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基础知识 | R语言绘图基础之柱形图

一般来说,X轴的数据可以分为数值型、序列型和类别型,图1的X轴很明显属于类别型,根据城市类别进行分类的。Y轴变量通常都是数值型的。如X轴的数据类型属于类别型,一般需要对数据进行降序处理,再展示图表。...通常来说,用ggplot2绘图时,默认X轴类别按照字母顺序排列,比如图1 X轴顺序,按照城市首字母进行排序。...这主要是因为ggplot2是根据因子向量的水平按顺序展示的,而不是根据X轴的因子向量顺序排列,因子向量叫做factor,水平向量为level。...⚠️要实现X轴变量的降序,需要改变因子向量的水平顺序,一定要对表格或者因子向量排序后,再改变其水平顺序,才能使得X轴的类别顺序能够匹配Y轴变量的降序呈现。...Age进行排序 mydata1$City<-factor(mydata1$City,levels=mydata$City[order$ix]) #根据“Age”的排序结果设定因子向量的水平顺序 ggplot

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ggplot2包图形参数(坐标轴、分面、配色)整理

本文根据《R数据可视化手册》整理ggplot2包的图形参数(图形外观、注解、图例、坐标轴、分面、配色)。...配色 6.1 设置对象的颜色 6.2 将变量映射到颜色上 6.3 对离散型变量使用不同的调色板 6.4 对离散型变量使用自定义调色板 6.5 使用色盲友好型调色板 6.6 对连续性变量使用自定义调色板...# drv和cyl为数据集中指定进行分割的变量 facet_grid(drv ~ .) # 纵向排列根据drv变量分面 facet_grid(. ~ cyl) # 横向排列根据cyl变量分面 facet_grid...对离散型变量使用不同的调色板 ?...查看因子顺序:levels(因子名)。 变量是字符型向量而非因子形式,那么它会被自动转化为因子;顺序也默认地按字母表排序。

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    关于南丁格尔图的“绘后感”

    关于数据整理,原则是根据你的呈现目标整理&根据R语言函数对数据的要求整理。即既要满足想要呈现的内容又要满足代码对输入数据的要求。因此,要用计算机语言的思考方式,根据自己的目标整理数据。...$Target) #映射中,分类变量一定要用因子,这是函数本身的要求 #自定义x轴顺序的因子化处理 dt.cl.resorted$Species 变量中的值对应,因子水平中没有的变量会被设置成缺失值(NA) 关于x轴的顺序。由于本次数据x轴本身也是分类变量,理论上也要先因子化,才能进行映射画图。...但是画柱状图的时候,默认会将x轴的分类变量自动因子化然后作图。自动因子化的时候,因子水平按照字母顺序排列,因此作图后x轴的顺序是字母顺序。因此需要手动指定因子水平的顺序。...关于因子 因子相当于是给分类变量设置顺序。即因子水平中指定的顺序即为分类变量的顺序。这与分类变量本身在向量中的排列顺序无关。

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    ggplot2热图扩展包(ggalign)的细节

    使用以下自定义布局: align_group():将布局轴分组到具有组变量的面板中。 align_kmeans():通过 kmeans 将布局轴分组到面板中。...与 ComplexHeatmap 比较 优点 与 ggplot2 生态系统完全集成。 热图注释轴和图例自动生成。 树状图可以轻松自定义和着色。 对图表大小和间距有灵活的控制。...默认的映射将使用 aes(.data.x, .data.y),但可以通过 mapping 参数进行控制。...目前,有四个 align_* 函数可用于图表布局控制: align_group:根据分类因子对图表进行分组和对齐。...align_dendro:根据层次聚类或树状图对图表进行对齐。 align_group align_group() 函数将行/列进行分组。它不会添加任何绘图区域。

