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R语言基础绘图教程——第2章:散点图

主要参数的含义如下: (1)type为一个字符的字符串,用于给定绘图的类型,可选的值如下: "p":绘点(默认值); "l":绘制线; "b":同时绘制点和线; "c":仅绘制参数"b"所示的线; "...o":同时绘制点和线,且线穿过点; "h":绘制出点到横坐标轴的垂直线; "s":绘制出阶梯图(先横后纵); "S":绘制出阶梯图(先纵后竖); "n":作空图。...(2)main参数 字符串,给出图形的标题; (3)sub参数 字符串,给出图形的子标题; (4)xlab 和 ylab参数 字符串,用于给出x轴和y轴的标签。...利用ggplot2绘制散点图 利用ggplot2绘图,请记住下面这个格式,因为这个格式ggplot2绘制其他图形都是这一格式。...ggplot(data, aes(x, y)) + geom_point() aes中的x,y值分别表示在x,y轴的变量;geom_point表示增加散点图图层。

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    (数据科学学习手札38)ggplot2基本图形简述

    abline()、hline()与vline()   在R的基础绘图系统中我们可以在已绘制的图床上通过abline来添加线条,在ggplot2中当然也有类似的方法: geom_abline():   ...我们主要使用两个参数控制线条的位置,slope控制斜率,intercept控制截距,下面是一个简单的例子,我们在散点图层上叠加截距为20,斜率为2的直线: library(ggplot2) p <-...():   如果你想添加的直线垂直于x轴,则可以使用geom_vline()来快捷地添加垂直线条,xintercept传入的参数即为线条在x轴上的位置,若传入向量则可同时添加多条线条: library...,我们通过在geom_hline()中传入参数yintercept来绘制垂直于y轴的线条: p <- ggplot(mtcars, aes(wt, mpg)) + geom_point() +...", hjust = "inward") 2.10 violin()   小提琴图是一种功能和箱线图类似,但增加了核密度估计功能的图形,且更为美观,ggplot2可以绘制出与seaborn中的小提琴图同样优美的图形

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    ggplot2--R语言宏基因组学统计分析(第四章)笔记

    在本例中,我们通过aes()函数实现美学映射:分别指定x和y变量。但是,只绘制了一个空白的GGPlot。因为到目前为止,我们只告诉gglot()应该使用什么数据集,以及应该为x、y轴和颜色使用哪些列。...4.3.3.3 使用坐标系统来调节和限制X轴和Y轴 坐标系的用途是在计算机屏幕上调整从坐标到二维平面的映射。在ggplot2中可用的不同坐标系中,笛卡尔坐标系和极坐标系是最常用的坐标系。...4.3.3.4 添加标签图层以更改标题和轴标签 默认情况下,由ggplot2创建的绘图没有任何标题,并且带有与绘图中使用的变量名相对应的轴标签。...但是,在某些情况下,例如出版物,我们可能希望将标题添加到绘图中,也可能希望更改X轴和Y轴标签。...刻面是在一个图中绘制多个图形。faceting的功能类似于lattice包中的panel。它经常出现在微生物组学研究的出版物上。在ggplot2中,刻面可以通过两种主要方式执行:网格刻面和包裹刻面。

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    R for data science (第一章) ②

    如果您不想在行或列维度中进行构面,请使用。 而不是变量名,例如facet_grid(.〜cyl)。 Genometric Objects 两个图包含相同的x变量,相同的y变量,并且都描述相同的数据。...但情节并不完全相同。 每个图使用不同的可视对象来表示数据。 在ggplot2语法中,我们说它们使用不同的geom。 geom是绘图用于表示数据的几何对象。 人们经常根据情节使用的几何类型来描绘情节。...ggplot2中的每个geom函数都有一个mapping参数。 然而,并非每一种aesthetic都适用于每个几何。 您可以设置点的形状,但无法设置线的“形状”。 另一方面,您可以设置线的线型。...如果这听起来很奇怪,我们可以通过在原始数据上叠加线条然后根据drv着色所有内容来使其更清晰。 请注意,此图包含同一图表中的两个geom!我们将很快学会如何在同一个地块中放置多个geoms。...许多geom,如geom_smooth(),使用单个几何对象来显示多行数据。对于这些geoms,您可以将组审美设置为分类变量以绘制多个对象。 ggplot2将为分组变量的每个唯一值绘制一个单独的对象。

