我想计算第一个链的第一个原子到第二个chain.Then的所有原子的距离,第一个链的第二个原子到第二个链的所有原子的距离。对于300个文件,必须重复此操作。只有当距离为>= 5时,我才需要打印原子对,并将输出保存到具有输入文件名的另一个文件夹中。求距离的公式是sqrt((x1-x2)^2+(y1-y2)^2+(z1-z2)^2)。ATOM 3 C MET A 1 -14.451 51.635 37.011 1.00 26.82
我有很多需要在Matlab中求逆的大矩阵(大约5000 x 5000)。我实际上需要反转,所以我不能使用mldivide,这对于求解一个b的Ax=b来说要快得多。我使用Matlab来获得这些矩阵,对于这些东西,我需要对它们的求逆进行处理,所以我更喜欢一种加速Matlab的方法。但是,如果我可以使用另一种更快的语言,请让我知道。我不知道很多其他的语言(只懂一点C和一点不懂Java),所以如果它在其他语言中真的很复杂,那么我可能无法使用它。但是,请继续并提出建议,以防万一。