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    温故而知新,ggplot2 饼图的几点笔记

    参数示例 结合一些示例,理解一下 coord_polar() 的几个参数。 theta="x" x 轴极化,x 轴刻度值对应扇形弧度,y 轴刻度值对应圆环半径。..."y" y 轴极化,y 轴刻度值对应扇形弧度,x 轴长度对应扇形半径。...mapping 中 aes(fill) 的因子顺序,譬如这里会按照 dat$type 填充,这种非有序因子会基于字母顺序来默认其填充顺序。...为了确定数据填充的先后,同时方便在不同区域上填写上对应数据的大小,所以会先去创建有序因子,从而使数据列 dat$Num 的自然顺序和因子的顺序在一定程度上一致(一致的同向对应或反向对应)。...(matrix(1:12, nrow = 3)) [1] 1 3 6 10 15 21 28 36 45 55 66 78 # 对数据框求和,返回结果仍然是数据框,cumsum 会对对每个变量进行求和处理

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    R语言入门系列之二

    : 缺失值是无法进行比较运算的,很多函数都有参数na.rm选项来移除缺失值,如下所示: 可以使用函数na.omit()来移除变量中缺失值或矩阵、数据框含有缺失值的行,如下所示: ②日期值 在R中,...z-score标准化可以去除不同环境因子量纲的影响。 一般情况下,上面方法中默认MARGIN=1是默认对样品进行处理,默认MARGIN=2是默认对物种或者环境变量进行处理。...环境变量由于量纲不同,在计算距离矩阵(欧氏距离)、根据特征根提取的主成分分析、比较系数的回归分析之前,均需要进行z-score标准化。..., mapping=aes(x=wt, y=mpg)) + geom_point(color="darkred", size=2) 作图结果如下所示: 我们继续根据因子cyl对数据点进行分组并添加趋势线...ggplot2不能识别矩阵,所有分组信息也必须转换为因子变量组成数据框。由于数据框存储的数据量要远大于矩阵,因此ggplot2可以做出信息含量更加丰富的图形。

    3.9K30

    如何通过R语言制作BBC风格的精美图片

    image.png 尽管可能性要小得多,但是如果您确实想对折线图进行等效处理并以大于默认高度的高度导出它,则需要执行相同的操作,但是要根据上表将t的值更改为负值 。...按大小重新排序栏 默认情况下,R将按字母顺序显示数据,但按大小排列则很简单:只需将reorder()包装在要重新排列的x或y变量周围,然后指定要变量 重新排序。 例如。...升序是默认设置,但是您可以通过将desc()包裹在要排序的变量周围来将其更改为降序: bars x = reorder(country, lifeExp),...image.png 修改柱状图柱子顺序 有时,您需要以不按字母顺序或按大小重新排序的方式对数据进行排序。...为了正确排序这些参数,需要在绘制图表之前设置数据的因子水平,在levels参数中指定要绘制类别的顺序: dataset$column <- factor(dataset$column, levels =

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    ggplot2|详解八大基本绘图要素

    #使用diamonds的数据子集作为绘图数据,克拉(carat)数为X轴变量,价格(price)为Y轴变量。...2 坐标轴标尺修改(x , y) 本部分主要是对坐标轴做如下改变, 更改坐标轴名称 更改x轴上标数的位置和内容 显示对一个轴做统计变换 只展示一个区域内的点 更改刻度标签的位置 实现上面的这些可以使用scale_x...1 facet_wrap:基于一个因子进行设置,形式为:~变量(~单元格) #cyl变量进行分面 p<-ggplot(mtcars,aes(mpg,hp))+geom_point() p+facet_wrap...2 facet_grid:基于两个因子进行设置,形式为:变量~变量(行~列),如果把一个因子用点表示,也可以达到facet_wrap的效果,也可以用加号设置成两个以上变量 p+facet_grid(vs...九 主题(Theme) ggplot画图之后,需要根据需求对图进行”精雕细琢“,title, xlab, ylab毋庸置疑,其他的细节也需修改。

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    数据视化的三大绘图系统概述:base、lattice和ggplot2

