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CPAT和CPC2软件安装报错的思考

一、CPAT和CPC2软件用于评估编码蛋白能力,一般在lncRNA分析中常用,生信技能树已经介绍过不再赘述。 二、CPAT软件安装。一般先网上搜索CPAT的安装信息,了解后进行软件安装。...三、CPC2软件安装安装前的网上查询信息,得知CPC2软件依赖python和biopython。 思考:CPC2能否与依赖python3.7的CPAT共同安装在同一个环境?...查阅“生信技能树LncRNA的组装和鉴定(下游流程)”文章,得知CPC2安装在有python2.7的独立环境。依赖不同版本python的软件安装在一起导致软件运行报错。...官网信息提示:CPC2可手动安装也可通过conda安装,且需提供安装python2.7 和biopython1.70。..../02cpc2/cpc2_result.txt 思考:CPC2正常使用的情况下,是否需要测试依赖软件python2.7 和biopython1.70安装后的运行情况?

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    CPC:转录本蛋白编码潜能预测工具

    网址如下 http://cpc2.cbi.pku.edu.cn/ 该软件最新版本为CPC2, 相比CPC1版本,运行速度快了1000倍左右,准确性也更高,安装方式如下 wget http://cpc2....cbi.pku.edu.cn/data/CPC2-beta.tar.gz tar xzvf CPC2-beta.tar.gz cd CPC2-beta/ export CPC_HOME="$PWD" cd...libs/libsvm tar xzvf libsvm-3.18.tar.gz cd libsvm-3.18 make clean && make 需要注意的是,该软件依赖biopython模块,需要自己先安装好这个模块...软件安装好之后,可以通过如下图所示的命令查看软件用法 ? 用法非常简单,-i参数指定输出的fasta格式的转录本序列,-o参数指定输出结果的名称。...除了本地版安装外,还提供了一个在线服务,支持上传Fasta, Bed, GTF格式的文件,示意如下 ? 详细用法和结果解读请参考官网的帮助文档。

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    MySQLMySQL安装

    MySQL安装 配置内置环境 输入 ps axj | grep mysql 查看系统当中是否有已经安装好的MySQL ---- 输入 ps ajx | grep mariadb 查看系统是否有 mariadb...mysqld 采用yum的方式,获取到MySQL安装包 ,一般都是.rpm ---- 输入 rpm -qa 获取所有的安装包 ---- 输入 rpm -qa | grep mysql 获取到mysql...查看系统中默认支持的yum源 发现其中并没有MySQL的yum源,若直接安装,可能安装不上 yum源 的安装 输入 rpm -ivh mysql-community-release-el7.rpm...源 来选择比较适配系统的mysql ---- 输入 yum install -y mysql-community-server 指令 yum会按照yum源的配置自动安装mysql 注意事项 安装期间可能会存在红色框的问题...-y mysql-community-server 指令 ,进行重新安装 最终出现 Complete 即 安装成功 检测是否安装成功 输入 ls /etc/my.cnf 指令 若 存在 /etc

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    Mysql安装多台mysql

    高级篇 下载Mysql最新版8.0.26 在当前mysql安装目录下面新建一个my.ini配置文件,进行初始化配置 初始化数据库,并注册MySql服务 以管理员的身份打开cmd命令工具 在系统上安装两个...Mysql 来到bin目录下面,执行初始化的命令 继续在bin目录下面执行安装MySql的命令 环境变量设置 启动mysql服务 如果一台机器上要安装多台mysql,一定要指定mysql的配置文件的路径...#设置mysql安装目录 basedir=D:/Mysql_8.0.26/mysql-8.0.26-winx64/ # 设置mysql数据库的数据的存放目录 # mysql 8+ 版本不需要手动配置...-- 在系统上安装两个Mysql 因为我这里之前安装了一个mysql 5.5的版本,因此我再次安装8.0.26版本的时候,就会有需要注意的地方 具体步骤,参考下面的文章: 一个系统上安装两个(或多个)...xxx\my.ini" 我已经安装好了,只是给大家演示一下 ---- 环境变量设置 ---- 启动mysql服务 net start 服务名 如果一台机器上要安装多台mysql,一定要指定mysql

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    MySQL安装-windows安装

    windows下安装MySQL 在windows下面安装MySQL 本文以5.7.17为示例 MySQL下载  官网:https://dev.mysql.com/downloads/mysql/  本次安装的...1D8qVrr7oKgx5-FXwezRZJA 提取码: 1bnh 可视化工具下载链接: https://pan.baidu.com/s/19u6awzxQxHdA2RIFu1IKJA 提取码: pnet 安装...双击安装包 不要着急,需要在该界面等待几分钟 选中  再点击 选择最下方的    再点击 依次点击启动mysql服务 启动黑屏终端,输入链接mysql服务 可视化工具安装使用 双击应用程序 选择即可 点击左上角的 连接名...:输入mysql实例名;密码:输入mysql示例密码 左侧显示数据库,可以鼠标右键点击 通过以上步骤,说明MySQL服务安装成功,并且可以通过可视化工具查看

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    MySQL 安装

    Windows 10 离线安装 MySQL 一、下载[1]MySQL 5.7 免安装版本 二、解压到指定目录 例如 D:\mysql-5.7.20-winx64 三、环境变量配置 右击我的电脑 -->...四、创建配置文件 在 D:\mysql-5.7.20-winx64 安装目录下新建文本文件 重命名为 my.ini ; 配置文件中冒号 或 #开头为注释 [mysql] ; 设置mysql客户端默认字符集...服务端使用字符集utf-8 character-set-server=utf8 ; 创建新表时将使用的默认存储引擎 default-storage-engine=INNODB ---- 五、初始化安装....dll 文件 复制到C:\Windows\System32目录下 再次执行初始化操作 mysqld install # 安装mysql net start mysql # 启动服务 六、...#最后删除安装目录下的所有文件 ---- 以上为Windows离线安装MySQL 5.7.20,当然也有在线安装,就是在下载MySQL版本的时候选择 .msi 后缀的软件包,直接双击该文件,根据提示下一步下一步即可完成安装

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