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    (数据科学学习手札37)ggplot2基本绘图语法介绍

    ,这是一种语法规则和参数设置介于常规plot与ggplot2之间的一种绘图函数;   与plot相似,qplot()的基本参数是x、y,分别代表所要绘制图像的x轴与y轴,并且为了和数据框高度契合(我也十分鼓励将变量都放进数据框中规整起来...y轴的显示区间 log:传入字符型,用于控制将哪个轴转成对数轴,'x'和'y'分别代表x轴与y轴,'xy'代表两个轴都进行变化 main:设置图形的主标题 xlab,ylab:设置x轴与y轴的名称 三、...,每一个属性都需要由标度x,y来驱动,才能实现从指定数据——指定图层的映射,对应的,colour,shape等参数,也是由标度进行控制,再映射到对应图层上的对应样式颜色的变换,而ggplot2有一个特性...中绘制的通常为2D图像,即图像的位置信息由(x,y)决定,且通常为笛卡尔坐标系,用得较少的是极坐标系和各种地图坐标系;   坐标系最大的特点是,它可以同时影响所有的位置变量,譬如说,条形图在笛卡尔坐标系中是规规矩矩的条形..., 3.2 通过ggplot()用图层来构建图像   前面我们依次介绍了ggplot2图层语法中的各种主要结构,但仅使用了qplot()进行绘图,其局限性是只能使用在qplot()中定义的一个数据集和对应的一组图形属性映射

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    R for data science (第一章)①Chapter1 使用ggplot2进行数据可视化

    创建ggplot 要绘制mpg,请运行此代码将displ放在x轴上,将hwy放在y轴上: ggplot(data = mpg) + geom_point(mapping = aes(x = displ...mapping参数始终与aes()配对,aes()的x和y参数指定要映射到x和y轴的变量。 ggplot2在data参数中查找映射变量,在本例中为mpg。...语法强调了对x和y的有用见解:点的x和y位置本身就是aesthetic,可以映射到变量以显示有关数据的信息的可视属性。 绘制美学图后,ggplot2会处理其余部分。...它选择了一个合理的尺度来与美学一起使用,它构建了一个解释水平和价值之间映射的图例。对于x和y美学,ggplot2不会创建图例,但会创建带有刻度线和标签的轴线。...例如,我们可以将我们的情节中的所有点都设为蓝色: ggplot(data = mpg) + geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy), color

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    R基础知识及快速检阅你的数据

    A: 使用library() 函数,在括号内直接添加加载包的名字。但是要注意包与库之间的区别,即库实际上是一个包含了若干包的目录。...ggplot2绘制散点图 library(ggplot2) ggplot(mtcars, aes(x= wt, y= mpg))+geom_point() #这里的第一部分ggplot2创建绘图对象,将数据框传递给该函数...ggplot2绘制折线图 ggplot(pressure,aes(x=temperature,y=pressure))+geom_line()+geom_point() #使用geom_line()得到类似的结果...plot(ToothGrowth$supp,ToothGrowth$len) 当两个参数向量在同一个数据框中时,使用boxplot(),其允许我们在x轴上使用变量 组合 #公式语法 boxplot(len...~supp,data=ToothGrowth) #在x轴引用两个变量的交互 boxplot(len~supp+dose,data=ToothGrowth) 3.ggplot2绘制箱线图 #基础画法

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    「R」ggplot2数据可视化

    最常见的元素是坐标轴上的刻度线和标签(还有图例)。 接下来以三个数据集解释ggplot2的使用。第一个是lattice包中的singer数据集,它包括纽约合唱团歌手的高度和语音变量。...在这里,变量wt的值映射到x轴,mpg的值映射到y轴。 ggplot函数设置图形但没有自己的视觉输出。使用一个或多个几何函数向图中添加了几何对象(简写为geom),包括点、线、条、箱线图和阴影区域。...在上述例子中,geom_point()函数在图形中画点,创建了一个散点图。labs()函数是可选的,可以添加注释、轴标签、标题等。 ggplot2中有很多函数,并且大多数包含可选的参数。...ggplot2包提供了分组和小面化的方法。分组指的是在一个图形中显示两组或多组观察结果。小面化指的是在单独、并排的图形上显示观察组。需要注意,ggplot2包在定义组或面时使用因子。...=指定这些水平的标签,limits=表示哪些水平应该展示 coord_filp() 颠倒x轴和y轴 我们将这些函数应用一个分组箱线图中,其中包含按学术等级和性别分组的薪资水平,代码如下: data(Salaries