    后续将分别就lattice和ggplot2可视化绘图系统进行简要介绍。...1.条件变量的用法~ x | A表示因子A各个水平下数值型变量x的分布情况;y ~ x | A * B表示因子A和B各个水平组合下数值型变量x和y之间的关系。...用来分组的变量(因子) index.cond 列表,设定面板的展示顺序 key(或auto.key) 函数,添加分组变量的图例符号 layout 两元素数值型向量,设定面板的摆放方式(行数和列数);如有需要...1.5 页面布局 lattice无法使用par()函数,因此需要将图形存储到对象中,然后利用plot()函数中的split = 或position = 选项来进行控制 split的方法,将第一幅图放置到第二幅图的上面...2 ggplot2绘图系统 ggplot2将数据、数据到图形要素的映射以及图形要素绘制分离,然后按图层叠加的方式作图,通过+进行叠加。

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    R语言ggplot画图(autocad命令输入方式有几种)

    plain",size=15,hjust=0.5)) (3) 坐标轴标题及标签字体、大小及样式设置 I.坐标轴标题样式调整 #axis.title.x:对x轴标题进行调整 #axis.title.y:...对y轴标题进行调整 #axis.title: 对整体坐标轴标题统一调整 #vjust的设置是为了将x轴标题离绘图区远一点 windowsFonts(myFont = windowsFont("宋体"))...II.坐标轴标签样式调整 #axis.text.x对x轴标签调整 #axis.text.y对y轴标签调整 #axis.text 统一对坐标轴标签调整 #angle旋转的角度 windowsFonts(myFont...主要修改数据框中变量的因子顺序 singer$voice.part=factor(singer$voice.part,level=rev(levels(singer$voice.part))) #逆序排列...图片p3占画布第二行的第二个位置 通过编写自定义函数,可以实现对图片指定位置摆放 三、ggplot2中的数据变换 通过上述的介绍,我们可以知道,其实ggplot中图例的出现是由于aes

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    「R」ggplot2数据可视化

    aes()函数的功能是指定每个变量扮演的角色(aes代表aesthetics,即如何用视觉形式呈现信息)。在这里,变量wt的值映射到x轴,mpg的值映射到y轴。...小面化指的是在单独、并排的图形上显示观察组。需要注意,ggplot2包在定义组或面时使用因子。 这里我们使用mtcars数据集查看分组和面,并进行绘图。 ?...分组 在R中,组通常用分类变量的水平(因子)来定义。 分组是通过ggplot2图将一个或多个带有诸如颜色、形状、填充、尺寸和线条类型的视觉特征的分组变量来完成的。...遗憾的是,这些对ggplot2图形没有影响,该包提供了特定了函数来改变其图形的外观。 坐标轴 ggplot2包会自动生成基本所需要的图形参数。当我们需要更大程度定制时,需要了解相应函数的用法。...指定刻度标记、labels=指定刻度标记标签、limits=控制要展示的值的范围 scale_x_discrete()和scale_y_discrete() breaks=对因子的水平进行放置和排序,labels

    7.4K10

    数据可视化的最佳解决方案:ggplot2

    () + # 坐标变换, 默认笛卡尔坐标系 scale_xxx() + # 标度调整, 调整具体的标度 facet_xxx() + # 分面, 将其中一个变量进行分面变换...箱线图 统计学中展示数据分散情况的直观图形,在探索性分析中常常用于展示在某个因子型变量下因变量的分散程度。...p1 <- p + geom_boxplot(aes(fill = cut)) + theme(legend.position = "None") # 两个因子型变量时, 可以将其中一个因子型变量设为...x, 将另一个因子型变量设为用图例颜色区分 p2 <- p + geom_boxplot(aes(fill = color)) + theme(legend.position = "None") # 将箱线图进行转置...library(ggplot2) ggplot(diamonds, aes(x = color, y = carat)) + # 切换主题 theme_linedraw() + # 箱线图颜色根据因子型变量

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    一篇小短文助你打开数据可视化的任督二脉!

