接上文,Kaplan-Meier曲线有助于可视化两个分类组之间的生存差异,当你设置参数pval = TRUE时,可以获得的对数秩检验值有助于探讨不同组之间的生存率是否存在差异。...> fit <- coxph(Surv(time, status)~sex, data=lung) > fit Call: coxph(formula = Surv(time, status) ~ sex...简单起见可以用下列来解释: HR = 1:无效 HR> 1:危险增加 HR <1:减少危害(保护性) 下一步让我们创建一个模型来分析数据集中的所有变量!...0.000192 n= 168, number of events= 121 (60 observations deleted due to missingness) 下一步,我们尝试在肺数据集上基于年龄属性创建一个分类变量...最后,我们可以将结果分配给肺数据集中的新对象。
生存资料的DCA 方法1 方法2 方法3 方法4 生存资料的DCA 方法1 使用dcurves包,使用的数据集是包自带的df_surv数据集,一共有750行,9列,其中ttcancer是时间,cancer...是结局事件,TRUE代表有癌症,FALSE代表没有癌症。...还是使用dcurves里面的df_surv数据集作为演示。...cox_fit3 <- coxph(Surv(ttcancer, cancer) ~ age + famhistory, data = df_surv) 多个模型同一时间点的DCA: df1 <-...数据还是用df_surv数据集。
对于寿命数据的分析,在生物学和医药学中是非常重要的话题。除此之外,在工程应用中的可靠性分析中也非常重要。寿命数据往往是高度非正态数据,因此使用标准的线性模型可能会有很多问题。...我们使用K.T.Drzewiecki收集的melanom(黑色素瘤)数据集,数据可以通过以下方法获取: > library(ISwR) 载入程辑包:‘ISwR’ The following object...变量status是病人在研究期结束时的状态:1表示“死于恶性黑色素瘤”,2表示“1978年1月1日的时候还是存活的”,3表示“死于其他原因”。...Surv()函数的第二个参数是一个逻辑向量:status==1对于死于黑色素瘤的患者观测为TRUE,其他为FALSE。 A....生存函数的Kaplan-Meier估计的计算可以通过调用函数survfit()来实现。该函数最简单的形式只带有一个参数,即为Surv对象。函数返回一个survfit对象。
var octalNum1 = 070; //56 var octalNum2 = 079; //79 var octalNum3 = 08; //8 注意: 严格模式下,八进制字面量无效,会抛出错误...十六进制字面值前两位必须是 0x,后面跟十六进制数字(0-9,a-f)。字母大小写都可以。 在进行数字计算时,所有八进制和十六进制表示的数值都将被转换为十进制数。...false isNaN('123abc'); //true isNaN 函数也适用于对象,基于对象调用 isNaN 时,会首先调用对象的 valueof() 方法,判断返回值是否可以转换为数值,如果不能...调用数值的 toString 方法时,可以传递参数,来确定输出数值的进制。...中对象就是一组数据和功能的集和。
0108 创建对象失败。创建对象 '%s' 时出错。 0109 成员未找到。 0110 未知的名称。 0111 未知的界面。 0112 参数丢失。 0113 脚本超时。超过了脚本运行的最长时间。...要创建有 Session 或 Application 作用范围的对象实例,请将在 Global.asa 文件中加入 Object 标记。 0122 对象标记中的范围无效。...外部对象的 OnStartPage 方法中出错。 0194 OnEndPage 失败。外部对象的 OnEndPage 方法中出错。 0195 无效的服务器方法调用。...ScriptEngine 在 '%s' 中从 '%s' 引发 '%X' 异常。 0241 CreateObject 异常。'%s' 的 CreateObject 引发 %X 异常。...查询的 '%s' 对象的 OnStartPage 或 OnEndPage 方法引发 %X 异常。 0243 Global.asa 中的 METADATA 标记无效。
Promise 应该被 reject reject(e) } } 复制代码 executor 函数需要使用 try catch 包裹执行的原因则是在 executor 函数执行中可能会抛出错误...需要完善的主要有以下两点: 不同 Promise 之间的兼容; 异步调用操作; 在实际中,有多种不同的 Promise 实现,关于不同 Promise 间的交互, Promises/A+ 规范已经做了详细的说明...== null) && ((typeof x === 'object') || (typeof x === 'function'))) { try { then = x.then..., resolve, reject) 复制代码 最后,在标准中,说明了某些地方需要使用异步调用,在我们的实现中,我们需要在 resolve、reject、onResolved、onRejected 加上异步调用的代码...== null) && ((typeof x === 'object') || (typeof x === 'function'))) { try { then = x.then
