Snakemake: trimmomatic包装属性错误
Snakemake是一个基于Python的工作流管理系统，用于构建和运行可重现且可扩展的数据分析流程。它允许用户定义工作流的规则、输入和输出文件以及任务之间的依赖关系。
关于Snakemake中trimmomatic包装属性错误的问题，可能是由于以下原因导致的：
- 错误的包装属性：Snakemake使用规则文件（Snakefile）来定义工作流中的规则和任务。在规则中，可能存在trimmomatic的包装属性错误，可能是参数值的拼写错误、参数值类型错误或者参数值缺失等情况。
- trimmomatic安装错误：如果trimmomatic未正确安装或版本不兼容，可能会导致包装属性错误。请确保已正确安装trimmomatic，并检查其版本是否与Snakemake兼容。
为了解决这个问题，可以尝试以下步骤：
- 检查包装属性：检查Snakefile中与trimmomatic相关的规则，确保包装属性没有拼写错误、值类型错误或值缺失。可以参考Snakemake官方文档来了解trimmomatic的正确用法和参数设置。
- 检查trimmomatic安装：确保trimmomatic已正确安装，并且版本与Snakemake兼容。可以通过在终端中运行
trimmomatic -version来检查trimmomatic的版本。如果版本不兼容，可以尝试升级或降级trimmomatic。
如果问题仍然存在，可以提供更具体的错误信息以便进一步排查和解决。同时，推荐腾讯云的云计算产品“云托管”（https://cloud.tencent.com/product/cvm）来搭建和管理云上的计算资源，以支持Snakemake工作流的运行。
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Pre-processingraw reads with trimmo
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编辑27-07-2018:包装器不考虑线程。此外，我在这里尝试的语法不起作用，据我所知，也不支持类似的语法。答案来自Snakemake、谷歌集团和下面meono的交叉帖子。我正在使用Snakemake，我对它很满意。然而，对于某些过程，我正在使用包装(即FastQC和Trimmomatic)。但是，我注意到这些包装器没有考虑到{线程}变量。同样，我测试了设置{wildcards.threads}和{snakemake.threads}。看来包装程序代码
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Building DAG of jobs.../MTG325_R1_
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"java -jar {config[trimmomat
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Failed to open e
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input:
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