工作的时候画出来这么一张图： p ggplot(compare_runs, aes(x = log10(V5 + 10^-3), y = log10(V10 + 10^-3), color = group...一开始我打算修改分组的levels的顺序，将这一组换一下位置，但是最终图并没有变化。...最后发现可以直接再加一个图层，将这一组重新画一组点图即可： compare_gencode <- compare_runs[1:8661, ] p + \ geom_point(data = compare_gencode
本节来介绍ggplot2绘制中图例设置方面的问题，通过一个热图的案例进行阐述。整个过程仅参考，希望对各位观众老爷能有所帮助。...ggplot2中的图例体系 ❝在ggplot2中针对图例的自定义设置可通过guide与guides函数来完成，二者虽只有一字之差具体参数上也基本一致，但是使用时却也有些许不同。...「guides函数中常使用的主要有 guide_legend 和 guide_colourba」两类 guide_legend：用于定义离散型数据图例 guide_colourba：用于定义连续型数据图例...❝因此在使用前需针对图例所对应的几何对象来选择正确的函数，同时在实际绘图过程中图例绘制还存在一种情况，即数据为连续型但是在绘制图例将其定义为离散型。...pivot_longer(-gene) df$gene % unique() %>% rev()) df %>% ggplot
今天尝试解决使用ggplot2画图时的一个问题，图例不按规矩出牌。 ggplot2的作者们在测试时发现更新版本也出这问题了，正好可以用于简单说明。 本来是一个这样的图形 ? 新版本变成了 ?...而我是画两个相似的图形时出现这问题，数据结构一样，然后画图后图例的顺序变了~ 根据文档，默认使用了某种“秘密魔法”？！...下面是一个例子： dat <- data.frame(x = LETTERS[1:3], y = 1) p ggplot(dat, aes(x, y, fill = x, colour = 1:3...如果我们要改变图例顺序，按下面的操作，将color变成1，然后fill使用默认排序： # And we can reverse the order p + guides( color = guide_colorbar
这是建立在ggplot2包[2]基础上设计的。你可以通过生成ggplot2图表以交互方式探索esquisse环境中的数据。入门门槛极低，有点类似tableau的感觉。...窗口操作 通过RStudio菜单启动插件（推荐） 注意：如果您的环境中没有data.frame，则可以使用ggplot2中的数据集。推荐还是自己前面已经导入数据了，界面才会有显示可以使用的数据。...改变输入数据的范围 Export&code 这可以显示操作后图对应的ggplot的代码！（非常管用！）你可以按( Insert code in script )将自动导入你的代码中。 ?...小编有话说 这个包对想学习ggplot语法的读者来说，也非常合适。可以直接导出你做图的代码，根据代码反过来学习对应语法，从实践中学习也是不错的选择。...参考资料 [1] esquisse包: https://github.com/dreamRs/esquisse [2] ggplot2包: https://github.com/tidyverse/ggplot2
eqtls.2 <- read_excel("data/20220627/ExtendedFig2.xlsx", sheet = "leg") 第一个小图a...library(latex2exp) library(ggplot2) im1 ggplot(eqtls, aes(x = 1:49,y=V2, size=sample)) + geom_point...values = as.character(eqtls$cls)) im1 image.png 这里新接触到一个R包latex2exp，用来添加比较复杂的文本公式之类的很方便，需要好好学习一下 第二个小图b...coord_cartesian(ylim = c(0,0.25)) + scale_fill_manual(values = as.character(eqtls$cls)) im2 image.png 贡献的图例...(get_legend(im3)) pm3 image.png 这里新接触到一个知识点是 ggplot2作图的图例可以单独提取出来然后和其他图去拼图 最后是拼图 p <- ggarrange(ggarrange
不知道大家用ggplot2绘制饼图的时候有没有遇到过饼图上展示的顺序和图注上展示的顺序不一致的情况。今天小编就来跟大家一起来探讨一下这个问题。...来绘制饼图 library(ggplot2) pie=ggplot(data, aes(x="", y=prop, fill=name)) + geom_bar(stat="identity",...图注上的顺序以及数字跟data里面的一致，但是饼图上的顺序和数字却不太对劲。...问题其实出在name的levels上，饼图默认会根据name的levels来按逆时针绘制。我们从堆积柱形图上可以发现，程序会默认按字母顺序来对name进行排序，这也是因子levels的默认排序方法。...所以这样得到的饼图的顺序实际上是apple，banana，cherry......而图注的顺序跟name本身的顺序一致为apple，pear，orange......