一个表达式列表,用于将输入数据集分组为离散组,每组运行一次回归。当此值为NULL时,不使用分组,并生成单个结果模型。...一个表达式列表,类似于SQL的“GROUP BY”子句,用于将输入数据集分组为离散组,每组运行一次回归。当此值为NULL时,不使用分组,并生成单个结果模型。...一个表达式列表,类似于SQL的“GROUP BY”子句,用于将输入数据集分组为离散组,每组运行一次回归。当此值为NULL时,不使用分组,并生成单个结果模型。...如果为TRUE,则打印回归拟合警告消息。...SELECT madlib.robust_variance_coxph(); 2. 创建一个输入数据集。
代表被观察对象的生存时间大于t时刻的概率,实际中t时刻的取值估算公式为:S(t) ≈ 生存时间长于t的患者数 / 患者总数 死亡概率函数:简称为死亡概率,常用F(t)表示。...Cox模型的注意事项 研究的协变量在被研究对象中的分布要适中,否则会给回归参数的估计带来困难。...尽管可以分析删失数据,但在观察时,要尽量避免观察对象的失访,过多失访容易造成结果的偏倚。 Cox模型对异常值较为敏感,所以在进行模型拟合时要注意拟合优度的检验。...right_censoring_status(可选) VARCHAR 缺省值为TRUE。表示右删失状态的字符串,如果无删失则为TRUE,否则为FALSE。...(1)条目预测 \x off drop table if exists sample_pred_terms; select madlib.coxph_predict('sample_cox',
导语 GUIDE ╲ 生存分析是指将终点事件和出现此事件所经历的时间结合起来分析的一种统计方法,研究生存现象和现象的响应时间数据及其规律,在肿瘤等疾病研究中运用广泛。...()) arrange_ggsurvplots(splots, print = TRUE,#为TRUE时展示排列好的图形 ncol = 2, nrow = 1,#行和列的数量 risk.table.height...= 0.4#这里设置risk.table为TRUE,风险表的高度默认0.25,有多个表时适当增加高度。...: 计算p值的方法 #pval.txt: 用于注释图形的文本 #pval.x, pval.y: 注释图形的x&y的坐标 #method.x, method.y: 计算p值的方法的坐标x & y coordinates...')) strt <- sample(1:2,100,replace=TRUE) # fit:cmprsk::cuminc类的对象——用cmprsk::cuminc函数创建,或者用survfit函数创建
首先,进一步处理数据集bmt中的变量。...regplot包中的regplot()函数可以绘制更多美观的列线图。但是,它目前仅接受由coxph(),lm()和glm()函数返回的回归对象。...因此,为了绘制竞争风险模型的列线图,我们需要对原始数据集进行加权,以创建用于竞争风险模型分析的新数据集。mstate包中crprep()函数的主要功能是创建此加权数据集,如下面的R代码所示。...然后,我们可以使用coxph()函数拟合加权数据集的竞争风险模型,再将其给regplot()函数以绘制列线图。对于特定的加权原理,读者可以参考Geskus等人发表的文章。此处不再详述。...当患者被截断或发生竞争风险事件时,两种模式的结算结果明显不同,读者可以自行尝试。 小结 本文详细描述了使用mstate和regplot 包来绘制竞争风险模型的列线图。
coxph()实现回归分析,并且模型以与常规线性模型中相同的方式指定,但使用coxph()函数。 开始 我们将使用内置的肺癌数据集7学习使用survival包。你可以通过运行?...让我们添加曲线的置信区间,并增加long-rank检验的结果p值以及风险表格: ggsurvplot(sfit, conf.int=TRUE, pval=TRUE, risk.table=TRUE,...Cox PH回归模型正好是处理这类问题的一把好手,它同样内置于survival包中,语法与lm()和glm()一致。 让我们再来用肺癌数据集看看不同性别的风险,这次使用Cox模型。...你可以通过调用summary(fit)来获得Cox模型结果。你也可以使用survdiff()直接计算log-rank测试p值。...最后,我们可以将这个结果分配给肺数据集中的一个新对象。
6.如果是对象,调用对象的 valueOf() 方法,然后按照前面的转换规则转换,如果转换值为 NaN,则调用对象的 toString() 方法。...F 利用原型对象上的 constructor 引用了自身,当 F 作为构造函数来创建对象时,原型上的 constructor 就被遗传到了新创建的对象上, 从原型链角度讲,构造函数 F 就是新对象的类型...(4) toString toString() 是 Object 的原型方式,调用该方法,默认返回当前对象的 [[CLass]],其格式为 [object Xxx],其中 Xxx 就是对象的类型。...在向参数传递基本数据类型的值时,被传递的值会被复制给一个局部变量(即命名参数,也就是 arguments 对象中的一个元素)。...在向参数传递引用类型的值时,会把这个值在内存中的地址复制给一个局部变量,因此这个局部变量的变化会反映在函数外部。
让我们为整个同类群组生成总体生存曲线,将其分配给object f1,然后查看names该对象的: names(f1) ## \[1\] "n" "time" "n.risk..., 会得出错误的估计中值生存时间226天。...我们可以使用coxph函数拟合生存数据的回归模型,该函数Surv在左侧使用一个对象,而在右侧具有用于回归公式的标准语法R。...当对象在事件发生时间设置中发生多个可能的事件时 例子: 复发 因疾病死亡 因其他原因死亡 治疗反应 在任何给定的研究中,所有这些(或其中一些 以及其他)可能都是可能的事件。 所以有什么问题?...黑色素瘤数据中的竞争风险回归-因果分析 审查所有没有引起关注的对象,在这种情况下是由于黑色素瘤死亡,并且照常使用coxph。