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    R语言作图基础20230206

    ps:高级绘图函数是指可以绘制出一张图,而低价绘图函数是指在图中添加的“零部件”,低级绘图函数必须在高级绘图函数的基础上才能绘制,二者都是base包的内容eg:plot绘图> plot(iris[,1]...,iris[,3],col=iris[,5]) #以iris表格第一列作为x轴,第三列作为y轴,根据品种来绘制不同颜色> text(6.5,4,label="hello") #添加文字,并加上坐标图片三...aes(x = Sepal.Length, y = Petal.Length))1⃣️ggplot是绘制整个画板,data是用于画图的数据2⃣️geom_point是绘制点图3⃣️mapping=aes...ggplot() 的映射可以在全局使用,geom_function的映射只能在局部使用7)柱状图/直方图 (y轴无需映射)ggplot(data = diamonds) + geom_bar(mapping...",color = "Species",shape="Species",add="jitter")ps:在ggplot2用geom_jitter() ,在ggpubr用add="jitter"图片五、保存文件

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    ggplot2|详解八大基本绘图要素

    此外, 图形中还可能包含数据的统计变换(statistical transformation, 缩写为stats), 最后绘制在某个特定的坐标系(coordinate system, 缩写为coord...#使用diamonds的数据子集作为绘图数据,克拉(carat)数为X轴变量,价格(price)为Y轴变量。...箱式图 箱线图通过绘制观测数据的五数总括,即最小值、下四分位数、中位数、上四分位数以及最大值,描述了变量值的分布情况。...2 坐标轴标尺修改(x , y) 本部分主要是对坐标轴做如下改变, 更改坐标轴名称 更改x轴上标数的位置和内容 显示对一个轴做统计变换 只展示一个区域内的点 更改刻度标签的位置 实现上面的这些可以使用scale_x...ggplot2的图层设置函数对映射的数据类型是有较严格要求的,比如geom_point和geom_line函数要求x映射的数据类型为数值向量,而geom_bar函数要使用因子型数据。

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    R绘图笔记 | 一般的散点图绘制

    (2)main参数 字符串,给出图形的标题; (3)sub参数 字符串,给出图形的子标题; (4)xlab 和 ylab参数 字符串,用于给出x轴和y轴的标签。...分别表示水平(x轴)和垂直(y轴)坐标的数字向量; boxplots # 如为x,则在下方绘制水平x轴的边界箱线图;如为y,则在左边绘制垂直y轴的边界箱线图; # 如为xy,则在水平和垂直轴上都绘制边界箱线图...# 分组变量或因子;使用不同的颜色、绘图符号等来绘制分组图形; by.groups # 为TRUE,则按分组拟合回归线; xlab、ylab # x轴和y轴标签; log # 绘制对数坐标轴; jitter...、y轴的标签;当xlab = FALSE时隐藏标签,y轴同 facet.by # 长度为1-2的字符向量,指定绘制分面的分组向量,分组向量应在数据框中 panel.labs # 修改面板标签的字符向量的列表...label.select # 字符向量,指定要显示的一些标签; repel # 逻辑词,是否使用ggrepel避免过度绘制文本标签。

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    ggplot2 | 关于标题,坐标轴和图例的细节修改,你可能想了解

    在使用ggplot2初步绘制(ggplot2|详解八大基本绘图要素)出需要展示的图形后,还需要对标题,坐标轴(ggplot2|theme主题设置,详解绘图优化-“精雕细琢”)和legend(ggplot2...|legend参数设置,图形精雕细琢)上的对象进行一系列的设置,包括但不限于名称更改,颜色,大小,位置和角度的调整。...一 载入R包 数据 为方便展示,使用ggplot2内置的iris数据集 library(ggplot2) p x=Sepal.Length,y=Sepal.Width...3.1 设置坐标轴 使用labs函数 ,其中x y 即为对应的坐标名字; p2 x="X轴",y = "这是Y轴",title = "生信补给站") p2 3.2 设置坐标大小...(name="color legend") + guides(shape=guide_legend(title = "shape legend")) 4.3 更改标签名称 4.3.1 使用scale

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