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Nat. Commun. | 深度学习探索可编程RNA开关

今天给大家介绍的是一篇发表在Nature Communications 的文章“A deep learning approach to programmable RNA switches”,工程RNA元件是能够检测小分子、蛋白质和核酸(合成生物学成分)的可编程工具。增强深度学习的模式识别可以用于预测合成生物学成分。本文用深度神经网络(DNN)来预测合成生物学中的经典核糖开关模型——toehold开关。为了促进DNN训练,作者在体内合成并表征了涵盖23个病毒基因组和906个人类转录因子的91,534个toehold开关的数据集。经过核苷酸序列训练的DNN表现(R 2  = 0.43–0.70)优于前沿的热力学和动力学模型(R 2 = 0.04–0.15),且允许实行人类可理解的注意力可视化(VIS4Map)识别成功和失败的模式。本文研究表明深度学习方法可用于RNA合成生物学中的功能预测。

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MySQL的体系结构

在使用淘宝网进行购物过程中,当我们查询商品时,实际上是查询淘宝网数据库中的商品;当我们购买某一件商品时,我们是在向淘宝网的数据库的订单中,填写了一条购买信息;当我们去银行办理相关业务,查询账户余额时,是查询银行数据库中我们的个人账户信息;当我们取款时,我们是在修改银行数据库中账户信息的数据。所以,其实我们一直都在使用数据库,通过网络和设备,在与数据库进行交互。一方面数据库可以给应用提供插入、删除、修改、查询数据的功能,另一方面,数据库也能保证数据库再关机之后,数据不丢失,也就是数据的持久化。那么,数据库具体是如何实现的呢?

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领券