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    Django中数据库的相关操作

    数据库操作—增、删、改、查 1 增加 增加数据有两种方法。 1)save 通过创建模型类对象,执行对象的save()方法保存到数据库中。...查询集,也称查询结果集、QuerySet,表示从数据库中获取的对象集合。 当调用如下过滤器方法时,Django会返回查询集(而不是简单的列表): all():返回所有数据。...2 两大特性 1)惰性执行 创建查询集不会访问数据库,直到调用数据时,才会访问数据库,调用数据的情况包括迭代、序列化、与if合用 例如,当执行如下语句时,并未进行数据库查询,只是创建了一个查询集qs qs...,第一次使用时会发生数据库的查询,然后Django会把结果缓存下来,再次使用这个查询集时会使用缓存的数据,减少了数据库的查询次数。...情况一:如下是两个查询集,无法重用缓存,每次查询都会与数据库进行一次交互,增加了数据库的负载。

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    从NT_NR数据库中提取子库

    1 首先下载NCBI的taxonomy数据库 下载完解压缩,其中names.dmp和nodes.dmp两个文件很重要,是后续提取子库的基础 2 下载NCBI的TaxonKit软件,http://bioinf.shenwei.me...3 下载NCBI的csvtk软件,http://bioinf.shenwei.me/csvtk/download/,linux系统也是直接解压,即可使用 4 (选择性步骤)NCBI taxonomy数据库下还有...库的accession不一致,前者可能冗余更多,因此该方法可忽略,见仁见智吧,下面给个例子,例如: #从taxonomy数据库中的nucl_wgs.accession2taxid提取accession号...outfmt "%a %T" | csvtk grep -d ' ' -D ' ' -f 2 -P $id.taxid.txt \ | cut -d ' ' -f 1 \ $id.acc.txt 7 从NT...这种从NT库中还原的nt.fa序列里面有很多重复的头文件,例如 所以使用的话,还需要写个perl把这些序列拆开,最终形成nt.anmail.fa.gz 8 如果直接想构建子库,那么没必要搞序列,直接运行

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    从NT_NR数据库中提取子库

    那么就有一个问题,如何选择去除污染的数据库呢? 思来想去,还是从NT库入手,打算把NT库所有动物的序列或者所有小鼠的序列提取出来,做成一个子库,用来去除宿主污染。...下面是一些步骤 1 首先下载NCBI的taxonomy数据库 下载完解压缩,其中names.dmp和nodes.dmp两个文件很重要,是后续提取子库的基础 2下载NCBI的TaxonKit软件,http...taxonkit 3下载NCBI的csvtk软件,http://bioinf.shenwei.me/csvtk/download/,linux系统也是直接解压,即可使用 4 (选择性步骤)NCBI taxonomy数据库下还有...库的accession不一致,前者可能冗余更多,因此该方法可忽略,见仁见智吧,下面给个例子,例如: #从taxonomy数据库中的nucl_wgs.accession2taxid提取accession号...这种从NT库中还原的nt.fa序列里面有很多重复的头文件,例如 所以使用的话,还需要写个perl把这些序列拆开,最终形成nt.anmail.fa.gz 8 如果直接想构建子库,那么没必要搞序列,直接运行

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    GEO数据库表达数据的提取以及limma包进行差异分析

    关于GEO数据库认识和在线使用教程,参考文章:GEO数据库使用教程及在线数据分析工具。...第二中方法只是融合了数据,并没有进行log2转换。为什么要进行log2转换。我们先去重了,再说。...GSE数据下载界面中的SOFT文件和Series Matrix File(s)文件中均有描述该系列的数据是如何进行标准化处理的,常见的标准化处理方法有3种:RMA算法、GC-RMA算法、MAS5算法,其中前两中算法的返回值已经经过...好了,我们提取数据后,就可以进行后续的分析了,比如差异分析、表达谱热图绘制了。但差异分析是不是还要分组,所以我们还得知道每个GSM是那一组,比如对照和实验组。 我们提取表型数据。...如果我们获得的数据是原始的Counts数,可以利用edgeR包和DESeq2包进行差异分析,可以参考我在TCGA数据库差异分析的文章,在哪里,我也说过,尽管那是TCGA数据库的教程,但仅仅是提取表达数据的方法不同

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    从多个数据源中提取数据进行ETL处理并导入数据仓库

    本文将介绍如何使用Python进行ETL数据处理的实战案例,包括从多个数据源中提取数据、进行数据转换和数据加载的完整流程。...一、数据来源 在本次实战案例中,我们将从三个不同的数据源中提取数据进行处理,包括: MySQL数据库中的销售数据表,其中包括订单ID、产品名称、销售额、销售日期等信息。...在本次实战案例中,我们需要对从三个数据源中提取的数据进行一些处理和转换,包括: 将MySQL数据库中的销售日期转换为日期类型,并提取出销售额的前两位作为销售分类。...五、总结 本文介绍了如何使用Python进行ETL数据处理的实战案例,包括从多个数据源中提取数据、对数据进行清洗和转换,以及将转换后的数据加载到目标系统中进行存储和分析。...在实际工作中,ETL是数据处理的重要环节,它可以帮助我们从多个数据源中提取、清洗和整理数据,以便进行更好的数据分析和业务决策。

