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R语言绘图之ggplot2

2. ggplot2的绘图原理: ggplot2的核心理念是将绘图与数据分离,数据相关的绘图与数据无关的绘图分离,并按图层作图。...ggplot的绘图有以下几个特点:第一,有明确的起始(以ggplot函数开始)与终止(一句语句一幅图);其二,图层之间的叠加是靠“+”号实现的,越后面其图层越高。...ggplot图的元素可以主要可以概括如下:最大的是plot(指整张图,包括background和title),其次是axis(包括stick,text,title和stick)、legend(包括backgroud...,来自colorbrewer.org网站展示的颜色标度 scale_continuous 连续标度 scale_data 日期 scale_datetime 日期和时间 scale_discrete 离散值...scale_gradient 两种颜色构建的渐变色 scale_gradient2 3中颜色构建的渐变色 scale_gradientn n种颜色构建的渐变色 scale_grey 灰度颜色 scale_hue

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    这样的地图一键绘制!这个工具绘制地图太方便了~~

    我们第一个数据可视化交流圈子也已经上线了,主要以我的第一本书籍《科研论文配图绘制指南-基于Python》为基础进行拓展,提供「课堂式」教学视频,还有更多拓展内容,可视化技巧远超书籍本身,书籍修正和新增都会分享到圈子里面...tidyterra工具简介 tiderterra是 R 语言中用于处理地理空间数据的工具包,它提供了一种基于tidyverse哲学的方式来处理栅格数据。...以下是 tiderterra的一些主要特点和功能: 「基于tidyverse:」 tidyterra 遵循了 tidyverse 的设计原则,因此可以与 dplyr、ggplot2 等包进行无缝集成,使得地理空间数据的处理更加流畅和一致...(na.value = "orange") + tidyterra中的渐变调色板 tidyterra工具中提供了大量的渐变调色板,以下列举出其中一个: 更多关于tidyterra包中的渐变颜色板样例,...大家可阅读:tidyterra*渐变颜色板样例[1] tidyterra可视化功能 既然集成了ggplot2的绘图功能, tidyterra包的可视化功能也是非常完善的,且再也不用之前的大量数据处理过程啦

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    R语言基础绘图教程——第3章:折线图和带状图

    "p":绘点(默认值); "l":绘制线; "b":同时绘制点和线; "c":仅绘制参数"b"所示的线; "o":同时绘制点和线,且线穿过点; "h":绘制出点到横坐标轴的垂直线; "s":绘制出阶梯图...我们可以更改成渐变色,RColorBrewer包来调色。这个包慢慢的会讲解。...但是这样感觉还是不好看,我们可以利用gplots包设置2种颜色,数值高为一种,数值低为一种,中间就为这2种颜色的渐变色。和热图的渐变色一样。...利用ggplot2绘折线图 前面我们说过ggplot2绘制散点图是ggplot()+geom_point()格式,绘制折线图,我们只需要再加上geom_line()。...利用ggplot2绘带状图 library(ggplot2) #read in data data = read.table("ribbon_plot.txt", header=T, sep="\t"

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    文献配套GitHub发表级别绘图03-条形图

    下面是去年实习生的分享 author: "ylchen" 文章来源:"Preoperative immune landscape predisposes adverse outcomes in...下面来实现Fig.2a的条形图(barplots) 一、数据载入 rm(list = ls()) library(reshape2) library(ggplot2) library(RColorBrewer...y变量的数量 #stat="identity"表示条形的高度是y变量的值 scale_fill_manual(values = colorRampPalette(brewer.pal(11...详解RColorBrewer包 ggplot2画图时会自带配色设置,但一般比较难看。当想使用一些高级,现有的颜色搭配时,不妨考虑下RColorBrewer包。...(brewer.pal(11, "Spectral"))(22)) 2. theme用法 相信大家也留意到上面设置theme时使用了几个函数,但实际上还有很多内容可以调整,下面这个图简直是宝藏

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    体验R和python的不同绘制风格

    它们两个编程语言的可视化体系也非常复杂,目前主流的是R的ggplot2和Python的matplotlib、seaborn,我们来分开介绍一下: ggplot2绘图体系的核心思想是将数据映射到图形属性上...下面是ggplot2绘图体系的一些关键概念: 数据:ggplot2使用数据框作为数据输入的基本单位。数据框是一个二维表格,其中每一列代表一个变量,每一行代表一个观察值。...映射(Mapping):映射是将数据变量与图形属性进行关联的过程。例如,将数据的x轴映射到图形的横坐标,将数据的颜色映射到图形的填充颜色。...标度(Scale):标度用于将数据的取值范围映射到图形属性的取值范围。例如,将数据的数值范围映射到颜色的渐变范围。...下面是matplotlib的一些关键特点和功能: 简单易用:matplotlib提供了简单直观的API,使得绘图变得简单易用。

