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. | 蛋白-蛋白(PPI)界面感知的分子生成框架用于PPI调节剂设计

鉴于这些差异,为不同药物靶点开发适配的分子生成模型成为设计针对不同靶点药物的关键。 表1. PPI 界面与蛋白结合位点之间的比较 生成式人工智能(AI)能够模拟训练样本的分布,并生成具有新颖性的样本。...在药物发现领域,生成式AI通过生成具有理想特性的分子,加速了药物研发的进程。...条件模型的评估结果显示,GENiPPI框架能够有效捕捉PPI界面与活性化合物之间的隐含关系,生成具有类药性质且与特定PPI靶点活性化合物相似的化合物。...通过广泛的条件评估实验,研究人员验证了GENiPPI框架学习PPI界面与活性分子之间隐含关系的能力,并展示了其生成化学多样性高且具有生物学相关性的分子的能力。...此外,通过引入条件Wasserstein生成对抗网络,模型能够在分子生成中施加特定约束,确保生成的分子不仅具有结构新颖性,还符合PPI靶点的类药性要求。

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Briefings in Bioinformatics | 用于PPI抑制剂设计的深度分子生成模型

结果表明生成的分子具有较好的PPI靶向药物的类药性。此外,通过化学空间分析,生成的分子与iPPI-DB抑制剂共享化学空间。...相比之下,从头药物设计(分子生成)旨在通过从头开始生成具有所需特性的新分子来探索类药分子的化学空间,以拓宽现有的化学库。...结果表明,生成的分子具有更好的PPI靶向药物相似性和药物相似性。生成的分子与 iPPI-DB 共享化学空间。探索了 PPI 抑制剂的基于肽和基于配体的分子生成。...结果表明,iPPIGAN生成的分子易于合成,具有更好的药物相似性和PPI靶向药物相似性。由于构建的训练集具有较高的药物相似性,该模型可以更好地学习药物相似性分布并扩展到新的药物相似性空间。...研究人员探索了基于肽的 PPI 抑制剂设计和基于配体的 PPI 抑制剂设计。结果表明,生成的分子具有更好的 PPI 靶向药物相似性和药物相似性。

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    IEEE|具有混合状态的强化分子生成

    一、研究背景 生成具有目标化学性质的分子是化学药物发现和材料设计领域的一个主要兴趣领域。近年来,深度学习技术被用来降低搜索复杂度,将生成过程描述为一个顺序决策问题。...通过将SMILES与拓扑(即图)表示结合,可以更全面和准确地描述代理状态,这有利于后续的决策。此外,强化学习的训练可能是不稳定的,因为在发现可能是最佳的策略之前,通常会有许多试验和错误。...二氧化碳顺序生成过程的一个例子 2.3 注意力机制 动作注意:此设置的目标是计算w,它可以为z中与专家操作a具有更高相关性的特征分配更大的权重。...三、实验结果 该任务旨在生成具有较高特定化学性质分数,如惩罚logP,QED等的分子。...模型与其他基线方法的比较 与其他模型相比,作者利用SMILES字符串具有全局上下文信息的优点来补偿不完全图状态下的部分信息,并通过每一步生成的中间状态的有效性检查,从而使模型能够生成100%有效的分子。

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    基于生成表征的自条件图像生成

    这种差距随着自监督学习( SSL )的出现而缩小,SSL从数据本身产生监督信号,实现了与监督学习相比具有竞争力或更优越的结果。 自条件图像生成是重要的。...其次,与自监督学习如何超越监督学习类似,自条件图像生成利用大量无标签数据集,具有超越条件图像生成性能的潜力。...图1:无类别条件图像生成性能 RCG具有出色的图像生成能力。...这种分布具有两个基本特性:通过表征扩散模型进行建模的简单性,以及用于指导像素生成的高层语义内容的丰富性。...对于我们的主要结果,RCG-L使用Moco v3 预训练的视觉转换器( ViT-L )作为图像编码器,具有12个块和1536个隐藏维度的网络作为RDM的骨干,MAGE-L 作为图像生成器。