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    ROW_EVENT 从BINLOG中提取数据(SQL) & 从BINLOG中回滚数据(SQL)

    只要解析了这部分, binlog基本上就算是解析完成了. row event 记录了数据类型, 但是没得符号信息(5.7)...., 由于数据存储方式和ibd文件太像了....我们主要测试数据类型的支持和回滚能力 (正向解析的话 就官方的就够了.)数据类型测试测试出来和官方的是一样的.普通数据类型我们的工具解析出来如下....我这里设置了binlog_row_metadata=full, 所以由字段名.官方的解析出来如下大字段空间坐标数据回滚测试数据正向解析用处不大, 主要还是看回滚, 为了方便验证, 这里就使用简单一点的表...写好了再发.能解析ibd和binlog之后, 数据恢复基本上没啥问题了. 更何况还有备份.

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    python 中单独调用 django 的数据库模块

    背景 最近用python做爬虫,爬取的数据需要入到数据库,本来都是一些小的爬虫程序,也没有用到任何框架,但是等数据入库的时候各种拼接sql语句,有时候文本中包含“,会直接报错,烦不胜烦,考虑是否有简单的数据库的...orm框架,方便数据库这块的操作,考虑到之前接触过一些django的知识,就想从这方面入手。...显然这里我们只需要Django的对象映射器帮助操作数据库。...class (preferred), or a package containing an application. 2.DATABASES DATABASES的类型是一个dictionary,字典中是相关的数据库配置...Entity说明 entity就比较简单,就是需要将与数据库中表映射的对象,继承Django的models.Model,Django环境启动后会自动映射到数据库中对应的表。

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    从文本文件中读取博客数据并将其提取到文件中

    通常情况下我们可以使用 Python 中的文件操作来实现这个任务。下面是一个简单的示例,演示了如何从一个文本文件中读取博客数据,并将其提取到另一个文件中。...假设你的博客数据文件(例如 blog_data.txt)的格式1、问题背景我们需要从包含博客列表的文本文件中读取指定数量的博客(n)。然后提取博客数据并将其添加到文件中。...它只能在直接给出链接时工作,例如:page = urllib2.urlopen("http://www.frugalrules.com")我们从另一个脚本调用这个函数,用户在其中给出输入n。...只需在最开始打开一次文件会更简单:with open("blog.txt") as blogs, open("data.txt", "wt") as f:这个脚本会读取 blog_data.txt 文件中的数据...,提取每个博客数据块的标题、作者、日期和正文内容,然后将这些数据写入到 extracted_blog_data.txt 文件中。

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    MySQL数据库从ibd和rfm中恢复(zabbix数据库)

    1、新建数据库 create database zabbix default charset utf8; 2、use zabbix; 3、设置表的默认字段模式,具体根据IBD文件中的格式来设置,set...global innodb_file_format=Barracuda; 4、设置不进行外键检查 set foreign_key_checks=0; 5、创建新的表,总的有127个表。...6、其他表类似 7、删除创建表后生成的ibd文件,alter table `users` discard tablespace; (其他表类似) 8、把要恢复的旧的ibd文件复制到当前zabbix的数据库目录中.../users.ibd /zabbix/users.ibd;  (其他表类似) 9、修改所有者,chown mysql:mysql /zabbix/users.ibd; (其他表类似) 10、恢复ibd数据到表中...PS:创建新数据库和表时,数据库引擎INNODB,库和表的编码格式CHARASET,FORMAT格式都要和原来的一致。

    1.7K20

    使用Django从数据库中随机取N条记录的不同方法及其性能实测

    2018-07-31 发表在 编程语言 2674 【声明】:本文中的实验仅限于特定数据库和特定框架。...不同数据库,数据库服务器的性能,甚至同一个数据库的不同配置都会影响到同一段代码的性能。具体情况请在自己的生产环境进行测试。...想象一下如果你有十亿行的数据。你是打算把它存储在一个有百万元素的list中,还是愿意一个一个的query?...” 在上边Yeo的回答中,freakish回复道:“.count的性能是基于数据库的。而Postgres的.count为人所熟知的相当之慢。...附上三种方法数据量和SQL时间/总时间的数据图表: 最后总结,Django下,使用mysql数据库,数据量在百万级以下时,使用 Python Record.objects.order_by('?')

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    java中运用mybatis进行数据库操作

    一般而言,mytatis其实就是ibatis演化而来的,于是这里自然要把ibatis和mytatis进行比较。 1 映射的条件已经不同。...ibatis中根元素是sqlMapConfig,mybatis中是configuration。 ibatis中是使用sqlMap元素,mybatis中是使用mappers元素。...4 mybatis中$和#的区别 我想我们原来都传单个值的时候都是用到#号,但$这个符号也是可以进行传值的,但$这个符合是动态传入某一个值,或者一个结果集。...重新打开eclipse建立三种配置文件 (1) configuration.xml 用于配置数据库访问连接配置和表操作xml配置mappers (2) dataBase.properties 用于配置数据库模块的参数...); 注意函数名字和sql语句中的配置保持一致 (7) 执行static进行加载mybatis数据库配置 static { try { reader = Resources.getResourceAsReader

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