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    如何试用 R 语言绘制散点图

    的确,火山图是使用频率最多的,在火山图中可以很轻松地根据基因在两组间的Fold Change值以及显著性p值,识别和判断差异表达基因概况。...火山图实质上就是一种散点图,通常横纵坐标分别代表了log2转化后的Fold Change以及- log10转化后的p值或p调整值信息(下图左)。...例如,基因表达值数量级相差过大,取个对数转换;基因名称按是否为差异基因作个排序,避免后续作图时被不显著的基因点遮盖,即排序的目的是让这些显著基因的点都位于图的上方。...第一种类型是将基因按上调、下调或不显著类型着色,便于从图中辨认差异基因。我们使用ggplot2的方法绘制差异基因散点图。...因此另一种思路是,颜色代表p值,这样就可以在图中获得一个渐变梯度。同样使用ggplot2的方法绘制,和上述过程相比仅在颜色指定上存在区别。

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    还有哈利波特主题的颜色包!?是时候汇总Python-R的颜色主题包了

    颜色主题包介绍 R ggplot2 颜色主题包介绍 单色系(Sequential)、双色渐变系(Diverging)和多色系(Qualitative) 优秀的可视化作品离不开颜色的合理设置,而有关图表绘制颜色搭配的三大准则...下面就简单介绍下这色彩搭配的三原则: 单色系(Sequential):颜色系中的颜色较为相近,其主要特点是颜色的亮度变化,这样的特点也就使其非常适合有序数字(数值从小到大变化) 的颜色映射,如城市二氧化碳的浓度变化值...单色系(Sequential)样例 双色渐变系(Diverging):这些颜色色系可以突出定量数据中中间值之上和之下的值。...中间颜色被分配给临界值(midpoint),两端的两个连续色系则被分别被分配给临界值上面或下面的值。如城市二氧化碳的浓度分布情况。色系如下: ?...cmaps -all -colormaps R 颜色主题包介绍 说到R的颜色主题包,由于其优秀的ggplot2 包,而基于此包的第三方颜色主题可谓是丰富且强大,由于数量较多,我们直接使用较大的几个第三方包

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    一个函数完成数据相关性热图计算和展示

    相关性矩阵是一个对称阵,这里用下三角热图展示全部信息。每个格子的颜色代表对于行与列的相关性,颜色越红正相关性越强,越蓝负相关性越强。...ggcorr要求的第二个设置是要计算的相关系数的类型。有三个可能的值:“pearson”(ggcorr和cor使用的默认值),“kendall”或“spearman”。...cor function的文档中说明了每个设置之间的差异。一般而言,除非数据是序数,否则默认选择应为“pearson”,即基于pearson的方法产生相关系数。...set at median correlation to 0.08 控制色阶颜色的最后一个选择是通过调色板参数使用ColorBrewer调色板。...相关矩阵中的变量标签可能会出现的一个问题是,变量标签太长而无法在图的左下方完整显示。

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    ggplot2|详解八大基本绘图要素

    箱式图 箱线图通过绘制观测数据的五数总括,即最小值、下四分位数、中位数、上四分位数以及最大值,描述了变量值的分布情况。...ggplot2的scale系列函数有很多,命名和用法是有一定规律的。...比如柱状图,fill是柱子的填充颜色,这时就使用scale_fill系列函数来更改颜色。 比如点图使用color分组,则使用scale_color_系列函数来更改颜色。...,比如0-100的数,数值越大颜色越深这样 gradient 创建渐变色 distiller 使用ColorBrewer的颜色 identity 使用color变量对应的颜色,对离散型和连续型都有效 1.3...注:以下为ggplot2提供的其他统计变换方式,也可以自己写函数基于原始数据进行计算。

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    ggplot2自定义离散型热图图例

    本节来介绍ggplot2绘制中图例设置方面的问题,通过一个热图的案例进行阐述。整个过程仅参考,希望对各位观众老爷能有所帮助。...ggplot2中的图例体系 ❝在ggplot2中针对图例的自定义设置可通过guide与guides函数来完成,二者虽只有一字之差具体参数上也基本一致,但是使用时却也有些许不同。...针对这种情况上方所列的两个函数就无法实现。这时就可使用「guide_colorsteps」函数来实现,该函数可将区域显示为单一恒定颜色,而不是从颜色条对应项中已知的渐变。...设置图例标题位置 guides(fill = guide_colorsteps(title.position = "top", show.limits = TRUE), # 显示了数据的最小值和最大值...color="none") # 剔除颜色图例