上面的形式，其实也可以用图 表示，所以它等同于下面的形式。 ? 不过，这是一种特殊的图，叫做二分图。...这样我们不难理解，匹配问题就可以转换成图的形式，用图论中的算法来解决问题，匈牙利算法就是求这样的二分图的匹配。 匹配 匹配是专业名词，它是指一组没有公共端点的边的集合。...匈牙利算法就是要找出一个图的最大匹配。 算法思想 其实匈牙利算法如果要感性理解起来是很容易的，核心就在于 冲突和协调 我们看看下图： ?...弄懂了道理，不代表你能写好代码，不信，你先不看下面的内容自己试一试怎么写出来。 匈牙利算法的思想就是： 1.如果没有冲突，按照正常的连接 2.有冲突的话，就冲突的顶点协调，递归下去。...下面图例说明： ? 上面是二分图。 ?
image.png 我选择使用R语言的ggplot2来实现，这个是箱线图和热图的拼接，右侧的热图可以借助geom_point()函数实现，将点的形状改为正方块，数值按照正负来映射颜色，按照一定的数值来映射大小...今天的推文记录一个小知识点是 如何将图例远离主图并且给放到右上角去 首先是构造一份数据 df<-data.frame(x=LETTERS[1:4],y=1:4) df ?...image.png 正常做一个柱形图 library(ggplot2) ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(aes(fill=x)) ?...image.png 拉大图例与主图的距离 使用theme()函数中的legend.box.margin参数来调节 ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(aes...image.png 还有另外两个知识点是调节图例的标题和图例的距离以及图例的文本和图例的距离 分别需要用到legend.spacing.y和legend.spacing.x参数 ggplot(data=
element_rect(fill = "transparent")) + guides(color = guide_legend(direction = "horizontal")) image.png 5-改变图例顺序...默认下，如果是多个图都指定了某个分组： 图例标记也会非常智能的显示的。...我们可以不希望显示，在几何对象中使用show.legend = FALSE ： ggplot(chic, aes(x = date, y = temp, color = season)) + geom_point...或者这张图也还行？...问题来了 在[[89-R可视化21-利用aplot拼图实现类似热图注释柱效果]] 中我提到过，下面这个图： 这样的好处是，注释柱可以堆叠在一起，比较节约空间；但是，不同类型的色块柱的图例却会“缝合”在一起
请注意，对于折线图而言，折线的颜色或对于条形图而言是条形的颜色，并不是从bbc_style（）函数中直接获得的，而是需要在其他标准ggplot图表函数中明确设置 。...默认值为占位符PNG文件，其背景与绘图的背景颜色匹配。...默认的ggplot图例在各个图例项目之间几乎没有空格。...例如，如果要创建带有很多条形图的条形图，并要确保每个条形图和标签之间有一定的呼吸空间，则可能是这种情况。 如果您确实保留了较大高度图的边距，那么轴和标签之间的间隙可能会更大。...image.png 修改柱状图柱子顺序 有时，您需要以不按字母顺序或按大小重新排序的方式对数据进行排序。
2023Naturemicrobiology--Ahigh-qualitygenomecompendiumofthehumangutmicrobiomeofInnerMongolians4.pdf 论文中大部分作图数据都有，争取把论文中的图都复现一下...今天的推文我们试着复现一下论文中的Figure2b image.png 今天推文的主要知识点就是四个柱子，每个柱子单独配色，然后4个图例如何调整四个图例的前后顺序 数据的部分截图 image.png..."Oscillospiraceae", "Lachnospiraceae"))) -> df04 作图代码 ggplot