k = apply(exprSet,1, function(x){sum(x>0)>0.5*ncol(exprSet)});table(k) # 对行进行计算,每行中至少有一半的样本的值大于0 exprSet...conf.int =TRUE) 连续型信息怎么作KM分析?...(x=x, y=y,lambda=cv_fit$lambda.1se) 选中的基因与系数存放于模型的子集beta中,用到的基因有一个s0值,没用的基因只记录了“.”...lasso_choose_gene_min.Rdata")) save(choose_gene_1se,file = paste0(proj,"_lasso_choose_gene_1se.Rdata")) 3.模型预测和评估 newx参数是预测对象...=0] length(choose_gene_min) length(choose_gene_1se) 4.模型预测 用训练集构建模型,预测测试集的生死,注意newx参数变了。
让我们为整个同类群组生成总体生存曲线,将其分配给object f1,然后查看names该对象的: names(f1) ## [1] "n" "time" "n.risk"..., 会得出错误的估计中值生存时间226天。...我们可以使用coxph函数拟合生存数据的回归模型,该函数Surv在左侧使用一个对象,而在右侧具有用于回归公式的标准语法R。...当对象在事件发生时间设置中发生多个可能的事件时 例子: 复发 因疾病死亡 因其他原因死亡 治疗反应 在任何给定的研究中,所有这些(或其中一些 以及其他)可能都是可能的事件。 所以有什么问题?...黑色素瘤数据中的竞争风险回归-因果分析 审查所有没有引起关注的对象,在这种情况下是由于黑色素瘤死亡,并且照常使用coxph。
参数错误抛出一个TypeError对象。当这些函数被叫做无效参数时,你将会看见这些。 如果没有回调被提供,运行时错误提供Error对象给函数回调或者发出一个error event。...如果你调用正确参数的函数,它应该不需要在一个try/catch结构中包括一个SerialPort对象 SerialPort...只读 binding object 支持串口的绑定对象,只读. isOpen boolean 如果串口打开时为true ,其他情况是 false.只读....用无效的参数或者无效的选项构造一个新的串口时,会抛出错误。...参数 类型 默认 描述 [options] object 当串口被打开时,所有设置都是操作系统的默认设置. 每个标识都被设置成每次调用时提供的或者默认的数值。
我们还会讲一下 JS 中内置的错误对象(Error, SyntaxError, ReferenceError等)以及如何定义自定义错误。...try..catch 无法捕获无效的 JS 代码,例如try块中的以下代码在语法上是错误的,但它不会被catch块捕获。...这里还要注意两件事: 在try块中抛出错误后往后的代码不会被执行了 即使在try块抛出错误之后,finally块仍然执行 finally块通常用于清理资源或关闭流,如下所示: try { openFile...JS 中的内置错误 3.1 Error JavaScript 有内置的错误对象,它通常由try块抛出,并在catch块中捕获,Error 对象包含以下属性: name:是错误的名称,例如 “Error”...➤ x = x + 1; ⓧ Uncaught ReferenceError: x is not defined 3.5 SyntaxError 当你在 JS 代码中使用任何错误的语法时,都会引发SyntaxError
让我们为整个同类群组生成总体生存曲线,将其分配给object f1,然后查看names该对象的: names(f1) ## \[1\] "n" "time" "n.risk..., 会得出错误的估计中值生存时间226天。...我们可以使用coxph函数拟合生存数据的回归模型,该函数Surv在左侧使用一个对象,而在右侧具有用于回归公式的标准语法R。...当对象在事件发生时间设置中发生多个可能的事件时 例子: 复发 因疾病死亡 因其他原因死亡 治疗反应 在任何给定的研究中,所有这些(或其中一些 以及其他)可能都是可能的事件。 所以有什么问题?...黑色素瘤数据中的竞争风险回归-因果分析 删失所有没有引起关注的对象,在这种情况下是由于黑色素瘤死亡,并且照常使用coxph。
让我们为整个同类群组生成总体生存曲线,将其分配给object f1,然后查看names该对象的: names(f1) ## [1] "n" "time" "n.risk"..., 会得出错误的估计中值生存时间226天。...我们可以使用coxph函数拟合生存数据的回归模型,该函数Surv在左侧使用一个对象,而在右侧具有用于回归公式的标准语法R。...当对象在事件发生时间设置中发生多个可能的事件时 例子: 复发 因疾病死亡 因其他原因死亡 治疗反应 在任何给定的研究中,所有这些(或其中一些 以及其他)可能都是可能的事件。 所以有什么问题?...黑色素瘤数据中的竞争风险回归-因果分析 删失所有没有引起关注的对象,在这种情况下是由于黑色素瘤死亡,并且照常使用coxph。
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