    30310

    图像结构样式分开生成的生成模型论文代码

    然而,这些方法忽略图像形成的最基本的原理:图像的产物:(a)结构:底层三维模型;(二)风格:纹理映射到结构。在本文中,我们因式分解图像 生成过程并提出体例结构生成对抗性网(S2-GAN)。...我们的S2-GAN有两个组成部分:StructureGAN产生一个结构图;style-GaN取面法线图作为输入并产生2D图像。除了真正的与生成图片的损失函数,我们使用计算机表面的额外损失 生成的图像。...的生成架构的基本假设是,如果该模型是足够好 以生成新的和现实的图像,它应该是一个很好的代表性 视觉任务为好。...我们相信,有融通的优势四倍 式和结构在图像生成处理。首先,保理和风格 结构简化了整个生成过程,并导致更逼真 高分辨率的图像。这也导致高度稳定的和强大的学习过程。...人们甚至可以在因素的错误和理解 当表面正常生成失败相比,纹理生成的。 第三,我们的结果表明,S2-GAN可以让我们学习RGBD表示 在无人监督的方式。这可用于许多机器人和图形关键 应用程序。

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    FreeU | 增强图像生成质量的插件

    有选择性地减弱跳层特征的低频成分。 Experiments Denoising process 最上面一行展示了图像在迭代过程中的渐进式去噪过程,随后两行则展示了反傅里叶变换后的低频和高频分量。...Effect of backbone and skip connection scaling factors 提高骨干缩放因子 b 能显著提高图像质量,而跳过缩放因子 s 的变化对图像合成的影响微乎其微...跳跃特征skip各个频率中的分量较为均衡,而骨干特征backbone大多都是低频成分,所以增强b才会出现图像越来越平滑的现象,增强s时,因为s在频域分布比较均衡,所以对图像影响有限。...image = pipe(prompt).images[0] image.save("astronaut_rides_horse.png") Conclusions 即插即用来提高扩散模型的生成质量...,不需要训练和额外的参数,可以应用到所有扩散模型中,包括各种基于扩散模型的图像、视频生成任务 Unet中跳跃连接贡献更多高频细节但会可能会影响去噪能力,骨干连接贡献更多去噪能力,选择性提高基础连接权重并降低跳跃连接中低频权重可提高生成质量

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    学界 | 极端图像压缩的生成对抗网络,可生成低码率的高质量图像

    选自arXiv 作者:Eirikur Agustsson等 机器之心编译 参与:白妤昕、刘晓坤 本文提出了一个基于生成对抗网络的极端学习图像压缩框架,能生成码率更低但视觉效果更好的图像。...在本文中,研究者提出并研究了基于生成对抗网络(GAN)的极端图像压缩框架,其中图像的码率低于 0.1 bpp。他们提出了一个基本的 GAN 公式,用于深度图像压缩,从而生成不同程度的内容。...与先前的深度图像压缩技术相比,该技术将对抗损失应用于图像补丁的伪像抑制 [6,14] 和纹理细节生成 [15] 或缩略图表征学习 [16],该框架的生成器/解码器由多尺度判别器训练,适用于全分辨率图像...我们研究两种操作模式(对应于无条件和有条件的生成对抗网络 [11,17]),即 全局性生成压缩(GC),保留整体图像内容,同时生成不同尺度的结构,例如建筑立面上的树叶或窗户的树叶; 选择性生成压缩(SC...),保留语义标签映射中完全生成图像的某些部分,同时高度保留用户定义区域的细节。

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    ReVersion|图像生成中的 Relation 定制化

    Inversion,Custom Diffusion等,该类方法可以将一个具体物体的概念从图片中提取出来,并加入到预训练的text-to-image diffusion model中,这样一来,人们就可以定制化地生成自己感兴趣的物体...目前还没有工作探索过如何从图片中提取一个具体关系(relation),并将该relation作用在生成任务上。为此,我们提出了一个新任务:Relation Inversion。...,并将其应用于生成新的场景,让其中的物体也按照这个relation互动,例如将蜘蛛侠装进篮子里。...我们同时对常见的relation提供了大量的inference templates,大家可以用这些inference templates来测试学到的relation prompt是否精准,也可以用来组合生成一些有意思的交互场景...4 结果展示 丰富多样的relation 我们可以invert丰富多样的relation,并将它们作用在新的物体上 丰富多样的背景以及风格 我们得到的relation ,还可以将不同风格和背景场景中的物体

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    能生成逼真图像的不只有 GAN

    BigGAN 及其加强版的问世让我们看到了生成对抗网络在图像生成方面的巨大威力,但 GAN在生成图像方面真的无懈可击吗?它是生成图像的最佳方式吗?...该模型借助图像压缩方面的概念,将像素空间映射到量化的离散空间,从而进一步借助自编码器的结构学习怎样生成高清大图。 此外,VQ-VAE 尤其适用于生成较大的图像。...GAN 利用生成器和判别器来优化 minimax 目标函数,前者通过将随机噪声映射到图像空间来生成图像,后者通过分辨生成器生成的图像是否为真来定义生成器的损失函数。...图 1:带类别约束的图像生成样本(256x256),它们通过 ImageNet 上训练的两阶段模型可以生成逼真且一致的图像。...最后,该研究中的编码器和解码器都保留了原始 VQ-VAE 的简单性与速度,这意味着这种方法对于需要快速、低开销的大图编码、解码过程具有很大的吸引力。

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    在玩图像分类和图像分割?来挑战基于 TensorFlow 的图像注解生成!

