SimpleITK 0.10.0 ()运行DCM文件中更新标记的代码时，代码正在按照解释工作。
当我在代码中引入烧瓶组件来创建API时，我得到
AttributeError:类型对象' object‘没有属性'__getattr__'
错误。我使用的代码如下
from __future__ import print_function
import SimpleITK
from flask import Flask
import time
app = Flask(__name__)
@app.route('
浏览 7提问于2016-10-05得票数 0
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编辑注意:这个问题最初的措辞是
如何在linux中将SimpleITK.Show()链接到imageJ？
通过将SimpleITK 1.0.0升级到1.0.1，我能够从SimpleITK.Show()启动ImageJ。然而，ImageJ无法打开"sample_mri.hdr“。ImageJ生成以下错误消息。
文件不是支持的格式，而是读取器。
插件是不可用的，或者没有找到。
root/local/linux/ImageJ/open("/temp/TempFile-7131-2.nii")；
root/local/linux/ImageJ/rename("/tem
浏览 3提问于2017-08-14得票数 5
我正在尝试使用VS代码调试一些python代码。我收到以下关于我确信已安装的模块的错误信息。
Exception has occurred: ModuleNotFoundError
No module named 'SimpleITK'
File "C:\Users\Mido\Desktop\ProstateX-project\src\01-preprocessing\03_resample_nifti.py", line 8, in <module>
import SimpleITK as sitk
我使用以下命令安装了该模块
sudo
浏览 303提问于2019-06-19得票数 15
1回答
从.mha文件读取头信息
、、、
我只想从.mha文件中读取标题。理想情况下，它会给我同样的感觉，就像只使用元数据读取.mhd文件一样。
我正在使用SimpleITK进行阅读，虽然它可以很好地读取图像，但我特别希望创建一个元数据字典。
.mha基本上是带有原始映像的.mhd，但是我找不到任何关于如何将它们分开的规范。我在ITK docs 中找到的
若要跳过图像数据文件中的头字节，请使用
HeaderSize = X
其中X是读取图像数据之前在文件开头要跳过的字节数。如果您知道没有尾随字节(文件末尾的额外字节)，则可以指定
HeaderSize = -1
MetaImage将自动计算数据文件中提取的字节数，假设这些字节位于数据
浏览 6提问于2021-04-08得票数 0
我正在尝试使用通过GitHub提供的以下脚本：。我安装了python 3.9.10，pip版本22.0.4。但是，当我运行py script.py时，我会收到以下错误消息："ImportError: DLL加载在导入_SimpleITK时失败。找不到给定的模块“
首先，我在下载SimpleITK时遇到了问题，因为CMake无法构建它，也无法识别建筑车轮。但是现在这似乎很好，我尝试过使用不同版本的SimpleITK (2.0.2和2.1.0)，但两者都给出了相同的错误。
我还确保删除任何其他版本的python，因为我以前安装了3.10，但这也解决不了任何问题。
浏览 7提问于2022-03-21得票数 0
2回答
SimpleITK提供了易于使用的Python接口。我可以从那里继续上课吗？
我需要解决一个注册问题，它要求我编写我的定制注册类，特别是相似度度量。如何在Python中扩展SimpleITK以供我使用？
浏览 9提问于2016-02-24得票数 0
回答已采纳
我正在尝试使用sitk.LabelIntensityStatisticsImageFilter来计算图像中标签的一阶统计量。 我的代码是 import SimpleITK as sitk
ADC600 = '/Users/omarkamal/PycharmProjects/DWI/Pt1/ADC600.nii'
ADC600_r = sitk.ReadImage(ADC600)
label = '/Users/omarkamal/PycharmProjects/DWI/Pt1/seg.nii.gz'
label = sitk.ReadImage(label
浏览 48提问于2019-12-16得票数 0
回答已采纳
我不明白sitk.ReadImage是否可以读取图像列表？我没有找到一个示例来说明如何将图像列表输入到该函数中。但在函数文档中，它写道：
ReadImage(**VectorString fileNames**, itk::simple::PixelIDValueEnum outputPixelType) -> Image
ReadImage(std::string const & filename, itk::simple::PixelIDValueEnum outputPixelType) -> Image
ReadImage is a procedural in
浏览 47提问于2017-07-14得票数 0
1回答
我对中描述的图像进行去噪，如下所示：
import SimpleITK as sitk
image=sitk.ReadImage("myimage.dcm")
imgSmooth = sitk.CurvatureFlow(image1=image,
timeStep=0.00125,
numberOfIterations=100)
我正在尝试将其另存为dicom文件：
sitk.WriteImage(imgSmooth, 'denoised.
浏览 2提问于2015-07-31得票数 2
2回答
在Ubuntu 16.04.1上编译时，我遇到了一些错误，
Linking CXX executable ../lib/Slicer-4.7/cli-modules/abcd
/path/to/SimpleITK/SimpleITK-build/SimpleITK-build/lib/libSimpleITKBasicFilters1-0.11.so.1: undefined reference to `itk::ImageToImageFilter<itk::Image<int, 2u>, itk::Image<int, 2u> >::PushFr
浏览 6提问于2017-02-09得票数 0
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