，我们可以用论文中提供的原始数据模仿出论文中的图 今天的推文重复一下论文中的Figure2a image.png 主要知识点 如何在山脊图上添加辅助线 另外一个知识点是如何把图例放到整个图的左下角...snps","indels","svs", "snps_indels","snps_indels_svs")) 基本作图代码 ggplot...x=mean_value, label=round(mean_value,2)), hjust=1.5,color="#2772a7") 绘制图例...ggplot(data=new.df,aes(x=value,y=new_col02))+ geom_density_ridges(aes(fill=new_col01,color=new_col01...(get_legend(p2)) -> p3 将图例和图组合到一起 library(latex2exp) pdf(file = "Rplot13.pdf", width=9.4,height
目录 一、基本绘图 二、精雕细琢 (1) 添加标题、横纵轴标签 (2) 图片标题字体、大小、样式设置 (3) 坐标轴标题及标签字体、大小及样式设置 (4) 颜色设置 (5) 图例样式设置 (6) 多图汇总...比如图片标题没有居中，横纵轴标题较小，字体样式不统一等。以下，将通过element_text函数继续进行调整。...scale_fill_brewer(palette='Set2') 当然legend.position也可以传入具体位置向量，如legend.position=c(0.5,0.6) II.更改图例顺序...此外，修改图例的顺序还可以通过scale_fill_discrete(breaks=c())等命令(但是它是将原图例和新的图例一起呈现的 (6) 多图汇总 当需要结合多组图片进行说明时，就需要将其放置一张画布上呈现...中的数据变换 通过上述的介绍，我们可以知道，其实ggplot中图例的出现是由于aes中fill(或者color、shape)的设置。
的小伙伴儿们大概都了解过，ggplot2的语法系统将数据层和美化层分开，这种理念给了学习更多的选择，你可以只学习数据层，这样大可保证做出正确的图来（虽然质量不敢恭维），也可以同时学习数据层和美化层(当然你要耗费双倍的精力...今天只讲图例系统，这一块是大部分学习者非常容易忽视的东西（有木有学会ggplot()+geom_xxx就觉得超神了然后自我感慨，哇塞ggplot2原来这么简单，远远没有传说中的那么难耶）。...这么想就不对了，即便你深入掌握了ggplot() + geom_xxx()及其内部参数继承逻辑关系，那也只能保证你正确的做出图来，正确的做出来图并不带表可以把图做好，就像工作不出错并不代表工作出色一样，...以上函数中，着重说一下order参数，order参数用于表明图例在图表上显示的顺序（因为在图表中如果有多个美学映射，那么会形成多个图例【如果这些美学映射不是映射在同一个变量上的话】，如果不对图例显示顺序加以限制...，那么顺序就会按照底层函数的逻辑呈现，不一定符合我们实际要求）。
对于ggplot的初学者而言，可能没有太多的在意图表的主题是否优雅，配色是否美观，仅求能够准确无误的出图就OK了。 但是如果仅限于此，那么使用ggplot作图真的就是杀鸡用了宰牛刀了。...就拿默认的图表来说，虽然你只靠两句代码就可以跑出来一幅还算及格的图表，可是ggplot语法博大精深，背后给你的代码默认匹配的参数不计其数。...以上代码（已经简化的不能再简化了，不夸张的说，再少一个标点符号，就要报错了）跑出来的默认堆积条形图。...以上两个图表分别套用了默认主题theme_gray()和备用主题theme_bw()，所以看去来前者与第一幅图无异，后者则差别很大。...至于图表中的颜色填充顺序和图例相反，这个问题只需追加一句代码即可： ggplot(mydata,aes(Conpany,Sale,fill=Year))+geom_bar(stat="identity"
注意了，我这里所说的完整的地理信息边界，并不带表行政边界，地理信息边界仅仅描述地球上实际存在的地理单位轮廓，所以这张图仅仅是地理轮廓的描述，而无法看到国界线。 那么国界线是通过什么定义的呢？...国家线通常需要在group的基础上，施加id（该id将同属一个国家的不同group归类为一个编号），当然我们也可以将id匹配上国家（行政区划）的实际名称（通常获取的数据地图素材都会同时匹配上id和行政区划名称...边界点不声明顺序，软件如何知道该按照什么样的顺序来进行打印呢？...当这种group和order顺序定义之后，软件首先将所有的经纬度坐标点按照group顺序打印，即先打印group顺序排在第一的多边形，group内部按照order的顺序，依次打印左边点，单个group但因完毕之后...zhibiao)) 以上是最为典型的数据地图做法，fill/colour的颜色映射结果会根据zhibiao变量的性质进行映射形式调整，即如果zhibiao是连续型变量，那么最终就会按照连续渐变色进行填充，图例也是练习渐变的图例