    原因无他:利用神经网络来生成贴合实际的图像注释,需要结合最新的计算机视觉和机器翻译技术,缺一不可。对于为输入图像生成文字注解,训练神经图像注解模型能使其成功几率最大化,并能生成新奇的图像描述。...注解生成——作为图像分类的延伸 作为一个历史悠久的 CV 任务,图像分类背后有许多强大模型。图像分类能把图像中相关联的形状、物体的视觉信息拼凑到一起,把图像放入物体类别中。...在我们的例子中,VGG-16 图像分类模型导入 224x224 分辨率的图像,生成对分类图像非常有用的 4,096 维特征矢量。...但对于静态图片而言,嵌入我们的注解生成器,将会聚焦于图像中对分类有用的特征,而不是对注解生成有用的特征。...为提升每个特征里涵盖的与任务相关的信息,我们可以训练图像嵌入模型(用来对特征进行编码的 VGG-16 网络)作为注解生成模型的一部分。这使得我们能为图像编码器调参,以更符合注解生成器的角色。

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    StarGAN:支持多领域图像生成的生成对抗网络实践

    1、论文原理   GAN的基本框架都是G和D两个模型,一个生成模型,一个判别模型,那么为了同时生成多个,那么这个G模型必须具备生成多样化图像的能力。...论文的基本框架如下: ? 要想让G拥有学习多个领域转换的能力,需要对生成网络G和判别网络D做如下改动。 在G的输入中添加目标领域信息,即把图片翻译到哪个领域这个信息告诉生成模型。...D除了具有判断图片是否真实的功能外,还要有判断图片属于哪个类别的能力。...这样可以保证G中同样的输入图像,随着目标领域的不同生成不同的效果 除了上述两样以外,还需要保证图像翻译过程中图像内容要保存,只改变领域差异的那部分。...图像重建可以完整这一部分,图像重建即将图像翻译从领域A翻译到领域B,再翻译回来,不会发生变化。 同时模型为了支持多个数据集,需要增加mask来实现,即补位加0的办法。

    1.3K20

    科普---图像细胞分割错误对后续分析的影响

    作者,Evil Genius今天我们来分享一下关于图像分割的内容,其中目前主流有三种分割方式。1、核分割,这是目前最成熟的分割方法。...2、核扩展分割,在核分割的基础上扩展一定的距离(5um),代表整个细胞。3、细胞分割,完整的分割,需要染细胞膜。现在Stereo-seq、HD、Xenium、CODEX等平台都有了图像分割的做法。...弥补了一定的损失,但是一刀切的扩展也有问题。那么不正确的细胞分割会给分析带来多大的影响?用空间转录组回答生物学问题,取决于准确分割细胞的能力。...细胞注释,基因表达的差异均发生了错误,掩盖了细胞状态的真实差异。细胞之间的互作与协调分析也发生了严重的错误如果一个细胞的状态持续受到附近其他细胞类型的影响,则可以推断出两种细胞类型相互作用。...由于分割错误往往会在相邻细胞之间错误分配分子,导致分析结论出现严重错误,从而产生虚假信号。分子邻域等个性化分析均受到影响可见大家做细胞分割还是要慎重,方法不成熟的情况下, 得到的分析结论都是错误的。

    9110

    开发 | 在玩图像分类和图像分割?来挑战基于 TensorFlow 的图像注解生成!

