Aspera在Ubuntu环境的安装过程如下: Step 1: 建立安装文件夹 mkdir ~/Biosofts cd ~/Biosofts Step 2: 下载Aspera软件...-64.tar.gz Step 3: 解压文件 是tar.gz格式,用tar命令和zvxf参数 tar zvxf aspera-connect-3.6.2.117442-linux-64....tar.gz Step 4: 安装Aspera 解压后是一个shell脚本,运行即可 sh aspera-connect-3.6.2.117442-linux-64.sh Step...5:测试Aspera是否安装成功 ascp命令默认安装地址在:~/.aspera/connect/bin ~/.aspera/connect/bin/ascp -h Step 6:将...aspera安装路径加入环境变量 echo 'export PATH=~/.aspera/connect/bin:$PATH' >> ~/.bashrc Step 7:使环境变量生效<
Aspera用法如下: Usage: ascp [参数] 目标文件 保存路径 一、 Aspera下载一个SRA文件 Step 1:建立Seqs文件夹保存下载序列 mkdir ~/Seqs...Step 2:下载SRA文件到Seqs文件夹 ascp -T -i /home/xiaoming/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh...ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov:/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR620/SRR6208854/SRR6208854.sra ~/Seqs/ 二、 Aspera...SRR6232299.sra 按Ctrl+O,Ctrl+X保存退出 Step 2:批量下载sra_list.txt列表中的文件 ascp -T -i /home/xiaoming/.aspera
虽然有aspera下载加速措施,但是每次下载至少失败一半!...fastq.gz fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR150/057/SRR15037157/SRR15037157_2.fastq.gz 继续使用脚本 step1-aspera.sh...~/miniconda3/envs/download/etc/asperaweb_id_dsa.openssh \ era-fasp@$id . done # nohup bash step1-aspera.sh...1>step1-aspera.log 2>&1 & 然后前面失败的文件这次就成功下载了。
我现在就在想我一开始用windows系统的时候怎么没有人教我这个,所以在一开始用电脑现在想想真的是混乱。...下面主要说说我的数据下载踩的坑,多亏了张老师的帮助让我从这两天的坑中跳了出来,我是用的aspera软件下载的。...在conda下安装aspera软件 conda install-y-chcc aspera-cli which ascp 找到要下载的数据的BioProject;一般知道它的GEO accession和...下载下来数据在windows下面用Excel打开了一下再上传的,由于点了每行行尾,然后在上传上去之后生成的sra.url文件每行行尾多了特殊字符,对数据下载流程即代码都不熟悉的我,开启了为时两天的踩坑。...在这里我是在后面生成sra.download.sh的时候才发现的,vim sra.download.sh,然后出现了下面这个图,我一直没有想明白怎么回事,后来在张老师的指点下,了解到时我上面写的那个问题
Aspera下载和安装 Aspera下载: http://downloads.asperasoft.com/connect2/。...zxf aspera-connect-3.5.1.92523-linux-64.tar.gz sh aspera-connect-3.5.1.92523-linux-64.sh echo 'PATH=$...PATH:~/.aspera/connect/bin/' >> ~/.bashrc source ~/.bashrc ascp --help 软件一般安装在 ~/.aspera/connect/ 目录下...Aspera使用: 使用说明:https://www.internationalgenome.org/faq/how-download-files-using-aspera Aspera 高速下载 NCBI...-i 免密从SRA和ENA下载的私钥,为·安装 aspera 后有在目录 ~/.aspera/connect/etc/ 下的asperaweb_id_dsa.openssh 文件。
官网资源: https://ftp.gnu.org/pub/gnu/libiconv/libiconv-1.16.tar.gz CSDN资源:https://...
xyz","http://api105.video88.xyz","http://api106.video88.xyz","http://api107.video88.xyz"}###以上就是json怎么用的详细内容
本文大部分都是代码案例, 如果您对 grpc 感兴趣, 可以作为基础参考的一部分.
第一种用法:string Son_a=a.substr(5);从下标5开始形成新的子字符串
Hi 大家好,大家都知道kuka机器人的程序是顺序执行的,那么如何能实现某个信号的连续监控呢。或者说某个信号触发后,机器人就立即停止当前的任务去执行另外一个任务...
安装 $ tar -zxvf aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.tar.gz $ ..../aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.sh $ sudo cp ~/.aspera/connect/etc/aspera-license /usr/local/bin...ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR507/SRR5077625/SRR5077625.sra EBI的aspera...命令 含义 ~/.aspera/connect/bin/ascp aspera的可执行文件 -k 1 断点续传 -QT 100M 提高下载速度 -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh...--user anonftp --file-list aspera_download.txt 4.
下载数据 由于是EBI数据库,用wget下载速度太慢,Jimmy大神强烈建议用aspera工具下载,于是参考生信技能树教程代码,首先需要熟悉GEO和SRA数据库: 解读GEO数据存放规律及下载,一文就够...使用conda安装aspera conda create -n download conda activate download conda install -y -c hcc aspera-cli...bioconda sra-tools which ascp ## 一定要搞清楚你的软件被conda安装在哪 ls -lh ~/miniconda3/etc/asperaweb_id_dsa.openssh 我用EBI...单个样本fq下载 找到单个样本的链接很容易: (base) vip31@tpm2-WD12:~/RNA_Seq/sra$ ascp -QT -l 300m -P33001 -i ~/.aspera/connect...nohup cat filereport_read_run_PRJNA229893_tsv.txt | while read id; do ascp -QT -l 300m -P33001 -i ~/.aspera
下面是100个lncRNA组装流程的软件的笔记教程 Aspera是IBM公司的一款高速传输软件,创造了新一代的传输技术(faspTM),并能不受文件大小、形态、传输距离、网络条件限制,以最高效的速度来协助用户迁移各地的数据...一、软件安装 使用conda安装 conda install -y -c hcc aspera-cli conda install -y -c bioconda sra-tools which ascp...ls -lh ~/miniconda3/etc/asperaweb_id_dsa.openssh # 一定要搞清楚你的软件被conda安装在哪 二、aspera的用法 安装完成以后,可以使用ascp...~/miniconda3/envs/download/etc/asperaweb_id_dsa.openssh \ era-fasp@$id . done # nohup bash step1-aspera.sh...1>step1-aspera.log 2>&1 &
相信很多像我一样的新手学习Android开发会遇到这个问题,通过这几天的归类和总结,将我的理解写在下面,欢迎大家一起前来讨论: 以按钮BUTTON的监听事件为例...
威胁情报在国内已经火了几年,威胁情报怎么用,具体的使用场景是什么,这方面的话题似乎较少。下面想根据个人所知,谈谈这方面,不完善准确的地方也请大家指正。 有些时候情报和威胁情报很容易被划等号,其实不然。
本文为2020年MongoDB应用案例与解决方案征集活动优秀应用案例:MongoDB在京东的应用,作者王勇。
动态规划适用于子问题不是独立的情况,即各个子问题之间包含公共的子问题。动态规划对每个子问题只计算一次,保存其计算结果到"一张表",重复利用,从而优化执行。
myphone_n;工作变量声明 myphone_n.num = 2;赋值 myphone_n.my_phone=#huawei;赋值 myphone_n={num 2,my_phone #vivo} ;赋值 怎么样很简单吧
一、揭开 Docker 的神秘面纱 Docker 是在Linux容器中运行的应用的开源工具,是一种轻量级的“虚拟机”诞生于2013年,短短几年时间,已经成为了开...
早点的时间是直接在Mapper类上面添加注解@Mapper,这种方式要求每一个mapper类都需要添加此注解,比较麻烦。
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