）多张图存在图层顺序！...具体顺序按照书写顺序从下往上安排图层ggplot(data = iris)+ geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length,y = Petal.Length))+...Petal.Length))+ geom_point(color = red")+ geom_smooth()aes()代表映射，只有键入该函数才能从数据中读取相应的内容可以在已有公共设置下进行二次映射代码不报错不代表没错...ppt卡死3 拼图R包patchwork优点：1.语法简单，完美兼容ggplot22.拼图比例设置简单#(1)支持p1+p2#(2)布局代码易读性更强#(3)可给子图添加标记#(4)可统一修改所有子图#...(5)可将子图图例移到一起，整体性好##常见问题代码可运行却不出图画板被占用——关闭画板dev.off()#多次运行至null device，再重新运行代码或dev.new()引用自生信技能树
当使用ggplot2作图的时候如果多个图拼接到一起，图例互相之间有一样的时候，比如如下的情况（我们用R语言内置的鸢尾花的数据集做三个散点图） ?...) ggarrange(p1,p2,p3,ncol = 3) 因为三个图的图例是一样的，我们完全可以只显示一个图例就够了。...image.png 图例放到顶部，默认的布局是3行3列，如果要改成1行6列呢？ggplot2里应该有对应的参数可以修改吧？...如果将ggplot2的图例设置为顶部，默认结果如下 p4ggplot(df,aes(x=V1,y=V2))+ geom_point(aes(color=V6))+ theme_bw()+...image.png 图例两行，顺序是从上到下依次排，那如果要改成2行从左到右依次排列呢？
ggplot(pg_mean,aes(x = group,y = weight)) + geom_col(fill="lightyellow",colour="black") 2绘制簇状条形图 演示数据...ggplot(cabbage_exp,aes(x = Date,y = Weight,fill = Cultivar)) + geom_col() 输出图片 反转图例顺序 我们可以通过guides(...)函数对图例顺序进行调整，指定图例所对应的需要调整的图例属性，本例中对应的是填充色（fill）。...(reverse = T)) 反转堆积顺序 可以通过position_stack(reverse = T)来实现。...(labels = scales::percent) 输出图片 5 绘制频数条形图 演示数据 以ggplot2包中的diamonds数据集为例。
R语言数据分析指南 论文 原图 加载R包 library(tidyverse) library(cowplot) 导入数据 df <- read_tsv("group.xls") 绘制热图...(aes(name, cluster, fill = value)) + # 使用ggplot绘图，设置映射 geom_tile() + # 添加瓷砖图层，用于绘制热图 scale_y_discrete...right") + # 设置y轴刻度位置 scale_x_discrete(limits = c("Epipelagic", "Mesopelagic", "Deep")) + # 设置x轴刻度顺序...legend.title = element_blank() # 设置图例标题为空 ) 绘制线图 line % ggplot(...text), nudge_x = 0.08) + # 添加文本图层，设置文本偏移 scale_x_discrete(limits = c("tVCs", "Hodts")) + # 设置x轴刻度顺序
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