    原因无他:利用神经网络来生成贴合实际的图像注释,需要结合最新的计算机视觉和机器翻译技术,缺一不可。对于为输入图像生成文字注解,训练神经图像注解模型能使其成功几率最大化,并能生成新奇的图像描述。...注解生成——作为图像分类的延伸 作为一个历史悠久的 CV 任务,图像分类背后有许多强大模型。图像分类能把图像中相关联的形状、物体的视觉信息拼凑到一起,把图像放入物体类别中。...在我们的例子中,VGG-16 图像分类模型导入 224x224 分辨率的图像,生成对分类图像非常有用的 4,096 维特征矢量。...铜鼓偶在大量图像—注解成对数据上训练,该模型学会了通过视觉特征抓取相关语义信息。 但对于静态图片而言,嵌入我们的注解生成器,将会聚焦于图像中对分类有用的特征,而不是对注解生成有用的特征。...为提升每个特征里涵盖的与任务相关的信息,我们可以训练图像嵌入模型(用来对特征进行编码的 VGG-16 网络)作为注解生成模型的一部分。这使得我们能为图像编码器调参,以更符合注解生成器的角色。

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    CART: 用于图像生成的复合自动回归Transformer !

    生成AI的常规方法,包括生成对抗网络(GANs)[13, 27]和变分自编码器(VAEs)[20, 37],通常旨在一次生成整个场景。然而,人类对视觉场景的感知和理解本质上具有组合性。...扩散模型具有很高的灵活性,并已应用于图像合成之外的多种生成任务,包括文本到图像生成[46, 49],修复[9, 25, 43],超分辨率[23, 45],3D重建[3, 48]和广义图像编辑[5, 19...然而,尽管它们具有优势,但扩散模型通常需要大量的迭代步骤来生成高质量图像,这可能导致长时间的生成时间,尤其是对于高分辨率图像。这种计算开销限制了它们在需要高效、实时合成的应用中的可扩展性。...然而,这些模型的限制在于预测具有数十亿像素的真实图像所需的计算复杂性。具有6.8亿参数的大型图像-GPT [8]模型只能预测一个96x96的图像。...从图5可以看出,与VAR相比,CART生成的图像具有增强的细节和结构,而VAR没有使用“下一细节”预测方案。

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    在Jupyter Notebook中显示AI生成的图像

    本教程介绍一种生成包含文字的自定义个性化图像并将其存储到 Cloudinary 的方法。...使用合适的工具,您可以将想法转化为创意,通过将文本转换为生成的图像并使用数字媒体管理工具Cloudinary将其存储在云中。 OpenAI的高智能图像API使得显示AI生成的图像成为可能。...该API提供从头开始生成原始图像、根据文本提示编辑现有图像以及创建图像变体的方法。该模型DALL-E是一个经过训练可以根据文本描述创建图像的神经网络。...设置配置参数 为配置设置的值将从您的Cloudinary密钥的.env中读取。 使用DALL-E 3生成原始图像 生成图像时,我们将允许用户使用Python的input函数输入他们想要的提示。...来自OpenAI API的生成的输出图像 Cloudinary中上传的AI生成的图像 项目的完整源代码,请使用这个gist或Google Colab中的这个notebook。 结论 已经有灵感了吗?

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    ImageFX,谷歌 AI 图像生成的新篇章

    ImageFX 是一个实验性的图像生成工具,它利用了 Imagen 2——Google DeepMind 最新的文本到图像的 AI 模型,为用户提供了一个强大的平台,以简单的文本提示快速生成高质量的图像...为了进一步激发创造力,ImageFX 包括了一个具有“表达芯片”的提示界面,让用户能够快速尝试他们创意的邻近维度。...透明的 IPTC 元数据 除了 SynthID 水印,ImageFX 生成的图像还包含了 IPTC 元数据,这为用户提供了更多关于 AI 生成图像的信息。...总结 ImageFX 不仅是一个图像生成工具,它更是一个创意探索的平台,如果你觉得 gemini 生成的图片还不是很满意,那么你可以尝试下谷歌的这个 ImageFX。...随着技术的不断进步和用户反馈的积累,ImageFX 有望成为创意产业中不可或缺的工具之一,开启 AI 图像生成的新篇章。

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    生成对抗网络(GAN):在图像生成和修复中的应用

    GAN在图像生成中的应用 图像生成 风格迁移 GAN在图像修复中的应用 图像修复 拓展应用领域 总结 欢迎来到AIGC人工智能专栏~生成对抗网络(GAN):在图像生成和修复中的应用 ☆* o(≧▽...,如果文中出现错误,希望大家能指正 欢迎大家关注!...两者通过对抗性的训练相互提升,最终生成器生成的图像越来越接近真实图像。 GAN在图像生成中的应用 图像生成 GAN最著名的应用之一就是图像生成。生成器通过随机向量作为输入,逐渐生成逼真的图像。...通过将一个图像的风格应用于另一个图像,生成器可以将源图像转化为具有特定风格的图像。...这在恢复老照片、修复损坏的图像等方面具有广泛的应用。

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