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    R语言ggplot2科研数据作图配色的一些小技巧

    以下是正文内容 大家好,在这里给大家介绍一下使用ggplot2绘图调色的几种小方法。正所谓绘图十分钟,调色一小时。图片的配色直接决定了图片质量的好坏。下面讲一下我平时绘图用到的调色工具。...image.png 1 对应的应该是sequential 2 对应的是 qualitative 3 对应的是diverging 生成颜色值我们需要使用brewer.pal()函数,这个函数又两个参数,第一个参数是调色板左侧的名字...,第二个位置是生成几个颜色 比如做柱形图,我们选择分类的颜色 colors<-brewer.pal(name="Set3",9) colors 这样就生成了9个颜色,接下来用这个颜色填充柱形图 ggplot...image.png 这样,就把照片导入Rstudio了,下面把图片中的颜色提取出来。...(这里mycolors直接就是包含颜色值的向量) ? 配色小技巧之四:R语言包 ggsci——一剑破万法!

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    【软件测试系列三】《测试用例编写原则与设计方法》

    划分等价类的方法:下面给出六条确定等价类的原则。 a) 在输入条件规定了取值范围或值的个数的情况下,则可以确立一个有效等价类和两个无效等价类。...等价类划分是最常用的方法,通常和边界值分析法一起用,在下面的流程分析法里,我会将等价类、边界值和流程分析法一起举例,一起写测试用例。 3.2. ...在下面的流程分析法里,我会将等价类、边界值和流程分析法一起举例,一起写测试用例。 3.3. ...下面根据等价类测试用例设计原则和边界值分析法设计测试用例的原则,进行用例的编写。 注:用例设计完后,对照流程图分析是否有遗漏的路径没有覆盖到。如果有,设计用例覆盖这些路径。...下面再举一个用户通过银行的ATM取款机进行取款的例子,来说明流程分析法、等价类分析法和边界值法。

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    绘制让人眼前一亮的美图--你需要这个!

    ggthemr是发布在github上的开源ggplot插件包,可以方便快捷的配置各种风格的主题,并且改变字体类型、大小,图例、坐标轴、背景等各种元素。...我们可以使用如下命令清除主题并返回到ggplot2的默认设置: ##清除主题 ggthemr_reset() 由于ggplot2函数会存在一些bug,在绘图的时候可能会返回错误(如:颜色名称未知),我们可以通过调用...,包括背景,文本,轴线,色板和渐变的颜色。...: 当我们已经确定了一个主题的时候,如果我们想单独对里面的颜色进行微调(互换),swatch()函数就可以实现这个功能,让我们看看前后对比图。...重置默认值 do.call(what = ggplot2::update_geom_defaults, args = dust_theme$geom_defaults$new$bar) ##直方图 ggplot

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    一小时掌握R语言数据可视化

    ggplot2是R语言最为强大的作图软件包,有着自成一派的可视化理念,数据可视化是数据分析的重要一步,让我们通过由浅入深的掌握数据可视化的精髓。...,后面是声明怎么成像 下面我们开始调整geom_point的参数,比如展示不同的颜色(左),和展示不同的形状(右) > ggplot(data, aes(x, y)) + geom_point(aes(...,看下面两个用法(如图左、右):左边的含义就是画红色点,右边是按照指定的一个维度展示不同的颜色 > ggplot(data, aes(x, y)) + geom_point(colour="red")...,因此默认的直方图的高度是counts或sum,也就是像下面这样子:因为我们的x只有1、2、3单独的三个值,所以直接geom_bar()高度相同,但如果判断x<2,那么有一个满足,两个不满足,所以高度分别是...: > ggplot(data, aes(x)) + geom_density(adjust = 1/5) 如果我们想按照不同的y值来分开画密度图,并且用不同颜色来表示不同的y值,那么我们可以用描边的方式

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    R可视乎|等高线图

    简介 等高线图(contour map) 是可视化二维空间标量场的基本方法[1],可以将三维数据使用二维的方法可视化,同时用颜色视觉特征表示第三维数据,如地图上的等高线、天气预报中的等压线和等温线等。...假设 是在点 处的数值,等值线是在二维数据场中满足 的空间点集按一定的顺序连接而成的线。...含义:转换前第一行在转换后第一列为1,对应位置在第二列,第三列是对应值。 ? ? >> 设置颜色调色盘,以后详细讲解。...使用ggplot2包中的geom_tile()或者geom_raster()绘制热 力分布图。...拓展:scale_*_gradient创建一个双色梯度(低-高),scale_*_gradient2创建一个渐变的颜色梯度(低-中-高),scale_*_gradientn创建一个n色梯度。

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