    本文主要讨论ggplot2是如何通过颜色信号来对多边形进行填充的底层理念,这也是想要进阶R语言数据可视化过程中必须搞明白的关键环节。...那么问题来了,为啥之前所说的order没有在geom_polygon()参数中进行显式声明呢? 边界点不声明顺序,软件如何知道该按照什么样的顺序来进行打印呢?...(aes(x=long,y=lat,group=group,fill/colour=zhibiao)) 以上是最为典型的数据地图做法,fill/colour的颜色映射结果会根据zhibiao变量的性质进行映射形式调整...,即如果zhibiao是连续型变量,那么最终就会按照连续渐变色进行填充,图例也是练习渐变的图例,指标是分类或者因子型,则会按照离散渐变进行填充。...更有意义的做法是,根据不同国家或者地区的某个指标进行连续渐变填充或者离散颜色填充。

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    VlnPlot结果及常用参数浅析

    ,并且将结果数据保存为一个变量,进行查看 p1 = VlnPlot(pbmc, features = "MS4A1") p1 在小提琴图中,x轴代表不同的样本或细胞群组,y轴代表基因表达水平。...sort:根据被绘制属性的平均表达量对身份类别(x轴上)进行排序。你也可以传递'increasing'或'decreasing'来改变排序方向。...group.by:根据对象元数据中的不同方式对细胞进行分组(例如,orig.ident)。 split.by:对象元数据中的一个因子,用于分割图表。传递'ident'可以按细胞身份分割。...log:是否对特征轴(通常是x轴)使用对数刻度。...fill.by:根据'feature'或'ident'对小提琴图进行着色。 flip:翻转图表方向(身份类别在x轴上)。

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    用ggpubr包制图

    简介 Hadley Wickham撰写的ggplot2[1]是好用的软件包,是可视化工具的必备包。但是,需要知道ggplot2一定的理论与原理,对新手来说,入门门槛还是比较高的。...有序的条形图 条形图(ggbarplot)中可以利用sort.val = "desc"把数据从大到小排序并且不在组内进行排序(sort.by.groups = FALSE),而是所有数据排序;旋转x轴标签...根据上面的数据,创建一个有序的箱型图,按升序对值排序(sort.val = "asc")。...这里和前面箱型图不同的是,使用刚建的mpg_grp变量作为填充参数,而该参数是因子(含两个水平,levels = c("low", "high"))。...旋转x,y轴(rotate = TRUE)并进行降序排序(sort.val = “desc”),如下图所示,该图非常美观,可读性很强。

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    R数据可视化之ggplot2 (一)

    先说说我们人手工作图的方式,1,先画一个坐标轴,2,然后根据数据在图上画图形3,在基础的图形上加一些注释,或加一些对比.基本上这就是我们作图的方式,那么ggplot2就跟这差不多了,1.先设定坐标轴和数据...2,选择要画图形的类型3,添加一些图形,4,丰富一下图形的信息.ggplot2根据这个步骤,把每一步当做一个图层,每一个图层我们都可以设定一些参数....)) #当变量为因子型,绘制频数条形图 qplot: 版本改掉了一些参数,暂时未知 ggplot: ggplot(BOD, aes(x=Time, y=demand)) + geom_bar...ggplot(mtcars, aes(x=factor(cyl))) + geom_bar() #当变量为因子型,绘制频数条形图,而且不用指定y 3.画直方图 基础绘图系统: hist(mtcars$mpg...,from,to表示x的定义域 #自定义一个函数 myfun <- function(xvar) { 1/(1 + exp(-xvar + 10))

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    如何通过Google来使用ggplot2可视化

    比如画多个分组变量(SNV和INDEL的het,hom)的条形图,并且标记每个变量的数值,还有修改图例,重新排序!...(x=price,fill=cut), position="fill") 直方图只需要一个数据,自动分组来得到X,Y轴变量,直方图把连续型的数据按照一个个等长的分区(bin)来切分,然后计数,画柱状图...如果ggplot2只是有这39个内置图形函数那就太没意思了,每个映射都是可以细化调整的,包括X,Y轴,颜色,大小等具体的熟悉,只是需要时间来熟练使用!...坐标系统(Coordinante) 坐标系统控制坐标轴,可以进行变换,例如XY轴翻转,笛卡尔坐标和极坐标转换,以满足我们的各种需求。...#这个bar图是统计cut的各个因子出现的次数,来作为Y轴。

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